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Description

Ensembl ID: ENSMOCG00000017816 (Gene tree)
Gene ID: 101981333
Gene Symbol: Gzf1
Alias: 8430437G08Rik|Zfp336
Full Name: GDNF inducible zinc finger protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Microtus_ochrogaster
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8935 bases
Position: chrJH996433.1:303578-312512
Accession: 101981333
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMOCP00000020016	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-31	1	5
ENSMOCP00000020016	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-31	2	5
ENSMOCP00000020016	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-31	3	5
ENSMOCP00000020016	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-31	4	5
ENSMOCP00000020016	zf-C2H2	PF00096.26	2.5e-31	5	5
ENSMOCP00000020016	zf-met	PF12874.7	4.7e-12	1	2
ENSMOCP00000020016	zf-met	PF12874.7	4.7e-12	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMOCT00000023832	-	3260	XM_013353206	ENSMOCP00000020016	705 (aa)	XP_013208660	UPI00038C2E86

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMOCG00000017816	Gzf1	52	35.435	ENSMOCG00000021124	Repin1	83	35.230
ENSMOCG00000017816	Gzf1	51	37.979	ENSMOCG00000014774	Zfp961	76	37.979
ENSMOCG00000017816	Gzf1	85	43.564	ENSMOCG00000000286	Zbtb24	74	43.564
ENSMOCG00000017816	Gzf1	66	42.667	ENSMOCG00000015696	Mynn	84	46.774
ENSMOCG00000017816	Gzf1	50	37.942	ENSMOCG00000006946	Zfp53	68	39.773
ENSMOCG00000017816	Gzf1	58	37.719	ENSMOCG00000001402	Zbtb16	61	39.706
ENSMOCG00000017816	Gzf1	56	45.872	ENSMOCG00000010611	Zbtb14	58	45.872
ENSMOCG00000017816	Gzf1	51	38.924	ENSMOCG00000007851	-	69	39.527
ENSMOCG00000017816	Gzf1	60	36.842	ENSMOCG00000022719	Zfp651	51	37.500
ENSMOCG00000017816	Gzf1	83	43.299	ENSMOCG00000020948	Zbtb49	75	43.299
ENSMOCG00000017816	Gzf1	83	36.667	ENSMOCG00000014488	Patz1	92	30.457
ENSMOCG00000017816	Gzf1	62	44.361	ENSMOCG00000019797	Bcl6b	91	44.361

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	79.102	ENSG00000125812	GZF1	100	89.583	Homo_sapiens
ENSMOCG00000017816	Gzf1	84	48.105	ENSAPOG00000012930	GZF1	94	47.947	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	73.501	ENSAMEG00000009853	GZF1	100	74.198	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMOCG00000017816	Gzf1	87	45.925	ENSACIG00000004753	-	74	45.768	Amphilophus_citrinellus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	83	47.611	ENSAOCG00000024275	GZF1	93	48.270	Amphiprion_ocellaris
ENSMOCG00000017816	Gzf1	86	44.923	ENSAPEG00000017195	GZF1	73	45.710	Amphiprion_percula
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	37.653	ENSATEG00000018374	GZF1	88	75.956	Anabas_testudineus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	77.809	ENSANAG00000028240	GZF1	100	78.230	Aotus_nancymaae
ENSMOCG00000017816	Gzf1	87	47.512	ENSACLG00000025866	GZF1	72	47.512	Astatotilapia_calliptera
ENSMOCG00000017816	Gzf1	87	46.372	ENSAMXG00000017178	GZF1	86	46.463	Astyanax_mexicanus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	77.809	ENSCJAG00000000733	GZF1	100	78.230	Callithrix_jacchus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	77.324	ENSCAFG00000005142	GZF1	100	77.324	Canis_familiaris
ENSMOCG00000017816	Gzf1	59	81.364	ENSCAFG00020027463	-	100	81.364	Canis_lupus_dingo
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	74.860	ENSTSYG00000028054	GZF1	100	74.860	Carlito_syrichta
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	72.626	ENSCAPG00000002173	GZF1	100	72.765	Cavia_aperea
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	72.626	ENSCPOG00000010790	GZF1	100	72.765	Cavia_porcellus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	77.247	ENSCCAG00000035601	GZF1	100	77.669	Cebus_capucinus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.291	ENSCATG00000039279	GZF1	100	78.711	Cercocebus_atys
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	72.131	ENSCLAG00000014714	GZF1	100	72.131	Chinchilla_lanigera
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.401	ENSCSAG00000011054	GZF1	100	78.822	Chlorocebus_sabaeus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	90	53.793	ENSCPBG00000023418	-	77	53.793	Chrysemys_picta_bellii
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	71.690	ENSCPBG00000023415	GZF1	100	71.690	Chrysemys_picta_bellii
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.230	ENSCANG00000041260	GZF1	100	78.792	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	89.362	ENSCGRG00001003944	Gzf1	100	90.213	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	89.362	ENSCGRG00000012721	Gzf1	100	90.213	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMOCG00000017816	Gzf1	80	75.130	ENSDNOG00000014290	GZF1	100	75.390	Dasypus_novemcinctus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	79.132	ENSDORG00000011855	Gzf1	100	79.832	Dipodomys_ordii
ENSMOCG00000017816	Gzf1	65	73.606	ENSEBUG00000004858	GZF1	59	73.606	Eptatretus_burgeri
ENSMOCG00000017816	Gzf1	59	85.000	ENSECAG00000040045	-	100	85.000	Equus_caballus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	83	46.593	ENSELUG00000013581	GZF1	86	47.963	Esox_lucius
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	77.298	ENSFCAG00000006484	GZF1	100	77.964	Felis_catus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	93	72.941	ENSFDAG00000019468	GZF1	96	72.941	Fukomys_damarensis
ENSMOCG00000017816	Gzf1	87	47.087	ENSGMOG00000011017	GZF1	100	47.249	Gadus_morhua
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	72.676	ENSGALG00000053640	GZF1	100	72.676	Gallus_gallus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	86	48.226	ENSGACG00000012415	GZF1	99	68.878	Gasterosteus_aculeatus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.571	ENSGGOG00000023248	GZF1	100	78.962	Gorilla_gorilla
ENSMOCG00000017816	Gzf1	92	46.074	ENSHBUG00000016502	-	79	45.617	Haplochromis_burtoni
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	71.623	ENSHGLG00000008891	GZF1	100	71.896	Heterocephalus_glaber_female
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	71.623	ENSHGLG00100015117	GZF1	100	71.896	Heterocephalus_glaber_male
ENSMOCG00000017816	Gzf1	99	40.556	ENSHCOG00000004326	GZF1	72	52.956	Hippocampus_comes
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.571	ENSSTOG00000009820	GZF1	100	79.021	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	80.650	ENSJJAG00000008172	Gzf1	100	81.435	Jaculus_jaculus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	50	72.632	ENSKMAG00000001453	-	80	73.404	Kryptolebias_marmoratus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	86	47.209	ENSLBEG00000025803	-	72	46.890	Labrus_bergylta
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.873	ENSLAFG00000002458	GZF1	100	79.606	Loxodonta_africana
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.291	ENSMFAG00000042408	GZF1	100	78.711	Macaca_fascicularis
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.291	ENSMMUG00000022387	GZF1	100	78.711	Macaca_mulatta
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.401	ENSMNEG00000033117	GZF1	100	78.822	Macaca_nemestrina
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.401	ENSMLEG00000036831	GZF1	100	78.822	Mandrillus_leucophaeus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	96	43.768	ENSMAMG00000011931	-	85	43.636	Mastacembelus_armatus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	87	47.673	ENSMZEG00005010711	-	73	47.673	Maylandia_zebra
ENSMOCG00000017816	Gzf1	88	92.905	ENSMAUG00000019656	Gzf1	100	92.905	Mesocricetus_auratus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.962	ENSMICG00000046070	GZF1	100	79.354	Microcebus_murinus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	88	46.042	ENSMMOG00000004395	-	76	46.624	Mola_mola
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	72.535	ENSMODG00000006238	GZF1	100	79.323	Monodelphis_domestica
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	87.729	MGP_CAROLIEiJ_G0024409	Gzf1	100	87.870	Mus_caroli
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	87.977	ENSMUSG00000027439	Gzf1	100	88.119	Mus_musculus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	87.994	MGP_PahariEiJ_G0025852	Gzf1	100	88.136	Mus_pahari
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	88.119	MGP_SPRETEiJ_G0025327	Gzf1	100	88.260	Mus_spretus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	76.257	ENSMPUG00000001160	GZF1	89	76.816	Mustela_putorius_furo
ENSMOCG00000017816	Gzf1	98	74.893	ENSMLUG00000002194	GZF1	100	75.321	Myotis_lucifugus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	83.898	ENSNGAG00000024012	Gzf1	100	84.626	Nannospalax_galili
ENSMOCG00000017816	Gzf1	85	41.732	ENSNBRG00000019987	GZF1	98	44.737	Neolamprologus_brichardi
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.090	ENSNLEG00000011565	GZF1	100	78.511	Nomascus_leucogenys
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	72.376	ENSOPRG00000004697	GZF1	100	73.895	Ochotona_princeps
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	70.056	ENSODEG00000013020	GZF1	100	70.763	Octodon_degus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	87	47.974	ENSONIG00000000989	GZF1	100	48.947	Oreochromis_niloticus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	77.292	ENSOCUG00000025214	GZF1	100	77.292	Oryctolagus_cuniculus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	89	43.969	ENSORLG00000010006	-	76	43.373	Oryzias_latipes
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	77.949	ENSOGAG00000028389	GZF1	100	78.340	Otolemur_garnettii
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	79.213	ENSPPAG00000028487	GZF1	100	79.184	Pan_paniscus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	77.298	ENSPPRG00000010040	GZF1	100	78.103	Panthera_pardus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	77.437	ENSPTIG00000019328	GZF1	100	78.243	Panthera_tigris_altaica
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	79.243	ENSPTRG00000013320	GZF1	100	79.213	Pan_troglodytes
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.261	ENSPANG00000017419	GZF1	100	78.682	Papio_anubis
ENSMOCG00000017816	Gzf1	99	46.458	ENSPKIG00000003781	GZF1	79	49.388	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	70.556	ENSPSIG00000014455	GZF1	100	70.851	Pelodiscus_sinensis
ENSMOCG00000017816	Gzf1	86	54.138	ENSPSIG00000014208	-	78	54.138	Pelodiscus_sinensis
ENSMOCG00000017816	Gzf1	60	56.332	ENSPMGG00000003778	-	62	56.332	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	87.553	ENSPEMG00000011285	Gzf1	100	88.826	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	73.099	ENSPCIG00000013803	GZF1	100	73.099	Phascolarctos_cinereus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	88	44.131	ENSPFOG00000002393	GZF1	100	46.016	Poecilia_formosa
ENSMOCG00000017816	Gzf1	88	45.055	ENSPLAG00000005232	GZF1	95	44.651	Poecilia_latipinna
ENSMOCG00000017816	Gzf1	88	38.916	ENSPMEG00000020017	-	71	38.916	Poecilia_mexicana
ENSMOCG00000017816	Gzf1	88	34.938	ENSPREG00000016398	GZF1	73	41.483	Poecilia_reticulata
ENSMOCG00000017816	Gzf1	88	82.659	ENSPPYG00000010766	GZF1	100	62.059	Pongo_abelii
ENSMOCG00000017816	Gzf1	82	78.253	ENSPCAG00000007544	GZF1	100	77.949	Procavia_capensis
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	79.775	ENSPCOG00000024180	GZF1	100	80.309	Propithecus_coquereli
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	77.465	ENSPVAG00000014056	GZF1	100	78.592	Pteropus_vampyrus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	87.994	ENSRNOG00000004735	Gzf1	100	88.136	Rattus_norvegicus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	77.793	ENSRBIG00000028715	GZF1	100	78.212	Rhinopithecus_bieti
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.011	ENSRROG00000030533	GZF1	100	78.431	Rhinopithecus_roxellana
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	77.669	ENSSBOG00000018893	GZF1	100	78.090	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	72.549	ENSSHAG00000009367	GZF1	100	72.549	Sarcophilus_harrisii
ENSMOCG00000017816	Gzf1	88	47.958	ENSSFOG00015008631	gzf1	74	47.352	Scleropages_formosus
ENSMOCG00000017816	Gzf1	97	44.460	ENSSDUG00000008186	GZF1	72	47.227	Seriola_dumerili
ENSMOCG00000017816	Gzf1	97	43.220	ENSSLDG00000002382	GZF1	81	44.051	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSMOCG00000017816	Gzf1	85	44.465	ENSSPAG00000011759	GZF1	75	44.865	Stegastes_partitus
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ENSMOCG00000017816	Gzf1	59	81.364	ENSUAMG00000021858	-	100	81.364	Ursus_americanus
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ENSMOCG00000017816	Gzf1	99	57.746	ENSXETG00000004510	gzf1	99	57.850	Xenopus_tropicalis
ENSMOCG00000017816	Gzf1	88	45.554	ENSXMAG00000023249	GZF1	75	45.242	Xiphophorus_maculatus