EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMZEG00005004913 (Gene tree)
Gene ID: 101484582
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Maylandia_zebra
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20488 bases
Position: chrLG7:51314662-51335149
Accession: 101484582
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMZEP00005006390	IBN_N	PF03810.19	1.8e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMZET00005006683	-	2664	XM_004549876	ENSMZEP00005006390	887 (aa)	XP_004549933	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.782	Homo_sapiens
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	98.202	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	98.202	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	91.314	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.094	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMZEG00005004913	tnpo1	87	98.965	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.965	Amphilophus_citrinellus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	98.202	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	98.202	Amphiprion_ocellaris
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	98.202	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	98.202	Amphiprion_percula
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	97.753	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.753	Anabas_testudineus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	99	89.064	ENSAPLG00000009619	-	97	89.794	Anas_platyrhynchos
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.034	Anolis_carolinensis
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	60.310	ENSANAG00000027118	-	99	60.089	Aotus_nancymaae
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	82.921	ENSANAG00000025351	-	99	82.921	Aotus_nancymaae
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.472	ENSANAG00000022453	-	99	92.472	Aotus_nancymaae
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	98.647	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	98.647	Astatotilapia_calliptera
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.498	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	93.274	Astyanax_mexicanus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.034	Bos_taurus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.584	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.584	Callithrix_jacchus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	92.882	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.882	Canis_familiaris
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	90.562	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.562	Canis_lupus_dingo
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.921	Capra_hircus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	99	89.379	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.696	Carlito_syrichta
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.472	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.472	Cebus_capucinus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	92.921	Cercocebus_atys
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.472	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.472	Chinchilla_lanigera
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	92.921	Chlorocebus_sabaeus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	94	81.287	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.406	Choloepus_hoffmanni
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.258	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.258	Chrysemys_picta_bellii
ENSMZEG00005004913	tnpo1	99	76.094	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.094	Ciona_savignyi
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	92.921	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.034	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	93.216	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.216	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	95.843	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.843	Cynoglossus_semilaevis
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.629	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.629	Cyprinodon_variegatus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.939	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.827	Danio_rerio
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	87.753	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.753	Dasypus_novemcinctus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	93	93.133	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.124	Dipodomys_ordii
ENSMZEG00005004913	tnpo1	99	58.305	FBgn0035693	CG8219	99	57.853	Drosophila_melanogaster
ENSMZEG00005004913	tnpo1	86	94.007	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.007	Echinops_telfairi
ENSMZEG00005004913	tnpo1	94	84.643	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.405	Eptatretus_burgeri
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	92.921	Equus_asinus_asinus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	92.921	Equus_caballus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	87.800	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.691	Esox_lucius
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	92.921	Felis_catus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.371	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.371	Ficedula_albicollis
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.584	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.584	Fukomys_damarensis
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.633	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	96.633	Fundulus_heteroclitus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.609	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.609	Gadus_morhua
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.584	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.584	Gallus_gallus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.076	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	96.076	Gambusia_affinis
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.067	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.067	Gasterosteus_aculeatus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.146	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.146	Gopherus_agassizii
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	92.921	Gorilla_gorilla
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	77.803	ENSGGOG00000022535	-	98	77.803	Gorilla_gorilla
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	99.551	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	99.551	Haplochromis_burtoni
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.472	ENSHGLG00000000970	-	99	92.472	Heterocephalus_glaber_female
ENSMZEG00005004913	tnpo1	97	72.442	ENSHGLG00100000963	-	99	71.860	Heterocephalus_glaber_male
ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	92.523	ENSHGLG00100017090	-	99	92.523	Heterocephalus_glaber_male
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.034	Jaculus_jaculus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.292	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.292	Kryptolebias_marmoratus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	92	92.430	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	92.972	Labrus_bergylta
ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	86.744	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.744	Latimeria_chalumnae
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	94.045	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.045	Lepisosteus_oculatus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	97	92.263	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.263	Loxodonta_africana
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	92.921	Macaca_fascicularis
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.809	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.889	Macaca_mulatta
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	92.921	Macaca_nemestrina
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	92.921	Mandrillus_leucophaeus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	98.202	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	98.202	Mastacembelus_armatus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	89.326	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.326	Microcebus_murinus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.034	Microtus_ochrogaster
ENSMZEG00005004913	tnpo1	87	96.392	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.392	Mola_mola
ENSMZEG00005004913	tnpo1	99	93.191	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.191	Monodelphis_domestica
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.854	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.854	Monopterus_albus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.820	Mus_caroli
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.820	Mus_musculus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.146	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	Mus_pahari
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.809	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.820	Mus_spretus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	92.921	Mustela_putorius_furo
ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	92.549	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.549	Myotis_lucifugus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.146	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.146	Nannospalax_galili
ENSMZEG00005004913	tnpo1	87	99.481	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	99.481	Neolamprologus_brichardi
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	92.921	Nomascus_leucogenys
ENSMZEG00005004913	tnpo1	90	87.730	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.730	Ochotona_princeps
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.247	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.247	Octodon_degus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	98.772	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	98.772	Oreochromis_niloticus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	92	93.537	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.537	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	86.799	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.565	Oryctolagus_cuniculus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	87	97.266	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.266	Oryzias_latipes
ENSMZEG00005004913	tnpo1	99	97.398	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.398	Oryzias_latipes_hni
ENSMZEG00005004913	tnpo1	99	97.069	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.069	Oryzias_latipes_hsok
ENSMZEG00005004913	tnpo1	99	96.618	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	96.618	Oryzias_melastigma
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	92.921	Otolemur_garnettii
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.034	Ovis_aries
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	92.921	Pan_paniscus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	92.921	Panthera_pardus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	92.921	Panthera_tigris_altaica
ENSMZEG00005004913	tnpo1	94	81.768	ENSPTRG00000047731	-	100	81.768	Pan_troglodytes
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	92.921	Pan_troglodytes
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	92.921	Papio_anubis
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	90.337	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.337	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.258	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.258	Pelodiscus_sinensis
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	94.164	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.827	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	93.216	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.216	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.820	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.820	Phascolarctos_cinereus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.417	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	96.417	Poecilia_formosa
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.417	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	96.417	Poecilia_latipinna
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.854	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	96.854	Poecilia_mexicana
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.637	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	96.637	Poecilia_reticulata
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.809	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.809	Pongo_abelii
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.921	Propithecus_coquereli
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.809	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.809	Pteropus_vampyrus
ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	99.551	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	99.551	Pundamilia_nyererei
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ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.633	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	96.633	Xiphophorus_maculatus