EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMODG00000015052 (Gene tree)
Gene ID: 100023792
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Monodelphis_domestica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11070 bases
Position: chr2:268186032-268197101
Accession: 100023792
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMODP00000018825	rRNA_proc-arch	PF13234.6	9.7e-39	1	1
ENSMODP00000018825	DEAD	PF00270.29	1.7e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMODT00000019164	SKIV2L-201	3760	XM_001369014	ENSMODP00000018825	1249 (aa)	XP_001369051	F7FUK8

Gene Model

Click here to download ENSMODG00000015052's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
mdo03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMODG00000015052's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMODG00000015052	SKIV2L	76	36.117	ENSMODG00000019494	MTREX	88	36.117

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.990	ENSG00000204351	SKIV2L	98	92.697	Homo_sapiens
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.746	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	61.587	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.910	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	87.910	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.657	ENSACIG00000016719	skiv2l	100	60.016	Amphilophus_citrinellus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.984	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	61.587	Amphiprion_ocellaris
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.825	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	61.474	Amphiprion_percula
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.226	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	60.845	Anabas_testudineus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	66.353	ENSACAG00000011746	SKIV2L	100	66.223	Anolis_carolinensis
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	88.471	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	88.471	Aotus_nancymaae
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	62.203	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.569	Astatotilapia_calliptera
ENSMODG00000015052	SKIV2L	98	59.936	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.763	Astyanax_mexicanus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.910	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	87.910	Bos_taurus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	96	39.443	WBGene00008502	skih-2	78	44.821	Caenorhabditis_elegans
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.590	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	87.590	Callithrix_jacchus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	98	88.192	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	87.830	Canis_familiaris
ENSMODG00000015052	SKIV2L	98	88.192	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	87.830	Canis_lupus_dingo
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.670	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	87.670	Capra_hircus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.030	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	87.030	Carlito_syrichta
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	86.069	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	85.203	Cavia_porcellus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.910	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	87.910	Cebus_capucinus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.830	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	87.830	Cercocebus_atys
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	86.709	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	86.709	Chinchilla_lanigera
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.670	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	87.670	Chlorocebus_sabaeus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	87	64.630	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	92	65.593	Chrysemys_picta_bellii
ENSMODG00000015052	SKIV2L	93	51.315	ENSCING00000005576	-	83	55.831	Ciona_intestinalis
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	87.901	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	87.901	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.360	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	87.360	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.563	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	61.722	Cynoglossus_semilaevis
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.532	ENSCVAG00000003072	skiv2l	96	67.218	Cyprinodon_variegatus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.914	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	60.537	Danio_rerio
ENSMODG00000015052	SKIV2L	94	88.506	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	83.133	Dasypus_novemcinctus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	93	44.054	FBgn0039117	tst	97	43.755	Drosophila_melanogaster
ENSMODG00000015052	SKIV2L	69	90.123	ENSETEG00000009522	SKIV2L	71	93.243	Echinops_telfairi
ENSMODG00000015052	SKIV2L	90	56.820	ENSEBUG00000013680	-	71	64.331	Eptatretus_burgeri
ENSMODG00000015052	SKIV2L	93	89.922	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	89.922	Equus_asinus_asinus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	96	87.762	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	88.335	Equus_caballus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	52	94.466	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	94.466	Erinaceus_europaeus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.374	ENSELUG00000000181	skiv2l	99	65.248	Esox_lucius
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	88.871	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	88.871	Felis_catus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	83.520	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	83.440	Fukomys_damarensis
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.965	ENSFHEG00000008853	skiv2l	96	67.805	Fundulus_heteroclitus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.064	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	60.096	Gadus_morhua
ENSMODG00000015052	SKIV2L	79	60.988	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	62.126	Gallus_gallus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.788	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.429	Gambusia_affinis
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.859	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	60.766	Gasterosteus_aculeatus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.910	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	87.910	Gorilla_gorilla
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	62.044	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.410	Haplochromis_burtoni
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	85.212	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	85.132	Heterocephalus_glaber_female
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	82.814	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	82.734	Heterocephalus_glaber_male
ENSMODG00000015052	SKIV2L	98	59.561	ENSHCOG00000007191	skiv2l	97	67.081	Hippocampus_comes
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.141	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	60.224	Ictalurus_punctatus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	88.070	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	88.070	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	71	60.671	ENSLACG00000002986	-	75	59.135	Latimeria_chalumnae
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	88.070	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	88.070	Loxodonta_africana
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.670	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	87.670	Macaca_fascicularis
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.590	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	87.590	Macaca_mulatta
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.590	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	87.590	Macaca_nemestrina
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.670	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	87.670	Mandrillus_leucophaeus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.965	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.270	Mastacembelus_armatus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	62.044	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.410	Maylandia_zebra
ENSMODG00000015052	SKIV2L	70	52.049	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	59	49.386	Meleagris_gallopavo
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	86.720	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	86.880	Mesocricetus_auratus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.510	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	87.510	Microcebus_murinus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	86.320	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	86.240	Microtus_ochrogaster
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.974	ENSMMOG00000014547	skiv2l	96	67.909	Mola_mola
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.321	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	60.209	Monopterus_albus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	86.800	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	86.800	Mus_caroli
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	86.960	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	86.960	Mus_musculus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	86.800	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	86.800	Mus_pahari
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	86.560	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	86.560	Mus_spretus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.830	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	87.830	Mustela_putorius_furo
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.030	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	87.030	Myotis_lucifugus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.373	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	60.894	Neolamprologus_brichardi
ENSMODG00000015052	SKIV2L	98	85.981	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	85.795	Nomascus_leucogenys
ENSMODG00000015052	SKIV2L	78	98.230	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	98.230	Notamacropus_eugenii
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.510	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	87.510	Ochotona_princeps
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	86.069	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	86.069	Octodon_degus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	62.440	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.300	Oreochromis_niloticus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	88.391	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	88.391	Oryctolagus_cuniculus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	62.006	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	62.074	Oryzias_latipes
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.927	ENSORLG00020009462	skiv2l	97	65.708	Oryzias_latipes_hni
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.563	ENSORLG00015016750	skiv2l	96	65.641	Oryzias_latipes_hsok
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	62.272	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	62.033	Oryzias_melastigma
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.750	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	87.750	Otolemur_garnettii
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	82.616	ENSOARG00000002411	-	100	82.707	Ovis_aries
ENSMODG00000015052	SKIV2L	98	87.379	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	87.260	Pan_paniscus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	88.551	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	88.551	Panthera_pardus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.990	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	87.990	Panthera_tigris_altaica
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.990	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	87.990	Pan_troglodytes
ENSMODG00000015052	SKIV2L	98	86.721	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	86.608	Papio_anubis
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.835	ENSPKIG00000011876	skiv2l	95	67.218	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.320	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	60.720	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.200	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	87.200	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	97.520	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	97.520	Phascolarctos_cinereus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.807	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	61.429	Poecilia_formosa
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.776	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.398	Poecilia_latipinna
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.886	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	61.508	Poecilia_mexicana
ENSMODG00000015052	SKIV2L	93	67.288	ENSPREG00000002277	skiv2l	97	67.288	Poecilia_reticulata
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.670	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	87.670	Pongo_abelii
ENSMODG00000015052	SKIV2L	77	89.423	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	89.423	Procavia_capensis
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	88.231	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	88.231	Propithecus_coquereli
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	86.869	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	86.869	Pteropus_vampyrus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	93	67.632	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	67.632	Pundamilia_nyererei
ENSMODG00000015052	SKIV2L	98	61.409	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	61.367	Pygocentrus_nattereri
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.200	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	87.200	Rattus_norvegicus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	98	85.772	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	85.612	Rhinopithecus_bieti
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.910	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	87.910	Rhinopithecus_roxellana
ENSMODG00000015052	SKIV2L	93	37.693	YLR398C	-	77	41.043	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	88.070	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	88.070	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	96.557	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	95.516	Sarcophilus_harrisii
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	62.077	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.405	Scleropages_formosus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.293	ENSSMAG00000020185	skiv2l	95	66.149	Scophthalmus_maximus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	62.520	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	62.282	Seriola_dumerili
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.901	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	59.904	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	63.305	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	62.568	Sphenodon_punctatus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	94	61.558	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	61.558	Stegastes_partitus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	88.551	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	88.551	Sus_scrofa
ENSMODG00000015052	SKIV2L	85	55.201	ENSTRUG00000000966	skiv2l	93	59.244	Takifugu_rubripes
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.398	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	60.159	Tetraodon_nigroviridis
ENSMODG00000015052	SKIV2L	94	88.466	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	88.466	Tupaia_belangeri
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	83.106	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	83.106	Tursiops_truncatus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	87.910	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	87.910	Ursus_americanus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	93	89.320	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	89.320	Ursus_maritimus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	98	88.029	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	87.772	Vulpes_vulpes
ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	59.062	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.824	Xenopus_tropicalis
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	62.099	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	61.576	Xiphophorus_couchianus
ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.599	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	61.190	Xiphophorus_maculatus