EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMODG00000029406 (Gene tree)
Gene ID: 100014928
Gene Symbol: POP4
Alias: RPP29
Full Name: POP4 homolog%2C ribonuclease P/MRP subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Monodelphis_domestica
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14292 bases
Position: chr1:432450901-432465192
Accession: 100014928
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMODP00000038995	UPF0086	PF01868.16	3e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMODT00000042104	POP4-201	3722	-	ENSMODP00000038995	231 (aa)	XP_007474875	K7DZP4

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
mdo03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
mdo03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMODG00000029406	POP4	94	78.241	ENSG00000105171	POP4	100	93.750	Homo_sapiens
ENSMODG00000029406	POP4	94	66.818	ENSAMEG00000003172	-	99	66.818	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMODG00000029406	POP4	94	76.852	ENSAMEG00000018329	-	98	76.852	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMODG00000029406	POP4	95	60.909	ENSACIG00000008358	pop4	100	60.909	Amphilophus_citrinellus
ENSMODG00000029406	POP4	86	64.179	ENSAOCG00000010116	pop4	98	63.184	Amphiprion_ocellaris
ENSMODG00000029406	POP4	89	62.500	ENSAPEG00000002829	pop4	87	61.538	Amphiprion_percula
ENSMODG00000029406	POP4	90	62.201	ENSATEG00000013028	pop4	94	61.244	Anabas_testudineus
ENSMODG00000029406	POP4	87	72.772	ENSAPLG00000014051	POP4	98	72.772	Anas_platyrhynchos
ENSMODG00000029406	POP4	94	78.241	ENSANAG00000020295	POP4	98	78.241	Aotus_nancymaae
ENSMODG00000029406	POP4	95	60.000	ENSACLG00000000526	pop4	92	63.235	Astatotilapia_calliptera
ENSMODG00000029406	POP4	93	60.465	ENSAMXG00000002899	pop4	98	60.465	Astyanax_mexicanus
ENSMODG00000029406	POP4	94	81.481	ENSBTAG00000002223	POP4	98	81.481	Bos_taurus
ENSMODG00000029406	POP4	94	77.419	ENSCJAG00000046750	POP4	96	84.971	Callithrix_jacchus
ENSMODG00000029406	POP4	79	80.220	ENSCAFG00000007630	POP4	100	80.220	Canis_familiaris
ENSMODG00000029406	POP4	93	80.465	ENSCHIG00000016743	POP4	98	80.465	Capra_hircus
ENSMODG00000029406	POP4	94	80.556	ENSTSYG00000003488	POP4	98	80.556	Carlito_syrichta
ENSMODG00000029406	POP4	94	56.944	ENSCAPG00000011105	POP4	99	56.944	Cavia_aperea
ENSMODG00000029406	POP4	94	77.778	ENSCPOG00000002992	POP4	98	77.778	Cavia_porcellus
ENSMODG00000029406	POP4	94	79.167	ENSCCAG00000020285	-	98	79.167	Cebus_capucinus
ENSMODG00000029406	POP4	94	66.204	ENSCCAG00000034244	-	98	66.204	Cebus_capucinus
ENSMODG00000029406	POP4	94	79.167	ENSCATG00000036022	POP4	100	93.750	Cercocebus_atys
ENSMODG00000029406	POP4	94	77.315	ENSCLAG00000013162	POP4	98	77.315	Chinchilla_lanigera
ENSMODG00000029406	POP4	94	79.630	ENSCSAG00000004868	POP4	99	79.630	Chlorocebus_sabaeus
ENSMODG00000029406	POP4	94	59.908	ENSCHOG00000002071	POP4	100	59.908	Choloepus_hoffmanni
ENSMODG00000029406	POP4	95	73.516	ENSCPBG00000016132	POP4	99	73.516	Chrysemys_picta_bellii
ENSMODG00000029406	POP4	81	32.474	ENSCING00000023871	-	95	30.653	Ciona_intestinalis
ENSMODG00000029406	POP4	86	81.818	ENSCANG00000005924	POP4	98	81.818	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMODG00000029406	POP4	94	76.852	ENSCGRG00001017185	Pop4	98	77.315	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMODG00000029406	POP4	94	76.852	ENSCGRG00000008155	Pop4	98	77.315	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMODG00000029406	POP4	90	54.808	ENSCSEG00000002946	pop4	94	54.327	Cynoglossus_semilaevis
ENSMODG00000029406	POP4	95	43.439	ENSCVAG00000018602	POP4	95	42.986	Cyprinodon_variegatus
ENSMODG00000029406	POP4	95	63.470	ENSDARG00000101472	pop4	99	62.557	Danio_rerio
ENSMODG00000029406	POP4	99	80.000	ENSDNOG00000047663	POP4	92	80.000	Dasypus_novemcinctus
ENSMODG00000029406	POP4	74	73.099	ENSDORG00000008577	Pop4	99	73.099	Dipodomys_ordii
ENSMODG00000029406	POP4	71	36.571	FBgn0035831	CG8038	71	37.415	Drosophila_melanogaster
ENSMODG00000029406	POP4	94	65.741	ENSETEG00000003607	POP4	99	65.741	Echinops_telfairi
ENSMODG00000029406	POP4	85	46.190	ENSEBUG00000010447	pop4	82	45.714	Eptatretus_burgeri
ENSMODG00000029406	POP4	94	39.301	ENSEBUG00000004305	pop4	98	38.865	Eptatretus_burgeri
ENSMODG00000029406	POP4	94	41.014	ENSEBUG00000008575	pop4	98	41.014	Eptatretus_burgeri
ENSMODG00000029406	POP4	94	88.462	ENSECAG00000020206	POP4	80	88.462	Equus_caballus
ENSMODG00000029406	POP4	85	60.914	ENSEEUG00000013109	POP4	99	60.914	Erinaceus_europaeus
ENSMODG00000029406	POP4	88	62.745	ENSELUG00000019812	pop4	93	61.765	Esox_lucius
ENSMODG00000029406	POP4	94	80.093	ENSFCAG00000001619	POP4	98	80.093	Felis_catus
ENSMODG00000029406	POP4	94	70.833	ENSFALG00000000206	POP4	96	70.833	Ficedula_albicollis
ENSMODG00000029406	POP4	94	77.315	ENSFDAG00000017859	POP4	98	77.315	Fukomys_damarensis
ENSMODG00000029406	POP4	88	55.340	ENSFHEG00000012745	pop4	93	54.369	Fundulus_heteroclitus
ENSMODG00000029406	POP4	73	67.059	ENSGMOG00000000335	pop4	85	67.059	Gadus_morhua
ENSMODG00000029406	POP4	98	68.722	ENSGALG00000041972	POP4	95	68.722	Gallus_gallus
ENSMODG00000029406	POP4	75	51.412	ENSGAFG00000003571	pop4	98	49.718	Gambusia_affinis
ENSMODG00000029406	POP4	90	59.906	ENSGACG00000014510	pop4	93	65.116	Gasterosteus_aculeatus
ENSMODG00000029406	POP4	95	74.429	ENSGAGG00000024544	POP4	79	74.429	Gopherus_agassizii
ENSMODG00000029406	POP4	94	78.704	ENSGGOG00000038346	POP4	98	78.704	Gorilla_gorilla
ENSMODG00000029406	POP4	88	63.235	ENSHBUG00000021821	pop4	92	63.235	Haplochromis_burtoni
ENSMODG00000029406	POP4	94	77.315	ENSHGLG00000015798	POP4	98	77.315	Heterocephalus_glaber_female
ENSMODG00000029406	POP4	94	77.064	ENSHGLG00100009737	POP4	99	77.064	Heterocephalus_glaber_male
ENSMODG00000029406	POP4	90	64.762	ENSHCOG00000020937	pop4	94	64.762	Hippocampus_comes
ENSMODG00000029406	POP4	90	61.538	ENSIPUG00000013652	pop4	99	58.904	Ictalurus_punctatus
ENSMODG00000029406	POP4	94	79.167	ENSSTOG00000011016	POP4	98	79.167	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMODG00000029406	POP4	94	77.778	ENSJJAG00000013376	Pop4	98	77.778	Jaculus_jaculus
ENSMODG00000029406	POP4	95	60.633	ENSKMAG00000012250	pop4	99	59.276	Kryptolebias_marmoratus
ENSMODG00000029406	POP4	95	54.299	ENSLBEG00000014139	pop4	98	55.046	Labrus_bergylta
ENSMODG00000029406	POP4	95	53.846	ENSLBEG00000018846	-	98	54.587	Labrus_bergylta
ENSMODG00000029406	POP4	94	67.130	ENSLACG00000008581	POP4	97	67.130	Latimeria_chalumnae
ENSMODG00000029406	POP4	95	68.950	ENSLOCG00000005597	pop4	99	68.950	Lepisosteus_oculatus
ENSMODG00000029406	POP4	95	77.626	ENSLAFG00000000084	POP4	99	77.626	Loxodonta_africana
ENSMODG00000029406	POP4	94	79.630	ENSMFAG00000029606	POP4	98	79.630	Macaca_fascicularis
ENSMODG00000029406	POP4	94	77.880	ENSMMUG00000017424	POP4	98	77.880	Macaca_mulatta
ENSMODG00000029406	POP4	94	77.880	ENSMNEG00000031374	POP4	98	77.880	Macaca_nemestrina
ENSMODG00000029406	POP4	94	79.167	ENSMLEG00000043454	POP4	98	79.167	Mandrillus_leucophaeus
ENSMODG00000029406	POP4	95	60.811	ENSMAMG00000011716	pop4	99	59.910	Mastacembelus_armatus
ENSMODG00000029406	POP4	88	63.235	ENSMZEG00005002360	pop4	92	63.235	Maylandia_zebra
ENSMODG00000029406	POP4	94	71.759	ENSMGAG00000005337	POP4	96	71.759	Meleagris_gallopavo
ENSMODG00000029406	POP4	94	78.704	ENSMAUG00000020110	Pop4	98	78.704	Mesocricetus_auratus
ENSMODG00000029406	POP4	94	75.926	ENSMICG00000035730	POP4	97	75.926	Microcebus_murinus
ENSMODG00000029406	POP4	95	58.182	ENSMMOG00000015321	pop4	99	58.182	Mola_mola
ENSMODG00000029406	POP4	91	63.810	ENSMALG00000012571	pop4	95	63.810	Monopterus_albus
ENSMODG00000029406	POP4	94	76.606	MGP_CAROLIEiJ_G0029600	Pop4	99	77.982	Mus_caroli
ENSMODG00000029406	POP4	94	77.064	ENSMUSG00000030423	Pop4	99	77.064	Mus_musculus
ENSMODG00000029406	POP4	94	76.498	MGP_SPRETEiJ_G0030699	Pop4	99	75.576	Mus_spretus
ENSMODG00000029406	POP4	94	77.315	ENSMPUG00000008041	-	98	77.315	Mustela_putorius_furo
ENSMODG00000029406	POP4	94	66.359	ENSMPUG00000008063	-	98	66.359	Mustela_putorius_furo
ENSMODG00000029406	POP4	94	63.134	ENSMLUG00000010774	POP4	98	63.134	Myotis_lucifugus
ENSMODG00000029406	POP4	54	88.800	ENSMEUG00000003636	-	100	88.800	Notamacropus_eugenii
ENSMODG00000029406	POP4	86	81.313	ENSOPRG00000004736	POP4	99	81.313	Ochotona_princeps
ENSMODG00000029406	POP4	94	76.852	ENSODEG00000013025	POP4	100	77.358	Octodon_degus
ENSMODG00000029406	POP4	95	60.000	ENSONIG00000003458	pop4	98	60.000	Oreochromis_niloticus
ENSMODG00000029406	POP4	94	79.630	ENSOCUG00000015974	POP4	98	79.630	Oryctolagus_cuniculus
ENSMODG00000029406	POP4	86	60.199	ENSORLG00000020317	pop4	91	59.204	Oryzias_latipes
ENSMODG00000029406	POP4	91	58.491	ENSORLG00015011624	pop4	99	55.656	Oryzias_latipes_hsok
ENSMODG00000029406	POP4	89	60.096	ENSOMEG00000002538	pop4	93	59.135	Oryzias_melastigma
ENSMODG00000029406	POP4	94	78.241	ENSOGAG00000011168	POP4	98	78.241	Otolemur_garnettii
ENSMODG00000029406	POP4	93	80.093	ENSOARG00000004041	POP4	98	80.093	Ovis_aries
ENSMODG00000029406	POP4	94	78.704	ENSPPAG00000040372	POP4	98	78.704	Pan_paniscus
ENSMODG00000029406	POP4	94	80.093	ENSPPRG00000010502	POP4	98	80.093	Panthera_pardus
ENSMODG00000029406	POP4	94	80.093	ENSPTIG00000016598	POP4	98	80.093	Panthera_tigris_altaica
ENSMODG00000029406	POP4	94	78.704	ENSPTRG00000010779	POP4	98	78.704	Pan_troglodytes
ENSMODG00000029406	POP4	94	79.630	ENSPANG00000008546	POP4	98	79.630	Papio_anubis
ENSMODG00000029406	POP4	86	65.385	ENSPKIG00000004468	pop4	88	66.667	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMODG00000029406	POP4	99	72.926	ENSPSIG00000015690	POP4	100	77.723	Pelodiscus_sinensis
ENSMODG00000029406	POP4	86	58.333	ENSPMGG00000008608	pop4	98	57.843	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMODG00000029406	POP4	94	64.352	ENSPEMG00000019982	-	99	64.352	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMODG00000029406	POP4	94	78.241	ENSPEMG00000014034	-	94	78.241	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMODG00000029406	POP4	63	68.966	ENSPMAG00000006265	pop4	73	68.966	Petromyzon_marinus
ENSMODG00000029406	POP4	100	90.476	ENSPCIG00000024738	POP4	100	90.476	Phascolarctos_cinereus
ENSMODG00000029406	POP4	95	55.455	ENSPFOG00000000925	pop4	99	54.545	Poecilia_formosa
ENSMODG00000029406	POP4	95	55.455	ENSPLAG00000003161	pop4	99	54.545	Poecilia_latipinna
ENSMODG00000029406	POP4	95	55.455	ENSPMEG00000002475	pop4	99	54.545	Poecilia_mexicana
ENSMODG00000029406	POP4	96	54.054	ENSPREG00000022403	pop4	94	53.153	Poecilia_reticulata
ENSMODG00000029406	POP4	94	79.167	ENSPPYG00000009805	POP4	98	79.167	Pongo_abelii
ENSMODG00000029406	POP4	94	72.811	ENSPCAG00000007737	POP4	99	72.811	Procavia_capensis
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ENSMODG00000029406	POP4	94	75.576	ENSPVAG00000006069	POP4	99	75.576	Pteropus_vampyrus
ENSMODG00000029406	POP4	88	63.725	ENSPNYG00000020038	pop4	92	63.725	Pundamilia_nyererei
ENSMODG00000029406	POP4	95	59.817	ENSPNAG00000005591	pop4	99	59.817	Pygocentrus_nattereri
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ENSMODG00000029406	POP4	75	72.832	ENSRBIG00000044769	POP4	89	78.261	Rhinopithecus_bieti
ENSMODG00000029406	POP4	94	79.167	ENSRROG00000028903	POP4	98	79.167	Rhinopithecus_roxellana
ENSMODG00000029406	POP4	55	34.532	YBR257W	-	50	34.532	Saccharomyces_cerevisiae
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