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Description

Ensembl ID: ENSMOCG00000009301 (Gene tree)
Gene ID: 101988149
Gene Symbol: Tnpo1
Alias: D13Ertd688e|Kpnb2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Microtus_ochrogaster
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 53598 bases
Position: chr19:1456765-1510362
Accession: 101988149
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMOCP00000009195	IBN_N	PF03810.19	5.5e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMOCT00000011972	-	8423	XM_005356431	ENSMOCP00000009195	900 (aa)	XP_005356488	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	85.569	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	99	85.569

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.663	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.708	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	98.675	ENSAMEG00000007147	TNPO1	100	98.675	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	86	93.023	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.023	Amphilophus_citrinellus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.820	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.820	Amphiprion_ocellaris
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.820	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	Amphiprion_percula
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.371	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.371	Anabas_testudineus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	98	92.446	ENSAPLG00000009619	-	97	93.448	Anas_platyrhynchos
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	96.629	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	Anolis_carolinensis
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	64.088	ENSANAG00000027118	-	99	63.867	Aotus_nancymaae
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	88.466	ENSANAG00000025351	-	99	88.466	Aotus_nancymaae
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.105	ENSANAG00000022453	-	99	99.105	Aotus_nancymaae
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	91.685	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	Astatotilapia_calliptera
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.601	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.265	Astyanax_mexicanus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.329	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	98.886	Bos_taurus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.217	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	99.217	Callithrix_jacchus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	95	99.417	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	Canis_familiaris
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	96.517	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.517	Canis_lupus_dingo
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.217	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	99.217	Capra_hircus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	98	95.367	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.895	Carlito_syrichta
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.213	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.213	Cebus_capucinus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.663	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.663	Cercocebus_atys
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.213	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.213	Chinchilla_lanigera
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.441	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	99.441	Chlorocebus_sabaeus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	94	86.595	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	86.595	Choloepus_hoffmanni
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	97.643	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	Chrysemys_picta_bellii
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	98	75.758	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.421	Ciona_savignyi
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.553	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	99.553	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.888	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	99.888	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	95	100.000	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.247	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	Cynoglossus_semilaevis
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.146	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	Cyprinodon_variegatus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.705	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.368	Danio_rerio
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.415	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.415	Dasypus_novemcinctus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	92	99.398	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.397	Dipodomys_ordii
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	98	57.675	FBgn0035693	CG8219	99	57.336	Drosophila_melanogaster
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	86	99.251	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.251	Echinops_telfairi
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	93	85.119	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	Eptatretus_burgeri
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.663	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.663	Equus_asinus_asinus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	98.997	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	98.997	Equus_caballus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	86.710	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.275	Esox_lucius
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.663	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.663	Felis_catus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	97.303	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	Ficedula_albicollis
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	98.885	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	98.885	Fukomys_damarensis
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.490	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	Fundulus_heteroclitus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	89.978	ENSGMOG00000000347	tnpo1	100	89.978	Gadus_morhua
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	96.629	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	Gallus_gallus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.265	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.265	Gambusia_affinis
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.729	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.729	Gasterosteus_aculeatus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	97.416	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	Gopherus_agassizii
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	82.905	ENSGGOG00000022535	-	99	82.905	Gorilla_gorilla
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.663	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.663	Gorilla_gorilla
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.258	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.258	Haplochromis_burtoni
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	98.554	ENSHGLG00000000970	-	99	98.554	Heterocephalus_glaber_female
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	95	98.832	ENSHGLG00100017090	-	99	98.832	Heterocephalus_glaber_male
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	75.139	ENSHGLG00100000963	-	99	74.582	Heterocephalus_glaber_male
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	100	99.444	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	98	99.444	Jaculus_jaculus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.483	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	Kryptolebias_marmoratus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	90	90.136	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	Labrus_bergylta
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	95	89.419	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.419	Latimeria_chalumnae
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	95.196	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	95.196	Lepisosteus_oculatus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	96	98.845	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	Loxodonta_africana
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.553	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	99.553	Macaca_fascicularis
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.552	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	99.552	Macaca_mulatta
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.553	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	99.553	Macaca_nemestrina
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.553	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	99.553	Mandrillus_leucophaeus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.371	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.371	Mastacembelus_armatus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.034	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	Maylandia_zebra
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.555	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	95.521	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	Microcebus_murinus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	86	92.526	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	Mola_mola
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	97.660	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	Monodelphis_domestica
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.247	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.247	Monopterus_albus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.775	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	100.000	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.776	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.664	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.441	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	99.441	Mustela_putorius_furo
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	95	98.952	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	Myotis_lucifugus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.776	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	99.776	Nannospalax_galili
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	86	92.894	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.894	Neolamprologus_brichardi
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.663	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.663	Nomascus_leucogenys
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	90	92.570	ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	92.570	Ochotona_princeps
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	98.554	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	98.554	Octodon_degus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	91.814	ENSONIG00000011151	tnpo1	100	91.814	Oreochromis_niloticus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	91	97.805	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	95	92.874	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	Oryctolagus_cuniculus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	86	92.607	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.607	Oryzias_latipes
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.897	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	Oryzias_latipes_hni
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.010	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.010	Oryzias_latipes_hsok
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.897	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.897	Oryzias_melastigma
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.441	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	99.441	Otolemur_garnettii
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	98.997	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	98.997	Ovis_aries
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.553	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	99.553	Pan_paniscus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.663	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.663	Panthera_pardus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.663	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.663	Panthera_tigris_altaica
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	93	86.602	ENSPTRG00000047731	-	100	86.602	Pan_troglodytes
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.553	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	99.553	Pan_troglodytes
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.553	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	99.553	Papio_anubis
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	90.562	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	96.983	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	96.983	Pelodiscus_sinensis
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	90.348	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	95	100.000	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	97.978	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.978	Phascolarctos_cinereus
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.057	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.057	Poecilia_formosa
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ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.441	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	99.441	Propithecus_coquereli
ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	98.885	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	98.885	Pteropus_vampyrus
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ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.265	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.713	Pygocentrus_nattereri
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