EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMODG00000011347 (Gene tree)
Gene ID: 100020245
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Monodelphis_domestica
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 56714 bases
Position: chr2:205030757-205087470
Accession: 100020245
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMODP00000032663	GTP_EFTU	PF00009.27	2.4e-45	1	1
ENSMODP00000032663	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	9.1e-13	1	1
ENSMODP00000032663	EFG_IV	PF03764.18	1.9e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMODT00000034242	EFTUD2-201	7469	-	ENSMODP00000032663	972 (aa)	XP_001368226	F7D3I7

Gene Model

Click here to download ENSMODG00000011347's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
mdo03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMODG00000011347's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMODG00000011347	EFTUD2	87	38.373	ENSMODG00000000750	-	99	38.373
ENSMODG00000011347	EFTUD2	87	38.717	ENSMODG00000025340	-	99	38.717

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.284	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	92.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.486	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	88.786	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.580	Amphilophus_citrinellus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	87	88.235	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.235	Amphiprion_ocellaris
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.387	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.181	Amphiprion_percula
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.695	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.490	Anabas_testudineus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	99	94.645	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.645	Anas_platyrhynchos
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	97.840	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.840	Anolis_carolinensis
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.588	Aotus_nancymaae
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.284	ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	Astatotilapia_calliptera
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.709	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.709	Astyanax_mexicanus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.177	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.177	Bos_taurus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	99	70.041	WBGene00001166	eftu-2	99	69.835	Caenorhabditis_elegans
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.588	Callithrix_jacchus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.486	Canis_familiaris
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.486	Canis_lupus_dingo
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.177	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.177	Capra_hircus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.177	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.177	Carlito_syrichta
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.868	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.868	Cavia_aperea
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.868	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	Cavia_porcellus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.588	Cebus_capucinus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.588	Cercocebus_atys
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.765	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	Chinchilla_lanigera
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.588	Chlorocebus_sabaeus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	91	86.599	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.599	Choloepus_hoffmanni
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.868	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.868	Chrysemys_picta_bellii
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	77.641	ENSCING00000009372	-	100	77.641	Ciona_intestinalis
ENSMODG00000011347	EFTUD2	99	78.004	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.599	Ciona_savignyi
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.588	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.177	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.177	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.177	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.177	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.872	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.078	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.872	Cyprinodon_variegatus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.059	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	Danio_rerio
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.971	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.971	Dasypus_novemcinctus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.074	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.074	Dipodomys_ordii
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	74.974	FBgn0039566	CG4849	100	74.974	Drosophila_melanogaster
ENSMODG00000011347	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSMODG00000011347	EFTUD2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	Eptatretus_burgeri
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.486	Equus_asinus_asinus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.383	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.383	Equus_caballus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	90.947	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	Esox_lucius
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.383	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.383	Felis_catus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.045	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.045	Ficedula_albicollis
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.074	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.074	Fukomys_damarensis
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.181	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	91.975	Fundulus_heteroclitus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.255	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.667	Gadus_morhua
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.148	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	Gallus_gallus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.078	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.975	Gambusia_affinis
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.770	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	Gasterosteus_aculeatus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.588	Gorilla_gorilla
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.181	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	Haplochromis_burtoni
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.663	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.663	Heterocephalus_glaber_female
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.663	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.663	Heterocephalus_glaber_male
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.049	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.358	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	Ictalurus_punctatus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	93.313	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.313	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	96	99.252	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.252	Jaculus_jaculus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.770	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.564	Kryptolebias_marmoratus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	95	91.802	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.824	Labrus_bergylta
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	94.342	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	Latimeria_chalumnae
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.181	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.181	Lepisosteus_oculatus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.074	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	Loxodonta_africana
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.588	Macaca_fascicularis
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.588	Macaca_nemestrina
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.588	Mandrillus_leucophaeus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.490	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.284	Mastacembelus_armatus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.284	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	92.078	Maylandia_zebra
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.152	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.152	Meleagris_gallopavo
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.177	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.177	Mesocricetus_auratus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.588	Microcebus_murinus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	92	81.461	ENSMOCG00000017653	-	90	81.461	Microtus_ochrogaster
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.280	ENSMOCG00000009039	-	100	99.280	Microtus_ochrogaster
ENSMODG00000011347	EFTUD2	87	94.000	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	94.000	Mola_mola
ENSMODG00000011347	EFTUD2	87	92.235	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.235	Monopterus_albus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.971	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	98.971	Mus_caroli
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.971	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	98.971	Mus_musculus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.971	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	98.971	Mus_pahari
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.971	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	98.971	Mus_spretus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	97	99.258	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.258	Mustela_putorius_furo
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.486	Myotis_lucifugus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.177	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.177	Nannospalax_galili
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.181	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	Neolamprologus_brichardi
ENSMODG00000011347	EFTUD2	97	97.768	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.768	Nomascus_leucogenys
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	96.193	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	96.193	Notamacropus_eugenii
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.152	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.152	Ochotona_princeps
ENSMODG00000011347	EFTUD2	93	79.885	ENSODEG00000003385	-	100	79.885	Octodon_degus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.457	ENSODEG00000018041	-	100	98.457	Octodon_degus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.284	ENSONIG00000000912	eftud2	100	92.078	Oreochromis_niloticus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.486	Oryctolagus_cuniculus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.770	Oryzias_latipes
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.667	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.667	Oryzias_latipes_hni
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.667	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.464	Oryzias_latipes_hsok
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	97.325	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.325	Otolemur_garnettii
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.177	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.177	Ovis_aries
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.588	Pan_paniscus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.486	Panthera_pardus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.486	Panthera_tigris_altaica
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.588	Pan_troglodytes
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.588	Papio_anubis
ENSMODG00000011347	EFTUD2	93	97.354	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.354	Pelodiscus_sinensis
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	84.465	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.177	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.177	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.897	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.897	Phascolarctos_cinereus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.078	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.975	Poecilia_formosa
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.078	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.975	Poecilia_latipinna
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.078	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.975	Poecilia_mexicana
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.148	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.148	Pongo_abelii
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	95.473	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	Procavia_capensis
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.486	Propithecus_coquereli
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	94.547	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.547	Pteropus_vampyrus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.181	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.975	Pundamilia_nyererei
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.975	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	Pygocentrus_nattereri
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.971	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	98.971	Rattus_norvegicus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.486	Rhinopithecus_bieti
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.486	Rhinopithecus_roxellana
ENSMODG00000011347	EFTUD2	97	33.893	YKL173W	SNU114	97	33.597	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.588	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMODG00000011347	EFTUD2	97	99.787	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.787	Sarcophilus_harrisii
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.461	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.684	Scleropages_formosus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.078	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.872	Scophthalmus_maximus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.387	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	Seriola_dumerili
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.490	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	90.844	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.844	Sorex_araneus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	97.840	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.840	Sphenodon_punctatus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.490	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.284	Stegastes_partitus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.280	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.280	Sus_scrofa
ENSMODG00000011347	EFTUD2	84	97.445	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	Taeniopygia_guttata
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.461	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	Takifugu_rubripes
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	86.988	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	Tetraodon_nigroviridis
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	93.930	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.930	Tupaia_belangeri
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	90.638	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.638	Tursiops_truncatus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.357	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.357	Ursus_americanus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.486	Ursus_maritimus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.486	Vulpes_vulpes
ENSMODG00000011347	EFTUD2	97	95.096	ENSXETG00000003394	eftud2	98	96.083	Xenopus_tropicalis
ENSMODG00000011347	EFTUD2	81	93.622	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	Xiphophorus_couchianus
ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.078	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	Xiphophorus_maculatus