EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMOCG00000006857 (Gene tree)
Gene ID: 101995499
Gene Symbol: Papolg
Alias: 9630006B20Rik
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Microtus_ochrogaster
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 29784 bases
Position: chrJH996452.1:5274518-5304301
Accession: 101995499
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMOCP00000007102	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1e-27	1	2
ENSMOCP00000007102	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMOCT00000008883	-	3738	XM_005367739	ENSMOCP00000007102	739 (aa)	XP_005367796	UPI00038BE0D7

Gene Model

Click here to download ENSMOCG00000006857's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMOCG00000006857's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	61.361	ENSMOCG00000021670	Papola	99	60.512

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.514	ENSG00000115421	PAPOLG	100	99.145	Homo_sapiens
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	72.437	ENSAPOG00000004798	papolg	99	70.811	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	93.360	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	93.496	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	69.946	ENSACIG00000010546	papolg	99	70.310	Amphilophus_citrinellus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	72.570	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.836	Amphiprion_ocellaris
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	72.703	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.969	Amphiprion_percula
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	72.400	ENSATEG00000009007	papolg	79	86.573	Anabas_testudineus
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	72.933	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.533	Anas_platyrhynchos
ENSMOCG00000006857	Papolg	81	64.086	ENSACAG00000015048	-	100	64.086	Anolis_carolinensis
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.514	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	93.514	Aotus_nancymaae
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	69.131	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.039	Astatotilapia_calliptera
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	73.775	ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.775	Astyanax_mexicanus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.522	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	93.522	Bos_taurus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.649	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	93.649	Callithrix_jacchus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.117	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	84.352	Canis_familiaris
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	91.700	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	92.637	Canis_lupus_dingo
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.252	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	93.252	Capra_hircus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	94.602	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	94.602	Carlito_syrichta
ENSMOCG00000006857	Papolg	51	91.579	ENSCAPG00000014901	-	99	91.579	Cavia_aperea
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	94.595	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.595	Cavia_porcellus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.919	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	93.919	Cebus_capucinus
ENSMOCG00000006857	Papolg	91	97.835	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	97.835	Cercocebus_atys
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	94.467	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	94.467	Chinchilla_lanigera
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.919	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	93.919	Chlorocebus_sabaeus
ENSMOCG00000006857	Papolg	89	91.351	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	91.351	Choloepus_hoffmanni
ENSMOCG00000006857	Papolg	68	64.356	ENSCING00000024664	-	94	64.356	Ciona_intestinalis
ENSMOCG00000006857	Papolg	65	65.361	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	94.054	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	94.054	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	97.674	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	97.674	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	97.674	ENSCGRG00000005552	-	100	97.674	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.580	ENSCSEG00000000771	papolg	99	71.255	Cynoglossus_semilaevis
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	68.799	ENSCVAG00000016602	papolg	90	84.524	Cyprinodon_variegatus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	73.351	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.351	Danio_rerio
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	92.568	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	92.568	Dasypus_novemcinctus
ENSMOCG00000006857	Papolg	58	99.065	ENSDORG00000016228	Papolg	99	99.065	Dipodomys_ordii
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	73.306	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.243	Echinops_telfairi
ENSMOCG00000006857	Papolg	65	56.224	ENSEBUG00000005042	-	81	57.082	Eptatretus_burgeri
ENSMOCG00000006857	Papolg	60	71.540	ENSEBUG00000004020	papolg	90	71.540	Eptatretus_burgeri
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.657	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	93.792	Equus_asinus_asinus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.657	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	93.360	Equus_caballus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	81.757	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	81.757	Erinaceus_europaeus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	72.443	ENSELUG00000014497	papolg	99	65.186	Esox_lucius
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.522	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	93.522	Felis_catus
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	65.741	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.741	Ficedula_albicollis
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	94.332	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	94.332	Fukomys_damarensis
ENSMOCG00000006857	Papolg	66	62.620	ENSFHEG00000019080	papolg	90	63.529	Fundulus_heteroclitus
ENSMOCG00000006857	Papolg	82	83.514	ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.514	Gadus_morhua
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.667	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	70.400	Gallus_gallus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	69.060	ENSGAFG00000003263	papolg	89	70.503	Gambusia_affinis
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	72.414	ENSGACG00000002718	papolg	100	72.751	Gasterosteus_aculeatus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.919	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	93.919	Gorilla_gorilla
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	69.131	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.757	Haplochromis_burtoni
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	93.767	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	93.767	Heterocephalus_glaber_female
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	94.197	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	94.197	Heterocephalus_glaber_male
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.706	ENSHCOG00000006782	papolg	89	71.238	Hippocampus_comes
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	71.990	ENSIPUG00000021642	papolg	100	72.922	Ictalurus_punctatus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	95.142	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.142	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMOCG00000006857	Papolg	58	98.832	ENSJJAG00000015601	Papolg	99	98.832	Jaculus_jaculus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.784	ENSKMAG00000016439	papolg	97	69.292	Kryptolebias_marmoratus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	68.025	ENSLBEG00000023218	papolg	89	68.462	Labrus_bergylta
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	70.133	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.133	Latimeria_chalumnae
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	73.001	ENSLOCG00000016130	papolg	100	73.001	Lepisosteus_oculatus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	92.857	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	97.664	Loxodonta_africana
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	94.054	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	94.189	Macaca_fascicularis
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	94.054	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	94.189	Macaca_mulatta
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	85.101	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	85.235	Macaca_nemestrina
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.514	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	93.649	Mandrillus_leucophaeus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	71.713	ENSMAMG00000010667	papolg	99	70.135	Mastacembelus_armatus
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	70.259	ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.099	Maylandia_zebra
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.895	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.628	Meleagris_gallopavo
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	98.085	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	98.085	Mesocricetus_auratus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	94.467	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	94.467	Microcebus_murinus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	71.448	ENSMMOG00000008020	papolg	99	71.713	Mola_mola
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	86.193	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	86.193	Monodelphis_domestica
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	71.713	ENSMALG00000007012	papolg	89	71.846	Monopterus_albus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	96.752	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	100	99.534	Mus_caroli
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	97.158	ENSMUSG00000020273	Papolg	100	99.534	Mus_musculus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	96.346	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	96.346	Mus_pahari
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	97.023	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	100	99.534	Mus_spretus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.252	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	93.387	Mustela_putorius_furo
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	92.266	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	92.266	Myotis_lucifugus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	95.535	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	95.535	Nannospalax_galili
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	62.732	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.408	Neolamprologus_brichardi
ENSMOCG00000006857	Papolg	58	98.598	ENSNLEG00000009507	-	99	98.598	Nomascus_leucogenys
ENSMOCG00000006857	Papolg	81	77.397	ENSMEUG00000013605	-	88	77.397	Notamacropus_eugenii
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.927	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	93.927	Ochotona_princeps
ENSMOCG00000006857	Papolg	58	94.824	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	94.824	Octodon_degus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	65.194	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.730	Oreochromis_niloticus
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	84.584	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	84.584	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	95.142	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	95.142	Oryctolagus_cuniculus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.277	ENSORLG00000001577	papolg	89	70.728	Oryzias_latipes
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.784	ENSORLG00020002482	papolg	89	71.049	Oryzias_latipes_hni
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.277	ENSORLG00015008836	papolg	89	70.728	Oryzias_latipes_hsok
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.439	ENSOMEG00000001406	papolg	89	70.331	Oryzias_melastigma
ENSMOCG00000006857	Papolg	58	86.512	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	86.512	Otolemur_garnettii
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.252	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	93.252	Ovis_aries
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.514	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	93.514	Pan_paniscus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.522	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	93.522	Panthera_pardus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.387	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	93.387	Panthera_tigris_altaica
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.514	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	93.514	Pan_troglodytes
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	89.623	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	89.757	Papio_anubis
ENSMOCG00000006857	Papolg	91	72.093	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	72.093	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	72.133	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.133	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	78.197	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.197	Pelodiscus_sinensis
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	97.674	ENSPEMG00000008960	-	100	97.674	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMOCG00000006857	Papolg	66	63.599	ENSPMAG00000004864	-	96	63.599	Petromyzon_marinus
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	53.627	ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.872	Petromyzon_marinus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	87.183	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.183	Phascolarctos_cinereus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	69.514	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.565	Poecilia_formosa
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	69.605	ENSPLAG00000018445	papolg	89	69.868	Poecilia_latipinna
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	69.160	ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.764	Poecilia_mexicana
ENSMOCG00000006857	Papolg	78	81.185	ENSPREG00000010358	papolg	89	69.372	Poecilia_reticulata
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.514	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.514	Pongo_abelii
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	80.952	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	80.952	Procavia_capensis
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	82.861	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	82.861	Propithecus_coquereli
ENSMOCG00000006857	Papolg	88	93.190	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	93.190	Pteropus_vampyrus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.946	ENSPNYG00000006729	papolg	99	70.676	Pundamilia_nyererei
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	73.190	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.190	Pygocentrus_nattereri
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	96.211	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	96.211	Rattus_norvegicus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	88.108	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	88.108	Rhinopithecus_bieti
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	94.054	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	94.054	Rhinopithecus_roxellana
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.378	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	93.514	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMOCG00000006857	Papolg	94	86.809	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	86.809	Sarcophilus_harrisii
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	64.372	ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.372	Scleropages_formosus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.066	ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.066	Scleropages_formosus
ENSMOCG00000006857	Papolg	78	81.282	ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.147	Scophthalmus_maximus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	71.812	ENSSDUG00000000912	papolg	99	70.872	Seriola_dumerili
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	72.170	ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.862	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	78.133	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	78.133	Sphenodon_punctatus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.405	ENSSPAG00000009004	papolg	99	70.135	Stegastes_partitus
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.387	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	93.387	Sus_scrofa
ENSMOCG00000006857	Papolg	73	76.340	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	76.340	Taeniopygia_guttata
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	71.024	ENSTRUG00000006410	papolg	99	71.024	Takifugu_rubripes
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	66.229	ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.229	Tetraodon_nigroviridis
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	85.714	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	85.714	Tupaia_belangeri
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	88.529	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	88.664	Tursiops_truncatus
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	93.452	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	93.588	Ursus_americanus
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	93.452	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	93.588	Ursus_maritimus
ENSMOCG00000006857	Papolg	99	89.524	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	89.660	Vicugna_pacos
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.522	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	93.657	Vulpes_vulpes
ENSMOCG00000006857	Papolg	100	74.138	ENSXETG00000002208	papolg	100	74.138	Xenopus_tropicalis
ENSMOCG00000006857	Papolg	67	85.371	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.371	Xiphophorus_couchianus
ENSMOCG00000006857	Papolg	74	82.800	ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.800	Xiphophorus_maculatus