EuRBPDB

Description

RBDs

Expression

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSMUSG00000040429 (Gene tree)
Gene ID: 545725
Gene Symbol: Mterf1a
Alias: 4931431L11Rik|9230106K09Rik|Mterf|Mterf1
Full Name: mitochondrial transcription termination factor 1a
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3353 bases
Position: chr5:3890581-3893933
Accession: 1918240
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMUSP00000046017	mTERF	PF02536.14	2.4e-79	1	1
ENSMUSP00000113306	mTERF	PF02536.14	2.4e-79	1	1

Expression

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMUST00000117463	-	2413	-	ENSMUSP00000113306	379 (aa)	-	Q8CHZ9
ENSMUST00000044746	-	1376	XM_017320999	ENSMUSP00000046017	379 (aa)	XP_017176488	Q8CHZ9
ENSMUST00000196417	-	1790	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSMUSG00000040429's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMUSG00000040429's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	100	98.681	ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	98.681

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	75.332	ENSG00000127989	MTERF1	99	75.332	Homo_sapiens
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	92	50.716	ENSAPOG00000022230	MTERF1	90	50.716	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	89	68.047	ENSAMEG00000007917	-	97	68.047	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	91	50.435	ENSACIG00000017700	MTERF1	89	50.435	Amphilophus_citrinellus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	89	50.148	ENSAOCG00000004345	MTERF1	87	50.148	Amphiprion_ocellaris
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	89	50.148	ENSAPEG00000005877	MTERF1	87	50.148	Amphiprion_percula
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	95	49.584	ENSATEG00000011055	MTERF1	93	49.584	Anabas_testudineus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	89	47.929	ENSACAG00000015777	MTERF1	85	47.929	Anolis_carolinensis
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	73.210	ENSANAG00000022640	MTERF1	97	73.210	Aotus_nancymaae
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	97	47.074	ENSACLG00000011571	MTERF1	88	48.680	Astatotilapia_calliptera
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	85	50.779	ENSAMXG00000017008	MTERF1	91	50.779	Astyanax_mexicanus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	72.487	ENSBTAG00000045617	MTERF1	95	72.751	Bos_taurus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	72.414	ENSCJAG00000014169	MTERF1	95	72.414	Callithrix_jacchus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	73.210	ENSCAFG00000001908	MTERF1	95	74.271	Canis_familiaris
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	73.210	ENSCAFG00020015983	MTERF1	95	74.271	Canis_lupus_dingo
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	72.149	ENSCHIG00000013172	MTERF1	94	72.149	Capra_hircus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	97	75.137	ENSTSYG00000012629	MTERF1	95	74.406	Carlito_syrichta
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	72.679	ENSCPOG00000003510	MTERF1	92	72.679	Cavia_porcellus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	72.944	ENSCCAG00000026587	MTERF1	95	72.944	Cebus_capucinus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	74.005	ENSCATG00000039620	MTERF1	94	74.005	Cercocebus_atys
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	75.332	ENSCSAG00000012508	MTERF1	94	75.332	Chlorocebus_sabaeus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	52.646	ENSCPBG00000021801	MTERF1	93	52.646	Chrysemys_picta_bellii
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	74.801	ENSCANG00000030925	MTERF1	94	74.801	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	82.228	ENSCGRG00001009716	-	99	82.228	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	82.228	ENSCGRG00000018838	-	99	82.228	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	93	48.148	ENSCVAG00000007837	MTERF1	91	48.295	Cyprinodon_variegatus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	90	45.773	ENSDARG00000086107	MTERF1	94	45.773	Danio_rerio
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	62	72.766	ENSDNOG00000032229	MTERF1	82	56.499	Dasypus_novemcinctus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	100	74.142	ENSDORG00000028877	-	99	74.142	Dipodomys_ordii
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	76.923	ENSEASG00005019646	MTERF1	96	76.923	Equus_asinus_asinus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	76.658	ENSECAG00000018128	MTERF1	96	76.658	Equus_caballus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	85	73.913	ENSEEUG00000013448	MTERF1	81	73.913	Erinaceus_europaeus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	86	52.454	ENSELUG00000014952	MTERF1	82	52.454	Esox_lucius
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	74.005	ENSFCAG00000044797	MTERF1	94	74.536	Felis_catus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	90	30.029	ENSFDAG00000004491	MTERF2	91	30.029	Fukomys_damarensis
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	86	51.376	ENSFHEG00000000224	MTERF1	85	51.376	Fundulus_heteroclitus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	86	48.485	ENSGMOG00000007262	-	97	48.182	Gadus_morhua
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	89	47.801	ENSGAFG00000008852	MTERF1	89	47.801	Gambusia_affinis
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	54.762	ENSGAGG00000025333	MTERF1	92	54.762	Gopherus_agassizii
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	75.332	ENSGGOG00000025995	MTERF1	96	75.332	Gorilla_gorilla
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	97	47.074	ENSHBUG00000022218	MTERF1	88	48.680	Haplochromis_burtoni
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	88	47.892	ENSHCOG00000016064	MTERF1	86	47.892	Hippocampus_comes
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	86	52.000	ENSIPUG00000004017	mterf1	84	52.000	Ictalurus_punctatus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	76.393	ENSSTOG00000001846	MTERF1	96	76.393	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	100	75.726	ENSJJAG00000011811	-	99	75.726	Jaculus_jaculus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	89	46.313	ENSKMAG00000009695	MTERF1	88	46.313	Kryptolebias_marmoratus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	94	51.685	ENSLACG00000009880	MTERF1	89	51.685	Latimeria_chalumnae
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	86	54.601	ENSLOCG00000018348	MTERF1	84	54.601	Lepisosteus_oculatus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	100	73.879	ENSLAFG00000000054	MTERF1	100	73.879	Loxodonta_africana
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	74.801	ENSMFAG00000038723	MTERF1	94	74.801	Macaca_fascicularis
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	74.801	ENSMMUG00000015516	MTERF1	99	74.801	Macaca_mulatta
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	74.801	ENSMNEG00000041445	MTERF1	94	74.801	Macaca_nemestrina
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	72.944	ENSMLEG00000008543	MTERF1	94	72.944	Mandrillus_leucophaeus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	86	52.294	ENSMAMG00000015682	MTERF1	85	52.294	Mastacembelus_armatus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	97	47.074	ENSMZEG00005026659	MTERF1	88	48.680	Maylandia_zebra
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	100	82.058	ENSMAUG00000006025	-	99	82.058	Mesocricetus_auratus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	76.658	ENSMICG00000046314	MTERF1	95	76.658	Microcebus_murinus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	62	83.898	MGP_CAROLIEiJ_G0026941	-	96	83.898	Mus_caroli
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	100	94.987	MGP_PahariEiJ_G0021712	-	99	94.987	Mus_pahari
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	100	94.987	MGP_PahariEiJ_G0021713	-	99	94.987	Mus_pahari
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	100	97.625	MGP_SPRETEiJ_G0027936	-	100	97.625	Mus_spretus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	100	97.625	MGP_SPRETEiJ_G0027937	-	100	97.625	Mus_spretus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	74.801	ENSMPUG00000008568	MTERF1	94	74.801	Mustela_putorius_furo
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	72.679	ENSMLUG00000011330	MTERF1	94	72.679	Myotis_lucifugus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	100	79.156	ENSNGAG00000014383	-	98	79.156	Nannospalax_galili
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	75.066	ENSNLEG00000015192	MTERF1	94	75.066	Nomascus_leucogenys
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	75.862	ENSODEG00000000904	-	93	75.862	Octodon_degus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	75.862	ENSODEG00000014952	-	93	75.862	Octodon_degus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	95	48.343	ENSONIG00000019792	MTERF1	95	48.343	Oreochromis_niloticus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	80	53.770	ENSOANG00000004680	-	98	53.770	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	76.923	ENSOCUG00000010902	MTERF1	94	76.923	Oryctolagus_cuniculus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	90	47.661	ENSORLG00000027811	MTERF1	89	47.661	Oryzias_latipes
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	90	48.246	ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	48.246	Oryzias_melastigma
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	75.862	ENSOGAG00000001378	MTERF1	94	75.862	Otolemur_garnettii
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	71.618	ENSOARG00000016682	MTERF1	94	71.618	Ovis_aries
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	75.597	ENSPPAG00000027361	MTERF1	96	75.597	Pan_paniscus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	74.005	ENSPPRG00000002171	MTERF1	94	74.005	Panthera_pardus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	74.005	ENSPTIG00000016254	MTERF1	94	74.536	Panthera_tigris_altaica
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	75.332	ENSPTRG00000052592	-	96	75.332	Pan_troglodytes
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	75.332	ENSPTRG00000019388	MTERF1	96	75.332	Pan_troglodytes
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	75.066	ENSPANG00000007445	MTERF1	94	75.155	Papio_anubis
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	74	31.338	ENSPKIG00000000498	mterf2	80	31.338	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	87	52.744	ENSPKIG00000017556	MTERF1	88	52.744	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	87	52.744	ENSPKIG00000017849	MTERF1	88	52.744	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	52.910	ENSPSIG00000016905	MTERF1	94	52.910	Pelodiscus_sinensis
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	84.881	ENSPEMG00000013884	-	99	84.881	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	87	38.720	ENSPMAG00000007898	MTERF1	98	38.720	Petromyzon_marinus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	89	49.853	ENSPFOG00000006919	MTERF1	88	49.853	Poecilia_formosa
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	90	49.854	ENSPLAG00000011584	MTERF1	89	49.854	Poecilia_latipinna
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	87	50.152	ENSPREG00000012369	MTERF1	86	50.152	Poecilia_reticulata
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	96	74.862	ENSPPYG00000017826	MTERF1	88	74.862	Pongo_abelii
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	76.658	ENSPCOG00000013179	MTERF1	94	76.658	Propithecus_coquereli
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	69	80.916	ENSPVAG00000006613	MTERF1	66	80.916	Pteropus_vampyrus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	97	46.809	ENSPNYG00000009120	MTERF1	88	48.387	Pundamilia_nyererei
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	86	52.308	ENSPNAG00000022366	MTERF1	85	52.308	Pygocentrus_nattereri
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	100	89.446	ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	89.446	Rattus_norvegicus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	74.536	ENSRBIG00000027323	MTERF1	94	74.536	Rhinopithecus_bieti
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	74.536	ENSRROG00000031256	MTERF1	94	74.536	Rhinopithecus_roxellana
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	72.414	ENSSBOG00000034146	MTERF1	99	72.414	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	94	50.838	ENSSFOG00015008650	mterf1	94	50.838	Scleropages_formosus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	86	51.070	ENSSMAG00000004934	MTERF1	71	51.070	Scophthalmus_maximus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	87	49.245	ENSSDUG00000013580	MTERF1	86	49.245	Seriola_dumerili
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	94	44.538	ENSSPUG00000017132	MTERF1	94	44.538	Sphenodon_punctatus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	90	51.906	ENSSPAG00000018734	MTERF1	89	51.906	Stegastes_partitus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	72.679	ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	73.210	Sus_scrofa
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	86	50.769	ENSTRUG00000013118	MTERF1	83	48.580	Takifugu_rubripes
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	100	76.517	ENSTBEG00000005760	MTERF1	96	76.517	Tupaia_belangeri
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	74.005	ENSTTRG00000010321	MTERF1	94	74.536	Tursiops_truncatus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	75.597	ENSUAMG00000022225	MTERF1	94	75.597	Ursus_americanus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	75.332	ENSUMAG00000018642	MTERF1	94	75.332	Ursus_maritimus
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	74.271	ENSVPAG00000005202	MTERF1	95	74.271	Vicugna_pacos
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	72.944	ENSVVUG00000013841	MTERF1	94	74.005	Vulpes_vulpes
ENSMUSG00000040429	Mterf1a	90	51.462	ENSXETG00000027398	mterf1	90	51.462	Xenopus_tropicalis

Gene Ontology

Go ID	Go_term	PubmedID	Evidence	Category
GO:0003677	DNA binding	-	IEA	Function
GO:0003690	double-stranded DNA binding	-	ISO	Function
GO:0005515	protein binding	21097510.	IPI	Function
GO:0005739	mitochondrion	18614015.	HDA	Component
GO:0005739	mitochondrion	15582606.	IDA	Component
GO:0005739	mitochondrion	-	ISO	Component
GO:0005829	cytosol	-	ISO	Component
GO:0006353	DNA-templated transcription, termination	-	IEA	Process
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-templated	-	IEA	Process
GO:0006393	termination of mitochondrial transcription	21873635.	IBA	Process
GO:0042645	mitochondrial nucleoid	-	ISO	Component