EuRBPDB

Description

RBDs

RBPome

Expression

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSMUSG00000052928 (Gene tree)
Gene ID: 269037
Gene Symbol: Ctif
Alias: Gm672|LOC269037
Full Name: CBP80/20-dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus
Status: confidence
Strand: Minus strand
Length: 266473 bases
Position: chr18:75431224-75697696
Accession: 2685518
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMUSP00000129974	MIF4G	PF02854.19	1.1e-27	1	1

RNA binding proteome (RBPome)

PID	Title	Method	Time	Author	Doi
27452465	The Cardiomyocyte RNA Binding Proteome: Links to Intermediary Metabolism and Heart Disease	IC & HL_1	2016 Jul 21	Liao Y	DOI: 10.1016/j.celrep.2016.06.084

Expression

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMUST00000165559	-	6173	XM_006525967	ENSMUSP00000129974	623 (aa)	XP_006526030	E9Q1U6

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	90.048	ENSG00000134030	CTIF	100	95.652	Homo_sapiens
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	57.254	ENSAPOG00000020192	ctif	99	56.942	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMUSG00000052928	Ctif	88	88.462	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	88.462	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	51.781	ENSACIG00000017099	ctif	99	53.030	Amphilophus_citrinellus
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	53.107	ENSAOCG00000014275	ctif	99	53.662	Amphiprion_ocellaris
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	53.665	ENSAPEG00000016975	ctif	99	55.761	Amphiprion_percula
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	54.290	ENSATEG00000016752	ctif	99	54.802	Anabas_testudineus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	72.754	ENSACAG00000018006	CTIF	100	72.904	Anolis_carolinensis
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	88.782	ENSANAG00000024925	CTIF	100	88.782	Aotus_nancymaae
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	54.972	ENSACLG00000005956	ctif	99	55.524	Astatotilapia_calliptera
ENSMUSG00000052928	Ctif	62	56.555	ENSAMXG00000015964	ctif	100	50.685	Astyanax_mexicanus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	86.998	ENSBTAG00000018901	CTIF	100	86.998	Bos_taurus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.263	ENSCJAG00000004729	CTIF	100	89.263	Callithrix_jacchus
ENSMUSG00000052928	Ctif	97	89.127	ENSCAFG00000019076	CTIF	100	89.246	Canis_familiaris
ENSMUSG00000052928	Ctif	97	88.962	ENSCAFG00020026482	CTIF	100	89.085	Canis_lupus_dingo
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	86.538	ENSCHIG00000014455	CTIF	100	86.538	Capra_hircus
ENSMUSG00000052928	Ctif	90	80.817	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	80.817	Carlito_syrichta
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	82.051	ENSCAPG00000011865	CTIF	100	82.692	Cavia_aperea
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	88.301	ENSCPOG00000001049	CTIF	100	88.301	Cavia_porcellus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.103	ENSCCAG00000022758	CTIF	100	89.103	Cebus_capucinus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.888	ENSCATG00000038134	CTIF	100	89.888	Cercocebus_atys
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.331	ENSCLAG00000008174	CTIF	100	89.331	Chinchilla_lanigera
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	87.637	ENSCSAG00000018021	CTIF	100	87.637	Chlorocebus_sabaeus
ENSMUSG00000052928	Ctif	50	83.333	ENSCHOG00000009041	-	71	83.333	Choloepus_hoffmanni
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	78.662	ENSCPBG00000025654	CTIF	100	78.662	Chrysemys_picta_bellii
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	90.048	ENSCANG00000030916	CTIF	100	90.048	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	93.269	ENSCGRG00001020158	Ctif	100	93.269	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.744	ENSCGRG00000000052	Ctif	100	89.744	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMUSG00000052928	Ctif	61	59.596	ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.352	Cynoglossus_semilaevis
ENSMUSG00000052928	Ctif	94	58.049	ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.443	Cyprinodon_variegatus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	53.488	ENSDARG00000090617	ctif	100	56.044	Danio_rerio
ENSMUSG00000052928	Ctif	73	86.374	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	86.374	Dasypus_novemcinctus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	90.048	ENSDORG00000003221	Ctif	100	90.048	Dipodomys_ordii
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.246	ENSEASG00005016094	CTIF	100	89.246	Equus_asinus_asinus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.727	ENSECAG00000020473	CTIF	100	89.727	Equus_caballus
ENSMUSG00000052928	Ctif	90	80.284	ENSEEUG00000012451	CTIF	100	80.284	Erinaceus_europaeus
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	60.957	ENSELUG00000008733	ctif	99	60.742	Esox_lucius
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.085	ENSFCAG00000000664	CTIF	100	89.085	Felis_catus
ENSMUSG00000052928	Ctif	97	78.347	ENSFALG00000008943	CTIF	97	78.347	Ficedula_albicollis
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.423	ENSFDAG00000017379	CTIF	100	89.423	Fukomys_damarensis
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	55.047	ENSFHEG00000004334	ctif	99	54.859	Fundulus_heteroclitus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	77.047	ENSGALG00000035912	-	100	77.047	Gallus_gallus
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	56.260	ENSGAFG00000011896	ctif	99	55.878	Gambusia_affinis
ENSMUSG00000052928	Ctif	69	72.093	ENSGAGG00000020663	CTIF	97	71.765	Gopherus_agassizii
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	90.048	ENSGGOG00000015204	CTIF	100	90.048	Gorilla_gorilla
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	55.114	ENSHBUG00000018092	ctif	99	55.666	Haplochromis_burtoni
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	88.301	ENSHGLG00000005663	CTIF	100	88.301	Heterocephalus_glaber_female
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	88.141	ENSHGLG00100006976	CTIF	100	88.141	Heterocephalus_glaber_male
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	54.705	ENSHCOG00000011784	ctif	99	55.821	Hippocampus_comes
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	53.617	ENSIPUG00000014050	ctif	99	52.949	Ictalurus_punctatus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.246	ENSSTOG00000001967	CTIF	100	89.246	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	92.135	ENSJJAG00000013706	Ctif	100	92.135	Jaculus_jaculus
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	52.782	ENSKMAG00000014651	ctif	99	53.923	Kryptolebias_marmoratus
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	59.777	ENSLBEG00000018277	ctif	99	60.697	Labrus_bergylta
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	59.888	ENSLOCG00000011697	ctif	100	61.364	Lepisosteus_oculatus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	82.692	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	89.236	Loxodonta_africana
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	90.209	ENSMFAG00000037903	CTIF	100	90.209	Macaca_fascicularis
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.888	ENSMMUG00000020898	CTIF	100	89.888	Macaca_mulatta
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.888	ENSMNEG00000039395	CTIF	100	89.888	Macaca_nemestrina
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	90.209	ENSMLEG00000041132	CTIF	100	90.209	Mandrillus_leucophaeus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	56.188	ENSMAMG00000014741	ctif	99	56.757	Mastacembelus_armatus
ENSMUSG00000052928	Ctif	89	51.654	ENSMZEG00005019767	ctif	90	52.276	Maylandia_zebra
ENSMUSG00000052928	Ctif	89	50.799	ENSMGAG00000001378	CTIF	100	50.622	Meleagris_gallopavo
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	91.493	ENSMAUG00000000656	Ctif	100	91.493	Mesocricetus_auratus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.727	ENSMICG00000010167	CTIF	100	89.727	Microcebus_murinus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	91.974	ENSMOCG00000020507	Ctif	100	91.974	Microtus_ochrogaster
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	52.374	ENSMMOG00000000831	ctif	99	52.875	Mola_mola
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	78.447	ENSMODG00000003464	CTIF	100	78.447	Monodelphis_domestica
ENSMUSG00000052928	Ctif	85	53.125	ENSMALG00000020553	ctif	99	54.044	Monopterus_albus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	99.037	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	100	99.037	Mus_caroli
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	98.237	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	100	98.237	Mus_pahari
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	99.518	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	100	99.518	Mus_spretus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.246	ENSMPUG00000000844	CTIF	100	89.246	Mustela_putorius_furo
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	88.764	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	88.764	Myotis_lucifugus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	92.135	ENSNGAG00000011452	Ctif	100	92.135	Nannospalax_galili
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	55.398	ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.119	Neolamprologus_brichardi
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	90.209	ENSNLEG00000011503	CTIF	100	90.209	Nomascus_leucogenys
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	73.558	ENSMEUG00000000218	CTIF	100	73.558	Notamacropus_eugenii
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	85.233	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	85.233	Ochotona_princeps
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	88.782	ENSODEG00000018390	CTIF	100	88.782	Octodon_degus
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	61.189	ENSONIG00000007750	ctif	99	61.346	Oreochromis_niloticus
ENSMUSG00000052928	Ctif	85	65.705	ENSOANG00000001337	CTIF	100	65.705	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	86.517	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	86.517	Oryctolagus_cuniculus
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	56.542	ENSORLG00000005786	ctif	99	57.076	Oryzias_latipes
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	56.406	ENSORLG00020005385	ctif	99	56.942	Oryzias_latipes_hni
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	55.956	ENSORLG00015011872	ctif	99	56.495	Oryzias_latipes_hsok
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	53.276	ENSOMEG00000007917	ctif	99	53.627	Oryzias_melastigma
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.406	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	89.406	Otolemur_garnettii
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	87.640	ENSOARG00000003754	CTIF	100	87.640	Ovis_aries
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	90.048	ENSPPAG00000023554	CTIF	100	90.048	Pan_paniscus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	88.925	ENSPPRG00000002265	CTIF	100	88.925	Panthera_pardus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	88.764	ENSPTIG00000013761	CTIF	100	88.764	Panthera_tigris_altaica
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	89.888	ENSPTRG00000010009	CTIF	100	89.888	Pan_troglodytes
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	90.209	ENSPANG00000017087	CTIF	100	90.209	Papio_anubis
ENSMUSG00000052928	Ctif	85	60.821	ENSPKIG00000011234	ctif	100	61.121	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	75.801	ENSPSIG00000006508	CTIF	100	75.801	Pelodiscus_sinensis
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	48.960	ENSPMGG00000022958	ctif	99	48.750	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	92.147	ENSPEMG00000022746	Ctif	100	92.147	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMUSG00000052928	Ctif	77	79.123	ENSPCIG00000026247	CTIF	95	79.123	Phascolarctos_cinereus
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	60.250	ENSPFOG00000009243	ctif	99	60.250	Poecilia_formosa
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	57.034	ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.339	Poecilia_latipinna
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	53.007	ENSPMEG00000020089	ctif	99	54.126	Poecilia_mexicana
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	50.341	ENSPREG00000017326	ctif	99	50.477	Poecilia_reticulata
ENSMUSG00000052928	Ctif	85	88.491	ENSPPYG00000009147	CTIF	100	88.491	Pongo_abelii
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	87.200	ENSPCOG00000013391	CTIF	100	87.200	Propithecus_coquereli
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	88.000	ENSPVAG00000001965	CTIF	100	88.000	Pteropus_vampyrus
ENSMUSG00000052928	Ctif	99	59.184	ENSPNYG00000007879	ctif	99	59.498	Pundamilia_nyererei
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	54.571	ENSPNAG00000029174	ctif	100	56.338	Pygocentrus_nattereri
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	93.258	ENSRNOG00000018342	Ctif	100	93.258	Rattus_norvegicus
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	90.209	ENSRBIG00000043937	CTIF	100	90.209	Rhinopithecus_bieti
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	90.048	ENSRROG00000006039	CTIF	100	90.048	Rhinopithecus_roxellana
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	88.782	ENSSBOG00000028468	CTIF	100	88.782	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMUSG00000052928	Ctif	100	76.923	ENSSHAG00000016321	CTIF	100	76.923	Sarcophilus_harrisii
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