EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMODG00000003464 (Gene tree)
Gene ID: 100014650
Gene Symbol: CTIF
Alias: KIAA0427
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Monodelphis_domestica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 476499 bases
Position: chr3:67821174-68297672
Accession: 100014650
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMODP00000037195	MIF4G	PF02854.19	7.4e-27	1	1
ENSMODP00000004237	MIF4G	PF02854.19	9e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMODT00000004326	CTIF-201	2735	-	ENSMODP00000004237	618 (aa)	-	F7DCB6
ENSMODT00000038794	CTIF-202	2558	-	ENSMODP00000037195	559 (aa)	XP_007486718	F7CKV2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.032	ENSG00000134030	CTIF	100	84.615	Homo_sapiens
ENSMODG00000003464	CTIF	100	56.833	ENSAPOG00000020192	ctif	99	56.427	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMODG00000003464	CTIF	88	77.049	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	79.008	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMODG00000003464	CTIF	91	64.917	ENSACIG00000017099	ctif	99	51.293	Amphilophus_citrinellus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	50.810	ENSAOCG00000014275	ctif	99	50.515	Amphiprion_ocellaris
ENSMODG00000003464	CTIF	91	62.602	ENSAPEG00000016975	ctif	99	52.827	Amphiprion_percula
ENSMODG00000003464	CTIF	100	52.296	ENSATEG00000016752	ctif	99	52.741	Anabas_testudineus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	73.239	ENSACAG00000018006	CTIF	100	73.396	Anolis_carolinensis
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.731	ENSANAG00000024925	CTIF	100	80.731	Aotus_nancymaae
ENSMODG00000003464	CTIF	99	51.929	ENSACLG00000005956	ctif	99	52.444	Astatotilapia_calliptera
ENSMODG00000003464	CTIF	93	60.055	ENSAMXG00000015964	ctif	100	49.286	Astyanax_mexicanus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	78.333	ENSBTAG00000018901	CTIF	100	78.333	Bos_taurus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.063	ENSCJAG00000004729	CTIF	100	81.063	Callithrix_jacchus
ENSMODG00000003464	CTIF	97	81.229	ENSCAFG00000019076	CTIF	100	81.561	Canis_familiaris
ENSMODG00000003464	CTIF	97	81.229	ENSCAFG00020026482	CTIF	100	81.561	Canis_lupus_dingo
ENSMODG00000003464	CTIF	100	78.037	ENSCHIG00000014455	CTIF	100	78.037	Capra_hircus
ENSMODG00000003464	CTIF	89	71.296	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	71.296	Carlito_syrichta
ENSMODG00000003464	CTIF	100	78.401	ENSCAPG00000011865	CTIF	100	78.401	Cavia_aperea
ENSMODG00000003464	CTIF	100	77.814	ENSCPOG00000001049	CTIF	100	77.814	Cavia_porcellus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.229	ENSCCAG00000022758	CTIF	100	81.229	Cebus_capucinus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.865	ENSCATG00000038134	CTIF	100	80.865	Cercocebus_atys
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.233	ENSCLAG00000008174	CTIF	100	80.233	Chinchilla_lanigera
ENSMODG00000003464	CTIF	100	78.930	ENSCSAG00000018021	CTIF	100	78.930	Chlorocebus_sabaeus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.467	ENSCPBG00000025654	CTIF	100	80.467	Chrysemys_picta_bellii
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.987	ENSCANG00000030916	CTIF	100	81.987	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	79.035	ENSCGRG00001020158	Ctif	100	79.035	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMODG00000003464	CTIF	100	74.722	ENSCGRG00000000052	Ctif	100	74.722	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMODG00000003464	CTIF	91	57.000	ENSCSEG00000019857	ctif	99	50.647	Cynoglossus_semilaevis
ENSMODG00000003464	CTIF	100	50.073	ENSCVAG00000017158	ctif	99	53.010	Cyprinodon_variegatus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	51.571	ENSDARG00000090617	ctif	100	53.659	Danio_rerio
ENSMODG00000003464	CTIF	76	85.219	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	85.219	Dasypus_novemcinctus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	79.534	ENSDORG00000003221	Ctif	100	79.534	Dipodomys_ordii
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.699	ENSEASG00005016094	CTIF	100	80.699	Equus_asinus_asinus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.865	ENSECAG00000020473	CTIF	100	80.865	Equus_caballus
ENSMODG00000003464	CTIF	89	73.148	ENSEEUG00000012451	CTIF	100	73.148	Erinaceus_europaeus
ENSMODG00000003464	CTIF	99	57.188	ENSELUG00000008733	ctif	99	56.714	Esox_lucius
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.364	ENSFCAG00000000664	CTIF	100	81.364	Felis_catus
ENSMODG00000003464	CTIF	97	77.431	ENSFALG00000008943	CTIF	97	77.431	Ficedula_albicollis
ENSMODG00000003464	CTIF	100	78.758	ENSFDAG00000017379	CTIF	100	78.758	Fukomys_damarensis
ENSMODG00000003464	CTIF	99	53.018	ENSFHEG00000004334	ctif	99	52.836	Fundulus_heteroclitus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	76.412	ENSGALG00000035912	-	100	76.412	Gallus_gallus
ENSMODG00000003464	CTIF	99	53.387	ENSGAFG00000011896	ctif	99	53.090	Gambusia_affinis
ENSMODG00000003464	CTIF	72	82.045	ENSGAGG00000020663	CTIF	97	81.818	Gopherus_agassizii
ENSMODG00000003464	CTIF	100	82.333	ENSGGOG00000015204	CTIF	100	82.333	Gorilla_gorilla
ENSMODG00000003464	CTIF	99	52.077	ENSHBUG00000018092	ctif	99	52.593	Haplochromis_burtoni
ENSMODG00000003464	CTIF	100	79.867	ENSHGLG00000005663	CTIF	100	79.867	Heterocephalus_glaber_female
ENSMODG00000003464	CTIF	100	79.700	ENSHGLG00100006976	CTIF	100	79.700	Heterocephalus_glaber_male
ENSMODG00000003464	CTIF	99	52.349	ENSHCOG00000011784	ctif	99	53.859	Hippocampus_comes
ENSMODG00000003464	CTIF	100	53.019	ENSIPUG00000014050	ctif	99	52.063	Ictalurus_punctatus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	79.201	ENSSTOG00000001967	CTIF	100	79.201	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	79.712	ENSJJAG00000013706	Ctif	100	79.712	Jaculus_jaculus
ENSMODG00000003464	CTIF	99	49.708	ENSKMAG00000014651	ctif	99	50.731	Kryptolebias_marmoratus
ENSMODG00000003464	CTIF	99	55.960	ENSLBEG00000018277	ctif	99	56.529	Labrus_bergylta
ENSMODG00000003464	CTIF	100	60.593	ENSLOCG00000011697	ctif	100	62.146	Lepisosteus_oculatus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	76.704	ENSLAFG00000016335	CTIF	100	92.884	Loxodonta_africana
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.198	ENSMFAG00000037903	CTIF	100	81.198	Macaca_fascicularis
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.865	ENSMMUG00000020898	CTIF	100	80.865	Macaca_mulatta
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.865	ENSMNEG00000039395	CTIF	100	80.865	Macaca_nemestrina
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.364	ENSMLEG00000041132	CTIF	100	81.364	Mandrillus_leucophaeus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	52.493	ENSMAMG00000014741	ctif	99	53.079	Mastacembelus_armatus
ENSMODG00000003464	CTIF	89	47.468	ENSMZEG00005019767	ctif	90	49.010	Maylandia_zebra
ENSMODG00000003464	CTIF	89	47.865	ENSMGAG00000001378	CTIF	100	48.694	Meleagris_gallopavo
ENSMODG00000003464	CTIF	100	79.201	ENSMAUG00000000656	Ctif	100	79.201	Mesocricetus_auratus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.532	ENSMICG00000010167	CTIF	100	80.532	Microcebus_murinus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.366	ENSMOCG00000020507	Ctif	100	80.366	Microtus_ochrogaster
ENSMODG00000003464	CTIF	100	49.710	ENSMMOG00000000831	ctif	99	49.927	Mola_mola
ENSMODG00000003464	CTIF	85	47.505	ENSMALG00000020553	ctif	96	54.867	Monopterus_albus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	78.130	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	100	78.130	Mus_caroli
ENSMODG00000003464	CTIF	100	78.447	ENSMUSG00000052928	Ctif	100	78.447	Mus_musculus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	79.236	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	100	79.236	Mus_pahari
ENSMODG00000003464	CTIF	100	78.288	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	92	88.158	Mus_spretus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.699	ENSMPUG00000000844	CTIF	100	80.699	Mustela_putorius_furo
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.699	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	80.699	Myotis_lucifugus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.198	ENSNGAG00000011452	Ctif	100	81.198	Nannospalax_galili
ENSMODG00000003464	CTIF	99	52.232	ENSNBRG00000008679	ctif	99	52.749	Neolamprologus_brichardi
ENSMODG00000003464	CTIF	100	82.492	ENSNLEG00000011503	CTIF	100	82.492	Nomascus_leucogenys
ENSMODG00000003464	CTIF	100	83.022	ENSMEUG00000000218	CTIF	100	83.022	Notamacropus_eugenii
ENSMODG00000003464	CTIF	100	77.537	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	77.537	Ochotona_princeps
ENSMODG00000003464	CTIF	100	78.628	ENSODEG00000018390	CTIF	100	77.953	Octodon_degus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	58.911	ENSONIG00000007750	ctif	99	59.174	Oreochromis_niloticus
ENSMODG00000003464	CTIF	85	64.444	ENSOANG00000001337	CTIF	100	65.893	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	78.702	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	78.702	Oryctolagus_cuniculus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	54.045	ENSORLG00000005786	ctif	99	54.619	Oryzias_latipes
ENSMODG00000003464	CTIF	100	54.106	ENSORLG00020005385	ctif	99	54.708	Oryzias_latipes_hni
ENSMODG00000003464	CTIF	100	55.246	ENSORLG00015011872	ctif	99	55.868	Oryzias_latipes_hsok
ENSMODG00000003464	CTIF	99	51.324	ENSOMEG00000007917	ctif	99	51.765	Oryzias_melastigma
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.865	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	80.865	Otolemur_garnettii
ENSMODG00000003464	CTIF	100	78.833	ENSOARG00000003754	CTIF	100	78.833	Ovis_aries
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.032	ENSPPAG00000023554	CTIF	100	81.032	Pan_paniscus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.364	ENSPPRG00000002265	CTIF	100	81.364	Panthera_pardus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.032	ENSPTIG00000013761	CTIF	100	81.032	Panthera_tigris_altaica
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.032	ENSPTRG00000010009	CTIF	100	81.032	Pan_troglodytes
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.364	ENSPANG00000017087	CTIF	100	81.364	Papio_anubis
ENSMODG00000003464	CTIF	83	59.798	ENSPKIG00000011234	ctif	100	59.281	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMODG00000003464	CTIF	100	77.143	ENSPSIG00000006508	CTIF	100	77.143	Pelodiscus_sinensis
ENSMODG00000003464	CTIF	100	46.948	ENSPMGG00000022958	ctif	99	47.170	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.399	ENSPEMG00000022746	Ctif	100	80.399	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMODG00000003464	CTIF	81	96.681	ENSPCIG00000026247	CTIF	96	96.681	Phascolarctos_cinereus
ENSMODG00000003464	CTIF	99	58.265	ENSPFOG00000009243	ctif	99	58.265	Poecilia_formosa
ENSMODG00000003464	CTIF	99	54.777	ENSPLAG00000019171	ctif	99	54.416	Poecilia_latipinna
ENSMODG00000003464	CTIF	100	50.490	ENSPMEG00000020089	ctif	99	52.111	Poecilia_mexicana
ENSMODG00000003464	CTIF	100	48.451	ENSPREG00000017326	ctif	99	48.641	Poecilia_reticulata
ENSMODG00000003464	CTIF	83	80.709	ENSPPYG00000009147	CTIF	100	80.709	Pongo_abelii
ENSMODG00000003464	CTIF	100	78.607	ENSPCOG00000013391	CTIF	100	78.607	Propithecus_coquereli
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.431	ENSPVAG00000001965	CTIF	100	80.431	Pteropus_vampyrus
ENSMODG00000003464	CTIF	99	55.941	ENSPNYG00000007879	ctif	99	56.436	Pundamilia_nyererei
ENSMODG00000003464	CTIF	100	53.372	ENSPNAG00000029174	ctif	100	54.786	Pygocentrus_nattereri
ENSMODG00000003464	CTIF	100	79.534	ENSRNOG00000018342	Ctif	99	80.636	Rattus_norvegicus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.818	ENSRBIG00000043937	CTIF	100	81.818	Rhinopithecus_bieti
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.987	ENSRROG00000006039	CTIF	100	81.987	Rhinopithecus_roxellana
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.897	ENSSBOG00000028468	CTIF	100	80.897	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMODG00000003464	CTIF	100	96.422	ENSSHAG00000016321	CTIF	100	96.422	Sarcophilus_harrisii
ENSMODG00000003464	CTIF	100	58.407	ENSSFOG00015022594	ctif	100	58.493	Scleropages_formosus
ENSMODG00000003464	CTIF	99	57.923	ENSSMAG00000005707	ctif	99	58.348	Scophthalmus_maximus
ENSMODG00000003464	CTIF	92	68.675	ENSSDUG00000016033	ctif	93	68.675	Seriola_dumerili
ENSMODG00000003464	CTIF	91	63.989	ENSSLDG00000007282	ctif	99	53.195	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMODG00000003464	CTIF	100	80.471	ENSSPUG00000014734	CTIF	100	80.471	Sphenodon_punctatus
ENSMODG00000003464	CTIF	99	56.807	ENSSPAG00000003721	ctif	99	57.621	Stegastes_partitus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.513	ENSSSCG00000004506	CTIF	100	81.513	Sus_scrofa
ENSMODG00000003464	CTIF	97	75.164	ENSTGUG00000000030	CTIF	100	75.559	Taeniopygia_guttata
ENSMODG00000003464	CTIF	99	56.837	ENSTNIG00000018763	ctif	99	57.072	Tetraodon_nigroviridis
ENSMODG00000003464	CTIF	96	85.714	ENSTBEG00000002613	CTIF	90	85.714	Tupaia_belangeri
ENSMODG00000003464	CTIF	100	77.038	ENSTTRG00000004347	CTIF	100	77.038	Tursiops_truncatus
ENSMODG00000003464	CTIF	84	78.558	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	78.558	Ursus_americanus
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ENSMODG00000003464	CTIF	97	81.229	ENSVVUG00000014347	CTIF	100	81.561	Vulpes_vulpes
ENSMODG00000003464	CTIF	97	56.271	ENSXETG00000026836	ctif	97	56.271	Xenopus_tropicalis
ENSMODG00000003464	CTIF	67	57.143	ENSXCOG00000002477	ctif	85	57.143	Xiphophorus_couchianus
ENSMODG00000003464	CTIF	100	53.532	ENSXMAG00000004236	ctif	99	54.147	Xiphophorus_maculatus