EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMODG00000002831 (Gene tree)
Gene ID: 100031924
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Monodelphis_domestica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 46672 bases
Position: chr1:630956317-631002988
Accession: 12825
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMODP00000003445	CRM1_C	PF08767.11	5.9e-131	1	1
ENSMODP00000003445	Xpo1	PF08389.12	4.3e-41	1	1
ENSMODP00000003445	IBN_N	PF03810.19	1.9e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMODT00000003519	XPO1-201	3224	-	ENSMODP00000003445	1071 (aa)	-	F7EIW1

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
mdo03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
mdo03013	RNA transport	KEGG
mdo05164	Influenza A	KEGG
mdo05166	Human T-cell leukemia virus 1 infection	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.572	ENSG00000082898	XPO1	100	99.441	Homo_sapiens
ENSMODG00000002831	XPO1	88	89.468	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	89.468	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.331	ENSAPOG00000004984	-	100	95.331	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.601	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	98.601	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMODG00000002831	XPO1	88	95.638	ENSACIG00000010818	-	100	95.638	Amphilophus_citrinellus
ENSMODG00000002831	XPO1	88	91.809	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.809	Amphilophus_citrinellus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.331	ENSAOCG00000010121	-	100	95.331	Amphiprion_ocellaris
ENSMODG00000002831	XPO1	100	91.130	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	91.130	Amphiprion_ocellaris
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.331	ENSAPEG00000007038	-	100	95.331	Amphiprion_percula
ENSMODG00000002831	XPO1	91	91.658	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	91.658	Amphiprion_percula
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.331	ENSATEG00000008816	-	100	95.331	Anabas_testudineus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	90.756	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	90.756	Anabas_testudineus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.599	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	98.599	Anas_platyrhynchos
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.413	ENSACAG00000002501	XPO1	100	98.413	Anolis_carolinensis
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.572	ENSANAG00000020802	XPO1	100	97.572	Aotus_nancymaae
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.145	ENSACLG00000015192	-	100	95.145	Astatotilapia_calliptera
ENSMODG00000002831	XPO1	88	92.128	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	92.128	Astatotilapia_calliptera
ENSMODG00000002831	XPO1	88	93.008	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.008	Astyanax_mexicanus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.798	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	95.798	Astyanax_mexicanus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.693	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	98.693	Bos_taurus
ENSMODG00000002831	XPO1	99	51.705	WBGene00002078	xpo-1	99	51.705	Caenorhabditis_elegans
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.572	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	97.572	Callithrix_jacchus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.693	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	98.693	Canis_familiaris
ENSMODG00000002831	XPO1	93	98.594	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	98.594	Canis_lupus_dingo
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.693	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	98.693	Capra_hircus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.693	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	98.693	Carlito_syrichta
ENSMODG00000002831	XPO1	53	93.440	ENSCAPG00000006454	-	100	93.440	Cavia_aperea
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.199	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	97.199	Cavia_porcellus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	78.479	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	78.664	Cebus_capucinus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.810	ENSCATG00000032674	XPO1	100	97.340	Cercocebus_atys
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.413	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.413	Chinchilla_lanigera
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.572	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	97.572	Chlorocebus_sabaeus
ENSMODG00000002831	XPO1	83	98.444	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.444	Choloepus_hoffmanni
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.506	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.506	Chrysemys_picta_bellii
ENSMODG00000002831	XPO1	100	80.633	ENSCING00000024562	-	100	80.633	Ciona_intestinalis
ENSMODG00000002831	XPO1	99	79.645	ENSCSAVG00000005965	-	99	79.645	Ciona_savignyi
ENSMODG00000002831	XPO1	100	93.371	ENSCANG00000028883	XPO1	100	96.631	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.386	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.386	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.386	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	97.386	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMODG00000002831	XPO1	88	94.468	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.468	Cynoglossus_semilaevis
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.238	ENSCVAG00000016788	-	100	95.238	Cyprinodon_variegatus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	90.476	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	90.476	Cyprinodon_variegatus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	92.344	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.356	Danio_rerio
ENSMODG00000002831	XPO1	100	96.078	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	96.078	Danio_rerio
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.786	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	98.786	Dasypus_novemcinctus
ENSMODG00000002831	XPO1	92	95.745	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.745	Dipodomys_ordii
ENSMODG00000002831	XPO1	99	70.947	FBgn0020497	emb	99	70.947	Drosophila_melanogaster
ENSMODG00000002831	XPO1	94	98.155	ENSETEG00000018045	XPO1	94	98.155	Echinops_telfairi
ENSMODG00000002831	XPO1	90	78.942	ENSEBUG00000012580	-	100	87.242	Eptatretus_burgeri
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.693	ENSEASG00005007223	XPO1	100	98.693	Equus_asinus_asinus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.693	ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.828	Equus_caballus
ENSMODG00000002831	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSMODG00000002831	XPO1	87	92.184	ENSELUG00000014306	-	99	92.184	Esox_lucius
ENSMODG00000002831	XPO1	88	94.255	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	94.255	Esox_lucius
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.693	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	98.693	Felis_catus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.506	ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.506	Ficedula_albicollis
ENSMODG00000002831	XPO1	100	96.825	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	96.825	Fukomys_damarensis
ENSMODG00000002831	XPO1	100	90.943	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	90.943	Fundulus_heteroclitus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	92.063	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.063	Gadus_morhua
ENSMODG00000002831	XPO1	100	89.262	ENSGMOG00000019063	-	100	89.262	Gadus_morhua
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.599	ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.599	Gallus_gallus
ENSMODG00000002831	XPO1	88	91.702	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.702	Gambusia_affinis
ENSMODG00000002831	XPO1	91	95.366	ENSGAFG00000003355	-	98	95.366	Gambusia_affinis
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.051	ENSGACG00000002743	-	100	95.051	Gasterosteus_aculeatus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	90.663	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.663	Gasterosteus_aculeatus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.413	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.413	Gopherus_agassizii
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.572	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	97.572	Gorilla_gorilla
ENSMODG00000002831	XPO1	100	91.317	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	91.317	Haplochromis_burtoni
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.238	ENSHBUG00000020037	-	100	95.238	Haplochromis_burtoni
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.319	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	98.319	Heterocephalus_glaber_female
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.319	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	98.319	Heterocephalus_glaber_male
ENSMODG00000002831	XPO1	88	94.574	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	94.574	Hippocampus_comes
ENSMODG00000002831	XPO1	100	93.091	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.091	Ictalurus_punctatus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.798	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	95.798	Ictalurus_punctatus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.506	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.506	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.413	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	98.413	Jaculus_jaculus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	94.771	ENSKMAG00000016218	-	100	94.771	Kryptolebias_marmoratus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	90.756	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	90.756	Kryptolebias_marmoratus
ENSMODG00000002831	XPO1	88	89.195	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	89.195	Labrus_bergylta
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.331	ENSLBEG00000005740	-	100	95.331	Labrus_bergylta
ENSMODG00000002831	XPO1	100	76.731	ENSLACG00000018213	XPO1	100	76.731	Latimeria_chalumnae
ENSMODG00000002831	XPO1	100	96.359	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	96.359	Lepisosteus_oculatus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.319	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	98.319	Loxodonta_africana
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.572	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	97.572	Macaca_fascicularis
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.572	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	97.572	Macaca_mulatta
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.572	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	97.572	Macaca_nemestrina
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.814	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	95.814	Mandrillus_leucophaeus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	91.036	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	91.036	Mastacembelus_armatus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.238	ENSMAMG00000010568	-	100	95.238	Mastacembelus_armatus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	91.317	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	91.317	Maylandia_zebra
ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.145	ENSMZEG00005018158	-	98	95.366	Maylandia_zebra
ENSMODG00000002831	XPO1	68	97.934	ENSMGAG00000001496	-	100	97.934	Meleagris_gallopavo
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.386	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	97.386	Mesocricetus_auratus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.693	ENSMICG00000027770	XPO1	100	98.693	Microcebus_murinus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.666	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	97.666	Microtus_ochrogaster
ENSMODG00000002831	XPO1	88	91.809	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	91.809	Mola_mola
ENSMODG00000002831	XPO1	87	95.304	ENSMMOG00000008001	-	99	95.304	Mola_mola
ENSMODG00000002831	XPO1	100	94.865	ENSMALG00000007085	-	100	94.865	Monopterus_albus
ENSMODG00000002831	XPO1	88	90.861	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	90.861	Monopterus_albus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.759	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	97.759	Mus_caroli
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.852	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	97.852	Mus_musculus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.852	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	97.852	Mus_pahari
ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.852	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	97.852	Mus_spretus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.693	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	98.693	Mustela_putorius_furo
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.599	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	98.599	Myotis_lucifugus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.506	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	98.506	Nannospalax_galili
ENSMODG00000002831	XPO1	100	91.317	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	91.317	Neolamprologus_brichardi
ENSMODG00000002831	XPO1	96	94.579	ENSNBRG00000012229	-	100	95.745	Neolamprologus_brichardi
ENSMODG00000002831	XPO1	100	94.177	ENSNLEG00000009680	XPO1	100	94.177	Nomascus_leucogenys
ENSMODG00000002831	XPO1	63	100.000	ENSMEUG00000013277	-	63	100.000	Notamacropus_eugenii
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ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.666	ENSRNOG00000009935	Xpo1	100	97.666	Rattus_norvegicus
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ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.572	ENSRROG00000038442	XPO1	100	97.572	Rhinopithecus_roxellana
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ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.238	ENSSLDG00000019530	-	100	95.238	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMODG00000002831	XPO1	91	97.677	ENSSARG00000014000	-	91	97.677	Sorex_araneus
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ENSMODG00000002831	XPO1	99	91.003	ENSTRUG00000001415	xpo1a	100	91.003	Takifugu_rubripes
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ENSMODG00000002831	XPO1	64	98.624	ENSTBEG00000014485	-	70	98.624	Tupaia_belangeri
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ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.693	ENSUAMG00000026512	XPO1	100	98.693	Ursus_americanus
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ENSMODG00000002831	XPO1	96	94.233	ENSVPAG00000011446	XPO1	100	94.233	Vicugna_pacos
ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.693	ENSVVUG00000012009	XPO1	100	98.693	Vulpes_vulpes
ENSMODG00000002831	XPO1	100	96.919	ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.919	Xenopus_tropicalis
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ENSMODG00000002831	XPO1	88	91.702	ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.702	Xiphophorus_couchianus
ENSMODG00000002831	XPO1	100	91.036	ENSXMAG00000005790	xpo1a	100	91.036	Xiphophorus_maculatus
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