EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMODG00000003337 (Gene tree)
Gene ID: 100030771
Gene Symbol: IPO4
Alias: FLJ23338|Imp4
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Monodelphis_domestica
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14874 bases
Position: chr1:173522649-173537522
Accession: 100030771
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMODP00000004081	IBN_N	PF03810.19	5.8e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMODT00000004167	IPO4-201	3553	XM_001380158	ENSMODP00000004081	1115 (aa)	XP_001380195	F7DCI6

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMODG00000003337	IPO4	95	73.966	ENSG00000196497	IPO4	99	73.772	Homo_sapiens
ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.923	ENSAPOG00000019018	ipo4	99	43.108	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMODG00000003337	IPO4	98	69.111	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	69.388	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMODG00000003337	IPO4	97	42.949	ENSACIG00000004246	ipo4	99	43.211	Amphilophus_citrinellus
ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.238	ENSAOCG00000004773	ipo4	99	43.330	Amphiprion_ocellaris
ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.238	ENSAPEG00000002112	ipo4	99	43.330	Amphiprion_percula
ENSMODG00000003337	IPO4	89	44.632	ENSATEG00000017082	ipo4	99	44.732	Anabas_testudineus
ENSMODG00000003337	IPO4	84	51.420	ENSACAG00000003973	-	99	51.852	Anolis_carolinensis
ENSMODG00000003337	IPO4	97	72.078	ENSANAG00000037973	IPO4	99	72.078	Aotus_nancymaae
ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.435	ENSACLG00000019742	ipo4	99	42.382	Astatotilapia_calliptera
ENSMODG00000003337	IPO4	96	41.774	ENSAMXG00000037878	ipo4	99	42.144	Astyanax_mexicanus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	72.753	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	72.938	Bos_taurus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	72.449	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	72.449	Callithrix_jacchus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.377	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	73.377	Canis_familiaris
ENSMODG00000003337	IPO4	95	72.813	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	71.005	Canis_lupus_dingo
ENSMODG00000003337	IPO4	97	72.196	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	72.382	Capra_hircus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	72.660	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	72.567	Carlito_syrichta
ENSMODG00000003337	IPO4	97	71.614	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	71.614	Cavia_porcellus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	72.820	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	72.820	Cebus_capucinus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.772	ENSCATG00000040395	IPO4	99	73.772	Cercocebus_atys
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.098	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	73.098	Chinchilla_lanigera
ENSMODG00000003337	IPO4	88	52.899	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	49.862	Chrysemys_picta_bellii
ENSMODG00000003337	IPO4	91	36.337	ENSCING00000008639	-	99	36.550	Ciona_intestinalis
ENSMODG00000003337	IPO4	88	35.743	ENSCSAVG00000011482	-	96	36.072	Ciona_savignyi
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.494	ENSCANG00000029513	IPO4	99	73.679	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	69.323	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	69.509	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMODG00000003337	IPO4	97	69.231	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	69.416	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMODG00000003337	IPO4	96	41.935	ENSCSEG00000009606	ipo4	99	42.091	Cynoglossus_semilaevis
ENSMODG00000003337	IPO4	95	42.500	ENSCVAG00000002281	ipo4	99	42.477	Cyprinodon_variegatus
ENSMODG00000003337	IPO4	96	45.185	ENSDARG00000041493	ipo4	99	45.278	Danio_rerio
ENSMODG00000003337	IPO4	97	72.356	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	72.171	Dasypus_novemcinctus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	72.449	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	72.449	Dipodomys_ordii
ENSMODG00000003337	IPO4	97	70.213	ENSETEG00000018381	IPO4	99	70.398	Echinops_telfairi
ENSMODG00000003337	IPO4	89	75.583	ENSEASG00005011954	IPO4	97	75.583	Equus_asinus_asinus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	74.304	ENSECAG00000009909	IPO4	99	74.304	Equus_caballus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	44.963	ENSELUG00000020628	ipo4	99	44.963	Esox_lucius
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.933	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	73.748	Felis_catus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	66.790	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	66.364	Fukomys_damarensis
ENSMODG00000003337	IPO4	96	37.220	ENSFHEG00000009351	ipo4	99	37.593	Fundulus_heteroclitus
ENSMODG00000003337	IPO4	96	44.044	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	44.137	Gadus_morhua
ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.658	ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.646	Gambusia_affinis
ENSMODG00000003337	IPO4	96	44.004	ENSGACG00000002276	ipo4	99	43.941	Gasterosteus_aculeatus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.957	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	73.957	Gorilla_gorilla
ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.804	ENSHBUG00000023269	ipo4	99	42.659	Haplochromis_burtoni
ENSMODG00000003337	IPO4	97	72.078	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	72.078	Heterocephalus_glaber_female
ENSMODG00000003337	IPO4	97	71.800	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	71.800	Heterocephalus_glaber_male
ENSMODG00000003337	IPO4	97	42.096	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	42.029	Hippocampus_comes
ENSMODG00000003337	IPO4	96	44.475	ENSIPUG00000001185	ipo4	99	44.651	Ictalurus_punctatus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.377	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	73.377	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	70.648	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	70.741	Jaculus_jaculus
ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.941	ENSKMAG00000004627	ipo4	99	43.692	Kryptolebias_marmoratus
ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.727	ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.911	Labrus_bergylta
ENSMODG00000003337	IPO4	96	46.946	ENSLACG00000001428	IPO4	99	47.037	Latimeria_chalumnae
ENSMODG00000003337	IPO4	72	44.987	ENSLOCG00000001149	ipo4	81	44.987	Lepisosteus_oculatus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	71.892	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	71.614	Loxodonta_africana
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.772	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	73.772	Macaca_fascicularis
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.587	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	73.587	Macaca_mulatta
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.587	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	73.587	Macaca_nemestrina
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.679	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	73.679	Mandrillus_leucophaeus
ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.623	ENSMAMG00000021976	ipo4	99	43.900	Mastacembelus_armatus
ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.949	ENSMZEG00005017273	ipo4	99	42.897	Maylandia_zebra
ENSMODG00000003337	IPO4	97	68.582	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	68.582	Mesocricetus_auratus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	71.800	ENSMICG00000001719	IPO4	99	71.800	Microcebus_murinus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	68.767	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	68.860	Microtus_ochrogaster
ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.752	ENSMMOG00000005264	ipo4	99	43.028	Mola_mola
ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.241	ENSMALG00000001587	ipo4	99	42.318	Monopterus_albus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	68.860	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	69.693	Mus_caroli
ENSMODG00000003337	IPO4	97	68.767	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	69.410	Mus_musculus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	68.646	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	99	69.042	Mus_pahari
ENSMODG00000003337	IPO4	97	68.860	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	69.571	Mus_spretus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	74.304	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	74.212	Mustela_putorius_furo
ENSMODG00000003337	IPO4	99	70.334	ENSMLUG00000025277	IPO4	86	71.614	Myotis_lucifugus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	70.779	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	70.779	Nannospalax_galili
ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.993	ENSNBRG00000005870	ipo4	99	43.623	Neolamprologus_brichardi
ENSMODG00000003337	IPO4	97	71.389	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	71.389	Ochotona_princeps
ENSMODG00000003337	IPO4	97	71.985	ENSODEG00000002609	IPO4	99	71.985	Octodon_degus
ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.860	ENSONIG00000014574	ipo4	99	43.767	Oreochromis_niloticus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	71.679	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	71.771	Oryctolagus_cuniculus
ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.105	ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.624	Oryzias_latipes
ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.738	ENSORLG00020004286	ipo4	99	43.148	Oryzias_latipes_hni
ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.923	ENSORLG00015021856	ipo4	99	43.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSMODG00000003337	IPO4	95	43.324	ENSOMEG00000016203	ipo4	99	43.675	Oryzias_melastigma
ENSMODG00000003337	IPO4	97	72.567	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	72.196	Otolemur_garnettii
ENSMODG00000003337	IPO4	97	70.556	ENSOARG00000019188	IPO4	99	70.741	Ovis_aries
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.494	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	73.494	Pan_paniscus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.748	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	73.562	Panthera_pardus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.840	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	73.655	Panthera_tigris_altaica
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.865	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	73.865	Pan_troglodytes
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.494	ENSPANG00000026278	IPO4	99	73.494	Papio_anubis
ENSMODG00000003337	IPO4	97	43.900	ENSPKIG00000007683	-	99	43.900	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMODG00000003337	IPO4	96	46.310	ENSPKIG00000007830	ipo4	99	46.402	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMODG00000003337	IPO4	96	41.690	ENSPMGG00000020871	ipo4	99	42.173	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	68.182	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	67.996	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMODG00000003337	IPO4	91	86.136	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	86.431	Phascolarctos_cinereus
ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.146	ENSPFOG00000009255	ipo4	99	43.041	Poecilia_formosa
ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.238	ENSPLAG00000020556	ipo4	99	43.134	Poecilia_latipinna
ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.146	ENSPMEG00000013102	ipo4	99	43.041	Poecilia_mexicana
ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.290	ENSPREG00000017605	ipo4	99	43.134	Poecilia_reticulata
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.562	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	73.562	Pongo_abelii
ENSMODG00000003337	IPO4	97	72.567	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	72.702	Procavia_capensis
ENSMODG00000003337	IPO4	97	71.800	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	71.800	Propithecus_coquereli
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.469	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	73.469	Pteropus_vampyrus
ENSMODG00000003337	IPO4	96	42.897	ENSPNYG00000021414	ipo4	99	42.844	Pundamilia_nyererei
ENSMODG00000003337	IPO4	96	44.259	ENSPNAG00000027964	ipo4	99	44.352	Pygocentrus_nattereri
ENSMODG00000003337	IPO4	97	69.573	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	69.573	Rattus_norvegicus
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.309	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	73.309	Rhinopithecus_bieti
ENSMODG00000003337	IPO4	97	73.216	ENSRROG00000011492	IPO4	99	73.216	Rhinopithecus_roxellana
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