EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMOCG00000017720 (Gene tree)
Gene ID: 101979151
Gene Symbol: Tyw1
Alias: Rsafd1
Full Name: S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase
Gene Type: protein_coding
Species: Microtus_ochrogaster
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 81651 bases
Position: chr2:27266597-27348247
Accession: 101979151
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMOCP00000019868	Wyosine_form	PF08608.12	5.8e-27	1	1
ENSMOCP00000019864	Wyosine_form	PF08608.12	5.8e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMOCT00000023679	-	2613	XM_005344675	ENSMOCP00000019864	725 (aa)	XP_005344732	UPI00038C0503
ENSMOCT00000023683	-	2163	-	ENSMOCP00000019868	720 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	80.218	ENSG00000198874	TYW1	100	80.491	Homo_sapiens
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	71.646	ENSG00000277149	TYW1B	100	71.646	Homo_sapiens
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	66.347	ENSAPOG00000014391	tyw1	97	66.758	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	64.771	ENSACIG00000007325	tyw1	99	63.836	Amphilophus_citrinellus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	64.411	ENSAOCG00000016792	tyw1	97	66.303	Amphiprion_ocellaris
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	64.276	ENSAPEG00000015939	tyw1	99	67.411	Amphiprion_percula
ENSMOCG00000017720	Tyw1	90	65.297	ENSATEG00000006856	tyw1	91	65.297	Anabas_testudineus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	78.990	ENSANAG00000037051	-	100	78.990	Aotus_nancymaae
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.022	ENSACLG00000018688	tyw1	96	64.641	Astatotilapia_calliptera
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	65.757	ENSAMXG00000004157	tyw1	100	65.041	Astyanax_mexicanus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	78.415	ENSBTAG00000008446	TYW1	100	78.279	Bos_taurus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	78.445	ENSCJAG00000004295	-	100	78.718	Callithrix_jacchus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	77.279	ENSCAFG00000010867	-	100	76.871	Canis_familiaris
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	70.083	ENSCAFG00020005367	-	98	71.930	Canis_lupus_dingo
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	79.372	ENSCHIG00000019510	-	100	79.235	Capra_hircus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	90	80.670	ENSTSYG00000008236	-	96	83.239	Carlito_syrichta
ENSMOCG00000017720	Tyw1	87	73.259	ENSCAPG00000013569	-	100	72.468	Cavia_aperea
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	76.216	ENSCPOG00000011182	-	100	75.237	Cavia_porcellus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	79.400	ENSCCAG00000026643	-	100	79.673	Cebus_capucinus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	80.082	ENSCATG00000043677	-	100	80.355	Cercocebus_atys
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	76.526	ENSCLAG00000006321	-	100	76.798	Chinchilla_lanigera
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	69.273	ENSCSAG00000018274	-	100	69.547	Chlorocebus_sabaeus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	68	92.735	ENSCHOG00000003801	-	75	92.735	Choloepus_hoffmanni
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	70.636	ENSCPBG00000014896	-	97	75.596	Chrysemys_picta_bellii
ENSMOCG00000017720	Tyw1	81	59.661	ENSCING00000004125	-	97	59.661	Ciona_intestinalis
ENSMOCG00000017720	Tyw1	90	54.479	ENSCSAVG00000005712	-	100	55.015	Ciona_savignyi
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	80.218	ENSCANG00000033209	-	100	80.491	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	70	94.444	ENSCGRG00001003679	Tyw1	87	94.651	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.667	ENSCSEG00000005810	tyw1	94	66.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSMOCG00000017720	Tyw1	88	64.188	ENSCVAG00000001054	tyw1	91	65.432	Cyprinodon_variegatus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	64.960	ENSDARG00000062987	tyw1	96	66.349	Danio_rerio
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	79.781	ENSDNOG00000024165	-	100	79.508	Dasypus_novemcinctus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	67.590	ENSDORG00000014772	Tyw1	99	67.036	Dipodomys_ordii
ENSMOCG00000017720	Tyw1	50	54.795	ENSETEG00000009904	-	80	54.875	Echinops_telfairi
ENSMOCG00000017720	Tyw1	60	71.296	ENSEBUG00000004494	tyw1	92	71.296	Eptatretus_burgeri
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	78.825	ENSEASG00005008818	-	100	78.962	Equus_asinus_asinus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	73.177	ENSECAG00000023164	-	100	73.315	Equus_caballus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	61	88.542	ENSEEUG00000005950	-	62	88.542	Erinaceus_europaeus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	65.531	ENSELUG00000008449	tyw1	81	83.285	Esox_lucius
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	77.551	ENSFCAG00000014262	-	100	77.007	Felis_catus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	66.530	ENSFALG00000013810	-	100	65.663	Ficedula_albicollis
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	77.186	ENSFDAG00000013270	-	99	77.186	Fukomys_damarensis
ENSMOCG00000017720	Tyw1	84	66.083	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	66.775	Fundulus_heteroclitus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	67.385	ENSGALG00000001110	-	99	68.937	Gallus_gallus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	66.120	ENSGACG00000012692	tyw1	100	64.054	Gasterosteus_aculeatus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	69.919	ENSGAGG00000022393	-	100	69.553	Gopherus_agassizii
ENSMOCG00000017720	Tyw1	90	72.061	ENSGGOG00000001473	TYW1	100	72.366	Gorilla_gorilla
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	65.884	ENSHBUG00000002640	tyw1	96	64.503	Haplochromis_burtoni
ENSMOCG00000017720	Tyw1	88	75.195	ENSHGLG00000012093	-	100	75.195	Heterocephalus_glaber_female
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	77.596	ENSHGLG00100011743	TYW1	100	77.732	Heterocephalus_glaber_male
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	61.592	ENSHCOG00000019949	tyw1	96	60.894	Hippocampus_comes
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	65.583	ENSIPUG00000016330	tyw1	97	65.531	Ictalurus_punctatus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	77.869	ENSSTOG00000004067	-	92	78.279	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	81.456	ENSJJAG00000022959	Tyw1	100	82.143	Jaculus_jaculus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	64.939	ENSKMAG00000018599	tyw1	96	66.022	Kryptolebias_marmoratus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	65.800	ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.800	Latimeria_chalumnae
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	67.082	ENSLOCG00000004035	tyw1	96	65.934	Lepisosteus_oculatus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	80.082	ENSMFAG00000035457	-	100	80.355	Macaca_fascicularis
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	80.082	ENSMMUG00000030374	-	100	80.355	Macaca_mulatta
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	80.355	ENSMNEG00000041992	-	100	80.628	Macaca_nemestrina
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	80.082	ENSMLEG00000039741	-	100	80.355	Mandrillus_leucophaeus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.528	ENSMAMG00000016089	tyw1	97	63.254	Mastacembelus_armatus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	91	69.520	ENSMZEG00005024386	tyw1	97	68.657	Maylandia_zebra
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	69.116	ENSMGAG00000002176	-	99	69.116	Meleagris_gallopavo
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	92.414	ENSMAUG00000002959	Tyw1	100	92.552	Mesocricetus_auratus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	80.055	ENSMICG00000014374	-	97	82.955	Microcebus_murinus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	61.765	ENSMMOG00000005064	tyw1	97	61.657	Mola_mola
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	70.245	ENSMODG00000025697	-	100	70.811	Monodelphis_domestica
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.851	ENSMALG00000010238	tyw1	96	66.851	Monopterus_albus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	87.950	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	99	87.673	Mus_caroli
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	87.812	ENSMUSG00000056310	Tyw1	99	87.535	Mus_musculus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	86.704	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	99	86.288	Mus_pahari
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	87.950	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	99	87.673	Mus_spretus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	95	78.437	ENSMPUG00000016191	-	99	78.739	Mustela_putorius_furo
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	75.305	ENSMLUG00000013582	-	100	75.305	Myotis_lucifugus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	81.466	ENSNGAG00000002742	Tyw1	99	81.328	Nannospalax_galili
ENSMOCG00000017720	Tyw1	96	65.997	ENSNBRG00000016996	tyw1	95	68.018	Neolamprologus_brichardi
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	78.990	ENSNLEG00000013210	-	99	79.127	Nomascus_leucogenys
ENSMOCG00000017720	Tyw1	92	63.024	ENSOPRG00000008734	-	88	63.024	Ochotona_princeps
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	70.914	ENSODEG00000014729	-	99	71.290	Octodon_degus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.713	ENSONIG00000005872	tyw1	96	65.603	Oreochromis_niloticus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	78.415	ENSOCUG00000003173	-	100	77.732	Oryctolagus_cuniculus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.713	ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.306	Oryzias_latipes
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.992	ENSORLG00020019361	tyw1	98	64.286	Oryzias_latipes_hni
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.944	ENSORLG00015008095	tyw1	95	65.331	Oryzias_latipes_hsok
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	78.670	ENSOGAG00000016555	-	98	78.393	Otolemur_garnettii
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	78.697	ENSOARG00000010673	-	100	78.562	Ovis_aries
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	77.945	ENSPPRG00000004945	-	100	77.397	Panthera_pardus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	78.082	ENSPTIG00000019545	-	100	77.534	Panthera_tigris_altaica
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	74.255	ENSPTRG00000023076	TYW1B	99	74.390	Pan_troglodytes
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	80.082	ENSPANG00000019053	-	100	80.355	Papio_anubis
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	65.702	ENSPKIG00000006545	tyw1	96	65.702	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMOCG00000017720	Tyw1	96	65.205	ENSPMGG00000004240	tyw1	95	67.213	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	91.010	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	91.148	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	66.439	ENSPFOG00000015855	tyw1	99	65.946	Poecilia_formosa
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	65.900	ENSPLAG00000000838	tyw1	89	81.152	Poecilia_latipinna
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	65.541	ENSPMEG00000019437	tyw1	100	64.476	Poecilia_mexicana
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	64.393	ENSPREG00000018773	tyw1	98	64.393	Poecilia_reticulata
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	80.491	ENSPPYG00000017514	TYW1	100	80.764	Pongo_abelii
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	63.574	ENSPCOG00000015294	-	93	70.980	Propithecus_coquereli
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.022	ENSPNYG00000022381	tyw1	96	64.641	Pundamilia_nyererei
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.019	ENSPNAG00000009001	tyw1	98	66.990	Pygocentrus_nattereri
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	89.241	ENSRNOG00000024352	Tyw1	100	89.517	Rattus_norvegicus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	80.218	ENSRBIG00000039619	-	100	80.491	Rhinopithecus_bieti
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ENSMOCG00000017720	Tyw1	92	40.909	YPL207W	-	75	40.410	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	78.718	ENSSBOG00000025873	-	100	78.718	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	65.928	ENSSMAG00000020514	tyw1	96	65.110	Scophthalmus_maximus
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ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	69.357	ENSSPUG00000002715	-	99	69.083	Sphenodon_punctatus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	79.424	ENSSSCG00000007733	-	99	79.287	Sus_scrofa
ENSMOCG00000017720	Tyw1	90	67.873	ENSTGUG00000003428	-	99	67.421	Taeniopygia_guttata
ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.017	ENSTRUG00000016107	tyw1	93	66.017	Takifugu_rubripes
ENSMOCG00000017720	Tyw1	90	69.910	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.910	Tetraodon_nigroviridis
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	77.959	ENSUMAG00000015343	-	100	77.415	Ursus_maritimus
ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	76.735	ENSVVUG00000016457	-	100	76.327	Vulpes_vulpes
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	69.755	ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.486	Xenopus_tropicalis
ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	64.883	ENSXMAG00000013125	tyw1	98	67.428	Xiphophorus_maculatus