EuRBPDB

Description

RBDs

Expression

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSMUSG00000096199 (Gene tree)
Gene ID: 69709
Gene Symbol: Ptrhd1
Alias: 2410017P09Rik
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5924 bases
Position: chr12:4234027-4239950
Accession: 1916959
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMUSP00000137070	PTH2	PF01981.16	9.4e-24	1	1

Expression

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMUST00000179139	-	3840	-	ENSMUSP00000137070	140 (aa)	-	D3Z4S3

Gene Model

Click here to download ENSMUSG00000096199's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMUSG00000096199's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	89.286	ENSG00000184924	PTRHD1	100	89.286	Homo_sapiens
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	100	56.693	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	85.714	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	100	85.714	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	56.693	Amphilophus_citrinellus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	100	56.693	Amphiprion_ocellaris
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	100	56.693	Amphiprion_percula
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	58.268	ENSATEG00000019199	ptrhd1	100	58.268	Anabas_testudineus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.143	ENSANAG00000019089	PTRHD1	100	87.143	Aotus_nancymaae
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	57.480	ENSACLG00000000814	ptrhd1	100	57.480	Astatotilapia_calliptera
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	88	59.350	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	59.350	Astyanax_mexicanus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.143	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	100	87.143	Bos_taurus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	81	44.737	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	45.161	Caenorhabditis_elegans
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.143	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	100	87.143	Callithrix_jacchus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	90.000	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	100	90.000	Canis_familiaris
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	86.429	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	100	86.429	Capra_hircus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.143	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	100	87.143	Carlito_syrichta
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	86.429	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	100	86.429	Cavia_porcellus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.857	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	100	87.857	Cebus_capucinus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	88.571	ENSCATG00000033690	PTRHD1	100	88.571	Cercocebus_atys
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	90.714	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	97	90.714	Chinchilla_lanigera
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	89.286	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	100	89.286	Chlorocebus_sabaeus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	96	74.627	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	96	74.627	Choloepus_hoffmanni
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	91	64.844	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	91	64.844	Chrysemys_picta_bellii
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	53.448	ENSCING00000019647	-	97	53.448	Ciona_intestinalis
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	88.571	ENSCANG00000034444	PTRHD1	100	88.571	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	90.714	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	66	90.714	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	90.714	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	100	90.714	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	57.812	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	100	57.812	Cynoglossus_semilaevis
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	100	56.693	Cyprinodon_variegatus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	61.207	ENSDARG00000016122	ptrhd1	91	61.207	Danio_rerio
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	85.714	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	93	85.714	Dasypus_novemcinctus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	97	90.647	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	99	87.770	Dipodomys_ordii
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	53.448	FBgn0038446	CG14903	97	53.448	Drosophila_melanogaster
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	95	66.165	ENSETEG00000009379	-	99	66.165	Echinops_telfairi
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	60	80.952	ENSETEG00000001615	-	100	80.952	Echinops_telfairi
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	60.345	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.345	Eptatretus_burgeri
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	99	58.993	ENSEASG00005001302	-	99	56.115	Equus_asinus_asinus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	91	63.780	ENSECAG00000005314	-	87	59.055	Equus_caballus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.857	ENSECAG00000017730	PTRHD1	100	87.857	Equus_caballus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	82.857	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	100	82.857	Erinaceus_europaeus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSELUG00000003837	ptrhd1	100	56.693	Esox_lucius
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.857	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	100	87.857	Felis_catus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	88.571	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	100	88.571	Fukomys_damarensis
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	100	56.693	Fundulus_heteroclitus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	60.345	ENSGALG00000016610	PTRHD1	100	53.191	Gallus_gallus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	100	56.693	Gambusia_affinis
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	86	56.667	ENSGACG00000006743	ptrhd1	94	56.667	Gasterosteus_aculeatus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	89	66.400	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	98	66.400	Gopherus_agassizii
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	92.063	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	100	92.063	Gorilla_gorilla
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	57.480	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	100	57.480	Haplochromis_burtoni
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	82.857	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	100	82.857	Heterocephalus_glaber_female
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	83.571	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	100	83.571	Heterocephalus_glaber_male
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	80.714	ENSHGLG00100004341	-	100	80.714	Heterocephalus_glaber_male
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.250	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	100	56.250	Hippocampus_comes
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	56.897	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	97	56.897	Ictalurus_punctatus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	89.286	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	100	89.286	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	95	87.218	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	96	87.218	Jaculus_jaculus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	81	56.637	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	56.637	Kryptolebias_marmoratus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	100	56.693	Labrus_bergylta
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	75	61.905	ENSLACG00000018052	PTRHD1	91	59.483	Latimeria_chalumnae
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	93	57.692	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	100	57.692	Lepisosteus_oculatus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	85.000	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	100	85.000	Loxodonta_africana
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.857	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	100	87.857	Macaca_fascicularis
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.857	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	100	87.857	Macaca_mulatta
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.857	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	100	87.857	Macaca_nemestrina
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	86.429	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	100	86.429	Mandrillus_leucophaeus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	54.331	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	100	54.331	Mastacembelus_armatus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	57.480	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	100	57.480	Maylandia_zebra
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	86.429	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	100	86.429	Mesocricetus_auratus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	85.714	ENSMICG00000001578	PTRHD1	100	85.714	Microcebus_murinus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	90.714	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	100	90.714	Microtus_ochrogaster
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	55.906	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	100	55.906	Mola_mola
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	92	71.318	ENSMODG00000015895	PTRHD1	92	71.318	Monodelphis_domestica
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	54.331	ENSMALG00000003471	ptrhd1	100	54.331	Monopterus_albus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	99.286	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	100	99.286	Mus_caroli
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	100	100.000	Mus_spretus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	85.714	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	100	85.714	Mustela_putorius_furo
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	82.857	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	100	82.857	Myotis_lucifugus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	88.571	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	100	88.571	Nannospalax_galili
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	57.480	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	100	57.480	Neolamprologus_brichardi
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	89.286	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	100	89.286	Nomascus_leucogenys
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	52	73.973	ENSMEUG00000010482	-	88	73.973	Notamacropus_eugenii
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	80.000	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	100	80.000	Ochotona_princeps
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.857	ENSODEG00000007805	PTRHD1	97	87.857	Octodon_degus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	97	55.474	ENSONIG00000015722	ptrhd1	100	55.474	Oreochromis_niloticus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	82.857	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	100	82.857	Oryctolagus_cuniculus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	55.556	ENSORLG00000028768	ptrhd1	98	55.556	Oryzias_latipes
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	56.410	ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.410	Oryzias_latipes_hni
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	55.556	ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	55.556	Oryzias_latipes_hsok
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	53.906	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	100	53.906	Oryzias_melastigma
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	80.000	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	100	80.000	Otolemur_garnettii
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.143	ENSOARG00000018052	PTRHD1	100	87.143	Ovis_aries
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	89.286	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	100	89.286	Pan_paniscus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.857	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	100	87.857	Panthera_pardus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.857	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	100	87.857	Panthera_tigris_altaica
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	89.286	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	100	89.286	Pan_troglodytes
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	88.571	ENSPANG00000006781	PTRHD1	100	88.571	Papio_anubis
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	99	51.799	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	91	51.799	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	59.483	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	100	57.480	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	75	60.000	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	91	59.483	Petromyzon_marinus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	84	74.576	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	94	74.576	Phascolarctos_cinereus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	96	55.882	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	96	55.882	Poecilia_formosa
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	56.693	Poecilia_latipinna
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	100	56.693	Poecilia_mexicana
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSPREG00000017624	ptrhd1	100	56.693	Poecilia_reticulata
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.143	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	100	87.143	Pongo_abelii
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	83.571	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	100	83.571	Procavia_capensis
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	86.429	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	100	86.429	Propithecus_coquereli
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	85.000	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	100	85.000	Pteropus_vampyrus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	57.480	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	100	57.480	Pundamilia_nyererei
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	60.345	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	91	60.345	Pygocentrus_nattereri
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	96.429	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	100	96.429	Rattus_norvegicus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	89.286	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	100	89.286	Rhinopithecus_bieti
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	89.286	ENSRROG00000029627	PTRHD1	100	89.286	Rhinopithecus_roxellana
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.143	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	100	87.143	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	91	71.654	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	82	71.654	Sarcophilus_harrisii
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	56.897	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	Scleropages_formosus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	57.759	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	100	55.469	Scophthalmus_maximus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	91	57.812	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	85	57.812	Seriola_dumerili
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	58.268	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	100	58.268	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	84	70.085	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	95	66.929	Sphenodon_punctatus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	56.693	Stegastes_partitus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	89	62.903	ENSSSCG00000040441	-	93	62.903	Sus_scrofa
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	84	57.265	ENSTGUG00000015169	-	85	57.265	Taeniopygia_guttata
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	54.331	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	100	54.331	Takifugu_rubripes
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	56.693	Tetraodon_nigroviridis
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	77.143	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	100	77.143	Tursiops_truncatus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	88.571	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	100	88.571	Ursus_americanus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	100	87.143	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	100	87.143	Vicugna_pacos
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	64.286	ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	64.234	Xenopus_tropicalis
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	100	56.693	Xiphophorus_couchianus
ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	100	56.693	Xiphophorus_maculatus

Gene Ontology

Go ID	Go_term	PubmedID	Evidence	Category
GO:0003674	molecular_function	-	ND	Function
GO:0004045	aminoacyl-tRNA hydrolase activity	-	IEA	Function
GO:0008150	biological_process	-	ND	Process
GO:0016787	hydrolase activity	-	IEA	Function