EuRBPDB

Description

RBDs

RBPome

Expression

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSMUSG00000072582 (Gene tree)
Gene ID: 217057
Gene Symbol: Ptrh2
Alias: A230072I16Rik|Bit1
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase 2
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus
Status: confidence
Strand: Plus strand
Length: 8473 bases
Position: chr11:86683985-86692457
Accession: 2444848
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMUSP00000103656	PTH2	PF01981.16	1.6e-46	1	1
ENSMUSP00000103657	PTH2	PF01981.16	1.6e-46	1	1

RNA binding proteome (RBPome)

PID	Title	Method	Time	Author	Doi
27452465	The Cardiomyocyte RNA Binding Proteome: Links to Intermediary Metabolism and Heart Disease	IC & HL_1	2016 Jul 21	Liao Y	DOI: 10.1016/j.celrep.2016.06.084

Expression

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMUST00000108022	-	3038	-	ENSMUSP00000103657	181 (aa)	-	Q8R2Y8
ENSMUST00000108021	-	3132	-	ENSMUSP00000103656	181 (aa)	-	Q8R2Y8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	79.006	ENSG00000141378	PTRH2	100	79.006	Homo_sapiens
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	96	68.966	ENSAPOG00000008893	-	100	68.966	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	98	68.362	ENSAPOG00000008379	ptrh2	99	68.362	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	82.873	ENSAMEG00000011479	PTRH2	93	82.873	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	83	72.848	ENSACIG00000004561	ptrh2	98	70.482	Amphilophus_citrinellus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	98	68.362	ENSAOCG00000002043	ptrh2	99	68.362	Amphiprion_ocellaris
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	94	69.143	ENSAPEG00000014719	ptrh2	90	69.143	Amphiprion_percula
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	97	68.000	ENSATEG00000004102	ptrh2	97	68.000	Anabas_testudineus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	99	68.715	ENSACAG00000012801	PTRH2	98	68.715	Anolis_carolinensis
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	78.453	ENSANAG00000021542	PTRH2	99	78.453	Aotus_nancymaae
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	69	80.800	ENSACLG00000025860	ptrh2	97	66.667	Astatotilapia_calliptera
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	93	67.857	ENSAMXG00000025556	ptrh2	97	67.857	Astyanax_mexicanus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	81.768	ENSBTAG00000016710	PTRH2	100	81.768	Bos_taurus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	80.110	ENSCJAG00000001503	PTRH2	99	80.110	Callithrix_jacchus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	83.978	ENSCAFG00000017662	PTRH2	100	83.978	Canis_familiaris
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	83.978	ENSCAFG00020026497	PTRH2	100	83.978	Canis_lupus_dingo
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	81.215	ENSCHIG00000010059	PTRH2	100	81.215	Capra_hircus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	81.215	ENSTSYG00000033941	PTRH2	99	81.215	Carlito_syrichta
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	82.873	ENSCAPG00000004268	PTRH2	100	82.873	Cavia_aperea
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	82.320	ENSCPOG00000032354	PTRH2	100	82.320	Cavia_porcellus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	80.110	ENSCCAG00000018678	PTRH2	99	80.110	Cebus_capucinus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	77.901	ENSCATG00000043363	PTRH2	99	77.901	Cercocebus_atys
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	83.978	ENSCLAG00000011379	PTRH2	100	83.978	Chinchilla_lanigera
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	79.006	ENSCSAG00000000552	PTRH2	100	79.006	Chlorocebus_sabaeus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	81.768	ENSCHOG00000004503	PTRH2	100	81.768	Choloepus_hoffmanni
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	93	69.048	ENSCPBG00000006143	PTRH2	99	69.048	Chrysemys_picta_bellii
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	90	56.173	ENSCING00000002435	-	95	56.173	Ciona_intestinalis
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	78.453	ENSCANG00000037379	PTRH2	99	78.453	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	92.818	ENSCGRG00001011782	Ptrh2	100	92.818	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	64.641	ENSCGRG00000006519	-	100	64.641	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	92.818	ENSCGRG00000011007	-	100	92.818	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	96	68.362	ENSCSEG00000011617	ptrh2	93	68.362	Cynoglossus_semilaevis
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	97	66.857	ENSCVAG00000016871	ptrh2	96	66.857	Cyprinodon_variegatus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	97	65.341	ENSDARG00000077339	ptrh2	100	65.341	Danio_rerio
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	77.901	ENSDNOG00000031122	PTRH2	100	77.901	Dasypus_novemcinctus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	83.425	ENSDORG00000027376	Ptrh2	100	83.425	Dipodomys_ordii
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	62	47.414	FBgn0038107	CG17327	83	47.414	Drosophila_melanogaster
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	66	52.101	FBgn0026566	CG1307	75	47.260	Drosophila_melanogaster
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	96	54.696	ENSEBUG00000003900	ptrh2	100	54.696	Eptatretus_burgeri
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	82.873	ENSEASG00005002310	PTRH2	100	82.873	Equus_asinus_asinus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	83.425	ENSECAG00000003621	PTRH2	100	83.425	Equus_caballus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	97	65.909	ENSELUG00000023013	ptrh2	87	65.909	Esox_lucius
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	82.873	ENSFCAG00000018969	PTRH2	100	82.873	Felis_catus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	97	65.193	ENSFALG00000015110	PTRH2	97	65.193	Ficedula_albicollis
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	81.215	ENSFDAG00000011721	PTRH2	100	81.215	Fukomys_damarensis
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	96	66.667	ENSFHEG00000015394	ptrh2	92	66.667	Fundulus_heteroclitus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	96	66.667	ENSGMOG00000020589	ptrh2	96	66.667	Gadus_morhua
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	96	70.690	ENSGALG00000005150	PTRH2	100	70.690	Gallus_gallus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	65.746	ENSGAFG00000015503	ptrh2	99	65.746	Gambusia_affinis
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	74	65.672	ENSGAGG00000024006	PTRH2	84	65.672	Gopherus_agassizii
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	99	79.330	ENSGGOG00000007957	PTRH2	98	79.330	Gorilla_gorilla
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	69	80.000	ENSHBUG00000017727	ptrh2	100	66.092	Haplochromis_burtoni
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	81.768	ENSHGLG00000007335	PTRH2	100	81.768	Heterocephalus_glaber_female
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	81.768	ENSHGLG00100011494	PTRH2	100	81.768	Heterocephalus_glaber_male
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	96	62.069	ENSHCOG00000012325	ptrh2	98	62.069	Hippocampus_comes
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	93	65.476	ENSIPUG00000019124	ptrh2	96	65.476	Ictalurus_punctatus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	83.425	ENSSTOG00000028844	PTRH2	100	83.425	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	81.215	ENSJJAG00000019588	-	100	81.215	Jaculus_jaculus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	97	67.429	ENSJJAG00000015451	-	100	67.429	Jaculus_jaculus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	97	67.614	ENSKMAG00000013276	ptrh2	88	67.614	Kryptolebias_marmoratus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	98	70.787	ENSLBEG00000004103	ptrh2	93	70.787	Labrus_bergylta
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	68.508	ENSLACG00000010258	PTRH2	99	68.508	Latimeria_chalumnae
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	96	70.115	ENSLOCG00000017426	ptrh2	99	70.115	Lepisosteus_oculatus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	83.425	ENSLAFG00000031641	PTRH2	100	83.425	Loxodonta_africana
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	77.901	ENSMFAG00000036307	PTRH2	99	77.901	Macaca_fascicularis
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	78.453	ENSMMUG00000001572	PTRH2	100	78.453	Macaca_mulatta
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	78.453	ENSMNEG00000037063	PTRH2	99	78.453	Macaca_nemestrina
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	77.901	ENSMLEG00000028260	PTRH2	99	77.901	Mandrillus_leucophaeus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	97	66.286	ENSMAMG00000005245	ptrh2	98	66.286	Mastacembelus_armatus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	69	80.800	ENSMZEG00005023327	ptrh2	98	66.667	Maylandia_zebra
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	97	69.143	ENSMGAG00000015485	PTRH2	97	69.143	Meleagris_gallopavo
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	90.608	ENSMAUG00000022169	Ptrh2	100	90.608	Mesocricetus_auratus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	79.558	ENSMICG00000032675	-	99	79.558	Microcebus_murinus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	97	64.804	ENSMICG00000043977	-	98	64.804	Microcebus_murinus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	91.160	ENSMOCG00000018927	Ptrh2	100	91.160	Microtus_ochrogaster
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	97	66.286	ENSMMOG00000005796	ptrh2	98	66.286	Mola_mola
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	75.269	ENSMODG00000024517	PTRH2	100	75.269	Monodelphis_domestica
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	99	66.480	ENSMALG00000001875	ptrh2	70	66.480	Monopterus_albus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	99.448	MGP_CAROLIEiJ_G0016918	Ptrh2	100	99.448	Mus_caroli
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	96.685	MGP_PahariEiJ_G0018048	Ptrh2	100	96.685	Mus_pahari
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0017764	Ptrh2	100	100.000	Mus_spretus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	83.425	ENSMPUG00000019628	PTRH2	100	83.425	Mustela_putorius_furo
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	83.978	ENSMLUG00000025120	PTRH2	100	83.978	Myotis_lucifugus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	88.398	ENSNGAG00000011147	Ptrh2	100	88.398	Nannospalax_galili
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	69	81.600	ENSNBRG00000017781	ptrh2	97	65.746	Neolamprologus_brichardi
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	78.453	ENSNLEG00000000792	PTRH2	99	78.453	Nomascus_leucogenys
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	80.110	ENSOPRG00000019186	PTRH2	100	80.110	Ochotona_princeps
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	81.215	ENSODEG00000020061	PTRH2	100	81.768	Octodon_degus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	78	73.944	ENSONIG00000020574	ptrh2	100	66.857	Oreochromis_niloticus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	76.923	ENSOANG00000008523	PTRH2	100	76.923	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	81.768	ENSOCUG00000023345	PTRH2	100	82.320	Oryctolagus_cuniculus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	73	75.188	ENSORLG00000012183	ptrh2	100	64.571	Oryzias_latipes
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	71	77.344	ENSORLG00020015390	ptrh2	80	65.714	Oryzias_latipes_hni
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	73	75.188	ENSORLG00015022173	ptrh2	80	64.773	Oryzias_latipes_hsok
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	82	69.128	ENSOMEG00000011056	ptrh2	96	63.333	Oryzias_melastigma
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	81.768	ENSOGAG00000026779	-	100	81.768	Otolemur_garnettii
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	99	74.860	ENSOGAG00000027962	-	99	74.860	Otolemur_garnettii
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	81.215	ENSOARG00000003891	PTRH2	100	81.215	Ovis_aries
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	79.006	ENSPPAG00000032040	PTRH2	99	79.006	Pan_paniscus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	83.425	ENSPPRG00000018489	PTRH2	100	83.425	Panthera_pardus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	83.425	ENSPTIG00000004923	PTRH2	100	83.425	Panthera_tigris_altaica
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	79.006	ENSPTRG00000009474	PTRH2	99	79.006	Pan_troglodytes
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	78.453	ENSPANG00000022269	PTRH2	99	78.453	Papio_anubis
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	92	70.060	ENSPKIG00000019982	ptrh2	99	70.060	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	99	68.156	ENSPSIG00000008890	PTRH2	98	68.156	Pelodiscus_sinensis
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	96	68.966	ENSPMGG00000014486	ptrh2	97	68.966	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	100	93.923	ENSPEMG00000024186	Ptrh2	100	93.923	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	98	74.863	ENSPCIG00000021876	PTRH2	98	74.863	Phascolarctos_cinereus
ENSMUSG00000072582	Ptrh2	97	66.477	ENSPFOG00000019981	ptrh2	97	66.477	Poecilia_formosa
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