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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSMOCG00000002286 (Gene tree)
Gene ID: 101999554
Gene Symbol: Msi1
Alias: Msi1|Msi1h|Musahi1|m-Msi-1
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Microtus_ochrogaster
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 27066 bases
Position: chr2:5332519-5359584
Accession: 101999554
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMOCP00000002876	RRM_1	PF00076.22	6.6e-34	1	2
ENSMOCP00000002876	RRM_1	PF00076.22	6.6e-34	2	2
ENSMOCP00000002882	RRM_1	PF00076.22	7.9e-34	1	2
ENSMOCP00000002882	RRM_1	PF00076.22	7.9e-34	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMOCT00000003070	-	2803	XM_005344308	ENSMOCP00000002876	362 (aa)	XP_005344365	UPI00038C1A0F
ENSMOCT00000003076	-	1092	-	ENSMOCP00000002882	363 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMOCG00000002286	Msi1	50	42.077	ENSMOCG00000004275	-	75	38.843
ENSMOCG00000002286	Msi1	52	40.976	ENSMOCG00000019409	-	71	41.784
ENSMOCG00000002286	Msi1	50	38.462	ENSMOCG00000016310	-	71	33.750
ENSMOCG00000002286	Msi1	52	40.385	ENSMOCG00000016931	Dazap1	98	43.713
ENSMOCG00000002286	Msi1	50	43.169	ENSMOCG00000021968	-	61	43.169
ENSMOCG00000002286	Msi1	50	36.264	ENSMOCG00000020786	-	57	36.869
ENSMOCG00000002286	Msi1	50	40.860	ENSMOCG00000015117	-	69	37.959
ENSMOCG00000002286	Msi1	50	46.667	ENSMOCG00000014470	Hnrnpab	74	40.800
ENSMOCG00000002286	Msi1	96	68.768	ENSMOCG00000005820	Msi2	96	70.904
ENSMOCG00000002286	Msi1	58	39.823	ENSMOCG00000007714	-	53	39.823
ENSMOCG00000002286	Msi1	51	44.324	ENSMOCG00000021398	Hnrnpd	75	39.453
ENSMOCG00000002286	Msi1	62	51.064	ENSMOCG00000008715	Rbm38	55	38.889

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	ENSG00000135097	MSI1	100	99.724	Homo_sapiens
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.516	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.516	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.978	ENSAPOG00000023458	-	100	83.978	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	81.102	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	81.102	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMOCG00000002286	Msi1	91	82.371	ENSACIG00000017754	-	83	80.000	Amphilophus_citrinellus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.516	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	83.516	Amphiprion_ocellaris
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	77.193	ENSAOCG00000009031	-	95	77.485	Amphiprion_ocellaris
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.978	ENSAPEG00000006857	-	84	83.978	Amphiprion_percula
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.516	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	83.516	Amphiprion_percula
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	80.163	ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.163	Anabas_testudineus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	78.142	ENSATEG00000023779	-	100	78.142	Anabas_testudineus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	96.143	ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.143	Anolis_carolinensis
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	ENSANAG00000027151	MSI1	100	99.724	Aotus_nancymaae
ENSMOCG00000002286	Msi1	82	95.973	ENSANAG00000027901	-	92	95.973	Aotus_nancymaae
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.702	ENSACLG00000000117	-	100	85.044	Astatotilapia_calliptera
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	82.967	ENSACLG00000011230	MSI1	100	82.967	Astatotilapia_calliptera
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	83.434	ENSAMXG00000038960	msi1	76	83.434	Astyanax_mexicanus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	99.724	Bos_taurus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	99.724	Callithrix_jacchus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.448	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	99.448	Canis_familiaris
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	99.678	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	99.678	Canis_lupus_dingo
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	94.309	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	94.309	Capra_hircus
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	99.694	ENSTSYG00000033949	MSI1	99	99.694	Carlito_syrichta
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	89.457	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	89.457	Cavia_aperea
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	99.708	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	99.708	Cavia_porcellus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	99.724	Cebus_capucinus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	ENSCATG00000030019	MSI1	100	99.724	Cercocebus_atys
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	99.708	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	99.708	Chinchilla_lanigera
ENSMOCG00000002286	Msi1	75	96.029	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.029	Chlorocebus_sabaeus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	95.580	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	95.580	Chrysemys_picta_bellii
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	99.695	ENSCANG00000040651	MSI1	100	99.695	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	99.724	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	99.696	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	99.696	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	78.006	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	78.006	Cynoglossus_semilaevis
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	82.873	ENSCSEG00000008352	-	100	82.873	Cynoglossus_semilaevis
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.242	ENSCSEG00000005834	-	100	83.242	Cynoglossus_semilaevis
ENSMOCG00000002286	Msi1	64	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.978	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	83.978	Cyprinodon_variegatus
ENSMOCG00000002286	Msi1	81	82.096	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	82.096	Danio_rerio
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	81.098	ENSDARG00000010710	msi1	100	84.581	Danio_rerio
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	89.666	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	89.666	Dasypus_novemcinctus
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	98.802	ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.198	Dipodomys_ordii
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	91.592	ENSETEG00000004756	MSI1	100	95.427	Echinops_telfairi
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	ENSEASG00005004736	MSI1	100	99.724	Equus_asinus_asinus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	ENSECAG00000017526	MSI1	100	99.724	Equus_caballus
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	80.938	ENSELUG00000023280	-	100	80.645	Esox_lucius
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	80.110	ENSELUG00000023219	MSI1	92	80.110	Esox_lucius
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	99.724	Felis_catus
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	95.498	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.498	Ficedula_albicollis
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	99.390	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.390	Fukomys_damarensis
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	84.254	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	84.254	Fundulus_heteroclitus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.516	ENSFHEG00000003560	-	100	83.516	Fundulus_heteroclitus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	82.597	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	Gadus_morhua
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	76.309	ENSGMOG00000017838	-	100	76.309	Gadus_morhua
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	94.872	ENSGALG00000007227	MSI1	98	86.701	Gallus_gallus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	64.932	ENSGAFG00000005860	-	100	64.932	Gambusia_affinis
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	85.088	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	85.088	Gambusia_affinis
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	80.387	ENSGACG00000008674	-	100	80.387	Gasterosteus_aculeatus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.149	ENSGACG00000012679	MSI1	100	83.149	Gasterosteus_aculeatus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	95.304	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	95.304	Gopherus_agassizii
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	99.682	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	99.682	Gorilla_gorilla
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.702	ENSHBUG00000011841	-	100	83.702	Haplochromis_burtoni
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	82.967	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	82.967	Haplochromis_burtoni
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.448	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	99.448	Heterocephalus_glaber_female
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	99.390	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.390	Heterocephalus_glaber_male
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	78.415	ENSHCOG00000012067	-	100	78.415	Hippocampus_comes
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	80.645	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	80.645	Hippocampus_comes
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	82.044	ENSIPUG00000001976	msi1	100	82.044	Ictalurus_punctatus
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	99.678	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	99.678	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	99.724	Jaculus_jaculus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	84.254	ENSJJAG00000010643	-	100	83.978	Jaculus_jaculus
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	83.284	ENSKMAG00000019877	-	100	83.284	Kryptolebias_marmoratus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.425	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	83.425	Kryptolebias_marmoratus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.978	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	83.978	Labrus_bergylta
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	82.967	ENSLBEG00000001375	-	100	82.967	Labrus_bergylta
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	87.135	ENSLACG00000018287	MSI1	100	87.135	Latimeria_chalumnae
ENSMOCG00000002286	Msi1	50	70.000	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	70.000	Lepisosteus_oculatus
ENSMOCG00000002286	Msi1	91	89.728	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.728	Loxodonta_africana
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	99.708	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	99.708	Macaca_fascicularis
ENSMOCG00000002286	Msi1	97	98.006	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	98.006	Macaca_mulatta
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	99.724	Macaca_nemestrina
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	99.695	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	99.695	Mandrillus_leucophaeus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.149	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.149	Mastacembelus_armatus
ENSMOCG00000002286	Msi1	96	85.673	ENSMAMG00000018426	-	100	83.516	Mastacembelus_armatus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	82.967	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	82.967	Maylandia_zebra
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.702	ENSMZEG00005000340	-	100	83.702	Maylandia_zebra
ENSMOCG00000002286	Msi1	64	98.225	ENSMGAG00000016518	-	100	98.225	Meleagris_gallopavo
ENSMOCG00000002286	Msi1	71	99.588	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.588	Mesocricetus_auratus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	ENSMICG00000033181	MSI1	100	99.724	Microcebus_murinus
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	76.023	ENSMMOG00000010492	MSI1	94	76.023	Mola_mola
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	81.269	ENSMMOG00000012265	-	99	80.119	Mola_mola
ENSMOCG00000002286	Msi1	91	67.470	ENSMODG00000003189	-	100	67.470	Monodelphis_domestica
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	84.751	ENSMALG00000001426	-	100	84.751	Monopterus_albus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.702	ENSMALG00000017889	MSI1	100	83.702	Monopterus_albus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.171	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	100	99.171	Mus_caroli
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.171	ENSMUSG00000054256	Msi1	100	99.171	Mus_musculus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	98.895	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	100	98.895	Mus_pahari
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.171	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	100	99.171	Mus_spretus
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	99.678	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	99.678	Mustela_putorius_furo
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	89.881	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	89.881	Myotis_lucifugus
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	93.575	ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.575	Nannospalax_galili
ENSMOCG00000002286	Msi1	88	77.432	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	77.432	Neolamprologus_brichardi
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.702	ENSNBRG00000000841	-	100	83.702	Neolamprologus_brichardi
ENSMOCG00000002286	Msi1	91	89.329	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.329	Nomascus_leucogenys
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	77.439	ENSMEUG00000015759	MSI1	100	77.439	Notamacropus_eugenii
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	91.746	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	91.746	Ochotona_princeps
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	99.695	ENSODEG00000006328	MSI1	100	99.695	Octodon_degus
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ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.242	ENSONIG00000019452	-	100	83.242	Oreochromis_niloticus
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	99.357	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	99.357	Oryctolagus_cuniculus
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ENSMOCG00000002286	Msi1	100	84.254	ENSORLG00015013672	-	76	80.939	Oryzias_latipes_hsok
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	84.530	ENSOMEG00000017536	MSI1	100	84.530	Oryzias_melastigma
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	86.550	ENSOMEG00000002272	-	100	84.341	Oryzias_melastigma
ENSMOCG00000002286	Msi1	99	95.330	ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.330	Otolemur_garnettii
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	95.758	ENSOARG00000012097	MSI1	100	95.758	Ovis_aries
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ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.448	ENSPANG00000006335	MSI1	100	99.448	Papio_anubis
ENSMOCG00000002286	Msi1	96	85.591	ENSPKIG00000023575	-	100	83.702	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	84.807	ENSPKIG00000016497	MSI1	100	84.807	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMOCG00000002286	Msi1	81	92.576	ENSPSIG00000009621	-	100	92.576	Pelodiscus_sinensis
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	91.813	ENSPSIG00000011608	-	93	91.813	Pelodiscus_sinensis
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	81.459	ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.459	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	70.930	ENSPMGG00000007743	-	89	71.304	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMOCG00000002286	Msi1	99	94.678	ENSPEMG00000010491	Msi1	99	94.678	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.978	ENSPMEG00000012796	MSI1	100	83.978	Poecilia_mexicana
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ENSMOCG00000002286	Msi1	100	98.895	ENSPPYG00000005027	MSI1	100	98.895	Pongo_abelii
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ENSMOCG00000002286	Msi1	100	82.320	ENSPNAG00000019337	msi1	100	82.320	Pygocentrus_nattereri
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	99.357	ENSRNOG00000001156	Msi1	100	99.357	Rattus_norvegicus
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ENSMOCG00000002286	Msi1	98	95.522	ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.394	Rhinopithecus_roxellana
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	99.708	ENSSBOG00000030259	MSI1	98	99.708	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	86.928	ENSSHAG00000006834	MSI1	100	86.928	Sarcophilus_harrisii
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ENSMOCG00000002286	Msi1	98	84.150	ENSSFOG00015005350	MSI1	96	87.719	Scleropages_formosus
ENSMOCG00000002286	Msi1	98	81.459	ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.459	Scophthalmus_maximus
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	85.455	ENSSMAG00000009156	-	71	85.455	Scophthalmus_maximus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.978	ENSSDUG00000001027	MSI1	100	83.978	Seriola_dumerili
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ENSMOCG00000002286	Msi1	94	75.684	ENSTRUG00000015636	-	88	72.156	Takifugu_rubripes
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ENSMOCG00000002286	Msi1	68	92.237	ENSUAMG00000015514	MSI1	94	92.237	Ursus_americanus
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ENSMOCG00000002286	Msi1	100	90.934	ENSXETG00000012216	msi1	100	90.984	Xenopus_tropicalis
ENSMOCG00000002286	Msi1	94	72.886	ENSXCOG00000017605	MSI1	89	72.886	Xiphophorus_couchianus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.978	ENSXMAG00000027103	MSI1	100	73.713	Xiphophorus_maculatus
ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.242	ENSXMAG00000018237	-	100	83.242	Xiphophorus_maculatus