EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMOCG00000017653 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Microtus_ochrogaster
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3359 bases
Position: chrLG3:23089966-23093324
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMOCP00000019760	GTP_EFTU	PF00009.27	1.2e-10	1	1
ENSMOCP00000019760	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.3e-09	1	1
ENSMOCP00000019760	EFG_IV	PF03764.18	2.2e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMOCT00000023573	-	2640	-	ENSMOCP00000019760	879 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSMOCG00000017653's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMOCG00000017653's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMOCG00000017653	-	61	37.280	ENSMOCG00000019641	-	71	37.280
ENSMOCG00000017653	-	74	33.430	ENSMOCG00000018569	-	80	33.430
ENSMOCG00000017653	-	71	37.406	ENSMOCG00000019369	-	76	37.406
ENSMOCG00000017653	-	90	82.135	ENSMOCG00000009039	-	92	82.135

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMOCG00000017653	-	90	82.159	ENSG00000108883	EFTUD2	100	94.340	Homo_sapiens
ENSMOCG00000017653	-	90	75.393	ENSAPOG00000002433	eftud2	92	75.281	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	92	81.685	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMOCG00000017653	-	90	76.817	ENSACIG00000009096	eftud2	91	76.701	Amphilophus_citrinellus
ENSMOCG00000017653	-	77	77.424	ENSAOCG00000023385	eftud2	87	77.424	Amphiprion_ocellaris
ENSMOCG00000017653	-	90	75.393	ENSAPEG00000003321	eftud2	92	75.281	Amphiprion_percula
ENSMOCG00000017653	-	90	75.955	ENSATEG00000000457	eftud2	92	75.843	Anabas_testudineus
ENSMOCG00000017653	-	89	77.165	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	91	77.165	Anas_platyrhynchos
ENSMOCG00000017653	-	90	79.888	ENSACAG00000007637	EFTUD2	92	79.888	Anolis_carolinensis
ENSMOCG00000017653	-	90	83.010	ENSANAG00000025320	EFTUD2	91	83.010	Aotus_nancymaae
ENSMOCG00000017653	-	90	75.506	ENSACLG00000001296	eftud2	92	75.393	Astatotilapia_calliptera
ENSMOCG00000017653	-	90	74.637	ENSAMXG00000000568	eftud2	92	74.749	Astyanax_mexicanus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.573	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	92	81.573	Bos_taurus
ENSMOCG00000017653	-	90	56.362	WBGene00001166	eftu-2	92	55.915	Caenorhabditis_elegans
ENSMOCG00000017653	-	90	83.200	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	91	83.200	Callithrix_jacchus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	92	81.685	Canis_familiaris
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	92	81.685	Canis_lupus_dingo
ENSMOCG00000017653	-	90	81.573	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	92	81.573	Capra_hircus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	92	81.798	Carlito_syrichta
ENSMOCG00000017653	-	90	81.236	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	92	81.236	Cavia_aperea
ENSMOCG00000017653	-	90	81.236	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	92	81.236	Cavia_porcellus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	92	81.798	Cebus_capucinus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	ENSCATG00000035809	EFTUD2	92	81.798	Cercocebus_atys
ENSMOCG00000017653	-	90	81.236	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	92	81.236	Chinchilla_lanigera
ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	92	81.798	Chlorocebus_sabaeus
ENSMOCG00000017653	-	84	70.729	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	93	70.729	Choloepus_hoffmanni
ENSMOCG00000017653	-	90	80.674	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	92	80.674	Chrysemys_picta_bellii
ENSMOCG00000017653	-	90	63.270	ENSCING00000009372	-	92	63.270	Ciona_intestinalis
ENSMOCG00000017653	-	90	63.385	ENSCSAVG00000004985	-	89	67.426	Ciona_savignyi
ENSMOCG00000017653	-	90	82.159	ENSCANG00000026557	EFTUD2	92	81.798	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMOCG00000017653	-	90	82.022	ENSCGRG00001009904	Eftud2	92	82.022	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMOCG00000017653	-	90	82.022	ENSCGRG00000003825	Eftud2	92	82.022	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMOCG00000017653	-	90	75.169	ENSCSEG00000016775	eftud2	92	75.056	Cynoglossus_semilaevis
ENSMOCG00000017653	-	90	75.730	ENSCVAG00000012537	eftud2	92	75.730	Cyprinodon_variegatus
ENSMOCG00000017653	-	90	74.523	ENSDARG00000012261	eftud2	100	71.157	Danio_rerio
ENSMOCG00000017653	-	90	81.573	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	92	81.573	Dasypus_novemcinctus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.910	ENSDORG00000011566	Eftud2	92	81.910	Dipodomys_ordii
ENSMOCG00000017653	-	90	60.582	FBgn0039566	CG4849	92	60.246	Drosophila_melanogaster
ENSMOCG00000017653	-	81	80.392	ENSETEG00000005678	EFTUD2	84	80.392	Echinops_telfairi
ENSMOCG00000017653	-	72	79.710	ENSEBUG00000004047	-	87	77.896	Eptatretus_burgeri
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSEASG00005010321	EFTUD2	92	81.685	Equus_asinus_asinus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSECAG00000019363	EFTUD2	85	81.685	Equus_caballus
ENSMOCG00000017653	-	68	63.821	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	78	63.821	Erinaceus_europaeus
ENSMOCG00000017653	-	90	74.719	ENSELUG00000017169	eftud2	92	74.719	Esox_lucius
ENSMOCG00000017653	-	90	81.573	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	92	81.573	Felis_catus
ENSMOCG00000017653	-	90	80.449	ENSFALG00000007551	EFTUD2	92	80.449	Ficedula_albicollis
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	92	81.685	Fukomys_damarensis
ENSMOCG00000017653	-	90	75.730	ENSFHEG00000013479	eftud2	92	75.730	Fundulus_heteroclitus
ENSMOCG00000017653	-	90	74.607	ENSGMOG00000014277	eftud2	92	75.506	Gadus_morhua
ENSMOCG00000017653	-	90	80.225	ENSGALG00000000988	EFTUD2	92	80.225	Gallus_gallus
ENSMOCG00000017653	-	90	75.618	ENSGAFG00000002263	eftud2	92	75.618	Gambusia_affinis
ENSMOCG00000017653	-	90	75.169	ENSGACG00000009163	eftud2	92	75.056	Gasterosteus_aculeatus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	92	81.798	Gorilla_gorilla
ENSMOCG00000017653	-	90	75.393	ENSHBUG00000023546	eftud2	93	75.281	Haplochromis_burtoni
ENSMOCG00000017653	-	90	81.573	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	92	81.573	Heterocephalus_glaber_female
ENSMOCG00000017653	-	90	81.573	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	92	81.573	Heterocephalus_glaber_male
ENSMOCG00000017653	-	90	74.382	ENSHCOG00000017689	eftud2	92	74.382	Hippocampus_comes
ENSMOCG00000017653	-	90	74.944	ENSIPUG00000023182	Eftud2	92	75.281	Ictalurus_punctatus
ENSMOCG00000017653	-	90	75.393	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	88	80.149	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMOCG00000017653	-	84	81.168	ENSJJAG00000018268	Eftud2	90	81.146	Jaculus_jaculus
ENSMOCG00000017653	-	90	75.169	ENSKMAG00000021027	eftud2	92	75.056	Kryptolebias_marmoratus
ENSMOCG00000017653	-	90	75.281	ENSLBEG00000005875	eftud2	95	75.169	Labrus_bergylta
ENSMOCG00000017653	-	90	77.865	ENSLACG00000012918	EFTUD2	92	78.451	Latimeria_chalumnae
ENSMOCG00000017653	-	90	75.618	ENSLOCG00000011460	eftud2	92	75.618	Lepisosteus_oculatus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	91	81.685	Loxodonta_africana
ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	92	81.798	Macaca_fascicularis
ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	92	81.798	Macaca_mulatta
ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	92	81.798	Macaca_nemestrina
ENSMOCG00000017653	-	90	82.159	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	92	81.798	Mandrillus_leucophaeus
ENSMOCG00000017653	-	90	75.730	ENSMAMG00000022190	eftud2	92	75.618	Mastacembelus_armatus
ENSMOCG00000017653	-	90	75.506	ENSMZEG00005022885	eftud2	92	75.393	Maylandia_zebra
ENSMOCG00000017653	-	90	80.269	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	91	80.269	Meleagris_gallopavo
ENSMOCG00000017653	-	90	82.022	ENSMAUG00000021178	Eftud2	92	82.022	Mesocricetus_auratus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	ENSMICG00000016592	EFTUD2	92	81.798	Microcebus_murinus
ENSMOCG00000017653	-	77	79.139	ENSMMOG00000020811	eftud2	87	79.139	Mola_mola
ENSMOCG00000017653	-	90	81.461	ENSMODG00000011347	EFTUD2	92	81.461	Monodelphis_domestica
ENSMOCG00000017653	-	77	77.389	ENSMALG00000014501	eftud2	87	77.389	Monopterus_albus
ENSMOCG00000017653	-	90	82.159	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	92	81.798	Mus_caroli
ENSMOCG00000017653	-	90	82.159	ENSMUSG00000020929	Eftud2	92	81.798	Mus_musculus
ENSMOCG00000017653	-	90	82.159	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	92	81.798	Mus_pahari
ENSMOCG00000017653	-	90	82.159	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	92	81.798	Mus_spretus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	85	81.798	Mustela_putorius_furo
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	91	81.685	Myotis_lucifugus
ENSMOCG00000017653	-	90	82.022	ENSNGAG00000017834	Eftud2	92	82.022	Nannospalax_galili
ENSMOCG00000017653	-	90	75.393	ENSNBRG00000020081	eftud2	92	75.281	Neolamprologus_brichardi
ENSMOCG00000017653	-	90	80.112	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	91	80.112	Nomascus_leucogenys
ENSMOCG00000017653	-	90	81.461	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	92	81.461	Notamacropus_eugenii
ENSMOCG00000017653	-	84	83.768	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	85	83.768	Ochotona_princeps
ENSMOCG00000017653	-	88	68.096	ENSODEG00000003385	-	94	64.028	Octodon_degus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.348	ENSODEG00000018041	-	92	81.348	Octodon_degus
ENSMOCG00000017653	-	90	75.506	ENSONIG00000000912	eftud2	92	75.393	Oreochromis_niloticus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.910	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	92	81.910	Oryctolagus_cuniculus
ENSMOCG00000017653	-	90	74.944	ENSORLG00000003109	eftud2	92	74.944	Oryzias_latipes
ENSMOCG00000017653	-	90	74.831	ENSORLG00020009865	eftud2	92	74.831	Oryzias_latipes_hni
ENSMOCG00000017653	-	90	74.831	ENSORLG00015002611	eftud2	91	75.957	Oryzias_latipes_hsok
ENSMOCG00000017653	-	90	80.834	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	92	80.834	Otolemur_garnettii
ENSMOCG00000017653	-	90	81.573	ENSOARG00000009078	EFTUD2	89	81.573	Ovis_aries
ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	92	81.798	Pan_paniscus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	92	81.685	Panthera_pardus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	92	81.685	Panthera_tigris_altaica
ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	92	81.798	Pan_troglodytes
ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	ENSPANG00000021284	EFTUD2	92	81.798	Papio_anubis
ENSMOCG00000017653	-	90	79.596	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	98	79.596	Pelodiscus_sinensis
ENSMOCG00000017653	-	90	72.066	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	65.237	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMOCG00000017653	-	90	82.022	ENSPEMG00000005129	Eftud2	92	82.022	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMOCG00000017653	-	90	81.461	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	92	81.461	Phascolarctos_cinereus
ENSMOCG00000017653	-	90	75.618	ENSPFOG00000008515	eftud2	92	75.618	Poecilia_formosa
ENSMOCG00000017653	-	90	75.618	ENSPLAG00000010393	eftud2	92	75.618	Poecilia_latipinna
ENSMOCG00000017653	-	90	75.618	ENSPMEG00000005087	eftud2	92	75.618	Poecilia_mexicana
ENSMOCG00000017653	-	90	83.200	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	91	83.200	Pongo_abelii
ENSMOCG00000017653	-	90	81.348	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	92	81.348	Procavia_capensis
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	92	81.685	Propithecus_coquereli
ENSMOCG00000017653	-	90	79.663	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	92	79.663	Pteropus_vampyrus
ENSMOCG00000017653	-	90	75.393	ENSPNYG00000012448	eftud2	92	75.281	Pundamilia_nyererei
ENSMOCG00000017653	-	90	75.056	ENSPNAG00000012490	eftud2	92	75.506	Pygocentrus_nattereri
ENSMOCG00000017653	-	90	81.124	ENSRNOG00000002818	Eftud2	92	80.674	Rattus_norvegicus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	92	81.685	Rhinopithecus_bieti
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSRROG00000042925	EFTUD2	92	81.685	Rhinopithecus_roxellana
ENSMOCG00000017653	-	72	30.100	YKL173W	SNU114	66	30.429	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMOCG00000017653	-	90	84.535	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	91	84.535	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMOCG00000017653	-	84	80.930	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	89	80.907	Sarcophilus_harrisii
ENSMOCG00000017653	-	90	74.831	ENSSFOG00015023272	eftud2	92	74.831	Scleropages_formosus
ENSMOCG00000017653	-	90	75.506	ENSSMAG00000010174	eftud2	92	75.393	Scophthalmus_maximus
ENSMOCG00000017653	-	90	75.618	ENSSDUG00000022675	eftud2	92	75.506	Seriola_dumerili
ENSMOCG00000017653	-	90	75.618	ENSSLDG00000001595	eftud2	92	75.506	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMOCG00000017653	-	90	74.266	ENSSARG00000008664	EFTUD2	92	74.266	Sorex_araneus
ENSMOCG00000017653	-	90	80.112	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	92	80.112	Sphenodon_punctatus
ENSMOCG00000017653	-	90	75.618	ENSSPAG00000016235	eftud2	91	75.506	Stegastes_partitus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.461	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	92	81.461	Sus_scrofa
ENSMOCG00000017653	-	81	81.242	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	81.219	Taeniopygia_guttata
ENSMOCG00000017653	-	90	74.719	ENSTRUG00000016422	eftud2	92	74.607	Takifugu_rubripes
ENSMOCG00000017653	-	90	74.516	ENSTNIG00000005346	eftud2	91	74.403	Tetraodon_nigroviridis
ENSMOCG00000017653	-	90	75.843	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	92	75.843	Tupaia_belangeri
ENSMOCG00000017653	-	90	72.697	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	92	72.697	Tursiops_truncatus
ENSMOCG00000017653	-	85	93.396	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	81	93.396	Ursus_americanus
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	92	81.685	Ursus_maritimus
ENSMOCG00000017653	-	79	73.858	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	81	73.858	Vicugna_pacos
ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	92	81.685	Vulpes_vulpes
ENSMOCG00000017653	-	86	76.986	ENSXETG00000003394	eftud2	89	78.017	Xenopus_tropicalis
ENSMOCG00000017653	-	77	79.408	ENSXCOG00000017309	eftud2	91	79.408	Xiphophorus_couchianus
ENSMOCG00000017653	-	90	75.618	ENSXMAG00000008494	eftud2	92	75.618	Xiphophorus_maculatus