EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMOCG00000020369 (Gene tree)
Gene ID: 101979058
Gene Symbol: Urb2
Alias: -
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Microtus_ochrogaster
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 27249 bases
Position: chr4:31885565-31912813
Accession: 101979058
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMOCP00000023741	Urb2	PF10441.9	4.1e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMOCT00000027596	-	5492	XM_005345869	ENSMOCP00000023741	1519 (aa)	XP_005345926	UPI00038C577B

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.692	ENSG00000135763	URB2	100	83.333	Homo_sapiens
ENSMOCG00000020369	Urb2	90	35.464	ENSAPOG00000000608	urb2	95	35.562	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	70.801	ENSAMEG00000009206	URB2	99	70.801	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	35.885	ENSAOCG00000019961	urb2	99	35.864	Amphiprion_ocellaris
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	35.902	ENSAPEG00000005263	urb2	99	35.881	Amphiprion_percula
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.869	ENSATEG00000020930	urb2	99	35.003	Anabas_testudineus
ENSMOCG00000020369	Urb2	97	47.281	ENSAPLG00000002998	URB2	100	47.215	Anas_platyrhynchos
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	48.028	ENSACAG00000001285	URB2	100	48.028	Anolis_carolinensis
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	73.084	ENSANAG00000033963	URB2	100	73.084	Aotus_nancymaae
ENSMOCG00000020369	Urb2	90	34.508	ENSACLG00000009254	urb2	95	34.735	Astatotilapia_calliptera
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	35.673	ENSAMXG00000003474	urb2	100	35.783	Astyanax_mexicanus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	65.596	ENSBTAG00000010180	URB2	99	65.596	Bos_taurus
ENSMOCG00000020369	Urb2	95	85.106	ENSCJAG00000010968	URB2	100	72.364	Callithrix_jacchus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	70.230	ENSCAFG00000012118	URB2	100	70.230	Canis_familiaris
ENSMOCG00000020369	Urb2	93	68.772	ENSCAFG00020027217	URB2	99	68.772	Canis_lupus_dingo
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	65.138	ENSCHIG00000014513	URB2	99	65.138	Capra_hircus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	71.494	ENSTSYG00000006924	URB2	99	71.494	Carlito_syrichta
ENSMOCG00000020369	Urb2	64	79.938	ENSCPOG00000020777	-	100	76.724	Cavia_porcellus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.692	ENSCCAG00000023932	URB2	100	72.692	Cebus_capucinus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.299	ENSCATG00000043366	URB2	100	72.299	Cercocebus_atys
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.477	ENSCLAG00000006268	URB2	100	72.477	Chinchilla_lanigera
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.233	ENSCSAG00000010599	URB2	100	72.233	Chlorocebus_sabaeus
ENSMOCG00000020369	Urb2	68	71.565	ENSCHOG00000010163	URB2	70	71.565	Choloepus_hoffmanni
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	51.642	ENSCPBG00000006191	URB2	100	51.642	Chrysemys_picta_bellii
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.626	ENSCANG00000023711	URB2	100	72.626	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	89.691	ENSCGRG00001009591	Urb2	100	89.691	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	89.691	ENSCGRG00000011259	Urb2	100	89.691	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	33.694	ENSCSEG00000000299	urb2	99	33.633	Cynoglossus_semilaevis
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.426	ENSCVAG00000011011	urb2	99	34.327	Cyprinodon_variegatus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	37.016	ENSDARG00000003217	urb2	99	60.194	Danio_rerio
ENSMOCG00000020369	Urb2	97	55.630	ENSDNOG00000043064	URB2	99	55.765	Dasypus_novemcinctus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	73.788	ENSDORG00000014975	Urb2	100	73.788	Dipodomys_ordii
ENSMOCG00000020369	Urb2	95	64.935	ENSETEG00000002869	URB2	95	64.935	Echinops_telfairi
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	70.773	ENSEASG00005012060	URB2	99	70.773	Equus_asinus_asinus
ENSMOCG00000020369	Urb2	93	85.106	ENSECAG00000012338	URB2	99	85.106	Equus_caballus
ENSMOCG00000020369	Urb2	92	80.142	ENSEEUG00000002669	URB2	92	80.142	Erinaceus_europaeus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	38.774	ENSELUG00000014647	urb2	99	38.710	Esox_lucius
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	69.201	ENSFCAG00000007662	URB2	100	69.201	Felis_catus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	48.096	ENSFALG00000003385	URB2	100	48.096	Ficedula_albicollis
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	73.084	ENSFDAG00000021079	URB2	100	73.084	Fukomys_damarensis
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	35.276	ENSFHEG00000010357	urb2	99	35.312	Fundulus_heteroclitus
ENSMOCG00000020369	Urb2	91	38.915	ENSGMOG00000012459	urb2	100	35.180	Gadus_morhua
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	48.232	ENSGALG00000011101	URB2	100	48.167	Gallus_gallus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	36.866	ENSGACG00000016179	urb2	99	36.994	Gasterosteus_aculeatus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	51.277	ENSGAGG00000021879	URB2	100	51.277	Gopherus_agassizii
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.430	ENSGGOG00000025643	URB2	100	72.430	Gorilla_gorilla
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	53.086	ENSHBUG00000018469	urb2	97	53.086	Haplochromis_burtoni
ENSMOCG00000020369	Urb2	97	74.764	ENSHGLG00000016561	URB2	99	74.764	Heterocephalus_glaber_female
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.674	ENSHGLG00100001838	URB2	100	72.674	Heterocephalus_glaber_male
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	35.765	ENSIPUG00000020315	urb2	99	35.714	Ictalurus_punctatus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	71.691	ENSSTOG00000025323	URB2	100	71.691	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	77.019	ENSJJAG00000011998	Urb2	100	77.019	Jaculus_jaculus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	33.873	ENSKMAG00000020129	urb2	99	33.592	Kryptolebias_marmoratus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	45.016	ENSLACG00000002038	URB2	100	45.221	Latimeria_chalumnae
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	40.192	ENSLOCG00000015462	urb2	100	40.192	Lepisosteus_oculatus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	68.414	ENSLAFG00000012484	URB2	100	68.414	Loxodonta_africana
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	71.840	ENSMFAG00000039905	URB2	100	71.840	Macaca_fascicularis
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	71.971	ENSMMUG00000009509	URB2	100	71.971	Macaca_mulatta
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.233	ENSMNEG00000038762	URB2	100	72.233	Macaca_nemestrina
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.168	ENSMLEG00000043252	URB2	100	72.168	Mandrillus_leucophaeus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.692	ENSMAMG00000020365	urb2	99	34.696	Mastacembelus_armatus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	53.086	ENSMZEG00005011027	urb2	97	53.086	Maylandia_zebra
ENSMOCG00000020369	Urb2	94	45.232	ENSMGAG00000012073	URB2	100	45.163	Meleagris_gallopavo
ENSMOCG00000020369	Urb2	95	92.908	ENSMAUG00000017980	Urb2	100	88.556	Mesocricetus_auratus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	71.953	ENSMICG00000033302	URB2	99	71.953	Microcebus_murinus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	35.769	ENSMALG00000006529	urb2	99	35.588	Monopterus_albus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	84.908	ENSMUSG00000031976	Urb2	100	84.908	Mus_musculus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	68.852	ENSMPUG00000012438	URB2	100	68.852	Mustela_putorius_furo
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	78.004	ENSNGAG00000016524	Urb2	100	78.004	Nannospalax_galili
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.810	ENSNLEG00000014450	URB2	100	72.810	Nomascus_leucogenys
ENSMOCG00000020369	Urb2	91	57.658	ENSMEUG00000016434	URB2	94	57.658	Notamacropus_eugenii
ENSMOCG00000020369	Urb2	92	67.941	ENSOPRG00000009906	URB2	92	67.941	Ochotona_princeps
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.375	ENSODEG00000005593	URB2	100	72.375	Octodon_degus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	37.396	ENSONIG00000017078	urb2	99	37.372	Oreochromis_niloticus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	47.554	ENSOANG00000013732	URB2	100	47.880	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	71.279	ENSOCUG00000010700	URB2	99	71.279	Oryctolagus_cuniculus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.709	ENSORLG00000010915	urb2	99	34.709	Oryzias_latipes
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.772	ENSORLG00020003361	urb2	99	34.772	Oryzias_latipes_hni
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.527	ENSORLG00015001534	urb2	99	34.825	Oryzias_latipes_hsok
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.820	ENSOMEG00000010076	urb2	99	34.860	Oryzias_melastigma
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	70.334	ENSOGAG00000003021	URB2	99	70.334	Otolemur_garnettii
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	65.007	ENSOARG00000003102	URB2	99	65.007	Ovis_aries
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	73.019	ENSPPAG00000040629	URB2	100	73.019	Pan_paniscus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	68.742	ENSPPRG00000012767	URB2	100	68.742	Panthera_pardus
ENSMOCG00000020369	Urb2	96	90.909	ENSPTIG00000012577	URB2	100	90.909	Panthera_tigris_altaica
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.757	ENSPTRG00000002092	URB2	100	72.757	Pan_troglodytes
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	70.399	ENSPANG00000002245	URB2	100	70.399	Papio_anubis
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	38.442	ENSPKIG00000005787	urb2	100	38.378	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	50.320	ENSPSIG00000002690	URB2	100	50.320	Pelodiscus_sinensis
ENSMOCG00000020369	Urb2	96	90.466	ENSPEMG00000019551	Urb2	100	90.466	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	59.058	ENSPCIG00000030071	URB2	100	59.058	Phascolarctos_cinereus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	35.531	ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.403	Poecilia_formosa
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.926	ENSPLAG00000014654	urb2	99	34.864	Poecilia_latipinna
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.515	ENSPMEG00000012356	urb2	99	34.515	Poecilia_mexicana
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.611	ENSPREG00000010268	urb2	99	34.425	Poecilia_reticulata
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	72.346	ENSPPYG00000000123	URB2	99	72.346	Pongo_abelii
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	71.953	ENSPCOG00000023537	URB2	99	71.953	Propithecus_coquereli
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	58.731	ENSPVAG00000002108	URB2	100	58.731	Pteropus_vampyrus
ENSMOCG00000020369	Urb2	90	34.712	ENSPNYG00000016840	urb2	95	34.939	Pundamilia_nyererei
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	36.446	ENSPNAG00000013684	urb2	100	36.381	Pygocentrus_nattereri
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	86.754	ENSRNOG00000026853	Urb2	97	86.754	Rattus_norvegicus
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.757	ENSRBIG00000037937	URB2	100	72.757	Rhinopithecus_bieti
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	72.364	ENSRROG00000039854	URB2	100	72.364	Rhinopithecus_roxellana
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	73.477	ENSSBOG00000023055	URB2	100	73.477	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	59.254	ENSSHAG00000014735	URB2	100	59.254	Sarcophilus_harrisii
ENSMOCG00000020369	Urb2	98	38.568	ENSSFOG00015015432	urb2	98	38.794	Scleropages_formosus
ENSMOCG00000020369	Urb2	89	34.490	ENSSMAG00000004984	urb2	95	34.490	Scophthalmus_maximus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	35.038	ENSSDUG00000000902	urb2	99	35.000	Seriola_dumerili
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	50.351	ENSSPUG00000018549	URB2	100	50.447	Sphenodon_punctatus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	35.916	ENSSPAG00000013632	urb2	99	35.916	Stegastes_partitus
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	66.601	ENSSSCG00000010186	URB2	99	66.601	Sus_scrofa
ENSMOCG00000020369	Urb2	100	48.018	ENSTGUG00000009990	URB2	100	48.018	Taeniopygia_guttata
ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.401	ENSTRUG00000008173	urb2	99	34.542	Takifugu_rubripes
ENSMOCG00000020369	Urb2	91	47.059	ENSTNIG00000017689	urb2	94	47.059	Tetraodon_nigroviridis
ENSMOCG00000020369	Urb2	97	75.290	ENSTTRG00000014864	URB2	96	75.290	Tursiops_truncatus
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ENSMOCG00000020369	Urb2	99	71.129	ENSUMAG00000004728	URB2	99	71.129	Ursus_maritimus
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ENSMOCG00000020369	Urb2	100	70.098	ENSVVUG00000006747	URB2	100	70.098	Vulpes_vulpes
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ENSMOCG00000020369	Urb2	99	34.852	ENSXMAG00000015059	urb2	99	34.622	Xiphophorus_maculatus