EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMODG00000009335 (Gene tree)
Gene ID: 100018331
Gene Symbol: POLR1A
Alias: DKFZP586M0122|FLJ21915|RPA1|RPO1-4
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Monodelphis_domestica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 67001 bases
Position: chr1:717408558-717475558
Accession: 17264
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMODP00000011668	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	8.7e-91	1	1
ENSMODP00000011668	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	1.5e-24	1	1
ENSMODP00000011668	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	1.5e-70	1	1
ENSMODP00000011668	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	6.9e-37	1	1
ENSMODP00000011668	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	4.8e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMODT00000011888	POLR1A-201	5184	-	ENSMODP00000011668	1727 (aa)	-	F7GAY7

Gene Model

Click here to download ENSMODG00000009335's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
mdo03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMODG00000009335's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMODG00000009335	POLR1A	61	37.931	ENSMODG00000001036	POLR3A	73	37.931
ENSMODG00000009335	POLR1A	66	34.906	ENSMODG00000007009	-	56	34.906

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.058	ENSG00000068654	POLR1A	100	75.476	Homo_sapiens
ENSMODG00000009335	POLR1A	69	67.590	ENSAPOG00000017945	polr1a	99	67.758	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.201	ENSAMEG00000005807	POLR1A	100	81.837	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMODG00000009335	POLR1A	83	83.465	ENSACIG00000022147	polr1a	100	63.236	Amphilophus_citrinellus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	62.823	ENSAOCG00000017336	polr1a	100	64.136	Amphiprion_ocellaris
ENSMODG00000009335	POLR1A	94	69.388	ENSAPEG00000016105	polr1a	98	69.388	Amphiprion_percula
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	62.521	ENSATEG00000016773	polr1a	100	62.179	Anabas_testudineus
ENSMODG00000009335	POLR1A	86	68.510	ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	68.460	Anas_platyrhynchos
ENSMODG00000009335	POLR1A	99	65.577	ENSACAG00000012141	POLR1A	99	65.462	Anolis_carolinensis
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.453	ENSANAG00000033927	POLR1A	100	74.943	Aotus_nancymaae
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	58.381	ENSACLG00000020541	polr1a	100	58.324	Astatotilapia_calliptera
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.000	ENSBTAG00000006481	POLR1A	100	75.302	Bos_taurus
ENSMODG00000009335	POLR1A	99	37.340	WBGene00012999	rpoa-1	77	58.696	Caenorhabditis_elegans
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.108	ENSCJAG00000019547	POLR1A	100	74.468	Callithrix_jacchus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.684	ENSCAFG00000007613	POLR1A	100	74.856	Canis_familiaris
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.670	ENSCAFG00020014752	POLR1A	95	82.049	Canis_lupus_dingo
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.433	ENSCHIG00000018204	POLR1A	100	75.548	Capra_hircus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	73.705	ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	73.976	Carlito_syrichta
ENSMODG00000009335	POLR1A	97	70.076	ENSCAPG00000010132	POLR1A	100	70.678	Cavia_aperea
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.282	ENSCPOG00000012350	POLR1A	100	74.813	Cavia_porcellus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.396	ENSCCAG00000019839	POLR1A	100	74.770	Cebus_capucinus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.914	ENSCATG00000029786	POLR1A	100	75.316	Cercocebus_atys
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.384	ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	74.570	Chinchilla_lanigera
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.856	ENSCSAG00000016251	POLR1A	100	75.330	Chlorocebus_sabaeus
ENSMODG00000009335	POLR1A	99	71.313	ENSCPBG00000001115	POLR1A	99	71.182	Chrysemys_picta_bellii
ENSMODG00000009335	POLR1A	91	54.110	ENSCSAVG00000007184	-	93	63.200	Ciona_savignyi
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	72.238	ENSCANG00000031785	POLR1A	100	72.764	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMODG00000009335	POLR1A	77	81.624	ENSCGRG00001006651	Polr1a	100	80.095	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMODG00000009335	POLR1A	60	70.192	ENSCGRG00000010834	Polr1a	100	70.605	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	58.932	ENSCSEG00000020190	polr1a	100	59.219	Cynoglossus_semilaevis
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	61.222	ENSCVAG00000020941	polr1a	100	61.460	Cyprinodon_variegatus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	63.809	ENSDARG00000098375	polr1a	100	63.772	Danio_rerio
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	71.429	ENSDNOG00000010829	POLR1A	100	71.601	Dasypus_novemcinctus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	73.808	ENSDORG00000008298	Polr1a	100	73.923	Dipodomys_ordii
ENSMODG00000009335	POLR1A	86	63.934	FBgn0019938	RpI1	99	41.190	Drosophila_melanogaster
ENSMODG00000009335	POLR1A	72	93.750	ENSETEG00000000412	-	71	93.750	Echinops_telfairi
ENSMODG00000009335	POLR1A	77	66.667	ENSEBUG00000005667	-	91	66.667	Eptatretus_burgeri
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.489	ENSEASG00005001625	POLR1A	100	75.604	Equus_asinus_asinus
ENSMODG00000009335	POLR1A	95	82.523	ENSECAG00000030510	-	100	82.420	Equus_caballus
ENSMODG00000009335	POLR1A	95	82.523	ENSECAG00000036306	-	100	82.420	Equus_caballus
ENSMODG00000009335	POLR1A	95	82.523	ENSECAG00000010092	POLR1A	100	82.420	Equus_caballus
ENSMODG00000009335	POLR1A	73	92.126	ENSEEUG00000000676	POLR1A	81	92.126	Erinaceus_europaeus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	63.798	ENSELUG00000012769	polr1a	99	63.476	Esox_lucius
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.914	ENSFCAG00000008966	POLR1A	100	75.086	Felis_catus
ENSMODG00000009335	POLR1A	92	73.173	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	67.656	Ficedula_albicollis
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.134	ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	74.236	Fukomys_damarensis
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	60.276	ENSFHEG00000005996	polr1a	100	60.472	Fundulus_heteroclitus
ENSMODG00000009335	POLR1A	87	85.039	ENSGMOG00000002230	polr1a	100	57.431	Gadus_morhua
ENSMODG00000009335	POLR1A	80	73.415	ENSGALG00000038160	-	97	68.840	Gallus_gallus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	60.949	ENSGAFG00000015266	polr1a	100	60.914	Gambusia_affinis
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	60.726	ENSGACG00000018791	polr1a	100	61.089	Gasterosteus_aculeatus
ENSMODG00000009335	POLR1A	90	70.777	ENSGAGG00000004984	-	95	79.975	Gopherus_agassizii
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.058	ENSGGOG00000001788	POLR1A	100	75.476	Gorilla_gorilla
ENSMODG00000009335	POLR1A	88	63.449	ENSHBUG00000020021	polr1a	99	63.449	Haplochromis_burtoni
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	59.336	ENSHCOG00000003345	polr1a	96	63.510	Hippocampus_comes
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	62.400	ENSIPUG00000013174	polr1a	100	62.006	Ictalurus_punctatus
ENSMODG00000009335	POLR1A	99	74.856	ENSSTOG00000012580	POLR1A	99	75.202	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.014	ENSJJAG00000013113	Polr1a	100	74.871	Jaculus_jaculus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	62.147	ENSKMAG00000007399	polr1a	100	62.493	Kryptolebias_marmoratus
ENSMODG00000009335	POLR1A	76	69.973	ENSLBEG00000015401	polr1a	99	63.643	Labrus_bergylta
ENSMODG00000009335	POLR1A	53	75.461	ENSLACG00000003218	polr1a	100	75.163	Latimeria_chalumnae
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	66.302	ENSLOCG00000010881	polr1a	100	66.609	Lepisosteus_oculatus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.057	ENSLAFG00000014948	POLR1A	100	75.115	Loxodonta_africana
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.029	ENSMFAG00000046097	POLR1A	100	75.431	Macaca_fascicularis
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.029	ENSMMUG00000015815	POLR1A	100	75.431	Macaca_mulatta
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.029	ENSMNEG00000043313	POLR1A	100	75.431	Macaca_nemestrina
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.455	ENSMLEG00000042428	POLR1A	100	74.856	Mandrillus_leucophaeus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	61.859	ENSMAMG00000016565	polr1a	100	62.400	Mastacembelus_armatus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	62.207	ENSMZEG00005004915	polr1a	100	61.921	Maylandia_zebra
ENSMODG00000009335	POLR1A	80	72.845	ENSMGAG00000013111	POLR1A	99	67.837	Meleagris_gallopavo
ENSMODG00000009335	POLR1A	72	82.297	ENSMAUG00000008497	Polr1a	100	75.016	Mesocricetus_auratus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.289	ENSMICG00000000757	POLR1A	100	75.231	Microcebus_murinus
ENSMODG00000009335	POLR1A	94	82.105	ENSMOCG00000000122	Polr1a	100	75.143	Microtus_ochrogaster
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	61.076	ENSMMOG00000010216	polr1a	100	61.079	Mola_mola
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	61.667	ENSMALG00000013363	polr1a	100	61.525	Monopterus_albus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.140	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	100	74.140	Mus_caroli
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	73.612	ENSMUSG00000049553	Polr1a	100	73.911	Mus_musculus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.025	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	100	74.255	Mus_pahari
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	73.288	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	100	73.526	Mus_spretus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.029	ENSMPUG00000009135	POLR1A	100	75.144	Mustela_putorius_furo
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.555	ENSMLUG00000015723	POLR1A	100	74.899	Myotis_lucifugus
ENSMODG00000009335	POLR1A	80	81.727	ENSNGAG00000017907	Polr1a	100	74.842	Nannospalax_galili
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	61.552	ENSNBRG00000000519	polr1a	100	61.864	Neolamprologus_brichardi
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	73.161	ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	73.506	Nomascus_leucogenys
ENSMODG00000009335	POLR1A	74	96.850	ENSMEUG00000011665	-	74	96.850	Notamacropus_eugenii
ENSMODG00000009335	POLR1A	99	69.464	ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	69.289	Ochotona_princeps
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.033	ENSODEG00000003542	POLR1A	100	74.136	Octodon_degus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.618	ENSOCUG00000010138	POLR1A	100	75.906	Oryctolagus_cuniculus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	61.239	ENSORLG00000008753	polr1a	99	60.974	Oryzias_latipes
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	59.692	ENSORLG00020020726	polr1a	99	60.034	Oryzias_latipes_hni
ENSMODG00000009335	POLR1A	95	71.875	ENSORLG00015016071	polr1a	99	71.875	Oryzias_latipes_hsok
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.115	ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	75.115	Otolemur_garnettii
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.244	ENSOARG00000020601	POLR1A	100	75.416	Ovis_aries
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.827	ENSPPAG00000042450	POLR1A	100	75.245	Pan_paniscus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.971	ENSPPRG00000006702	POLR1A	100	75.086	Panthera_pardus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.541	ENSPTIG00000018783	POLR1A	100	74.656	Panthera_tigris_altaica
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.885	ENSPTRG00000012147	POLR1A	100	75.303	Pan_troglodytes
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.144	ENSPANG00000025908	POLR1A	100	75.545	Papio_anubis
ENSMODG00000009335	POLR1A	94	74.483	ENSPKIG00000005468	polr1a	98	74.483	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMODG00000009335	POLR1A	63	65.217	ENSPSIG00000009321	-	99	65.911	Pelodiscus_sinensis
ENSMODG00000009335	POLR1A	54	67.128	ENSPMGG00000009718	polr1a	95	67.128	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMODG00000009335	POLR1A	80	81.890	ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	75.316	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMODG00000009335	POLR1A	95	83.575	ENSPCIG00000004222	POLR1A	99	83.898	Phascolarctos_cinereus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	61.105	ENSPFOG00000005025	polr1a	100	61.276	Poecilia_formosa
ENSMODG00000009335	POLR1A	81	66.405	ENSPLAG00000021389	polr1a	100	61.517	Poecilia_latipinna
ENSMODG00000009335	POLR1A	80	64.023	ENSPMEG00000006463	polr1a	100	59.681	Poecilia_mexicana
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	61.697	ENSPREG00000002389	polr1a	100	61.433	Poecilia_reticulata
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.538	ENSPPYG00000012217	POLR1A	100	74.899	Pongo_abelii
ENSMODG00000009335	POLR1A	87	77.864	ENSPCAG00000011582	POLR1A	87	77.709	Procavia_capensis
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.751	ENSPCOG00000026987	POLR1A	100	75.635	Propithecus_coquereli
ENSMODG00000009335	POLR1A	75	80.275	ENSPVAG00000012674	POLR1A	95	74.386	Pteropus_vampyrus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	62.207	ENSPNYG00000000026	polr1a	100	61.921	Pundamilia_nyererei
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	63.360	ENSPNAG00000019223	polr1a	99	64.750	Pygocentrus_nattereri
ENSMODG00000009335	POLR1A	80	81.460	ENSRNOG00000009545	Polr1a	100	74.484	Rattus_norvegicus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.684	ENSRBIG00000028335	POLR1A	100	75.100	Rhinopithecus_bieti
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.684	ENSRROG00000031473	POLR1A	100	75.100	Rhinopithecus_roxellana
ENSMODG00000009335	POLR1A	86	42.276	YOR341W	RPA190	99	35.389	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.396	ENSSBOG00000030262	POLR1A	100	74.455	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	76.410	ENSSHAG00000014739	POLR1A	100	76.905	Sarcophilus_harrisii
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	64.507	ENSSFOG00015019716	polr1a	100	65.043	Scleropages_formosus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	61.848	ENSSMAG00000014342	polr1a	100	61.929	Scophthalmus_maximus
ENSMODG00000009335	POLR1A	80	67.786	ENSSDUG00000014631	polr1a	100	62.628	Seriola_dumerili
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	64.685	ENSSLDG00000024095	polr1a	98	70.423	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMODG00000009335	POLR1A	67	100.000	ENSSARG00000003136	-	69	100.000	Sorex_araneus
ENSMODG00000009335	POLR1A	93	74.620	ENSSPUG00000004215	POLR1A	99	73.665	Sphenodon_punctatus
ENSMODG00000009335	POLR1A	63	70.880	ENSSPAG00000016341	polr1a	95	70.162	Stegastes_partitus
ENSMODG00000009335	POLR1A	82	80.099	ENSSSCG00000008226	POLR1A	98	80.169	Sus_scrofa
ENSMODG00000009335	POLR1A	99	67.832	ENSTGUG00000010704	POLR1A	100	68.007	Taeniopygia_guttata
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	60.667	ENSTRUG00000002210	polr1a	97	64.338	Takifugu_rubripes
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	57.925	ENSTNIG00000010116	polr1a	100	57.943	Tetraodon_nigroviridis
ENSMODG00000009335	POLR1A	70	94.872	ENSTBEG00000008646	POLR1A	70	94.872	Tupaia_belangeri
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	71.116	ENSTTRG00000008597	POLR1A	100	71.404	Tursiops_truncatus
ENSMODG00000009335	POLR1A	69	72.742	ENSUAMG00000012158	-	94	73.077	Ursus_americanus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.281	ENSUMAG00000006700	POLR1A	97	80.993	Ursus_maritimus
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.684	ENSVVUG00000001245	POLR1A	100	74.856	Vulpes_vulpes
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	64.527	ENSXETG00000001952	polr1a	99	68.641	Xenopus_tropicalis
ENSMODG00000009335	POLR1A	100	61.276	ENSXMAG00000004032	polr1a	100	61.560	Xiphophorus_maculatus