EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMODG00000003066 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POP5
Alias: -
Full Name: POP5 homolog%2C ribonuclease P/MRP subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Monodelphis_domestica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7160 bases
Position: chr3:490110394-490117553
Accession: 17689
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMODP00000003729	RNase_P_Rpp14	PF01900.19	6.4e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMODT00000003812	POP5-201	3090	-	ENSMODP00000003729	246 (aa)	-	F6PNN7

Gene Model

Click here to download ENSMODG00000003066's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMODG00000003066's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMODG00000003066	POP5	60	81.081	ENSG00000167272	POP5	98	77.778	Homo_sapiens
ENSMODG00000003066	POP5	60	56.757	ENSAPOG00000023686	POP5	100	56.287	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMODG00000003066	POP5	68	72.674	ENSAMEG00000008503	POP5	100	72.674	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMODG00000003066	POP5	60	56.463	ENSACIG00000018362	pop5	100	53.614	Amphilophus_citrinellus
ENSMODG00000003066	POP5	62	53.595	ENSAOCG00000001930	pop5	100	53.293	Amphiprion_ocellaris
ENSMODG00000003066	POP5	62	53.595	ENSAPEG00000006795	pop5	100	53.293	Amphiprion_percula
ENSMODG00000003066	POP5	62	54.902	ENSATEG00000016792	pop5	100	53.892	Anabas_testudineus
ENSMODG00000003066	POP5	67	59.146	ENSACAG00000003091	POP5	99	59.146	Anolis_carolinensis
ENSMODG00000003066	POP5	73	66.851	ENSANAG00000023744	POP5	100	75.000	Aotus_nancymaae
ENSMODG00000003066	POP5	62	54.605	ENSACLG00000021131	-	100	54.762	Astatotilapia_calliptera
ENSMODG00000003066	POP5	61	55.034	ENSAMXG00000038175	pop5	97	50.898	Astyanax_mexicanus
ENSMODG00000003066	POP5	68	74.118	ENSBTAG00000005385	POP5	100	74.118	Bos_taurus
ENSMODG00000003066	POP5	60	81.757	ENSCJAG00000001309	POP5	100	76.786	Callithrix_jacchus
ENSMODG00000003066	POP5	68	74.118	ENSCAFG00000010389	POP5	100	74.118	Canis_familiaris
ENSMODG00000003066	POP5	68	74.118	ENSCAFG00020020663	POP5	100	74.118	Canis_lupus_dingo
ENSMODG00000003066	POP5	68	75.294	ENSCHIG00000016402	POP5	100	75.294	Capra_hircus
ENSMODG00000003066	POP5	67	74.699	ENSTSYG00000027616	POP5	98	74.699	Carlito_syrichta
ENSMODG00000003066	POP5	68	73.810	ENSCPOG00000012337	POP5	100	73.810	Cavia_porcellus
ENSMODG00000003066	POP5	60	80.405	ENSCCAG00000023154	POP5	100	75.595	Cebus_capucinus
ENSMODG00000003066	POP5	60	81.081	ENSCATG00000036825	POP5	98	79.012	Cercocebus_atys
ENSMODG00000003066	POP5	68	75.740	ENSCLAG00000007808	POP5	100	75.740	Chinchilla_lanigera
ENSMODG00000003066	POP5	60	81.081	ENSCSAG00000002246	POP5	98	77.778	Chlorocebus_sabaeus
ENSMODG00000003066	POP5	58	69.014	ENSCHOG00000013969	POP5	100	64.706	Choloepus_hoffmanni
ENSMODG00000003066	POP5	66	71.605	ENSCPBG00000011331	POP5	96	71.605	Chrysemys_picta_bellii
ENSMODG00000003066	POP5	60	81.081	ENSCANG00000028001	POP5	98	76.506	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMODG00000003066	POP5	68	75.740	ENSCGRG00001017974	Pop5	100	75.740	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMODG00000003066	POP5	68	75.740	ENSCGRG00000010102	Pop5	100	75.740	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMODG00000003066	POP5	62	52.941	ENSCSEG00000008332	-	99	50.602	Cynoglossus_semilaevis
ENSMODG00000003066	POP5	56	58.394	ENSCSEG00000011103	pop5	99	53.896	Cynoglossus_semilaevis
ENSMODG00000003066	POP5	66	40.000	ENSCVAG00000009152	-	99	40.000	Cyprinodon_variegatus
ENSMODG00000003066	POP5	62	54.194	ENSDARG00000053452	pop5	98	52.121	Danio_rerio
ENSMODG00000003066	POP5	58	81.690	ENSDNOG00000045952	-	100	75.882	Dasypus_novemcinctus
ENSMODG00000003066	POP5	70	70.690	ENSDNOG00000012668	-	100	67.327	Dasypus_novemcinctus
ENSMODG00000003066	POP5	67	73.333	ENSDORG00000029401	Pop5	98	75.301	Dipodomys_ordii
ENSMODG00000003066	POP5	66	75.758	ENSETEG00000009283	POP5	98	75.301	Echinops_telfairi
ENSMODG00000003066	POP5	59	42.361	ENSEBUG00000016369	pop5	88	42.361	Eptatretus_burgeri
ENSMODG00000003066	POP5	58	80.986	ENSEASG00005004714	POP5	100	75.294	Equus_asinus_asinus
ENSMODG00000003066	POP5	58	80.986	ENSECAG00000010012	POP5	100	75.294	Equus_caballus
ENSMODG00000003066	POP5	66	53.704	ENSELUG00000023394	pop5	99	53.704	Esox_lucius
ENSMODG00000003066	POP5	68	74.118	ENSFCAG00000042614	POP5	100	74.118	Felis_catus
ENSMODG00000003066	POP5	62	69.935	ENSFALG00000007537	POP5	100	66.467	Ficedula_albicollis
ENSMODG00000003066	POP5	67	72.727	ENSFDAG00000009972	POP5	98	74.699	Fukomys_damarensis
ENSMODG00000003066	POP5	66	55.758	ENSFHEG00000022341	pop5	99	56.098	Fundulus_heteroclitus
ENSMODG00000003066	POP5	52	56.589	ENSGMOG00000001073	pop5	98	56.589	Gadus_morhua
ENSMODG00000003066	POP5	60	65.986	ENSGALG00000007124	POP5	57	65.217	Gallus_gallus
ENSMODG00000003066	POP5	62	57.895	ENSGAFG00000005937	-	100	57.059	Gambusia_affinis
ENSMODG00000003066	POP5	66	53.704	ENSGACG00000012710	-	99	53.704	Gasterosteus_aculeatus
ENSMODG00000003066	POP5	67	71.341	ENSGAGG00000016005	POP5	98	71.341	Gopherus_agassizii
ENSMODG00000003066	POP5	60	81.081	ENSGGOG00000013505	POP5	98	77.778	Gorilla_gorilla
ENSMODG00000003066	POP5	62	54.605	ENSHBUG00000011718	-	100	54.762	Haplochromis_burtoni
ENSMODG00000003066	POP5	68	73.810	ENSHGLG00000011786	POP5	100	73.810	Heterocephalus_glaber_female
ENSMODG00000003066	POP5	68	73.810	ENSHGLG00100014284	POP5	100	73.810	Heterocephalus_glaber_male
ENSMODG00000003066	POP5	61	53.691	ENSHCOG00000011809	pop5	99	52.469	Hippocampus_comes
ENSMODG00000003066	POP5	61	53.020	ENSIPUG00000003437	pop5	99	51.205	Ictalurus_punctatus
ENSMODG00000003066	POP5	68	76.331	ENSSTOG00000012577	POP5	100	76.331	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMODG00000003066	POP5	58	81.690	ENSJJAG00000001080	Pop5	100	75.294	Jaculus_jaculus
ENSMODG00000003066	POP5	60	52.381	ENSKMAG00000011158	-	100	50.588	Kryptolebias_marmoratus
ENSMODG00000003066	POP5	64	51.899	ENSLBEG00000008652	pop5	91	50.898	Labrus_bergylta
ENSMODG00000003066	POP5	68	65.269	ENSLACG00000018188	POP5	100	65.269	Latimeria_chalumnae
ENSMODG00000003066	POP5	60	58.108	ENSLOCG00000002924	pop5	94	56.790	Lepisosteus_oculatus
ENSMODG00000003066	POP5	68	74.854	ENSLAFG00000014545	POP5	100	74.854	Loxodonta_africana
ENSMODG00000003066	POP5	60	81.081	ENSMFAG00000045933	POP5	97	79.739	Macaca_fascicularis
ENSMODG00000003066	POP5	60	81.081	ENSMMUG00000040120	POP5	98	77.778	Macaca_mulatta
ENSMODG00000003066	POP5	60	81.081	ENSMNEG00000041716	POP5	98	77.778	Macaca_nemestrina
ENSMODG00000003066	POP5	60	80.405	ENSMLEG00000029377	POP5	98	77.160	Mandrillus_leucophaeus
ENSMODG00000003066	POP5	61	56.376	ENSMAMG00000002108	pop5	100	54.706	Mastacembelus_armatus
ENSMODG00000003066	POP5	62	54.605	ENSMZEG00005000069	-	100	54.762	Maylandia_zebra
ENSMODG00000003066	POP5	68	75.148	ENSMAUG00000019670	Pop5	100	75.148	Mesocricetus_auratus
ENSMODG00000003066	POP5	68	75.882	ENSMICG00000008692	POP5	100	77.059	Microcebus_murinus
ENSMODG00000003066	POP5	68	69.231	ENSMOCG00000013322	Pop5	100	69.231	Microtus_ochrogaster
ENSMODG00000003066	POP5	57	55.714	ENSMMOG00000010471	pop5	97	54.088	Mola_mola
ENSMODG00000003066	POP5	61	54.305	ENSMALG00000017797	-	100	53.293	Monopterus_albus
ENSMODG00000003066	POP5	68	77.515	MGP_CAROLIEiJ_G0027618	Pop5	100	77.515	Mus_caroli
ENSMODG00000003066	POP5	68	77.515	ENSMUSG00000060152	Pop5	100	77.515	Mus_musculus
ENSMODG00000003066	POP5	68	74.556	MGP_PahariEiJ_G0024198	Pop5	100	74.556	Mus_pahari
ENSMODG00000003066	POP5	68	76.331	MGP_SPRETEiJ_G0028616	Pop5	100	76.331	Mus_spretus
ENSMODG00000003066	POP5	61	76.159	ENSMPUG00000003221	POP5	98	72.892	Mustela_putorius_furo
ENSMODG00000003066	POP5	66	73.494	ENSMLUG00000014657	POP5	99	73.494	Myotis_lucifugus
ENSMODG00000003066	POP5	58	83.099	ENSNGAG00000002594	Pop5	97	78.313	Nannospalax_galili
ENSMODG00000003066	POP5	60	81.081	ENSNLEG00000015839	POP5	98	78.395	Nomascus_leucogenys
ENSMODG00000003066	POP5	68	89.222	ENSMEUG00000015288	POP5	100	89.222	Notamacropus_eugenii
ENSMODG00000003066	POP5	58	82.394	ENSOPRG00000004327	POP5	99	75.294	Ochotona_princeps
ENSMODG00000003066	POP5	67	73.653	ENSODEG00000006549	-	100	74.556	Octodon_degus
ENSMODG00000003066	POP5	67	66.867	ENSODEG00000010351	-	100	65.663	Octodon_degus
ENSMODG00000003066	POP5	62	54.605	ENSONIG00000011172	pop5	100	53.571	Oreochromis_niloticus
ENSMODG00000003066	POP5	67	74.556	ENSOCUG00000006537	POP5	99	74.556	Oryctolagus_cuniculus
ENSMODG00000003066	POP5	59	53.793	ENSORLG00000014745	pop5	87	53.793	Oryzias_latipes
ENSMODG00000003066	POP5	67	50.898	ENSORLG00020001168	pop5	100	50.898	Oryzias_latipes_hni
ENSMODG00000003066	POP5	67	49.704	ENSORLG00015013535	pop5	100	49.704	Oryzias_latipes_hsok
ENSMODG00000003066	POP5	68	49.701	ENSOMEG00000017643	pop5	97	49.701	Oryzias_melastigma
ENSMODG00000003066	POP5	61	78.667	ENSOGAG00000008528	POP5	92	78.667	Otolemur_garnettii
ENSMODG00000003066	POP5	68	74.419	ENSOARG00000012764	POP5	100	74.419	Ovis_aries
ENSMODG00000003066	POP5	60	81.081	ENSPPAG00000043719	POP5	98	77.778	Pan_paniscus
ENSMODG00000003066	POP5	68	74.118	ENSPPRG00000006474	POP5	100	74.118	Panthera_pardus
ENSMODG00000003066	POP5	68	74.118	ENSPTIG00000012194	POP5	100	74.118	Panthera_tigris_altaica
ENSMODG00000003066	POP5	60	81.081	ENSPTRG00000005543	POP5	98	77.778	Pan_troglodytes
ENSMODG00000003066	POP5	60	81.081	ENSPANG00000014166	POP5	98	77.778	Papio_anubis
ENSMODG00000003066	POP5	61	56.000	ENSPKIG00000025154	pop5	97	54.658	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMODG00000003066	POP5	66	50.299	ENSPMGG00000000812	-	99	50.299	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMODG00000003066	POP5	65	76.074	ENSPEMG00000017493	Pop5	96	76.074	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMODG00000003066	POP5	60	58.784	ENSPFOG00000013000	pop5	99	56.548	Poecilia_formosa
ENSMODG00000003066	POP5	60	58.503	ENSPLAG00000014070	pop5	99	56.287	Poecilia_latipinna
ENSMODG00000003066	POP5	62	56.579	ENSPMEG00000012863	POP5	100	56.471	Poecilia_mexicana
ENSMODG00000003066	POP5	62	56.579	ENSPMEG00000024039	pop5	100	56.471	Poecilia_mexicana
ENSMODG00000003066	POP5	60	57.823	ENSPREG00000020151	pop5	100	55.294	Poecilia_reticulata
ENSMODG00000003066	POP5	69	72.515	ENSPPYG00000005036	POP5	89	70.270	Pongo_abelii
ENSMODG00000003066	POP5	67	74.118	ENSPCOG00000017618	POP5	100	75.294	Propithecus_coquereli
ENSMODG00000003066	POP5	58	80.282	ENSPVAG00000002233	POP5	100	74.706	Pteropus_vampyrus
ENSMODG00000003066	POP5	62	54.605	ENSPNYG00000002679	pop5	100	54.762	Pundamilia_nyererei
ENSMODG00000003066	POP5	59	52.055	ENSPNAG00000012662	pop5	98	48.851	Pygocentrus_nattereri
ENSMODG00000003066	POP5	64	77.358	ENSRNOG00000001199	Pop5	100	75.740	Rattus_norvegicus
ENSMODG00000003066	POP5	58	80.986	ENSRBIG00000043505	POP5	100	77.070	Rhinopithecus_bieti
ENSMODG00000003066	POP5	60	79.730	ENSRROG00000045063	POP5	100	77.070	Rhinopithecus_roxellana
ENSMODG00000003066	POP5	60	81.081	ENSSBOG00000032691	POP5	100	80.882	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMODG00000003066	POP5	60	60.135	ENSSFOG00015005630	pop5	98	57.317	Scleropages_formosus
ENSMODG00000003066	POP5	60	54.362	ENSSMAG00000018868	pop5	100	52.663	Scophthalmus_maximus
ENSMODG00000003066	POP5	65	54.217	ENSSDUG00000001282	-	99	54.217	Seriola_dumerili
ENSMODG00000003066	POP5	65	53.614	ENSSLDG00000003801	-	99	53.614	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMODG00000003066	POP5	65	53.614	ENSSLDG00000017031	pop5	99	53.614	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMODG00000003066	POP5	60	77.703	ENSSPUG00000015531	POP5	97	73.333	Sphenodon_punctatus
ENSMODG00000003066	POP5	60	56.463	ENSSPAG00000015306	pop5	100	55.090	Stegastes_partitus
ENSMODG00000003066	POP5	68	75.882	ENSSSCG00000009912	POP5	100	75.882	Sus_scrofa
ENSMODG00000003066	POP5	67	69.697	ENSTGUG00000009602	POP5	100	69.697	Taeniopygia_guttata
ENSMODG00000003066	POP5	66	56.790	ENSTRUG00000016214	pop5	98	56.790	Takifugu_rubripes
ENSMODG00000003066	POP5	58	59.859	ENSTNIG00000011465	pop5	85	59.859	Tetraodon_nigroviridis
ENSMODG00000003066	POP5	67	74.850	ENSTBEG00000010131	POP5	99	74.850	Tupaia_belangeri
ENSMODG00000003066	POP5	68	74.706	ENSTTRG00000000153	POP5	100	74.706	Tursiops_truncatus
ENSMODG00000003066	POP5	65	71.951	ENSUAMG00000015541	POP5	76	71.951	Ursus_americanus
ENSMODG00000003066	POP5	68	72.941	ENSUMAG00000006137	POP5	100	72.941	Ursus_maritimus
ENSMODG00000003066	POP5	68	75.882	ENSVPAG00000010365	POP5	100	75.882	Vicugna_pacos
ENSMODG00000003066	POP5	68	74.118	ENSVVUG00000021154	POP5	100	74.118	Vulpes_vulpes
ENSMODG00000003066	POP5	63	55.769	ENSXMAG00000003508	-	89	55.172	Xiphophorus_maculatus