EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMODG00000025156 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Monodelphis_domestica
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 116159 bases
Position: chr7:72129471-72245629
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMODP00000037206	Transposase_22	PF02994.14	0.00011	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMODT00000038805	-	972	-	ENSMODP00000037206	324 (aa)	-	F7GHX4

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMODG00000025156	-	56	42.708	ENSMODG00000029399	-	62	42.708
ENSMODG00000025156	-	79	33.835	ENSMODG00000028981	-	94	33.835
ENSMODG00000025156	-	90	36.093	ENSMODG00000028543	-	89	36.093
ENSMODG00000025156	-	52	44.000	ENSMODG00000029088	-	76	44.000
ENSMODG00000025156	-	75	38.306	ENSMODG00000029086	-	88	38.306
ENSMODG00000025156	-	55	42.180	ENSMODG00000029087	-	77	42.180
ENSMODG00000025156	-	85	62.581	ENSMODG00000011162	-	84	62.581
ENSMODG00000025156	-	89	36.455	ENSMODG00000027417	-	86	36.455
ENSMODG00000025156	-	61	61.039	ENSMODG00000028619	-	87	61.039
ENSMODG00000025156	-	56	42.708	ENSMODG00000027636	-	62	42.708
ENSMODG00000025156	-	54	42.703	ENSMODG00000027830	-	68	42.703
ENSMODG00000025156	-	90	36.246	ENSMODG00000029382	-	89	36.246
ENSMODG00000025156	-	56	42.708	ENSMODG00000027744	-	62	42.708
ENSMODG00000025156	-	77	60.900	ENSMODG00000029779	-	85	60.900
ENSMODG00000025156	-	64	75.210	ENSMODG00000029256	-	86	75.210
ENSMODG00000025156	-	82	49.688	ENSMODG00000025279	-	89	49.688
ENSMODG00000025156	-	89	68.438	ENSMODG00000028239	-	85	68.438
ENSMODG00000025156	-	51	41.477	ENSMODG00000028234	-	67	41.477
ENSMODG00000025156	-	90	35.117	ENSMODG00000028237	-	89	35.117
ENSMODG00000025156	-	88	64.241	ENSMODG00000027891	-	90	64.688
ENSMODG00000025156	-	89	37.209	ENSMODG00000029533	-	90	37.209
ENSMODG00000025156	-	56	42.708	ENSMODG00000029536	-	80	42.708
ENSMODG00000025156	-	80	37.262	ENSMODG00000028522	-	86	37.262
ENSMODG00000025156	-	59	62.500	ENSMODG00000029221	-	83	62.500
ENSMODG00000025156	-	90	36.093	ENSMODG00000027364	-	90	36.093
ENSMODG00000025156	-	80	58.784	ENSMODG00000024707	-	90	58.784
ENSMODG00000025156	-	78	56.202	ENSMODG00000024673	-	79	56.202
ENSMODG00000025156	-	89	68.750	ENSMODG00000029520	-	85	68.750
ENSMODG00000025156	-	75	38.710	ENSMODG00000029512	-	88	38.710
ENSMODG00000025156	-	85	56.090	ENSMODG00000010276	-	84	56.090
ENSMODG00000025156	-	63	75.641	ENSMODG00000027575	-	68	76.050
ENSMODG00000025156	-	75	38.306	ENSMODG00000027571	-	88	38.306
ENSMODG00000025156	-	54	57.222	ENSMODG00000023935	-	93	57.222
ENSMODG00000025156	-	75	38.710	ENSMODG00000027460	-	88	38.710
ENSMODG00000025156	-	89	36.455	ENSMODG00000029519	-	86	36.455
ENSMODG00000025156	-	90	36.424	ENSMODG00000028506	-	89	36.424
ENSMODG00000025156	-	89	66.875	ENSMODG00000028503	-	82	66.875
ENSMODG00000025156	-	89	34.114	ENSMODG00000027342	-	85	34.114
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ENSMODG00000025156	-	75	38.710	ENSMODG00000028415	-	88	38.710
ENSMODG00000025156	-	79	57.045	ENSMODG00000025406	-	88	57.045
ENSMODG00000025156	-	90	36.093	ENSMODG00000028517	-	89	36.093
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ENSMODG00000025156	-	84	36.396	ENSMODG00000028512	-	94	36.396
ENSMODG00000025156	-	70	62.791	ENSMODG00000028421	-	99	62.791
ENSMODG00000025156	-	71	37.229	ENSMODG00000029291	-	86	37.229
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ENSMODG00000025156	-	56	42.708	ENSMODG00000029177	-	62	42.708
ENSMODG00000025156	-	88	37.000	ENSMODG00000028271	-	86	37.000
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ENSMODG00000025156	-	81	63.433	ENSMODG00000018480	-	74	63.433
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ENSMODG00000025156	-	56	42.188	ENSMODG00000028813	-	62	42.188
ENSMODG00000025156	-	89	68.750	ENSMODG00000028818	-	85	68.750
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ENSMODG00000025156	-	84	69.408	ENSMODG00000027583	-	93	69.408
ENSMODG00000025156	-	52	44.000	ENSMODG00000027581	-	76	44.000
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ENSMODG00000025156	-	61	61.039	ENSMODG00000028932	-	87	61.039
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ENSMODG00000025156	-	85	56.522	ENSMODG00000028752	-	89	56.522
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Orthologs

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ENSMODG00000025156	-	66	33.043	ENSECAG00000032660	-	57	33.043	Equus_caballus
ENSMODG00000025156	-	60	31.731	ENSECAG00000035420	-	56	31.731	Equus_caballus
ENSMODG00000025156	-	80	30.224	ENSPTRG00000046475	-	76	30.224	Pan_troglodytes
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ENSMODG00000025156	-	90	37.318	ENSPCIG00000023466	-	90	37.318	Phascolarctos_cinereus
ENSMODG00000025156	-	78	43.411	ENSPCIG00000004721	-	75	43.411	Phascolarctos_cinereus
ENSMODG00000025156	-	62	30.144	ENSSSCG00000040293	-	68	30.144	Sus_scrofa