EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMOCG00000022938 (Gene tree)
Gene ID: 101994000
Gene Symbol: Syf2
Alias: 1110018L13Rik|Cbpin|D4Bwg1551e|Gcipip|Ntc31|mp29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Microtus_ochrogaster
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6540 bases
Position: chr10:49856268-49862807
Accession: 101994000
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMOCP00000027461	SYF2	PF08231.12	5.2e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMOCT00000031366	-	1282	XM_005353059	ENSMOCP00000027461	242 (aa)	XP_005353116	UPI00038C3751

Gene Model

Click here to download ENSMOCG00000022938's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMOCG00000022938's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.123	ENSG00000117614	SYF2	100	91.358	Homo_sapiens
ENSMOCG00000022938	Syf2	92	85.135	ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.579	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMOCG00000022938	Syf2	99	90.083	ENSAMEG00000010115	-	99	90.083	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMOCG00000022938	Syf2	81	95.385	ENSAMEG00000010134	-	100	95.385	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMOCG00000022938	Syf2	96	79.828	ENSACIG00000023688	syf2	94	78.814	Amphilophus_citrinellus
ENSMOCG00000022938	Syf2	93	80.000	ENSAOCG00000010912	syf2	69	80.000	Amphiprion_ocellaris
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	81.405	ENSAOCG00000022046	syf2	97	83.478	Amphiprion_ocellaris
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	81.405	ENSAPEG00000018858	syf2	92	81.405	Amphiprion_percula
ENSMOCG00000022938	Syf2	90	84.332	ENSATEG00000007745	syf2	100	78.926	Anabas_testudineus
ENSMOCG00000022938	Syf2	83	88.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	Anas_platyrhynchos
ENSMOCG00000022938	Syf2	84	84.314	ENSACAG00000013653	-	100	84.314	Anolis_carolinensis
ENSMOCG00000022938	Syf2	69	75.449	ENSACAG00000026777	-	94	75.796	Anolis_carolinensis
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.181	ENSANAG00000032473	SYF2	100	92.181	Aotus_nancymaae
ENSMOCG00000022938	Syf2	92	81.532	ENSACLG00000019916	syf2	100	77.686	Astatotilapia_calliptera
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	79.752	ENSAMXG00000004051	syf2	100	79.752	Astyanax_mexicanus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.245	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	Bos_taurus
ENSMOCG00000022938	Syf2	86	50.476	WBGene00019402	syf-2	90	50.237	Caenorhabditis_elegans
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.181	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	92.181	Callithrix_jacchus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.244	ENSCAFG00000012895	-	100	90.244	Canis_familiaris
ENSMOCG00000022938	Syf2	93	85.778	ENSCAFG00000030331	-	96	85.778	Canis_familiaris
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.244	ENSCAFG00020021091	-	100	90.244	Canis_lupus_dingo
ENSMOCG00000022938	Syf2	75	85.714	ENSCAFG00020021094	-	83	93.590	Canis_lupus_dingo
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.593	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.593	Capra_hircus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.593	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.593	Carlito_syrichta
ENSMOCG00000022938	Syf2	82	95.960	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	95.960	Cavia_aperea
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.393	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.393	Cavia_porcellus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.593	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	92.593	Cebus_capucinus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.535	ENSCATG00000026917	SYF2	100	90.535	Cercocebus_atys
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	93.852	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.852	Chinchilla_lanigera
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.947	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.947	Chlorocebus_sabaeus
ENSMOCG00000022938	Syf2	71	75.287	ENSCHOG00000005273	-	96	75.287	Choloepus_hoffmanni
ENSMOCG00000022938	Syf2	93	88.444	ENSCPBG00000025073	SYF2	92	87.719	Chrysemys_picta_bellii
ENSMOCG00000022938	Syf2	87	53.991	ENSCING00000003017	-	89	53.991	Ciona_intestinalis
ENSMOCG00000022938	Syf2	87	50.235	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.235	Ciona_savignyi
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	78.601	ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.601	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	97.521	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	97.521	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMOCG00000022938	Syf2	82	98.995	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	98.995	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMOCG00000022938	Syf2	90	79.358	ENSCSEG00000000117	syf2	93	78.378	Cynoglossus_semilaevis
ENSMOCG00000022938	Syf2	91	82.805	ENSCVAG00000019543	syf2	100	78.512	Cyprinodon_variegatus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	78.926	ENSDARG00000004706	syf2	100	78.926	Danio_rerio
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.429	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	91.429	Dasypus_novemcinctus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.623	ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.623	Dipodomys_ordii
ENSMOCG00000022938	Syf2	90	57.273	FBgn0033556	CG12343	97	57.273	Drosophila_melanogaster
ENSMOCG00000022938	Syf2	94	77.729	ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.729	Echinops_telfairi
ENSMOCG00000022938	Syf2	81	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.837	ENSEASG00005004224	-	100	91.837	Equus_asinus_asinus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	81.893	ENSEASG00005004232	-	100	81.893	Equus_asinus_asinus
ENSMOCG00000022938	Syf2	94	94.760	ENSECAG00000010440	-	96	94.760	Equus_caballus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.245	ENSECAG00000012023	-	100	92.245	Equus_caballus
ENSMOCG00000022938	Syf2	75	79.781	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.781	Erinaceus_europaeus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	80.165	ENSELUG00000003465	syf2	99	80.165	Esox_lucius
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.245	ENSFCAG00000010324	-	85	92.245	Felis_catus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.870	ENSFCAG00000043095	-	100	91.870	Felis_catus
ENSMOCG00000022938	Syf2	84	84.804	ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.116	Ficedula_albicollis
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	93.004	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.004	Fukomys_damarensis
ENSMOCG00000022938	Syf2	92	67.857	ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.857	Fundulus_heteroclitus
ENSMOCG00000022938	Syf2	90	84.862	ENSGMOG00000019138	syf2	97	84.862	Gadus_morhua
ENSMOCG00000022938	Syf2	93	88.444	ENSGALG00000013639	SYF2	90	87.719	Gallus_gallus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	76.033	ENSGAFG00000019435	syf2	100	76.033	Gambusia_affinis
ENSMOCG00000022938	Syf2	89	84.651	ENSGACG00000007305	syf2	99	78.243	Gasterosteus_aculeatus
ENSMOCG00000022938	Syf2	93	88.889	ENSGAGG00000010670	SYF2	92	88.158	Gopherus_agassizii
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.535	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	91.770	Gorilla_gorilla
ENSMOCG00000022938	Syf2	96	79.828	ENSHBUG00000020477	syf2	99	79.828	Haplochromis_burtoni
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.803	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	91.803	Heterocephalus_glaber_female
ENSMOCG00000022938	Syf2	93	82.143	ENSHGLG00000004304	-	100	76.860	Heterocephalus_glaber_female
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.803	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	91.803	Heterocephalus_glaber_male
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	78.099	ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.099	Hippocampus_comes
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	80.165	ENSIPUG00000019859	syf2	100	80.165	Ictalurus_punctatus
ENSMOCG00000022938	Syf2	60	94.521	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	94.521	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMOCG00000022938	Syf2	82	97.487	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	Jaculus_jaculus
ENSMOCG00000022938	Syf2	96	78.814	ENSKMAG00000013856	syf2	99	78.814	Kryptolebias_marmoratus
ENSMOCG00000022938	Syf2	90	84.475	ENSLBEG00000014425	syf2	100	78.926	Labrus_bergylta
ENSMOCG00000022938	Syf2	95	82.174	ENSLACG00000012064	SYF2	97	82.174	Latimeria_chalumnae
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	81.818	ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.818	Lepisosteus_oculatus
ENSMOCG00000022938	Syf2	76	63.587	ENSLAFG00000030814	-	100	63.587	Loxodonta_africana
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.837	ENSLAFG00000023150	-	100	91.837	Loxodonta_africana
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.947	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	90.947	Macaca_fascicularis
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.358	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	91.358	Macaca_mulatta
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.947	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	90.947	Macaca_nemestrina
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.535	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	90.535	Mandrillus_leucophaeus
ENSMOCG00000022938	Syf2	90	82.949	ENSMAMG00000010403	syf2	98	78.099	Mastacembelus_armatus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	77.686	ENSMZEG00005006429	syf2	100	77.686	Maylandia_zebra
ENSMOCG00000022938	Syf2	82	88.442	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	Meleagris_gallopavo
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	97.934	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	97.934	Mesocricetus_auratus
ENSMOCG00000022938	Syf2	82	96.985	ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.985	Microcebus_murinus
ENSMOCG00000022938	Syf2	96	78.541	ENSMMOG00000002396	syf2	97	78.541	Mola_mola
ENSMOCG00000022938	Syf2	93	87.773	ENSMODG00000013951	-	100	87.773	Monodelphis_domestica
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	77.778	ENSMALG00000010706	syf2	100	77.778	Monopterus_albus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	97.521	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	97.521	Mus_caroli
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	97.521	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	97.521	Mus_musculus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	97.521	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	97.521	Mus_pahari
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	97.521	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	97.521	Mus_spretus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.244	ENSMPUG00000015801	-	100	90.244	Mustela_putorius_furo
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.057	ENSMPUG00000015802	-	100	91.057	Mustela_putorius_furo
ENSMOCG00000022938	Syf2	94	94.323	ENSMLUG00000001885	SYF2	94	94.323	Myotis_lucifugus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	94.309	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	94.309	Nannospalax_galili
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	70.325	ENSNBRG00000010720	syf2	96	72.845	Neolamprologus_brichardi
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.535	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	91.770	Nomascus_leucogenys
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	93.004	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	93.004	Ochotona_princeps
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	81.148	ENSODEG00000014338	-	100	81.148	Octodon_degus
ENSMOCG00000022938	Syf2	96	93.133	ENSODEG00000017664	-	98	93.133	Octodon_degus
ENSMOCG00000022938	Syf2	92	81.532	ENSONIG00000008213	syf2	100	77.686	Oreochromis_niloticus
ENSMOCG00000022938	Syf2	83	90.594	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	93.443	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.443	Oryctolagus_cuniculus
ENSMOCG00000022938	Syf2	92	81.982	ENSORLG00000028820	syf2	95	81.982	Oryzias_latipes
ENSMOCG00000022938	Syf2	99	77.917	ENSORLG00020018333	syf2	99	77.917	Oryzias_latipes_hni
ENSMOCG00000022938	Syf2	99	78.750	ENSORLG00015014665	syf2	99	78.750	Oryzias_latipes_hsok
ENSMOCG00000022938	Syf2	99	79.079	ENSOMEG00000013911	syf2	99	79.079	Oryzias_melastigma
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	93.852	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.852	Otolemur_garnettii
ENSMOCG00000022938	Syf2	81	65.641	ENSOARG00000006269	-	100	65.641	Ovis_aries
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.498	ENSOARG00000006348	-	100	91.498	Ovis_aries
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.535	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	91.770	Pan_paniscus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.870	ENSPPRG00000001651	-	100	91.870	Panthera_pardus
ENSMOCG00000022938	Syf2	99	91.393	ENSPPRG00000001638	-	99	91.393	Panthera_pardus
ENSMOCG00000022938	Syf2	89	96.759	ENSPTIG00000005711	-	81	95.516	Panthera_tigris_altaica
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.870	ENSPTIG00000007036	-	100	91.870	Panthera_tigris_altaica
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.535	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	91.770	Pan_troglodytes
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.947	ENSPANG00000008139	SYF2	100	90.947	Papio_anubis
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	79.752	ENSPKIG00000008130	syf2	100	79.752	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMOCG00000022938	Syf2	99	83.817	ENSPSIG00000011816	SYF2	94	83.817	Pelodiscus_sinensis
ENSMOCG00000022938	Syf2	93	81.696	ENSPMGG00000008755	syf2	88	81.696	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	99.174	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	99.174	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMOCG00000022938	Syf2	93	91.964	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	85.600	Phascolarctos_cinereus
ENSMOCG00000022938	Syf2	96	78.112	ENSPFOG00000004116	syf2	95	78.112	Poecilia_formosa
ENSMOCG00000022938	Syf2	97	77.872	ENSPLAG00000006691	syf2	100	77.872	Poecilia_latipinna
ENSMOCG00000022938	Syf2	99	73.859	ENSPMEG00000011684	syf2	98	76.087	Poecilia_mexicana
ENSMOCG00000022938	Syf2	89	82.407	ENSPREG00000003009	syf2	97	78.696	Poecilia_reticulata
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.770	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	91.770	Pongo_abelii
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	64.198	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.786	Propithecus_coquereli
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	80.000	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.000	Pteropus_vampyrus
ENSMOCG00000022938	Syf2	92	81.532	ENSPNYG00000004979	syf2	99	78.243	Pundamilia_nyererei
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	82.231	ENSPNAG00000015570	syf2	100	82.231	Pygocentrus_nattereri
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	97.521	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	97.521	Rattus_norvegicus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	88.889	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	88.889	Rhinopithecus_bieti
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.947	ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.947	Rhinopithecus_roxellana
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.181	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.181	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMOCG00000022938	Syf2	85	91.748	ENSSHAG00000007152	-	100	91.748	Sarcophilus_harrisii
ENSMOCG00000022938	Syf2	93	90.749	ENSSHAG00000015630	-	100	84.739	Sarcophilus_harrisii
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	80.165	ENSSFOG00015023647	syf2	100	80.165	Scleropages_formosus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	76.446	ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.446	Scophthalmus_maximus
ENSMOCG00000022938	Syf2	90	83.945	ENSSDUG00000013072	syf2	99	79.079	Seriola_dumerili
ENSMOCG00000022938	Syf2	90	83.945	ENSSLDG00000012677	syf2	99	79.079	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	73.770	ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.770	Sorex_araneus
ENSMOCG00000022938	Syf2	93	87.946	ENSSPUG00000005251	SYF2	89	87.946	Sphenodon_punctatus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	78.099	ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.099	Stegastes_partitus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.245	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	92.245	Sus_scrofa
ENSMOCG00000022938	Syf2	62	58.940	ENSTGUG00000001126	SYF2	87	58.523	Taeniopygia_guttata
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	76.446	ENSTRUG00000001499	syf2	91	79.825	Takifugu_rubripes
ENSMOCG00000022938	Syf2	92	79.821	ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.821	Tetraodon_nigroviridis
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	70.782	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.370	Tupaia_belangeri
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.623	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.623	Tursiops_truncatus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.244	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	90.244	Ursus_americanus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	89.837	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	90.650	Ursus_maritimus
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.393	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.393	Vicugna_pacos
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	87.903	ENSVVUG00000027181	-	100	87.903	Vulpes_vulpes
ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.244	ENSVVUG00000027175	-	100	90.244	Vulpes_vulpes
ENSMOCG00000022938	Syf2	95	84.279	ENSXETG00000022797	syf2	92	84.279	Xenopus_tropicalis
ENSMOCG00000022938	Syf2	89	82.326	ENSXMAG00000022698	syf2	100	75.620	Xiphophorus_maculatus