EuRBPDB

Description

RBDs

Expression

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSMUSG00000053178 (Gene tree)
Gene ID: 208595
Gene Symbol: Mterf1b
Alias: Gm9897
Full Name: mitochondrial transcription termination factor 1b
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5285 bases
Position: chr5:4192367-4197651
Accession: 3704243
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMUSP00000135408	mTERF	PF02536.14	3.7e-79	1	1

Expression

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMUST00000177258	-	1368	XM_006503569	ENSMUSP00000135408	381 (aa)	XP_006503632	A0A096P6K7

Gene Model

Click here to download ENSMUSG00000053178's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMUSG00000053178's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	98.681	ENSMUSG00000040429	Mterf1a	100	98.681

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.661	ENSG00000127989	MTERF1	99	75.597	Homo_sapiens
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	88	51.039	ENSAPOG00000022230	MTERF1	87	51.039	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	89	68.437	ENSAMEG00000007917	-	97	68.437	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	95	48.780	ENSACIG00000017700	MTERF1	89	50.145	Amphilophus_citrinellus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	88	50.148	ENSAOCG00000004345	MTERF1	87	50.148	Amphiprion_ocellaris
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	88	50.148	ENSAPEG00000005877	MTERF1	87	50.148	Amphiprion_percula
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	95	49.171	ENSATEG00000011055	MTERF1	93	49.171	Anabas_testudineus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	88	47.929	ENSACAG00000015777	MTERF1	85	47.929	Anolis_carolinensis
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	73.545	ENSANAG00000022640	MTERF1	97	73.545	Aotus_nancymaae
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	97	47.074	ENSACLG00000011571	MTERF1	89	48.986	Astatotilapia_calliptera
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	84	50.779	ENSAMXG00000017008	MTERF1	91	50.779	Astyanax_mexicanus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	72.296	ENSBTAG00000045617	MTERF1	95	72.559	Bos_taurus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	72.751	ENSCJAG00000014169	MTERF1	95	72.751	Callithrix_jacchus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	73.351	ENSCAFG00000001908	MTERF1	96	74.406	Canis_familiaris
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	73.351	ENSCAFG00020015983	MTERF1	96	74.406	Canis_lupus_dingo
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	72.222	ENSCHIG00000013172	MTERF1	95	72.222	Capra_hircus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	96	75.204	ENSTSYG00000012629	MTERF1	95	74.474	Carlito_syrichta
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	72.823	ENSCPOG00000003510	MTERF1	92	72.823	Cavia_porcellus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	73.280	ENSCCAG00000026587	MTERF1	96	73.280	Cebus_capucinus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	74.339	ENSCATG00000039620	MTERF1	94	74.339	Cercocebus_atys
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.661	ENSCSAG00000012508	MTERF1	94	75.661	Chlorocebus_sabaeus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	52.646	ENSCPBG00000021801	MTERF1	93	52.646	Chrysemys_picta_bellii
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.132	ENSCANG00000030925	MTERF1	94	75.132	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	82.322	ENSCGRG00001009716	-	99	82.322	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	82.493	ENSCGRG00000018838	-	99	82.493	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	92	48.148	ENSCVAG00000007837	MTERF1	91	48.295	Cyprinodon_variegatus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	85	47.692	ENSDARG00000086107	MTERF1	89	47.692	Danio_rerio
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	62	72.766	ENSDNOG00000032229	MTERF1	83	56.878	Dasypus_novemcinctus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	74.474	ENSDORG00000028877	-	99	74.474	Dipodomys_ordii
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	76.984	ENSEASG00005019646	MTERF1	96	76.984	Equus_asinus_asinus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	76.720	ENSECAG00000018128	MTERF1	96	76.720	Equus_caballus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	85	73.913	ENSEEUG00000013448	MTERF1	81	73.913	Erinaceus_europaeus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	86	52.454	ENSELUG00000014952	MTERF1	82	52.454	Esox_lucius
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	74.603	ENSFCAG00000044797	MTERF1	94	75.132	Felis_catus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	86	51.376	ENSFHEG00000000224	MTERF1	85	51.376	Fundulus_heteroclitus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	85	48.182	ENSGMOG00000007262	-	97	48.182	Gadus_morhua
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	89	47.801	ENSGAFG00000008852	MTERF1	89	47.801	Gambusia_affinis
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	54.762	ENSGAGG00000025333	MTERF1	92	54.762	Gopherus_agassizii
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.661	ENSGGOG00000025995	MTERF1	96	75.661	Gorilla_gorilla
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	97	47.074	ENSHBUG00000022218	MTERF1	89	48.986	Haplochromis_burtoni
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	90	47.093	ENSHCOG00000016064	MTERF1	90	47.093	Hippocampus_comes
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	85	52.000	ENSIPUG00000004017	mterf1	84	52.000	Ictalurus_punctatus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	76.720	ENSSTOG00000001846	MTERF1	96	76.720	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.726	ENSJJAG00000011811	-	99	75.726	Jaculus_jaculus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	88	46.313	ENSKMAG00000009695	MTERF1	88	46.313	Kryptolebias_marmoratus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	93	51.685	ENSLACG00000009880	MTERF1	89	51.685	Latimeria_chalumnae
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	86	54.601	ENSLOCG00000018348	MTERF1	84	54.601	Lepisosteus_oculatus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	74.142	ENSLAFG00000000054	MTERF1	100	74.142	Loxodonta_africana
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.132	ENSMFAG00000038723	MTERF1	94	75.132	Macaca_fascicularis
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.132	ENSMMUG00000015516	MTERF1	99	75.066	Macaca_mulatta
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.132	ENSMNEG00000041445	MTERF1	94	75.132	Macaca_nemestrina
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	73.280	ENSMLEG00000008543	MTERF1	94	73.280	Mandrillus_leucophaeus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	94	49.020	ENSMAMG00000015682	MTERF1	92	49.020	Mastacembelus_armatus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	97	47.074	ENSMZEG00005026659	MTERF1	89	48.986	Maylandia_zebra
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	100	82.415	ENSMAUG00000006025	-	100	82.415	Mesocricetus_auratus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	76.984	ENSMICG00000046314	MTERF1	95	76.984	Microcebus_murinus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	62	84.454	MGP_CAROLIEiJ_G0026941	-	97	84.454	Mus_caroli
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	100	95.801	MGP_PahariEiJ_G0021713	-	100	95.801	Mus_pahari
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	100	95.801	MGP_PahariEiJ_G0021712	-	100	95.801	Mus_pahari
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	98.153	MGP_SPRETEiJ_G0027937	-	100	98.153	Mus_spretus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	98.153	MGP_SPRETEiJ_G0027936	-	100	98.153	Mus_spretus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.132	ENSMPUG00000008568	MTERF1	94	75.132	Mustela_putorius_furo
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	73.016	ENSMLUG00000011330	MTERF1	94	73.016	Myotis_lucifugus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	100	79.265	ENSNGAG00000014383	-	98	79.265	Nannospalax_galili
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.397	ENSNLEG00000015192	MTERF1	94	75.397	Nomascus_leucogenys
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.926	ENSODEG00000014952	-	94	75.926	Octodon_degus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.926	ENSODEG00000000904	-	94	75.926	Octodon_degus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	94	48.343	ENSONIG00000019792	MTERF1	95	48.343	Oreochromis_niloticus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	80	53.770	ENSOANG00000004680	-	98	53.770	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	76.984	ENSOCUG00000010902	MTERF1	94	76.984	Oryctolagus_cuniculus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	88	48.071	ENSORLG00000027811	MTERF1	88	48.071	Oryzias_latipes
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	90	48.538	ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	48.538	Oryzias_melastigma
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.926	ENSOGAG00000001378	MTERF1	94	75.926	Otolemur_garnettii
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	71.693	ENSOARG00000016682	MTERF1	95	71.693	Ovis_aries
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.926	ENSPPAG00000027361	MTERF1	96	75.926	Pan_paniscus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	74.339	ENSPPRG00000002171	MTERF1	94	74.339	Panthera_pardus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	74.339	ENSPTIG00000016254	MTERF1	94	74.868	Panthera_tigris_altaica
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.661	ENSPTRG00000019388	MTERF1	96	75.661	Pan_troglodytes
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.661	ENSPTRG00000052592	-	96	75.661	Pan_troglodytes
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.132	ENSPANG00000007445	MTERF1	94	75.232	Papio_anubis
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	86	52.744	ENSPKIG00000017849	MTERF1	88	52.744	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	86	52.744	ENSPKIG00000017556	MTERF1	88	52.744	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	74	31.338	ENSPKIG00000000498	mterf2	80	31.338	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	52.910	ENSPSIG00000016905	MTERF1	94	52.910	Pelodiscus_sinensis
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	85.488	ENSPEMG00000013884	-	99	85.488	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	86	38.720	ENSPMAG00000007898	MTERF1	98	38.720	Petromyzon_marinus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	89	49.853	ENSPFOG00000006919	MTERF1	88	49.853	Poecilia_formosa
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	90	49.854	ENSPLAG00000011584	MTERF1	89	49.854	Poecilia_latipinna
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	86	50.152	ENSPREG00000012369	MTERF1	86	50.152	Poecilia_reticulata
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	95	75.207	ENSPPYG00000017826	MTERF1	88	75.207	Pongo_abelii
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	76.984	ENSPCOG00000013179	MTERF1	95	76.984	Propithecus_coquereli
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	69	80.916	ENSPVAG00000006613	MTERF1	66	80.916	Pteropus_vampyrus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	97	46.809	ENSPNYG00000009120	MTERF1	89	48.696	Pundamilia_nyererei
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	85	52.308	ENSPNAG00000022366	MTERF1	85	52.308	Pygocentrus_nattereri
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	89.710	ENSRNOG00000007899	Mterf1	100	89.710	Rattus_norvegicus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	74.868	ENSRBIG00000027323	MTERF1	94	74.868	Rhinopithecus_bieti
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	74.868	ENSRROG00000031256	MTERF1	94	74.868	Rhinopithecus_roxellana
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	72.679	ENSSBOG00000034146	MTERF1	99	72.679	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	88	53.274	ENSSFOG00015008650	mterf1	88	53.274	Scleropages_formosus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	86	51.070	ENSSMAG00000004934	MTERF1	71	51.070	Scophthalmus_maximus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	87	49.245	ENSSDUG00000013580	MTERF1	86	49.245	Seriola_dumerili
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	94	44.538	ENSSPUG00000017132	MTERF1	94	44.538	Sphenodon_punctatus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	90	51.453	ENSSPAG00000018734	MTERF1	90	51.453	Stegastes_partitus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	72.751	ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	73.210	Sus_scrofa
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	85	50.769	ENSTRUG00000013118	MTERF1	83	48.580	Takifugu_rubripes
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	76.781	ENSTBEG00000005760	MTERF1	96	76.781	Tupaia_belangeri
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	74.074	ENSTTRG00000010321	MTERF1	94	74.603	Tursiops_truncatus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.926	ENSUAMG00000022225	MTERF1	94	75.926	Ursus_americanus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	75.661	ENSUMAG00000018642	MTERF1	94	75.661	Ursus_maritimus
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	74.603	ENSVPAG00000005202	MTERF1	95	74.603	Vicugna_pacos
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	73.087	ENSVVUG00000013841	MTERF1	94	74.142	Vulpes_vulpes
ENSMUSG00000053178	Mterf1b	90	51.462	ENSXETG00000027398	mterf1	90	51.462	Xenopus_tropicalis

Gene Ontology

Go ID	Go_term	PubmedID	Evidence	Category
GO:0003677	DNA binding	-	IEA	Function
GO:0003690	double-stranded DNA binding	-	ISO	Function
GO:0005739	mitochondrion	18614015.	HDA	Component
GO:0005739	mitochondrion	-	ISO	Component
GO:0005829	cytosol	-	ISO	Component
GO:0006353	DNA-templated transcription, termination	-	IEA	Process
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-templated	-	IEA	Process
GO:0006391	transcription initiation from mitochondrial promoter	23562081.	IDA	Process
GO:0006393	termination of mitochondrial transcription	21873635.	IBA	Process
GO:0042645	mitochondrial nucleoid	-	ISO	Component
GO:0043565	sequence-specific DNA binding	23562081.	IDA	Function