EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMODG00000018493 (Gene tree)
Gene ID: 100617644
Gene Symbol: SRPRB
Alias: APMCF1|SR-beta
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Monodelphis_domestica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 29478 bases
Position: chr4:94218280-94247757
Accession: 100617644
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMODP00000023054	MMR_HSR1	PF01926.23	3.2e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMODT00000023466	SRPRB-201	2818	XM_003341205	ENSMODP00000023054	268 (aa)	XP_003341253	F7BRN2

Gene Model

Click here to download ENSMODG00000018493's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
mdo03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMODG00000018493's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	83.026	ENSG00000144867	SRPRB	99	88.050	Homo_sapiens
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	84.556	ENSANAG00000028236	SRPRB	96	84.556	Aotus_nancymaae
ENSMODG00000018493	SRPRB	95	85.827	ENSBTAG00000044075	SRPRB	92	83.026	Bos_taurus
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	84.556	ENSCJAG00000002845	SRPRB	96	84.556	Callithrix_jacchus
ENSMODG00000018493	SRPRB	95	87.795	ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	85.240	Canis_lupus_dingo
ENSMODG00000018493	SRPRB	95	85.433	ENSCHIG00000019717	SRPRB	100	82.657	Capra_hircus
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	81.481	ENSTSYG00000031948	SRPRB	100	81.481	Carlito_syrichta
ENSMODG00000018493	SRPRB	96	78.682	ENSCPOG00000030107	SRPRB	95	78.682	Cavia_porcellus
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	83.398	ENSCCAG00000033027	SRPRB	96	83.398	Cebus_capucinus
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	86.100	ENSCATG00000033438	SRPRB	96	86.100	Cercocebus_atys
ENSMODG00000018493	SRPRB	98	83.588	ENSCLAG00000002810	SRPRB	97	83.588	Chinchilla_lanigera
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	86.100	ENSCSAG00000010699	SRPRB	96	86.100	Chlorocebus_sabaeus
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	75.556	ENSCHOG00000011792	SRPRB	100	75.556	Choloepus_hoffmanni
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	67.528	ENSCANG00000043327	SRPRB	100	67.528	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	82.528	ENSCGRG00001018121	Srprb	100	82.528	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMODG00000018493	SRPRB	96	84.556	ENSCGRG00000014367	Srprb	99	84.556	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	83.398	ENSDNOG00000032146	SRPRB	96	83.398	Dasypus_novemcinctus
ENSMODG00000018493	SRPRB	87	81.897	ENSDORG00000000764	Srprb	85	84.862	Dipodomys_ordii
ENSMODG00000018493	SRPRB	94	86.561	ENSEASG00005003967	SRPRB	100	83.026	Equus_asinus_asinus
ENSMODG00000018493	SRPRB	94	86.561	ENSECAG00000036666	SRPRB	100	83.026	Equus_caballus
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	83.764	ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	83.764	Felis_catus
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	85.328	ENSFDAG00000017529	SRPRB	96	85.328	Fukomys_damarensis
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	83.395	ENSGGOG00000027849	SRPRB	100	83.395	Gorilla_gorilla
ENSMODG00000018493	SRPRB	94	85.771	ENSHGLG00000016818	SRPRB	100	82.288	Heterocephalus_glaber_female
ENSMODG00000018493	SRPRB	94	85.771	ENSHGLG00100018893	SRPRB	100	82.288	Heterocephalus_glaber_male
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	77.122	ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	77.122	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	86.100	ENSMFAG00000039758	SRPRB	96	86.100	Macaca_fascicularis
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	86.100	ENSMMUG00000008918	SRPRB	96	86.100	Macaca_mulatta
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	86.100	ENSMNEG00000032832	SRPRB	96	86.100	Macaca_nemestrina
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	86.100	ENSMLEG00000035589	SRPRB	96	86.100	Mandrillus_leucophaeus
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	82.900	ENSMAUG00000021695	Srprb	100	82.900	Mesocricetus_auratus
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	82.288	ENSMICG00000048959	SRPRB	100	82.288	Microcebus_murinus
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	82.900	MGP_CAROLIEiJ_G0032586	Srprb	100	82.900	Mus_caroli
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	82.528	ENSMUSG00000032553	Srprb	100	82.528	Mus_musculus
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	83.271	MGP_PahariEiJ_G0015454	Srprb	100	83.271	Mus_pahari
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	82.900	MGP_SPRETEiJ_G0033731	Srprb	100	82.900	Mus_spretus
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	84.942	ENSMPUG00000009687	SRPRB	96	84.942	Mustela_putorius_furo
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	81.784	ENSNGAG00000024311	-	100	81.784	Nannospalax_galili
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	85.328	ENSNLEG00000003655	SRPRB	96	85.328	Nomascus_leucogenys
ENSMODG00000018493	SRPRB	94	85.771	ENSODEG00000018092	SRPRB	100	82.288	Octodon_degus
ENSMODG00000018493	SRPRB	94	85.375	ENSOCUG00000007623	SRPRB	100	82.288	Oryctolagus_cuniculus
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	82.657	ENSOGAG00000005243	SRPRB	100	82.657	Otolemur_garnettii
ENSMODG00000018493	SRPRB	86	83.913	ENSOARG00000008412	SRPRB	92	87.156	Ovis_aries
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	83.026	ENSPPAG00000023940	SRPRB	100	83.026	Pan_paniscus
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	83.764	ENSPPRG00000023305	SRPRB	100	83.764	Panthera_pardus
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	83.764	ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	83.764	Panthera_tigris_altaica
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	83.026	ENSPTRG00000015413	SRPRB	100	83.026	Pan_troglodytes
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	86.100	ENSPANG00000023015	SRPRB	96	86.100	Papio_anubis
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	82.528	ENSPEMG00000017954	Srprb	100	82.528	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	82.657	ENSPPYG00000014115	SRPRB	100	82.657	Pongo_abelii
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	77.407	ENSPCAG00000013823	SRPRB	100	77.407	Procavia_capensis
ENSMODG00000018493	SRPRB	98	86.260	ENSPVAG00000011319	SRPRB	97	86.260	Pteropus_vampyrus
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	86.100	ENSRBIG00000027819	SRPRB	96	86.100	Rhinopithecus_bieti
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	86.100	ENSRROG00000030536	SRPRB	96	86.100	Rhinopithecus_roxellana
ENSMODG00000018493	SRPRB	71	84.656	ENSSBOG00000015129	SRPRB	94	84.656	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMODG00000018493	SRPRB	98	84.791	ENSSARG00000012943	SRPRB	97	84.791	Sorex_araneus
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	81.919	ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	81.919	Sus_scrofa
ENSMODG00000018493	SRPRB	94	84.190	ENSTBEG00000006116	SRPRB	97	83.206	Tupaia_belangeri
ENSMODG00000018493	SRPRB	100	75.646	ENSTTRG00000007802	SRPRB	100	75.646	Tursiops_truncatus
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	84.942	ENSUAMG00000018135	SRPRB	96	84.942	Ursus_americanus
ENSMODG00000018493	SRPRB	97	84.556	ENSUMAG00000015817	SRPRB	96	84.556	Ursus_maritimus
ENSMODG00000018493	SRPRB	95	88.189	ENSVVUG00000005707	SRPRB	100	85.240	Vulpes_vulpes