EuRBPDB

Description

RBDs

Expression

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSMUSG00000020273 (Gene tree)
Gene ID: 216578
Gene Symbol: Papolg
Alias: 9630006B20Rik
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 32608 bases
Position: chr11:23862646-23895253
Accession: 2442119
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMUSP00000020513	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.5e-27	1	2
ENSMUSP00000020513	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.5e-27	2	2
ENSMUSP00000099927	PAP_RNA-bind	PF04926.15	8.8e-20	1	1

Expression

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMUST00000020513	-	3747	XM_006514653	ENSMUSP00000020513	739 (aa)	XP_006514716	Q6PCL9
ENSMUST00000102863	-	2171	-	ENSMUSP00000099927	429 (aa)	-	Q8BY05
ENSMUST00000150711	-	1882	-	-	- (aa)	-	-
ENSMUST00000145013	-	1882	-	ENSMUSP00000115518	256 (aa)	-	F6THF3

Gene Model

Click here to download ENSMUSG00000020273's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
mmu03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMUSG00000020273's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMUSG00000020273	Papolg	97	81.884	ENSMUSG00000021111	Papola	98	61.224
ENSMUSG00000020273	Papolg	95	78.973	ENSMUSG00000074817	Papolb	86	68.421

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSG00000115421	PAPOLG	100	99.573	Homo_sapiens
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.089	ENSAPOG00000004798	papolg	99	70.811	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.059	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	94.173	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.089	ENSACIG00000010546	papolg	99	70.850	Amphilophus_citrinellus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.854	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.836	Amphiprion_ocellaris
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.089	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.969	Amphiprion_percula
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.324	ENSATEG00000009007	papolg	79	86.774	Anabas_testudineus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	88.263	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.715	Anas_platyrhynchos
ENSMUSG00000020273	Papolg	81	63.816	ENSACAG00000015048	-	100	63.816	Anolis_carolinensis
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	93.927	Aotus_nancymaae
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.854	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.558	Astatotilapia_calliptera
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.916	ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.775	Astyanax_mexicanus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	94.467	Bos_taurus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.197	Callithrix_jacchus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.533	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	85.819	Canis_familiaris
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.574	Canis_lupus_dingo
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.065	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.332	Capra_hircus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.065	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	94.602	Carlito_syrichta
ENSMUSG00000020273	Papolg	89	91.842	ENSCAPG00000014901	-	99	91.842	Cavia_aperea
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.533	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.865	Cavia_porcellus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.332	Cebus_capucinus
ENSMUSG00000020273	Papolg	91	98.268	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	98.268	Cercocebus_atys
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.533	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.142	Chinchilla_lanigera
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	94.062	Chlorocebus_sabaeus
ENSMUSG00000020273	Papolg	89	91.958	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	91.958	Choloepus_hoffmanni
ENSMUSG00000020273	Papolg	94	68.719	ENSCING00000024664	-	94	64.554	Ciona_intestinalis
ENSMUSG00000020273	Papolg	94	68.719	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	94.197	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMUSG00000020273	Papolg	98	99.287	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	96.306	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMUSG00000020273	Papolg	98	99.287	ENSCGRG00000005552	-	100	96.306	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.089	ENSCSEG00000000771	papolg	99	70.612	Cynoglossus_semilaevis
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.150	ENSCVAG00000016602	papolg	92	83.109	Cyprinodon_variegatus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.150	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.677	Danio_rerio
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	95.093	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	93.108	Dasypus_novemcinctus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.533	ENSDORG00000016228	Papolg	99	99.533	Dipodomys_ordii
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	73.577	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.514	Echinops_telfairi
ENSMUSG00000020273	Papolg	90	59.173	ENSEBUG00000005042	-	81	57.294	Eptatretus_burgeri
ENSMUSG00000020273	Papolg	75	84.291	ENSEBUG00000004020	papolg	90	71.279	Eptatretus_burgeri
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	94.602	Equus_asinus_asinus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	94.173	Equus_caballus
ENSMUSG00000020273	Papolg	100	82.703	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	82.703	Erinaceus_europaeus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.247	ENSELUG00000014497	papolg	99	65.666	Esox_lucius
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	94.467	Felis_catus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	79.953	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.426	Ficedula_albicollis
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	94.737	Fukomys_damarensis
ENSMUSG00000020273	Papolg	66	61.850	ENSFHEG00000019080	papolg	90	62.941	Fundulus_heteroclitus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.150	ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.213	Gadus_morhua
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.981	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	70.533	Gallus_gallus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.385	ENSGAFG00000003263	papolg	89	70.092	Gambusia_affinis
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.089	ENSGACG00000002718	papolg	100	72.222	Gasterosteus_aculeatus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	94.062	Gorilla_gorilla
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.854	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.558	Haplochromis_burtoni
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.059	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	94.986	Heterocephalus_glaber_female
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	95.412	Heterocephalus_glaber_male
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.620	ENSHCOG00000006782	papolg	89	71.238	Hippocampus_comes
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.588	ENSIPUG00000021642	papolg	100	72.460	Ictalurus_punctatus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.142	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSJJAG00000015601	Papolg	99	99.299	Jaculus_jaculus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.651	ENSKMAG00000016439	papolg	97	69.530	Kryptolebias_marmoratus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.150	ENSLBEG00000023218	papolg	89	67.949	Labrus_bergylta
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	77.176	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	69.867	Latimeria_chalumnae
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.383	ENSLOCG00000016130	papolg	100	73.132	Lepisosteus_oculatus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	98.372	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	98.131	Loxodonta_africana
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.533	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	94.332	Macaca_fascicularis
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.533	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	94.332	Macaca_mulatta
ENSMUSG00000020273	Papolg	100	85.255	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	85.389	Macaca_nemestrina
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.065	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	93.927	Mandrillus_leucophaeus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.089	ENSMAMG00000010667	papolg	99	70.405	Mastacembelus_armatus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.854	ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.332	Maylandia_zebra
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	84.615	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.628	Meleagris_gallopavo
ENSMUSG00000020273	Papolg	98	99.762	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	96.443	Mesocricetus_auratus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	94.872	Microcebus_murinus
ENSMUSG00000020273	Papolg	100	99.534	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	97.158	Microtus_ochrogaster
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.385	ENSMMOG00000008020	papolg	99	72.112	Mola_mola
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	95.294	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	86.747	Monodelphis_domestica
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.089	ENSMALG00000007012	papolg	89	71.846	Monopterus_albus
ENSMUSG00000020273	Papolg	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	100	100.000	Mus_caroli
ENSMUSG00000020273	Papolg	100	99.534	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	98.647	Mus_pahari
ENSMUSG00000020273	Papolg	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	100	100.000	Mus_spretus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	94.467	Mustela_putorius_furo
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	97.882	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	92.537	Myotis_lucifugus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.533	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	95.535	Nannospalax_galili
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	73.286	ENSNBRG00000011943	papolg	99	64.021	Neolamprologus_brichardi
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.065	ENSNLEG00000009507	-	99	99.065	Nomascus_leucogenys
ENSMUSG00000020273	Papolg	66	98.551	ENSMEUG00000013605	-	88	78.082	Notamacropus_eugenii
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	94.197	Ochotona_princeps
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	95.059	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	95.059	Octodon_degus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	75.878	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.730	Oreochromis_niloticus
ENSMUSG00000020273	Papolg	98	95.261	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	85.121	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	95.412	Oryctolagus_cuniculus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.748	ENSORLG00000001577	papolg	89	70.542	Oryzias_latipes
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.981	ENSORLG00020002482	papolg	89	70.861	Oryzias_latipes_hni
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.981	ENSORLG00015008836	papolg	89	70.542	Oryzias_latipes_hsok
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.915	ENSOMEG00000001406	papolg	89	70.040	Oryzias_melastigma
ENSMUSG00000020273	Papolg	58	87.674	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	87.674	Otolemur_garnettii
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.065	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	94.332	Ovis_aries
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	93.657	Pan_paniscus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	94.467	Panthera_pardus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.533	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.332	Panthera_tigris_altaica
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	93.657	Pan_troglodytes
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	91.860	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	89.906	Papio_anubis
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.781	ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.067	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	84.615	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	72.929	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMUSG00000020273	Papolg	98	91.686	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.600	Pelodiscus_sinensis
ENSMUSG00000020273	Papolg	98	99.762	ENSPEMG00000008960	-	100	96.033	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMUSG00000020273	Papolg	97	65.105	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.088	Petromyzon_marinus
ENSMUSG00000020273	Papolg	95	67.241	ENSPMAG00000004864	-	96	63.599	Petromyzon_marinus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	96.028	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.600	Phascolarctos_cinereus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.150	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.841	Poecilia_formosa
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.150	ENSPLAG00000018445	papolg	89	70.263	Poecilia_latipinna
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.150	ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.935	Poecilia_mexicana
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.915	ENSPREG00000010358	papolg	89	69.908	Poecilia_reticulata
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.792	Pongo_abelii
ENSMUSG00000020273	Papolg	98	93.839	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.497	Procavia_capensis
ENSMUSG00000020273	Papolg	90	99.485	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	84.076	Propithecus_coquereli
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.065	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.250	Pteropus_vampyrus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.854	ENSPNYG00000006729	papolg	99	70.405	Pundamilia_nyererei
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.294	ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.959	Pygocentrus_nattereri
ENSMUSG00000020273	Papolg	100	99.767	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	97.429	Rattus_norvegicus
ENSMUSG00000020273	Papolg	100	88.259	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	88.259	Rhinopithecus_bieti
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	94.197	Rhinopithecus_roxellana
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	93.927	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMUSG00000020273	Papolg	90	97.656	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.252	Sarcophilus_harrisii
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	78.220	ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.881	Scleropages_formosus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	84.038	ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.503	Scleropages_formosus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.781	ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.535	Scophthalmus_maximus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.089	ENSSDUG00000000912	papolg	99	71.216	Seriola_dumerili
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.089	ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.596	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	90.824	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	78.000	Sphenodon_punctatus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.089	ENSSPAG00000009004	papolg	99	70.000	Stegastes_partitus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	94.467	Sus_scrofa
ENSMUSG00000020273	Papolg	96	81.356	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	76.525	Taeniopygia_guttata
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.150	ENSTRUG00000006410	papolg	99	70.833	Takifugu_rubripes
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	77.598	ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.876	Tetraodon_nigroviridis
ENSMUSG00000020273	Papolg	98	92.891	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	86.667	Tupaia_belangeri
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	98.832	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	89.609	Tursiops_truncatus
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.407	Ursus_americanus
ENSMUSG00000020273	Papolg	98	99.762	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	94.407	Ursus_maritimus
ENSMUSG00000020273	Papolg	98	93.602	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	90.476	Vicugna_pacos
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	94.332	Vulpes_vulpes
ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.047	ENSXETG00000002208	papolg	100	73.342	Xenopus_tropicalis
ENSMUSG00000020273	Papolg	97	86.158	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.571	Xiphophorus_couchianus
ENSMUSG00000020273	Papolg	97	83.095	ENSXMAG00000007383	papolg	95	83.000	Xiphophorus_maculatus

Gene Ontology

Go ID	Go_term	PubmedID	Evidence	Category
GO:0000166	nucleotide binding	-	IEA	Function
GO:0003723	RNA binding	-	IEA	Function
GO:0004652	polynucleotide adenylyltransferase activity	21873635.	IBA	Function
GO:0004652	polynucleotide adenylyltransferase activity	-	ISO	Function
GO:0005524	ATP binding	-	IEA	Function
GO:0005634	nucleus	21873635.	IBA	Component
GO:0005634	nucleus	-	ISO	Component
GO:0005654	nucleoplasm	-	ISO	Component
GO:0005829	cytosol	-	ISO	Component
GO:0006378	mRNA polyadenylation	21873635.	IBA	Process
GO:0006397	mRNA processing	-	IEA	Process
GO:0016604	nuclear body	-	ISO	Component
GO:0016740	transferase activity	-	IEA	Function
GO:0016779	nucleotidyltransferase activity	-	IEA	Function
GO:0031123	RNA 3'-end processing	-	IEA	Process
GO:0043631	RNA polyadenylation	-	ISO	Process
GO:0046872	metal ion binding	-	ISO	Function