EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMODG00000014772 (Gene tree)
Gene ID: 100014271
Gene Symbol: MTRF1
Alias: MGC47721|MTTRF1|RF1
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Monodelphis_domestica
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 22913 bases
Position: chr7:164901445-164924357
Accession: 100014271
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMODP00000018475	RF-1	PF00472.20	1.7e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMODT00000018808	MTRF1-201	1332	XM_007501516	ENSMODP00000018475	444 (aa)	XP_007501578	F7G763

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMODG00000014772	MTRF1	72	48.438	ENSMODG00000008487	MTRF1L	80	48.438

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.378	ENSG00000120662	MTRF1	100	73.378	Homo_sapiens
ENSMODG00000014772	MTRF1	78	55.747	ENSAPOG00000010181	mtrf1	86	55.747	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	71.812	ENSAMEG00000008696	MTRF1	100	71.812	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMODG00000014772	MTRF1	52	66.812	ENSACIG00000001495	mtrf1	92	66.812	Amphilophus_citrinellus
ENSMODG00000014772	MTRF1	90	52.206	ENSAOCG00000002832	mtrf1	92	52.206	Amphiprion_ocellaris
ENSMODG00000014772	MTRF1	90	51.961	ENSAPEG00000014844	mtrf1	92	51.961	Amphiprion_percula
ENSMODG00000014772	MTRF1	77	58.017	ENSATEG00000017403	mtrf1	82	58.017	Anabas_testudineus
ENSMODG00000014772	MTRF1	85	68.700	ENSAPLG00000009317	MTRF1	87	68.700	Anas_platyrhynchos
ENSMODG00000014772	MTRF1	96	61.395	ENSACAG00000000897	MTRF1	95	61.395	Anolis_carolinensis
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	66.964	ENSANAG00000023063	-	100	66.964	Aotus_nancymaae
ENSMODG00000014772	MTRF1	77	76.901	ENSANAG00000025310	-	94	76.901	Aotus_nancymaae
ENSMODG00000014772	MTRF1	89	52.882	ENSACLG00000023945	mtrf1	87	52.882	Astatotilapia_calliptera
ENSMODG00000014772	MTRF1	52	66.094	ENSAMXG00000031859	mtrf1	97	66.094	Astyanax_mexicanus
ENSMODG00000014772	MTRF1	99	73.034	ENSBTAG00000012260	MTRF1	99	73.034	Bos_taurus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	70.694	ENSCJAG00000017739	MTRF1	100	78.736	Callithrix_jacchus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	70.444	ENSCAFG00000004795	MTRF1	100	70.444	Canis_familiaris
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	70.444	ENSCAFG00020018178	MTRF1	100	70.444	Canis_lupus_dingo
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	72.483	ENSCHIG00000011810	MTRF1	100	72.483	Capra_hircus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	71.588	ENSTSYG00000006976	MTRF1	100	71.588	Carlito_syrichta
ENSMODG00000014772	MTRF1	98	73.210	ENSCAPG00000013163	MTRF1	100	73.210	Cavia_aperea
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	71.588	ENSCPOG00000005264	MTRF1	100	71.588	Cavia_porcellus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	71.365	ENSCCAG00000035116	MTRF1	100	71.365	Cebus_capucinus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.378	ENSCATG00000009909	MTRF1	100	73.378	Cercocebus_atys
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	70.470	ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	70.470	Chinchilla_lanigera
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.154	ENSCSAG00000017835	MTRF1	100	73.154	Chlorocebus_sabaeus
ENSMODG00000014772	MTRF1	90	68.342	ENSCHOG00000011915	-	97	68.342	Choloepus_hoffmanni
ENSMODG00000014772	MTRF1	95	67.059	ENSCPBG00000007969	MTRF1	94	67.059	Chrysemys_picta_bellii
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.154	ENSCANG00000040353	MTRF1	100	73.154	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMODG00000014772	MTRF1	94	72.182	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	94	72.182	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMODG00000014772	MTRF1	94	72.182	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	94	72.182	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMODG00000014772	MTRF1	85	55.526	ENSCSEG00000005667	mtrf1	85	55.526	Cynoglossus_semilaevis
ENSMODG00000014772	MTRF1	90	52.956	ENSCVAG00000021729	mtrf1	94	52.956	Cyprinodon_variegatus
ENSMODG00000014772	MTRF1	53	54.274	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	54.274	Danio_rerio
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	72.160	ENSDNOG00000034196	MTRF1	100	81.935	Dasypus_novemcinctus
ENSMODG00000014772	MTRF1	99	71.076	ENSDORG00000016429	Mtrf1	100	71.076	Dipodomys_ordii
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	72.036	ENSETEG00000014811	MTRF1	100	72.036	Echinops_telfairi
ENSMODG00000014772	MTRF1	51	57.269	ENSEBUG00000000778	mtrf1	93	57.269	Eptatretus_burgeri
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	72.160	ENSEASG00005015715	MTRF1	100	72.160	Equus_asinus_asinus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	71.492	ENSECAG00000014389	MTRF1	97	71.492	Equus_caballus
ENSMODG00000014772	MTRF1	95	56.604	ENSEEUG00000004450	-	95	57.075	Erinaceus_europaeus
ENSMODG00000014772	MTRF1	86	52.865	ENSELUG00000006544	mtrf1	89	52.865	Esox_lucius
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	70.694	ENSFCAG00000031635	MTRF1	100	70.694	Felis_catus
ENSMODG00000014772	MTRF1	85	67.905	ENSFALG00000008036	MTRF1	94	67.905	Ficedula_albicollis
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	70.246	ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	70.246	Fukomys_damarensis
ENSMODG00000014772	MTRF1	84	54.155	ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	54.155	Fundulus_heteroclitus
ENSMODG00000014772	MTRF1	85	50.529	ENSGMOG00000008608	mtrf1	99	50.529	Gadus_morhua
ENSMODG00000014772	MTRF1	86	69.010	ENSGALG00000016951	MTRF1	84	69.010	Gallus_gallus
ENSMODG00000014772	MTRF1	86	54.474	ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	54.474	Gambusia_affinis
ENSMODG00000014772	MTRF1	84	55.556	ENSGACG00000013728	mtrf1	98	55.556	Gasterosteus_aculeatus
ENSMODG00000014772	MTRF1	69	75.570	ENSGAGG00000025696	MTRF1	97	75.570	Gopherus_agassizii
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.154	ENSGGOG00000002529	MTRF1	100	73.154	Gorilla_gorilla
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	71.365	ENSHGLG00000003210	MTRF1	100	71.365	Heterocephalus_glaber_female
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	71.365	ENSHGLG00100011843	MTRF1	100	71.365	Heterocephalus_glaber_male
ENSMODG00000014772	MTRF1	90	48.235	ENSHCOG00000009449	mtrf1	96	48.235	Hippocampus_comes
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	71.365	ENSSTOG00000021682	MTRF1	100	71.365	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	71.875	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	100	71.875	Jaculus_jaculus
ENSMODG00000014772	MTRF1	86	54.308	ENSKMAG00000003231	mtrf1	85	54.308	Kryptolebias_marmoratus
ENSMODG00000014772	MTRF1	52	65.236	ENSLBEG00000023151	mtrf1	94	65.236	Labrus_bergylta
ENSMODG00000014772	MTRF1	52	65.236	ENSLBEG00000027169	-	94	65.236	Labrus_bergylta
ENSMODG00000014772	MTRF1	86	66.319	ENSLACG00000010582	MTRF1	95	61.502	Latimeria_chalumnae
ENSMODG00000014772	MTRF1	98	54.955	ENSLOCG00000005937	MTRF1	98	54.955	Lepisosteus_oculatus
ENSMODG00000014772	MTRF1	99	58.014	ENSLAFG00000030499	-	99	58.014	Loxodonta_africana
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	71.812	ENSLAFG00000022177	-	100	71.812	Loxodonta_africana
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.154	ENSMFAG00000037972	MTRF1	100	73.154	Macaca_fascicularis
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.378	ENSMNEG00000035487	MTRF1	100	73.378	Macaca_nemestrina
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.378	ENSMLEG00000033582	MTRF1	100	73.378	Mandrillus_leucophaeus
ENSMODG00000014772	MTRF1	84	56.836	ENSMAMG00000022048	mtrf1	84	56.836	Mastacembelus_armatus
ENSMODG00000014772	MTRF1	89	52.882	ENSMZEG00005017922	mtrf1	87	52.882	Maylandia_zebra
ENSMODG00000014772	MTRF1	88	67.436	ENSMGAG00000014971	MTRF1	93	67.436	Meleagris_gallopavo
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	70.156	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	100	70.156	Mesocricetus_auratus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.154	ENSMICG00000033131	MTRF1	100	73.154	Microcebus_murinus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	69.866	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	100	69.866	Microtus_ochrogaster
ENSMODG00000014772	MTRF1	52	58.952	ENSMMOG00000013394	mtrf1	94	58.952	Mola_mola
ENSMODG00000014772	MTRF1	85	55.026	ENSMALG00000013274	mtrf1	86	55.026	Monopterus_albus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	68.610	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	99	68.610	Mus_caroli
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	69.283	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	100	69.283	Mus_musculus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	69.731	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	100	69.731	Mus_pahari
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	69.731	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	100	69.731	Mus_spretus
ENSMODG00000014772	MTRF1	99	72.072	ENSMPUG00000001874	MTRF1	99	72.072	Mustela_putorius_furo
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	72.483	ENSMLUG00000017237	MTRF1	100	72.483	Myotis_lucifugus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	72.707	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	100	72.707	Nannospalax_galili
ENSMODG00000014772	MTRF1	52	64.378	ENSNBRG00000004634	mtrf1	98	64.378	Neolamprologus_brichardi
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.826	ENSNLEG00000001236	MTRF1	100	73.826	Nomascus_leucogenys
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	82.432	ENSMEUG00000001846	MTRF1	100	82.432	Notamacropus_eugenii
ENSMODG00000014772	MTRF1	69	48.534	ENSOPRG00000006450	-	93	48.534	Ochotona_princeps
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	71.141	ENSODEG00000005782	MTRF1	100	71.141	Octodon_degus
ENSMODG00000014772	MTRF1	86	54.569	ENSONIG00000012476	mtrf1	99	54.569	Oreochromis_niloticus
ENSMODG00000014772	MTRF1	70	73.885	ENSOANG00000003383	-	99	73.885	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	71.812	ENSOCUG00000025207	MTRF1	100	71.812	Oryctolagus_cuniculus
ENSMODG00000014772	MTRF1	86	55.091	ENSORLG00000003225	mtrf1	87	55.091	Oryzias_latipes
ENSMODG00000014772	MTRF1	86	55.614	ENSORLG00020021048	mtrf1	86	55.614	Oryzias_latipes_hni
ENSMODG00000014772	MTRF1	86	55.091	ENSORLG00015020957	mtrf1	87	55.091	Oryzias_latipes_hsok
ENSMODG00000014772	MTRF1	96	51.522	ENSOMEG00000002022	mtrf1	96	51.522	Oryzias_melastigma
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	68.456	ENSOGAG00000009719	-	100	68.456	Otolemur_garnettii
ENSMODG00000014772	MTRF1	73	68.405	ENSOGAG00000026411	-	100	68.405	Otolemur_garnettii
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	72.036	ENSOARG00000006994	MTRF1	100	72.036	Ovis_aries
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.378	ENSPPAG00000000050	MTRF1	100	73.378	Pan_paniscus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	71.141	ENSPPRG00000009511	MTRF1	100	71.141	Panthera_pardus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	70.917	ENSPTIG00000006673	MTRF1	100	70.917	Panthera_tigris_altaica
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.378	ENSPTRG00000005815	MTRF1	100	73.378	Pan_troglodytes
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.378	ENSPANG00000010809	MTRF1	100	73.378	Papio_anubis
ENSMODG00000014772	MTRF1	86	53.927	ENSPKIG00000015711	mtrf1	89	53.927	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMODG00000014772	MTRF1	87	70.361	ENSPSIG00000004773	MTRF1	86	70.361	Pelodiscus_sinensis
ENSMODG00000014772	MTRF1	54	65.966	ENSPMGG00000006724	mtrf1	97	65.966	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	69.420	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	100	69.420	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMODG00000014772	MTRF1	70	55.238	ENSPMAG00000009849	mtrf1	90	55.238	Petromyzon_marinus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	86.712	ENSPCIG00000012940	MTRF1	100	86.712	Phascolarctos_cinereus
ENSMODG00000014772	MTRF1	85	54.787	ENSPFOG00000000254	mtrf1	86	54.787	Poecilia_formosa
ENSMODG00000014772	MTRF1	85	55.319	ENSPLAG00000014280	mtrf1	86	55.319	Poecilia_latipinna
ENSMODG00000014772	MTRF1	85	54.521	ENSPMEG00000023245	mtrf1	86	54.521	Poecilia_mexicana
ENSMODG00000014772	MTRF1	52	63.519	ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.519	Poecilia_reticulata
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	72.483	ENSPPYG00000005313	MTRF1	100	72.483	Pongo_abelii
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.378	ENSPCOG00000018133	MTRF1	100	73.378	Propithecus_coquereli
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	71.365	ENSPVAG00000008573	MTRF1	100	71.365	Pteropus_vampyrus
ENSMODG00000014772	MTRF1	52	65.665	ENSPNYG00000004357	mtrf1	94	65.665	Pundamilia_nyererei
ENSMODG00000014772	MTRF1	87	53.316	ENSPNAG00000010682	mtrf1	90	53.316	Pygocentrus_nattereri
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	69.799	ENSRNOG00000047106	Mtrf1	93	78.761	Rattus_norvegicus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.154	ENSRBIG00000007069	MTRF1	100	73.154	Rhinopithecus_bieti
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.154	ENSRROG00000035345	MTRF1	100	73.154	Rhinopithecus_roxellana
ENSMODG00000014772	MTRF1	85	77.513	ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	77.513	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMODG00000014772	MTRF1	92	86.064	ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	86.064	Sarcophilus_harrisii
ENSMODG00000014772	MTRF1	87	53.807	ENSSFOG00015006191	mtrf1	89	53.807	Scleropages_formosus
ENSMODG00000014772	MTRF1	87	54.756	ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	54.756	Scophthalmus_maximus
ENSMODG00000014772	MTRF1	86	55.469	ENSSDUG00000022608	mtrf1	75	55.469	Seriola_dumerili
ENSMODG00000014772	MTRF1	86	55.729	ENSSLDG00000013584	mtrf1	75	55.729	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	68.820	ENSSARG00000002306	MTRF1	100	68.820	Sorex_araneus
ENSMODG00000014772	MTRF1	53	72.340	ENSSPUG00000007354	MTRF1	97	72.340	Sphenodon_punctatus
ENSMODG00000014772	MTRF1	89	52.357	ENSSPAG00000000881	mtrf1	91	52.357	Stegastes_partitus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	72.036	ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	72.036	Sus_scrofa
ENSMODG00000014772	MTRF1	90	65.075	ENSTGUG00000012422	MTRF1	96	65.075	Taeniopygia_guttata
ENSMODG00000014772	MTRF1	86	55.469	ENSTRUG00000000396	mtrf1	85	55.469	Takifugu_rubripes
ENSMODG00000014772	MTRF1	83	56.522	ENSTNIG00000017149	-	99	55.759	Tetraodon_nigroviridis
ENSMODG00000014772	MTRF1	54	71.548	ENSTBEG00000004696	-	100	71.548	Tupaia_belangeri
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	73.602	ENSTTRG00000010370	MTRF1	100	73.602	Tursiops_truncatus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	72.260	ENSUMAG00000014772	MTRF1	100	72.260	Ursus_maritimus
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	72.284	ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	72.284	Vicugna_pacos
ENSMODG00000014772	MTRF1	100	70.667	ENSVVUG00000028755	MTRF1	100	70.667	Vulpes_vulpes
ENSMODG00000014772	MTRF1	86	63.874	ENSXETG00000018904	mtrf1	98	63.874	Xenopus_tropicalis
ENSMODG00000014772	MTRF1	85	54.787	ENSXMAG00000009853	mtrf1	85	54.787	Xiphophorus_maculatus