EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMODG00000001721 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Monodelphis_domestica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 72419 bases
Position: chr3:46993315-47065733
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMODP00000002110	IBN_N	PF03810.19	4.7e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMODT00000002153	TNPO1-201	3714	-	ENSMODP00000002110	1146 (aa)	-	F6XGA5

Gene Model

Click here to download ENSMODG00000001721's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMODG00000001721's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	88.584	ENSMODG00000006888	TNPO2	99	88.584

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSG00000083312	TNPO1	99	97.872	Homo_sapiens
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.468	ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	94.468	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.458	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	97.458	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMODG00000001721	TNPO1	69	95.402	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	95.402	Amphilophus_citrinellus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.681	ENSAOCG00000008154	tnpo1	99	94.681	Amphiprion_ocellaris
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.681	ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	94.681	Amphiprion_percula
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.255	ENSATEG00000010408	tnpo1	99	94.255	Anabas_testudineus
ENSMODG00000001721	TNPO1	79	96.617	ENSAPLG00000009619	-	98	96.617	Anas_platyrhynchos
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	ENSACAG00000009599	TNPO1	99	97.660	Anolis_carolinensis
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	90.851	ENSANAG00000025351	-	99	90.851	Aotus_nancymaae
ENSMODG00000001721	TNPO1	73	67.386	ENSANAG00000027118	-	97	67.386	Aotus_nancymaae
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.234	ENSANAG00000022453	-	99	97.234	Aotus_nancymaae
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	90.638	ENSACLG00000027223	tnpo1	99	90.638	Astatotilapia_calliptera
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.404	ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	93.404	Astyanax_mexicanus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	97.872	Bos_taurus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.234	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	97.234	Callithrix_jacchus
ENSMODG00000001721	TNPO1	77	97.458	ENSCAFG00000008081	TNPO1	99	97.458	Canis_familiaris
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	97.872	Canis_lupus_dingo
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	97.872	Capra_hircus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.234	ENSTSYG00000001871	TNPO1	98	97.234	Carlito_syrichta
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.021	ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	97.021	Cebus_capucinus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSCATG00000043792	TNPO1	99	97.872	Cercocebus_atys
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.447	ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	97.447	Chinchilla_lanigera
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	97.872	Chlorocebus_sabaeus
ENSMODG00000001721	TNPO1	76	81.862	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.339	Choloepus_hoffmanni
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	98.085	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	98.085	Chrysemys_picta_bellii
ENSMODG00000001721	TNPO1	82	76.582	ENSCSAVG00000010981	-	99	77.953	Ciona_savignyi
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	97.872	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	97.660	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMODG00000001721	TNPO1	78	97.660	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	99	97.660	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.191	ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	93.191	Cynoglossus_semilaevis
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.830	ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	93.830	Cyprinodon_variegatus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.404	ENSDARG00000035390	tnpo1	99	93.404	Danio_rerio
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	86.469	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	86.469	Dasypus_novemcinctus
ENSMODG00000001721	TNPO1	75	97.872	ENSDORG00000006476	Tnpo1	99	97.872	Dipodomys_ordii
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	58.936	FBgn0035693	CG8219	99	58.936	Drosophila_melanogaster
ENSMODG00000001721	TNPO1	64	100.000	ENSETEG00000017805	TNPO1	80	100.000	Echinops_telfairi
ENSMODG00000001721	TNPO1	76	85.745	ENSEBUG00000001895	tnpo1	99	85.745	Eptatretus_burgeri
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSEASG00005018055	TNPO1	99	97.872	Equus_asinus_asinus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	97.872	Equus_caballus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	82.353	ENSELUG00000002821	tnpo1	99	82.353	Esox_lucius
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSFCAG00000013181	TNPO1	99	97.872	Felis_catus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	98.085	ENSFALG00000010292	TNPO1	99	98.085	Ficedula_albicollis
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.447	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	97.447	Fukomys_damarensis
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.468	ENSFHEG00000019234	tnpo1	99	94.468	Fundulus_heteroclitus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	91.064	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	91.064	Gadus_morhua
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.447	ENSGALG00000015014	TNPO1	99	97.447	Gallus_gallus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.043	ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	94.043	Gambusia_affinis
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.191	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.191	Gasterosteus_aculeatus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	98.085	ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	98.085	Gopherus_agassizii
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	84.468	ENSGGOG00000022535	-	98	84.468	Gorilla_gorilla
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSGGOG00000026800	TNPO1	99	97.872	Gorilla_gorilla
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.830	ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	93.830	Haplochromis_burtoni
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.447	ENSHGLG00000000970	-	99	97.447	Heterocephalus_glaber_female
ENSMODG00000001721	TNPO1	78	76.744	ENSHGLG00100000963	-	99	76.744	Heterocephalus_glaber_male
ENSMODG00000001721	TNPO1	77	97.447	ENSHGLG00100017090	-	99	97.447	Heterocephalus_glaber_male
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	96	97.872	Jaculus_jaculus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.617	ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	93.617	Kryptolebias_marmoratus
ENSMODG00000001721	TNPO1	69	96.552	ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	96.552	Labrus_bergylta
ENSMODG00000001721	TNPO1	77	86.624	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	85.565	Latimeria_chalumnae
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	96.596	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	96.596	Lepisosteus_oculatus
ENSMODG00000001721	TNPO1	78	98.085	ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	98.085	Loxodonta_africana
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	97.872	Macaca_fascicularis
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	97.872	Macaca_mulatta
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	97.872	Macaca_nemestrina
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	97.872	Mandrillus_leucophaeus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.468	ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	94.468	Mastacembelus_armatus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.191	ENSMZEG00005004913	tnpo1	99	93.191	Maylandia_zebra
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	97.660	Mesocricetus_auratus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	97.872	Microcebus_murinus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	97.660	Microtus_ochrogaster
ENSMODG00000001721	TNPO1	69	95.115	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	95.115	Mola_mola
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.043	ENSMALG00000009782	tnpo1	99	94.043	Monopterus_albus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	99	97.674	Mus_caroli
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	99	97.674	Mus_musculus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	97.674	Mus_pahari
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.234	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	99	97.234	Mus_spretus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	97.872	Mustela_putorius_furo
ENSMODG00000001721	TNPO1	77	97.660	ENSMLUG00000016317	TNPO1	99	97.660	Myotis_lucifugus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	97.660	Nannospalax_galili
ENSMODG00000001721	TNPO1	69	95.115	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	95.115	Neolamprologus_brichardi
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSNLEG00000004572	TNPO1	99	97.872	Nomascus_leucogenys
ENSMODG00000001721	TNPO1	68	90.415	ENSOPRG00000012390	TNPO1	85	90.301	Ochotona_princeps
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.447	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	97.447	Octodon_degus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	92.437	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.437	Oreochromis_niloticus
ENSMODG00000001721	TNPO1	74	97.931	ENSOANG00000015785	TNPO1	99	97.931	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMODG00000001721	TNPO1	77	88.110	ENSOCUG00000013318	TNPO1	99	88.110	Oryctolagus_cuniculus
ENSMODG00000001721	TNPO1	69	95.115	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	95.115	Oryzias_latipes
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.404	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.404	Oryzias_latipes_hni
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.830	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.830	Oryzias_latipes_hsok
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.404	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.404	Oryzias_melastigma
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	97.872	Otolemur_garnettii
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSOARG00000005038	TNPO1	83	97.872	Ovis_aries
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	97.872	Pan_paniscus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSPPRG00000022336	TNPO1	99	97.872	Panthera_pardus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSPTIG00000018839	TNPO1	99	97.872	Panthera_tigris_altaica
ENSMODG00000001721	TNPO1	76	92.230	ENSPTRG00000047731	-	99	92.230	Pan_troglodytes
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	97.872	Pan_troglodytes
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	97.872	Papio_anubis
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	95.319	ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	95.319	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	97.872	Pelodiscus_sinensis
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	91.720	ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	91.720	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMODG00000001721	TNPO1	77	97.660	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	99	97.660	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	98.511	ENSPCIG00000026080	TNPO1	99	98.511	Phascolarctos_cinereus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.043	ENSPFOG00000011447	tnpo1	99	94.043	Poecilia_formosa
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.043	ENSPLAG00000018696	tnpo1	99	94.043	Poecilia_latipinna
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.043	ENSPMEG00000024121	tnpo1	99	94.043	Poecilia_mexicana
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.255	ENSPREG00000020705	tnpo1	99	94.255	Poecilia_reticulata
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	97.872	Pongo_abelii
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	97.872	Propithecus_coquereli
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	97.660	Pteropus_vampyrus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.617	ENSPNYG00000001522	tnpo1	99	93.617	Pundamilia_nyererei
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.617	ENSPNAG00000021484	tnpo1	99	93.617	Pygocentrus_nattereri
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	99	97.660	Rattus_norvegicus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSRBIG00000021642	TNPO1	99	97.872	Rhinopithecus_bieti
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSRROG00000035271	TNPO1	99	97.872	Rhinopithecus_roxellana
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.234	ENSSBOG00000029256	TNPO1	99	97.234	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMODG00000001721	TNPO1	77	98.511	ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	98.511	Sarcophilus_harrisii
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	95.532	ENSSFOG00015015448	tnpo1	99	95.532	Scleropages_formosus
ENSMODG00000001721	TNPO1	77	93.830	ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	93.830	Scophthalmus_maximus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.468	ENSSDUG00000007943	tnpo1	99	94.468	Seriola_dumerili
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.468	ENSSLDG00000014578	tnpo1	99	94.468	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSSPUG00000000149	TNPO1	99	97.872	Sphenodon_punctatus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.681	ENSSPAG00000000258	tnpo1	99	94.681	Stegastes_partitus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSSSCG00000027293	TNPO1	99	97.872	Sus_scrofa
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	95.763	ENSTGUG00000005729	TNPO1	99	95.763	Taeniopygia_guttata
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	92.766	ENSTRUG00000018491	tnpo1	99	92.766	Takifugu_rubripes
ENSMODG00000001721	TNPO1	55	93.514	ENSTNIG00000007483	tnpo1	99	93.514	Tetraodon_nigroviridis
ENSMODG00000001721	TNPO1	64	98.667	ENSTBEG00000007848	TNPO1	77	98.667	Tupaia_belangeri
ENSMODG00000001721	TNPO1	77	90.638	ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	90.638	Tursiops_truncatus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSUMAG00000007635	TNPO1	99	97.872	Ursus_maritimus
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	90.213	ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	90.213	Vicugna_pacos
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	ENSVVUG00000007338	TNPO1	99	97.872	Vulpes_vulpes
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	95.957	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	95.957	Xenopus_tropicalis
ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.468	ENSXMAG00000005440	tnpo1	99	94.468	Xiphophorus_maculatus