EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMOCG00000014240 (Gene tree)
Gene ID: 102002170
Gene Symbol: Skiv2l
Alias: 4930534J06Rik|Ski2w
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Microtus_ochrogaster
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11147 bases
Position: chrJH996517.1:1366373-1377519
Accession: 102002170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMOCP00000014869	rRNA_proc-arch	PF13234.6	6.7e-41	1	1
ENSMOCP00000014869	DEAD	PF00270.29	1.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMOCT00000018632	-	3687	XM_013355020	ENSMOCP00000014869	1228 (aa)	XP_013210474	-

Gene Model

Click here to download ENSMOCG00000014240's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMOCG00000014240's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	76	36.108	ENSMOCG00000019886	Mtrex	88	36.004

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.820	ENSG00000204351	SKIV2L	98	95.506	Homo_sapiens
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.857	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	60.257	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	92.170	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	91.820	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	58.828	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	58.999	Amphilophus_citrinellus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.539	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	59.775	Amphiprion_ocellaris
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.698	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	59.952	Amphiprion_percula
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.649	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	59.775	Anabas_testudineus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	64.286	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	64.490	Anolis_carolinensis
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	92.221	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	92.141	Aotus_nancymaae
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.524	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	60.514	Astatotilapia_calliptera
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	58.466	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	58.527	Astyanax_mexicanus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	92.061	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	91.901	Bos_taurus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	96	38.624	WBGene00008502	skih-2	99	38.605	Caenorhabditis_elegans
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	92.382	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	92.302	Callithrix_jacchus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.820	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	91.740	Canis_familiaris
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.740	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	91.660	Canis_lupus_dingo
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	92.141	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	91.981	Capra_hircus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.179	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	91.099	Carlito_syrichta
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	90.756	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	90.354	Cavia_porcellus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	92.061	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	91.981	Cebus_capucinus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.740	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	91.500	Cercocebus_atys
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.259	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	91.179	Chinchilla_lanigera
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.901	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	91.660	Chlorocebus_sabaeus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	87	63.953	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	96	64.327	Chrysemys_picta_bellii
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	93	50.254	ENSCING00000005576	-	99	50.425	Ciona_intestinalis
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	92.095	ENSCANG00000039709	SKIV2L	98	91.850	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	95.096	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	95.096	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.840	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	59.887	Cynoglossus_semilaevis
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.352	ENSCVAG00000003072	skiv2l	96	64.615	Cyprinodon_variegatus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.209	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	59.247	Danio_rerio
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	93	91.410	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	85.657	Dasypus_novemcinctus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	93	42.689	FBgn0039117	tst	97	42.821	Drosophila_melanogaster
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	69	90.886	ENSETEG00000009522	SKIV2L	69	90.886	Echinops_telfairi
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	89	55.448	ENSEBUG00000013680	-	97	54.986	Eptatretus_burgeri
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	93	93.115	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	93.029	Equus_asinus_asinus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	95	91.688	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	92.210	Equus_caballus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	52	97.628	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	56	97.628	Erinaceus_europaeus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.192	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	64.566	Esox_lucius
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	92.741	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	92.382	Felis_catus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	89.094	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	88.933	Fukomys_damarensis
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.952	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.209	Fundulus_heteroclitus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	57.853	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	57.839	Gadus_morhua
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	79	59.858	ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	59.959	Gallus_gallus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.143	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	60.289	Gambusia_affinis
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.303	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	59.645	Gasterosteus_aculeatus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.580	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	91.500	Gorilla_gorilla
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.286	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	60.273	Haplochromis_burtoni
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	89.031	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	89.111	Heterocephalus_glaber_female
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	86.950	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	86.789	Heterocephalus_glaber_male
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	58.354	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	58.517	Hippocampus_comes
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	58.656	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	58.729	Ictalurus_punctatus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	92.783	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	92.622	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	57	58.753	ENSLACG00000002986	-	59	59.698	Latimeria_chalumnae
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.179	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	91.018	Loxodonta_africana
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	92.061	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	91.820	Macaca_fascicularis
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.981	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	91.740	Macaca_mulatta
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.981	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	91.740	Macaca_nemestrina
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.740	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	91.500	Mandrillus_leucophaeus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.048	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	59.984	Mastacembelus_armatus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.207	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	60.193	Maylandia_zebra
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	70	51.153	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	51.153	Meleagris_gallopavo
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	94.137	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	93.976	Mesocricetus_auratus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	91.932	ENSMICG00000046331	SKIV2L	98	91.850	Microcebus_murinus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.048	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	60.195	Mola_mola
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	86.240	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	86.320	Monodelphis_domestica
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	58.629	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	58.680	Monopterus_albus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	93.810	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	93.810	Mus_caroli
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	93.810	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	93.810	Mus_musculus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	93.248	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	93.248	Mus_pahari
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	93.408	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	93.408	Mus_spretus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	92.170	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	91.820	Mustela_putorius_furo
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	90.858	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	90.698	Myotis_lucifugus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.505	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	59.935	Neolamprologus_brichardi
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	89.396	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	89.233	Nomascus_leucogenys
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	78	92.920	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	92.920	Notamacropus_eugenii
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.580	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	91.580	Ochotona_princeps
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	90.056	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	89.896	Octodon_degus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.942	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.152	Oreochromis_niloticus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	92.382	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	92.061	Oryctolagus_cuniculus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.270	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	60.385	Oryzias_latipes
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.190	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	60.305	Oryzias_latipes_hni
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.032	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	60.144	Oryzias_latipes_hsok
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.780	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	60.821	Oryzias_melastigma
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.901	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	91.740	Otolemur_garnettii
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	86.776	ENSOARG00000002411	-	100	86.620	Ovis_aries
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	91.005	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	99	90.924	Pan_paniscus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	92.741	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	92.382	Panthera_pardus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	92.414	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	92.061	Panthera_tigris_altaica
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.740	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	91.660	Pan_troglodytes
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	90.835	ENSPANG00000011501	SKIV2L	99	90.592	Papio_anubis
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	58.991	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	59.091	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	58.743	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	59.121	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	95.177	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	95.177	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	86.011	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	85.851	Phascolarctos_cinereus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.349	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	60.370	Poecilia_formosa
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.476	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	60.499	Poecilia_latipinna
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.270	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	60.289	Poecilia_mexicana
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	58.776	ENSPREG00000002277	skiv2l	96	64.463	Poecilia_reticulata
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.179	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	91.099	Pongo_abelii
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	77	92.105	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	92.105	Procavia_capensis
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	92.702	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	92.622	Propithecus_coquereli
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	90.297	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	89.976	Pteropus_vampyrus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	58.809	ENSPNYG00000017853	skiv2l	98	64.809	Pundamilia_nyererei
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	59.856	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	59.952	Pygocentrus_nattereri
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	94.453	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	94.453	Rattus_norvegicus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	89.393	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	89.150	Rhinopithecus_bieti
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.660	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	91.419	Rhinopithecus_roxellana
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	93	36.645	YLR398C	-	93	36.645	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	92.221	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	92.141	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	85.760	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	84.560	Sarcophilus_harrisii
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.685	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	59.936	Scleropages_formosus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.360	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	59.566	Scophthalmus_maximus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.349	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	60.611	Seriola_dumerili
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	58.280	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	58.924	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	61.634	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	61.295	Sphenodon_punctatus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	94	60.167	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.357	Stegastes_partitus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	93.103	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	92.863	Sus_scrofa
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	85	54.764	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	54.655	Takifugu_rubripes
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	58.486	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	58.819	Tetraodon_nigroviridis
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	94	91.299	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	91.299	Tupaia_belangeri
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	88.159	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	87.997	Tursiops_truncatus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	92.577	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	92.221	Ursus_americanus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	93	92.771	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	92.685	Ursus_maritimus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	92.170	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	98	92.088	Vulpes_vulpes
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	56.995	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	57.268	Xenopus_tropicalis
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.353	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	60.503	Xiphophorus_couchianus
ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.794	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	60.048	Xiphophorus_maculatus