EuRBPDB

Description

RBDs

RBPome

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Gene Model

PPI

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSMUSG00000020454 (Gene tree)
Gene ID: 74203
Gene Symbol: Eif4enif1
Alias: 2610509L04Rik|A930019J01Rik|Clast4|D11Ertd166e
Full Name: eukaryotic translation initiation factor 4E nuclear import factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus
Status: confidence
Strand: Plus strand
Length: 42197 bases
Position: chr11:3202392-3244588
Accession: 1921453
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMUSP00000105676	EIF4E-T	PF10477.9	2.1e-168	1	1
ENSMUSP00000136768	EIF4E-T	PF10477.9	2.1e-168	1	1
ENSMUSP00000020734	EIF4E-T	PF10477.9	1.1e-164	1	1
ENSMUSP00000105675	EIF4E-T	PF10477.9	1.1e-164	1	1
ENSMUSP00000112550	EIF4E-T	PF10477.9	3.1e-102	1	3
ENSMUSP00000112550	EIF4E-T	PF10477.9	3.1e-102	2	3
ENSMUSP00000112550	EIF4E-T	PF10477.9	3.1e-102	3	3
ENSMUSP00000118527	EIF4E-T	PF10477.9	7.1e-48	1	1
ENSMUSP00000122912	EIF4E-T	PF10477.9	7.9e-32	1	2
ENSMUSP00000122912	EIF4E-T	PF10477.9	7.9e-32	2	2

RNA binding proteome (RBPome)

PID	Title	Method	Time	Author	Doi
23912277	The RNA binding protein repertoire of embryonic stem cells	IC & mESC	2013 Aug 4	Kwon SC	DOI: 10.1038/nsmb.2638
27452465	The Cardiomyocyte RNA Binding Proteome: Links to Intermediary Metabolism and Heart Disease	IC & HL_1	2016 Jul 21	Liao Y	DOI: 10.1016/j.celrep.2016.06.084
27452465	The Cardiomyocyte RNA Binding Proteome: Links to Intermediary Metabolism and Heart Disease	RBDmap & HL_1	2016 Jul 21	Liao Y	DOI: 10.1016/j.celrep.2016.06.084

Expression

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMUST00000131693	-	405	-	-	- (aa)	-	-
ENSMUST00000125637	-	869	-	ENSMUSP00000118527	194 (aa)	-	Q5NBZ7
ENSMUST00000132425	-	301	-	-	- (aa)	-	-
ENSMUST00000147534	-	297	-	-	- (aa)	-	-
ENSMUST00000125224	-	2546	-	-	- (aa)	-	-
ENSMUST00000143770	-	437	-	-	- (aa)	-	-
ENSMUST00000110049	-	3614	XM_006514841	ENSMUSP00000105676	983 (aa)	XP_006514904	Q9EST3
ENSMUST00000110048	-	3712	-	ENSMUSP00000105675	959 (aa)	-	Q9EST3
ENSMUST00000120721	-	2952	-	ENSMUSP00000112550	808 (aa)	-	A8Y5K6
ENSMUST00000135223	-	718	-	ENSMUSP00000122912	239 (aa)	-	Q5NBZ4
ENSMUST00000179770	-	3676	XM_006514843	ENSMUSP00000136768	983 (aa)	XP_006514906	Q9EST3
ENSMUST00000020734	-	3565	XM_006514844	ENSMUSP00000020734	959 (aa)	XP_006514907	Q9EST3
ENSMUST00000127950	-	813	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	91.667	ENSG00000184708	EIF4ENIF1	100	89.540	Homo_sapiens
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	61.500	ENSAPOG00000018460	EIF4ENIF1	99	54.519	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	90.625	ENSAMEG00000007030	EIF4ENIF1	99	90.142	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	62.755	ENSACIG00000016848	EIF4ENIF1	93	65.443	Amphilophus_citrinellus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	97	61.538	ENSAOCG00000010670	EIF4ENIF1	95	64.848	Amphiprion_ocellaris
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	97	61.538	ENSAPEG00000013379	EIF4ENIF1	99	54.130	Amphiprion_percula
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	97	62.694	ENSATEG00000011226	EIF4ENIF1	99	54.678	Anabas_testudineus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	78.463	ENSAPLG00000004503	EIF4ENIF1	99	78.261	Anas_platyrhynchos
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	93.229	ENSANAG00000033641	EIF4ENIF1	99	90.407	Aotus_nancymaae
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	64.286	ENSACLG00000010640	EIF4ENIF1	99	65.443	Astatotilapia_calliptera
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	60.914	ENSAMXG00000002271	EIF4ENIF1	100	53.741	Astyanax_mexicanus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	91.237	ENSBTAG00000008991	EIF4ENIF1	100	90.051	Bos_taurus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	93.229	ENSCJAG00000011034	EIF4ENIF1	99	90.511	Callithrix_jacchus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	91.667	ENSCAFG00000013163	EIF4ENIF1	99	90.234	Canis_familiaris
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	91.667	ENSCAFG00020001521	EIF4ENIF1	99	90.208	Canis_lupus_dingo
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	91.237	ENSCHIG00000016528	EIF4ENIF1	100	89.490	Capra_hircus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	88	88.889	ENSTSYG00000010207	EIF4ENIF1	99	88.889	Carlito_syrichta
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	92	92.135	ENSCAPG00000014944	EIF4ENIF1	100	89.100	Cavia_aperea
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	90.625	ENSCPOG00000010795	EIF4ENIF1	99	88.705	Cavia_porcellus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	92.188	ENSCCAG00000017419	EIF4ENIF1	99	90.094	Cebus_capucinus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	92.188	ENSCATG00000026186	EIF4ENIF1	99	90.511	Cercocebus_atys
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	92.708	ENSCLAG00000010057	EIF4ENIF1	99	90.188	Chinchilla_lanigera
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	92.188	ENSCSAG00000008717	EIF4ENIF1	99	90.336	Chlorocebus_sabaeus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	94	85.354	ENSCHOG00000007435	EIF4ENIF1	93	85.354	Choloepus_hoffmanni
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	98	80.412	ENSCPBG00000011268	EIF4ENIF1	99	81.715	Chrysemys_picta_bellii
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	89.425	ENSCANG00000029408	EIF4ENIF1	100	90.860	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	96.923	ENSCGRG00001023434	Eif4enif1	100	95.109	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	96.923	ENSCGRG00000004368	Eif4enif1	100	95.109	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	94	60.000	ENSCSEG00000001394	EIF4ENIF1	99	52.526	Cynoglossus_semilaevis
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	40.956	ENSCVAG00000007656	EIF4ENIF1	99	52.154	Cyprinodon_variegatus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	93.750	ENSDNOG00000001315	EIF4ENIF1	99	90.549	Dasypus_novemcinctus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	74.971	ENSDORG00000000183	Eif4enif1	94	89.362	Dipodomys_ordii
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	94	76.749	ENSETEG00000017274	EIF4ENIF1	99	77.180	Echinops_telfairi
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	85	43.452	ENSEBUG00000007659	EIF4ENIF1	91	34.703	Eptatretus_burgeri
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	94.271	ENSEASG00005010461	EIF4ENIF1	99	90.743	Equus_asinus_asinus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	94.271	ENSECAG00000000311	EIF4ENIF1	99	91.032	Equus_caballus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	97	85.310	ENSEEUG00000000860	EIF4ENIF1	100	84.995	Erinaceus_europaeus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	98	59.135	ENSELUG00000002320	EIF4ENIF1	99	51.453	Esox_lucius
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	93.750	ENSFCAG00000001323	EIF4ENIF1	99	91.363	Felis_catus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	87	83.432	ENSFALG00000007431	EIF4ENIF1	96	78.579	Ficedula_albicollis
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	92.708	ENSFDAG00000014690	EIF4ENIF1	99	90.491	Fukomys_damarensis
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	61.809	ENSFHEG00000014788	EIF4ENIF1	99	65.758	Fundulus_heteroclitus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	95	60.209	ENSGMOG00000001090	EIF4ENIF1	99	51.805	Gadus_morhua
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	98	81.865	ENSGALG00000006898	EIF4ENIF1	99	78.622	Gallus_gallus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	61.307	ENSGAFG00000010034	EIF4ENIF1	99	63.636	Gambusia_affinis
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	94	62.234	ENSGACG00000001486	EIF4ENIF1	99	52.178	Gasterosteus_aculeatus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	98	79.381	ENSGAGG00000003193	EIF4ENIF1	99	78.093	Gopherus_agassizii
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	84.688	ENSGGOG00000003505	EIF4ENIF1	99	84.688	Gorilla_gorilla
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	64.286	ENSHBUG00000023147	EIF4ENIF1	93	65.944	Haplochromis_burtoni
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	93.750	ENSHGLG00000015208	-	99	91.223	Heterocephalus_glaber_female
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	87.500	ENSHGLG00100007804	-	99	84.507	Heterocephalus_glaber_male
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	93.750	ENSHGLG00100009559	-	98	93.750	Heterocephalus_glaber_male
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	97	64.615	ENSHCOG00000017603	EIF4ENIF1	99	61.095	Hippocampus_comes
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	98	62.827	ENSIPUG00000017613	eif4enif1	99	52.502	Ictalurus_punctatus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	92.708	ENSSTOG00000014197	EIF4ENIF1	99	89.572	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	90	100.000	ENSJJAG00000015303	-	90	100.000	Jaculus_jaculus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	90	78.326	ENSJJAG00000018898	-	95	78.326	Jaculus_jaculus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	61.616	ENSKMAG00000008185	EIF4ENIF1	99	52.999	Kryptolebias_marmoratus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	96	62.176	ENSLBEG00000001074	EIF4ENIF1	99	52.786	Labrus_bergylta
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	97	69.110	ENSLACG00000016906	EIF4ENIF1	99	64.149	Latimeria_chalumnae
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	50.362	ENSLOCG00000001513	EIF4ENIF1	97	60.561	Lepisosteus_oculatus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	92.188	ENSLAFG00000002321	EIF4ENIF1	99	88.045	Loxodonta_africana
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	91.146	ENSMFAG00000037813	EIF4ENIF1	99	90.407	Macaca_fascicularis
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	91.146	ENSMMUG00000031035	EIF4ENIF1	99	88.628	Macaca_mulatta
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	92.188	ENSMLEG00000029191	EIF4ENIF1	100	90.681	Mandrillus_leucophaeus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	58.376	ENSMAMG00000023655	EIF4ENIF1	99	53.666	Mastacembelus_armatus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	64.286	ENSMZEG00005016063	EIF4ENIF1	99	65.443	Maylandia_zebra
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	98	81.865	ENSMGAG00000008355	EIF4ENIF1	99	78.499	Meleagris_gallopavo
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	88.554	ENSMAUG00000002370	Eif4enif1	100	88.565	Mesocricetus_auratus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	54	77.273	ENSMICG00000045464	-	93	88.557	Microcebus_murinus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	94.271	ENSMICG00000005470	EIF4ENIF1	99	88.125	Microcebus_murinus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	93.909	ENSMOCG00000020588	Eif4enif1	100	93.909	Microtus_ochrogaster
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	97	61.458	ENSMMOG00000021680	EIF4ENIF1	99	50.909	Mola_mola
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	81.443	ENSMODG00000009732	EIF4ENIF1	99	69.645	Monodelphis_domestica
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	60.914	ENSMALG00000021126	EIF4ENIF1	99	54.252	Monopterus_albus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	98.438	MGP_CAROLIEiJ_G0016005	Eif4enif1	100	98.438	Mus_caroli
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	98.019	MGP_PahariEiJ_G0016886	Eif4enif1	100	98.019	Mus_pahari
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016844	Eif4enif1	100	100.000	Mus_spretus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	92.708	ENSMPUG00000012801	EIF4ENIF1	96	90.641	Mustela_putorius_furo
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	90.104	ENSMLUG00000007053	EIF4ENIF1	100	89.053	Myotis_lucifugus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	94.792	ENSNGAG00000017244	Eif4enif1	99	94.301	Nannospalax_galili
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	100	64.286	ENSNBRG00000015925	EIF4ENIF1	93	65.635	Neolamprologus_brichardi
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	92.708	ENSNLEG00000004391	EIF4ENIF1	99	90.397	Nomascus_leucogenys
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	92	76.551	ENSMEUG00000016179	EIF4ENIF1	92	78.064	Notamacropus_eugenii
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	86.578	ENSOPRG00000011535	EIF4ENIF1	100	86.578	Ochotona_princeps
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	95.312	ENSODEG00000003485	-	99	90.397	Octodon_degus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	64.684	ENSODEG00000000151	-	98	70.769	Octodon_degus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	99	64.103	ENSONIG00000004251	EIF4ENIF1	99	53.366	Oreochromis_niloticus
ENSMUSG00000020454	Eif4enif1	97	83.069	ENSOANG00000010679	-	97	89.362	Ornithorhynchus_anatinus
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