EuRBPDB

Description

RBDs

Expression

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSMUSG00000042500 (Gene tree)
Gene ID: 76850
Gene Symbol: Ago4
Alias: 5730550L01Rik|Eif2c4|argonaute 4
Full Name: argonaute RISC catalytic subunit 4
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 43932 bases
Position: chr4:126489541-126533472
Accession: 1924100
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMUSP00000081312	PAZ	PF02170.22	3.4e-28	1	1
ENSMUSP00000081312	Piwi	PF02171.17	6.4e-104	1	1

Expression

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMUST00000084289	-	6537	XM_006503481	ENSMUSP00000081312	861 (aa)	XP_006503544	Q8CJF8
ENSMUST00000122951	-	574	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSMUSG00000042500's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMUSG00000042500's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	80.734	ENSMUSG00000028842	Ago3	100	80.734
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	82.670	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	84.248
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	78.077	ENSMUSG00000036698	Ago2	98	78.077

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.839	ENSG00000134698	AGO4	100	98.839	Homo_sapiens
ENSMUSG00000042500	Ago4	96	95.227	ENSAPOG00000023867	ago4	99	95.227	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.370	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	98.370	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMUSG00000042500	Ago4	92	96.599	ENSACIG00000014548	ago4	100	96.599	Amphilophus_citrinellus
ENSMUSG00000042500	Ago4	92	91.940	ENSAPEG00000022426	ago4	100	91.940	Amphiprion_percula
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.309	ENSATEG00000006717	ago4	100	95.280	Anabas_testudineus
ENSMUSG00000042500	Ago4	98	98.347	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	98.347	Anas_platyrhynchos
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	97.427	ENSACAG00000017275	AGO4	99	97.427	Anolis_carolinensis
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.722	ENSANAG00000031428	AGO4	100	98.722	Aotus_nancymaae
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.195	ENSACLG00000005181	ago4	100	95.195	Astatotilapia_calliptera
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.423	ENSAMXG00000010318	ago4	100	95.423	Astyanax_mexicanus
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	97.669	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	97.669	Bos_taurus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.839	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	98.839	Callithrix_jacchus
ENSMUSG00000042500	Ago4	92	98.741	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	98.741	Canis_familiaris
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.722	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	98.722	Capra_hircus
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.713	ENSTSYG00000014007	AGO4	100	98.713	Carlito_syrichta
ENSMUSG00000042500	Ago4	94	95.526	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	95.526	Cavia_aperea
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	96.400	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	96.400	Cavia_porcellus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.839	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	98.839	Cebus_capucinus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.839	ENSCATG00000043421	AGO4	100	98.839	Cercocebus_atys
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.478	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	98.478	Chinchilla_lanigera
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.839	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	98.839	Chlorocebus_sabaeus
ENSMUSG00000042500	Ago4	80	99.174	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	99.174	Choloepus_hoffmanni
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.363	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.363	Chrysemys_picta_bellii
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.830	ENSCANG00000016914	AGO4	100	98.830	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	99.071	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	99.071	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	99.063	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	99.063	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMUSG00000042500	Ago4	92	90.578	ENSCSEG00000010696	ago4	100	90.578	Cynoglossus_semilaevis
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	96.640	ENSDARG00000100854	ago4	100	96.640	Danio_rerio
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.606	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	98.606	Dasypus_novemcinctus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.722	ENSDORG00000008933	Ago4	100	98.722	Dipodomys_ordii
ENSMUSG00000042500	Ago4	60	98.083	ENSETEG00000018390	AGO4	83	98.083	Echinops_telfairi
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.839	ENSEASG00005012079	AGO4	100	98.839	Equus_asinus_asinus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.839	ENSECAG00000024686	AGO4	100	98.839	Equus_caballus
ENSMUSG00000042500	Ago4	79	96.820	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	96.820	Erinaceus_europaeus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	94.761	ENSELUG00000023873	ago4	100	94.761	Esox_lucius
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.722	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	98.722	Felis_catus
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.712	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	98.712	Fukomys_damarensis
ENSMUSG00000042500	Ago4	97	88.038	ENSFHEG00000019658	ago4	100	88.038	Fundulus_heteroclitus
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	96.158	ENSGMOG00000009544	ago4	99	96.158	Gadus_morhua
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.374	ENSGALG00000039713	AGO4	100	98.374	Gallus_gallus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.195	ENSGAFG00000017239	ago4	100	95.195	Gambusia_affinis
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	96.512	ENSGACG00000002683	ago4	99	96.512	Gasterosteus_aculeatus
ENSMUSG00000042500	Ago4	92	98.237	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.237	Gopherus_agassizii
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	95.417	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	95.417	Gorilla_gorilla
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.195	ENSHBUG00000001525	ago4	100	95.195	Haplochromis_burtoni
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.722	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	98.722	Heterocephalus_glaber_female
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.824	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	98.824	Heterocephalus_glaber_male
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.080	ENSHCOG00000003725	ago4	100	95.080	Hippocampus_comes
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.309	ENSIPUG00000015600	ago4	100	95.309	Ictalurus_punctatus
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.721	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	98.721	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.309	ENSKMAG00000018602	ago4	100	95.309	Kryptolebias_marmoratus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	94.659	ENSLBEG00000010670	ago4	100	94.659	Labrus_bergylta
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	97.561	ENSLACG00000016888	AGO4	100	97.561	Latimeria_chalumnae
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.418	ENSLOCG00000000584	ago4	100	95.418	Lepisosteus_oculatus
ENSMUSG00000042500	Ago4	93	98.127	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	98.127	Loxodonta_africana
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.839	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	98.839	Macaca_fascicularis
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.601	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	97.619	Macaca_mulatta
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.839	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	98.839	Macaca_nemestrina
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.829	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	98.829	Mandrillus_leucophaeus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.195	ENSMAMG00000003874	ago4	100	95.195	Mastacembelus_armatus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.195	ENSMZEG00005026346	ago4	100	95.195	Maylandia_zebra
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.012	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	98.012	Meleagris_gallopavo
ENSMUSG00000042500	Ago4	82	99.265	ENSMAUG00000021743	Ago4	94	99.265	Mesocricetus_auratus
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.596	ENSMICG00000033507	AGO4	100	98.596	Microcebus_murinus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	99.187	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	99.187	Microtus_ochrogaster
ENSMUSG00000042500	Ago4	92	95.718	ENSMMOG00000013473	ago4	100	95.718	Mola_mola
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.490	ENSMODG00000017888	AGO4	100	98.490	Monodelphis_domestica
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	94.639	ENSMALG00000011797	ago4	100	94.639	Monopterus_albus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	99.652	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.652	Mus_caroli
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.374	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.374	Mus_pahari
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	99.652	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	99.652	Mus_spretus
ENSMUSG00000042500	Ago4	92	98.741	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	98.741	Mustela_putorius_furo
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	97.664	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	97.664	Myotis_lucifugus
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.712	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	98.712	Nannospalax_galili
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.195	ENSNBRG00000013492	ago4	100	95.195	Neolamprologus_brichardi
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.829	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	98.829	Nomascus_leucogenys
ENSMUSG00000042500	Ago4	90	97.846	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	97.846	Notamacropus_eugenii
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	91.452	ENSOPRG00000012309	AGO4	100	91.452	Ochotona_princeps
ENSMUSG00000042500	Ago4	93	98.622	ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.622	Octodon_degus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.195	ENSONIG00000013603	ago4	100	95.195	Oreochromis_niloticus
ENSMUSG00000042500	Ago4	92	98.363	ENSOANG00000002082	AGO4	100	98.363	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.606	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	98.606	Oryctolagus_cuniculus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.309	ENSORLG00000009865	ago4	92	95.309	Oryzias_latipes
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.309	ENSORLG00020016978	ago4	92	95.309	Oryzias_latipes_hni
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.309	ENSORLG00015008800	ago4	92	95.309	Oryzias_latipes_hsok
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.309	ENSOMEG00000006399	ago4	100	95.309	Oryzias_melastigma
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	89.779	ENSOGAG00000027107	-	100	89.779	Otolemur_garnettii
ENSMUSG00000042500	Ago4	93	97.372	ENSOGAG00000004233	-	100	97.372	Otolemur_garnettii
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	97.905	ENSOARG00000019568	AGO4	98	97.905	Ovis_aries
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.829	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	98.829	Pan_paniscus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.722	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	98.722	Panthera_pardus
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.712	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	98.712	Panthera_tigris_altaica
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.839	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	98.839	Pan_troglodytes
ENSMUSG00000042500	Ago4	92	98.741	ENSPANG00000007232	AGO4	100	98.741	Papio_anubis
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.080	ENSPKIG00000022598	ago4	100	95.080	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.363	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	98.363	Pelodiscus_sinensis
ENSMUSG00000042500	Ago4	92	96.474	ENSPMGG00000023325	ago4	100	96.474	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	88.413	ENSPEMG00000022651	-	97	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.490	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	98.490	Phascolarctos_cinereus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.309	ENSPFOG00000001935	ago4	100	95.309	Poecilia_formosa
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	96.524	ENSPLAG00000011534	ago4	100	96.524	Poecilia_latipinna
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.309	ENSPMEG00000005049	ago4	100	95.309	Poecilia_mexicana
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.309	ENSPREG00000010315	ago4	100	95.309	Poecilia_reticulata
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.829	ENSPPYG00000001552	AGO4	100	98.829	Pongo_abelii
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.480	ENSPCOG00000015935	AGO4	100	98.480	Propithecus_coquereli
ENSMUSG00000042500	Ago4	87	100.000	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.195	ENSPNYG00000002089	ago4	100	95.195	Pundamilia_nyererei
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	96.060	ENSPNAG00000005191	ago4	100	96.060	Pygocentrus_nattereri
ENSMUSG00000042500	Ago4	69	97.990	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	97.990	Rattus_norvegicus
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	97.650	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	97.650	Rhinopithecus_bieti
ENSMUSG00000042500	Ago4	92	98.741	ENSRROG00000035783	AGO4	100	98.741	Rhinopithecus_roxellana
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	94.878	ENSSBOG00000026529	AGO4	100	98.679	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	97.677	ENSSHAG00000017320	AGO4	100	97.677	Sarcophilus_harrisii
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.309	ENSSFOG00015022028	ago4	100	95.309	Scleropages_formosus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	92.849	ENSSMAG00000000808	ago4	93	94.543	Scophthalmus_maximus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	94.337	ENSSDUG00000020781	ago4	100	95.970	Seriola_dumerili
ENSMUSG00000042500	Ago4	92	96.599	ENSSLDG00000021841	ago4	100	96.599	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMUSG00000042500	Ago4	79	99.275	ENSSARG00000011504	AGO4	79	99.275	Sorex_araneus
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.026	ENSSPUG00000000889	AGO4	100	98.026	Sphenodon_punctatus
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	92.824	ENSTGUG00000001631	AGO4	99	92.093	Taeniopygia_guttata
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	94.966	ENSTRUG00000008052	ago4	100	94.966	Takifugu_rubripes
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	96.149	ENSTNIG00000006331	ago4	99	96.149	Tetraodon_nigroviridis
ENSMUSG00000042500	Ago4	77	100.000	ENSTBEG00000016478	AGO4	77	100.000	Tupaia_belangeri
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	94.965	ENSTTRG00000015086	AGO4	100	94.965	Tursiops_truncatus
ENSMUSG00000042500	Ago4	92	98.741	ENSUAMG00000027156	-	100	98.741	Ursus_americanus
ENSMUSG00000042500	Ago4	99	96.624	ENSUMAG00000006297	AGO4	99	95.449	Ursus_maritimus
ENSMUSG00000042500	Ago4	88	98.024	ENSVPAG00000006662	AGO4	100	98.024	Vicugna_pacos
ENSMUSG00000042500	Ago4	92	98.741	ENSVVUG00000000465	-	100	98.741	Vulpes_vulpes
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	84.803	ENSXETG00000009664	ago4	100	84.803	Xenopus_tropicalis
ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.309	ENSXMAG00000016657	ago4	100	95.309	Xiphophorus_maculatus

Gene Ontology

Go ID	Go_term	PubmedID	Evidence	Category
GO:0000932	P-body	19898466.	IDA	Component
GO:0003676	nucleic acid binding	-	IEA	Function
GO:0003723	RNA binding	19536157.	IDA	Function
GO:0003725	double-stranded RNA binding	-	ISO	Function
GO:0003727	single-stranded RNA binding	-	ISO	Function
GO:0005634	nucleus	22863743.	IDA	Component
GO:0005654	nucleoplasm	-	ISO	Component
GO:0005737	cytoplasm	-	ISO	Component
GO:0005829	cytosol	-	ISO	Component
GO:0006402	mRNA catabolic process	-	ISO	Process
GO:0006417	regulation of translation	-	IEA	Process
GO:0007130	synaptonemal complex assembly	22863743.	IMP	Process
GO:0007140	male meiotic nuclear division	22863743.	IMP	Process
GO:0008584	male gonad development	22863743.	IMP	Process
GO:0010501	RNA secondary structure unwinding	-	ISO	Process
GO:0010586	miRNA metabolic process	22863743.	IMP	Process
GO:0016442	RISC complex	-	ISO	Component
GO:0016604	nuclear body	-	ISO	Component
GO:0022604	regulation of cell morphogenesis	22863743.	IMP	Process
GO:0031047	gene silencing by RNA	-	IEA	Process
GO:0031054	pre-miRNA processing	-	ISO	Process
GO:0035068	micro-ribonucleoprotein complex	19536157.	IDA	Component
GO:0035196	production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA	-	ISO	Process
GO:0035198	miRNA binding	-	ISO	Function
GO:0035278	miRNA mediated inhibition of translation	-	ISO	Process
GO:0035280	miRNA loading onto RISC involved in gene silencing by miRNA	-	ISO	Process
GO:0043066	negative regulation of apoptotic process	22863743.	IMP	Process
GO:0070578	RISC-loading complex	-	ISO	Component