EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMZEG00005006429 (Gene tree)
Gene ID: 101476680
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Maylandia_zebra
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8465 bases
Position: chrLG19:9163897-9172361
Accession: 101476680
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMZEP00005008439	SYF2	PF08231.12	3.3e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMZET00005008776	-	819	XM_004566571	ENSMZEP00005008439	238 (aa)	XP_004566628	UPI0003296F0D

Gene Model

Click here to download ENSMZEG00005006429's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
mze03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMZEG00005006429's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.407	ENSG00000117614	SYF2	95	78.390	Homo_sapiens
ENSMZEG00005006429	syf2	100	91.176	ENSAPOG00000001174	syf2	100	91.176	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMZEG00005006429	syf2	82	81.538	ENSAMEG00000010134	-	100	81.538	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMZEG00005006429	syf2	94	79.821	ENSAMEG00000010115	-	91	79.821	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMZEG00005006429	syf2	99	93.617	ENSACIG00000023688	syf2	94	93.617	Amphilophus_citrinellus
ENSMZEG00005006429	syf2	93	89.593	ENSAOCG00000010912	syf2	69	89.593	Amphiprion_ocellaris
ENSMZEG00005006429	syf2	100	90.336	ENSAOCG00000022046	syf2	99	90.213	Amphiprion_ocellaris
ENSMZEG00005006429	syf2	100	90.336	ENSAPEG00000018858	syf2	92	90.336	Amphiprion_percula
ENSMZEG00005006429	syf2	100	92.857	ENSATEG00000007745	syf2	100	92.857	Anabas_testudineus
ENSMZEG00005006429	syf2	84	83.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.000	Anas_platyrhynchos
ENSMZEG00005006429	syf2	70	67.066	ENSACAG00000026777	-	100	67.066	Anolis_carolinensis
ENSMZEG00005006429	syf2	86	81.373	ENSACAG00000013653	-	100	81.373	Anolis_carolinensis
ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.870	ENSANAG00000032473	SYF2	95	78.390	Aotus_nancymaae
ENSMZEG00005006429	syf2	100	99.580	ENSACLG00000019916	syf2	100	99.580	Astatotilapia_calliptera
ENSMZEG00005006429	syf2	100	83.193	ENSAMXG00000004051	syf2	100	83.193	Astyanax_mexicanus
ENSMZEG00005006429	syf2	95	79.476	ENSBTAG00000001651	SYF2	94	81.081	Bos_taurus
ENSMZEG00005006429	syf2	87	50.476	WBGene00019402	syf-2	90	49.763	Caenorhabditis_elegans
ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.870	ENSCJAG00000046570	SYF2	95	78.814	Callithrix_jacchus
ENSMZEG00005006429	syf2	91	76.389	ENSCAFG00000030331	-	92	76.389	Canis_familiaris
ENSMZEG00005006429	syf2	91	81.481	ENSCAFG00000012895	-	95	77.119	Canis_familiaris
ENSMZEG00005006429	syf2	76	72.527	ENSCAFG00020021094	-	95	72.527	Canis_lupus_dingo
ENSMZEG00005006429	syf2	91	81.481	ENSCAFG00020021091	-	95	77.119	Canis_lupus_dingo
ENSMZEG00005006429	syf2	99	76.667	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	76.667	Capra_hircus
ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.083	ENSTSYG00000005114	SYF2	99	77.083	Carlito_syrichta
ENSMZEG00005006429	syf2	83	81.818	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.818	Cavia_aperea
ENSMZEG00005006429	syf2	100	77.311	ENSCPOG00000005326	SYF2	95	77.311	Cavia_porcellus
ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.870	ENSCCAG00000022459	SYF2	95	78.814	Cebus_capucinus
ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.119	ENSCATG00000026917	SYF2	95	77.119	Cercocebus_atys
ENSMZEG00005006429	syf2	98	79.399	ENSCLAG00000008474	SYF2	93	79.399	Chinchilla_lanigera
ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.119	ENSCSAG00000000948	SYF2	95	77.119	Chlorocebus_sabaeus
ENSMZEG00005006429	syf2	72	61.494	ENSCHOG00000005273	-	96	61.494	Choloepus_hoffmanni
ENSMZEG00005006429	syf2	94	81.333	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	79.747	Chrysemys_picta_bellii
ENSMZEG00005006429	syf2	98	52.766	ENSCING00000003017	-	97	53.448	Ciona_intestinalis
ENSMZEG00005006429	syf2	89	52.113	ENSCSAVG00000006627	-	97	52.113	Ciona_savignyi
ENSMZEG00005006429	syf2	99	68.220	ENSCANG00000037322	SYF2	94	68.220	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	77.686	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	77.686	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMZEG00005006429	syf2	82	82.653	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.828	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMZEG00005006429	syf2	92	88.991	ENSCSEG00000000117	syf2	99	84.810	Cynoglossus_semilaevis
ENSMZEG00005006429	syf2	100	90.795	ENSCVAG00000019543	syf2	100	90.795	Cyprinodon_variegatus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	86.555	ENSDARG00000004706	syf2	100	86.555	Danio_rerio
ENSMZEG00005006429	syf2	95	79.476	ENSDNOG00000047605	SYF2	93	79.476	Dasypus_novemcinctus
ENSMZEG00005006429	syf2	99	78.723	ENSDORG00000001274	Syf2	95	78.723	Dipodomys_ordii
ENSMZEG00005006429	syf2	90	56.481	FBgn0033556	CG12343	94	56.481	Drosophila_melanogaster
ENSMZEG00005006429	syf2	87	67.633	ENSETEG00000015729	SYF2	100	62.882	Echinops_telfairi
ENSMZEG00005006429	syf2	83	58.376	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.376	Eptatretus_burgeri
ENSMZEG00005006429	syf2	100	76.735	ENSEASG00005004224	-	100	76.735	Equus_asinus_asinus
ENSMZEG00005006429	syf2	97	70.386	ENSEASG00005004232	-	96	70.386	Equus_asinus_asinus
ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.273	ENSECAG00000012023	-	99	77.273	Equus_caballus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	77.178	ENSECAG00000010440	-	100	77.178	Equus_caballus
ENSMZEG00005006429	syf2	74	66.480	ENSEEUG00000015084	SYF2	98	66.480	Erinaceus_europaeus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	84.034	ENSELUG00000003465	syf2	99	84.034	Esox_lucius
ENSMZEG00005006429	syf2	92	81.735	ENSFCAG00000010324	-	76	81.735	Felis_catus
ENSMZEG00005006429	syf2	95	78.947	ENSFCAG00000043095	-	93	78.947	Felis_catus
ENSMZEG00005006429	syf2	86	80.882	ENSFALG00000000460	SYF2	91	77.155	Ficedula_albicollis
ENSMZEG00005006429	syf2	98	78.541	ENSFDAG00000008310	SYF2	94	78.541	Fukomys_damarensis
ENSMZEG00005006429	syf2	95	77.434	ENSFHEG00000007238	syf2	100	77.434	Fundulus_heteroclitus
ENSMZEG00005006429	syf2	90	88.837	ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.837	Gadus_morhua
ENSMZEG00005006429	syf2	95	80.176	ENSGALG00000013639	SYF2	93	79.060	Gallus_gallus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.916	ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.916	Gambusia_affinis
ENSMZEG00005006429	syf2	93	90.991	ENSGACG00000007305	syf2	100	88.703	Gasterosteus_aculeatus
ENSMZEG00005006429	syf2	94	81.778	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	79.747	Gopherus_agassizii
ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.407	ENSGGOG00000012796	SYF2	95	78.390	Gorilla_gorilla
ENSMZEG00005006429	syf2	100	99.160	ENSHBUG00000020477	syf2	100	99.160	Haplochromis_burtoni
ENSMZEG00005006429	syf2	93	71.171	ENSHGLG00000004304	-	99	69.492	Heterocephalus_glaber_female
ENSMZEG00005006429	syf2	99	78.298	ENSHGLG00000014393	SYF2	94	78.298	Heterocephalus_glaber_female
ENSMZEG00005006429	syf2	99	78.298	ENSHGLG00100014722	SYF2	94	78.298	Heterocephalus_glaber_male
ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.496	ENSHCOG00000012904	syf2	78	89.496	Hippocampus_comes
ENSMZEG00005006429	syf2	100	83.682	ENSIPUG00000019859	syf2	100	83.682	Ictalurus_punctatus
ENSMZEG00005006429	syf2	61	76.027	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.027	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMZEG00005006429	syf2	84	82.412	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.412	Jaculus_jaculus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	91.597	ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.597	Kryptolebias_marmoratus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	91.176	ENSLBEG00000014425	syf2	100	91.176	Labrus_bergylta
ENSMZEG00005006429	syf2	93	80.090	ENSLACG00000012064	SYF2	93	80.090	Latimeria_chalumnae
ENSMZEG00005006429	syf2	100	83.193	ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.193	Lepisosteus_oculatus
ENSMZEG00005006429	syf2	77	54.348	ENSLAFG00000030814	-	100	54.348	Loxodonta_africana
ENSMZEG00005006429	syf2	100	76.327	ENSLAFG00000023150	-	100	76.327	Loxodonta_africana
ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.119	ENSMFAG00000041831	SYF2	95	77.119	Macaca_fascicularis
ENSMZEG00005006429	syf2	91	81.481	ENSMMUG00000002968	SYF2	95	77.119	Macaca_mulatta
ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.119	ENSMNEG00000030180	SYF2	95	77.119	Macaca_nemestrina
ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.119	ENSMLEG00000030248	SYF2	95	77.119	Mandrillus_leucophaeus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	92.017	ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.017	Mastacembelus_armatus
ENSMZEG00005006429	syf2	84	82.915	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.915	Meleagris_gallopavo
ENSMZEG00005006429	syf2	100	78.099	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	78.099	Mesocricetus_auratus
ENSMZEG00005006429	syf2	84	82.412	ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.412	Microcebus_murinus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	77.686	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	77.686	Microtus_ochrogaster
ENSMZEG00005006429	syf2	97	87.500	ENSMMOG00000002396	syf2	97	87.500	Mola_mola
ENSMZEG00005006429	syf2	93	76.786	ENSMODG00000013951	-	98	76.786	Monodelphis_domestica
ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.212	ENSMALG00000010706	syf2	100	89.627	Monopterus_albus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	78.099	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	78.099	Mus_caroli
ENSMZEG00005006429	syf2	100	78.099	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	78.099	Mus_musculus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	78.099	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	78.099	Mus_pahari
ENSMZEG00005006429	syf2	100	78.099	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	78.099	Mus_spretus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	76.050	ENSMPUG00000015801	-	96	76.050	Mustela_putorius_furo
ENSMZEG00005006429	syf2	91	81.481	ENSMPUG00000015802	-	89	80.365	Mustela_putorius_furo
ENSMZEG00005006429	syf2	99	76.667	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	76.667	Myotis_lucifugus
ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.872	ENSNGAG00000007912	Syf2	93	77.872	Nannospalax_galili
ENSMZEG00005006429	syf2	100	87.603	ENSNBRG00000010720	syf2	99	87.603	Neolamprologus_brichardi
ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.407	ENSNLEG00000035185	SYF2	95	78.390	Nomascus_leucogenys
ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.119	ENSOPRG00000012870	SYF2	95	77.119	Ochotona_princeps
ENSMZEG00005006429	syf2	98	77.682	ENSODEG00000017664	-	96	77.682	Octodon_degus
ENSMZEG00005006429	syf2	99	68.936	ENSODEG00000014338	-	95	69.528	Octodon_degus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	97.899	ENSONIG00000008213	syf2	100	97.899	Oreochromis_niloticus
ENSMZEG00005006429	syf2	85	81.683	ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.870	ENSOCUG00000013050	SYF2	95	78.390	Oryctolagus_cuniculus
ENSMZEG00005006429	syf2	98	89.700	ENSORLG00000028820	syf2	100	89.700	Oryzias_latipes
ENSMZEG00005006429	syf2	100	88.655	ENSORLG00020018333	syf2	100	88.655	Oryzias_latipes_hni
ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.076	ENSORLG00015014665	syf2	100	89.076	Oryzias_latipes_hsok
ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.916	ENSOMEG00000013911	syf2	100	89.916	Oryzias_melastigma
ENSMZEG00005006429	syf2	99	78.723	ENSOGAG00000009962	SYF2	95	78.723	Otolemur_garnettii
ENSMZEG00005006429	syf2	82	55.385	ENSOARG00000006269	-	100	55.385	Ovis_aries
ENSMZEG00005006429	syf2	95	78.355	ENSOARG00000006348	-	91	79.911	Ovis_aries
ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.407	ENSPPAG00000036579	SYF2	95	78.390	Pan_paniscus
ENSMZEG00005006429	syf2	92	81.735	ENSPPRG00000001638	-	89	81.735	Panthera_pardus
ENSMZEG00005006429	syf2	95	78.947	ENSPPRG00000001651	-	93	78.947	Panthera_pardus
ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.870	ENSPTIG00000005711	-	83	78.879	Panthera_tigris_altaica
ENSMZEG00005006429	syf2	95	78.947	ENSPTIG00000007036	-	93	78.947	Panthera_tigris_altaica
ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.407	ENSPTRG00000000352	SYF2	95	78.390	Pan_troglodytes
ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.119	ENSPANG00000008139	SYF2	95	77.119	Papio_anubis
ENSMZEG00005006429	syf2	100	83.193	ENSPKIG00000008130	syf2	100	83.193	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMZEG00005006429	syf2	99	78.008	ENSPSIG00000011816	SYF2	94	78.008	Pelodiscus_sinensis
ENSMZEG00005006429	syf2	97	88.745	ENSPMGG00000008755	syf2	90	88.745	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	77.273	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	77.273	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMZEG00005006429	syf2	93	80.631	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	75.200	Phascolarctos_cinereus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	88.285	ENSPFOG00000004116	syf2	99	88.285	Poecilia_formosa
ENSMZEG00005006429	syf2	98	89.700	ENSPLAG00000006691	syf2	100	89.700	Poecilia_latipinna
ENSMZEG00005006429	syf2	100	87.395	ENSPMEG00000011684	syf2	100	87.395	Poecilia_mexicana
ENSMZEG00005006429	syf2	100	90.336	ENSPREG00000003009	syf2	100	90.336	Poecilia_reticulata
ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.966	ENSPPYG00000001713	SYF2	95	77.966	Pongo_abelii
ENSMZEG00005006429	syf2	99	54.237	ENSPCOG00000027011	SYF2	93	54.237	Propithecus_coquereli
ENSMZEG00005006429	syf2	98	71.245	ENSPVAG00000005841	SYF2	93	71.245	Pteropus_vampyrus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	99.160	ENSPNYG00000004979	syf2	100	99.160	Pundamilia_nyererei
ENSMZEG00005006429	syf2	100	84.454	ENSPNAG00000015570	syf2	100	84.454	Pygocentrus_nattereri
ENSMZEG00005006429	syf2	100	78.099	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	78.099	Rattus_norvegicus
ENSMZEG00005006429	syf2	99	75.000	ENSRBIG00000042970	SYF2	95	75.000	Rhinopithecus_bieti
ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.119	ENSRROG00000001347	SYF2	95	77.119	Rhinopithecus_roxellana
ENSMZEG00005006429	syf2	100	77.311	ENSSBOG00000020184	SYF2	96	78.151	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMZEG00005006429	syf2	86	81.553	ENSSHAG00000007152	-	100	81.553	Sarcophilus_harrisii
ENSMZEG00005006429	syf2	93	79.730	ENSSHAG00000015630	-	89	79.730	Sarcophilus_harrisii
ENSMZEG00005006429	syf2	93	87.330	ENSSFOG00015023647	syf2	93	87.330	Scleropages_formosus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	88.235	ENSSMAG00000009867	syf2	100	88.235	Scophthalmus_maximus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.916	ENSSDUG00000013072	syf2	100	89.916	Seriola_dumerili
ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.916	ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.916	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMZEG00005006429	syf2	99	59.336	ENSSARG00000012889	SYF2	99	59.336	Sorex_araneus
ENSMZEG00005006429	syf2	99	78.099	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	78.099	Sphenodon_punctatus
ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.916	ENSSPAG00000009626	syf2	100	89.916	Stegastes_partitus
ENSMZEG00005006429	syf2	97	77.778	ENSSSCG00000037481	SYF2	96	77.778	Sus_scrofa
ENSMZEG00005006429	syf2	63	52.318	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	52.000	Taeniopygia_guttata
ENSMZEG00005006429	syf2	100	85.833	ENSTRUG00000001499	syf2	95	84.810	Takifugu_rubripes
ENSMZEG00005006429	syf2	93	90.090	ENSTNIG00000016912	syf2	99	90.090	Tetraodon_nigroviridis
ENSMZEG00005006429	syf2	100	57.202	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	57.202	Tupaia_belangeri
ENSMZEG00005006429	syf2	97	74.897	ENSTTRG00000003550	SYF2	99	75.934	Tursiops_truncatus
ENSMZEG00005006429	syf2	94	79.821	ENSUAMG00000002897	SYF2	90	79.821	Ursus_americanus
ENSMZEG00005006429	syf2	91	81.019	ENSUMAG00000013108	SYF2	90	79.372	Ursus_maritimus
ENSMZEG00005006429	syf2	99	76.349	ENSVPAG00000005705	SYF2	99	76.349	Vicugna_pacos
ENSMZEG00005006429	syf2	91	81.481	ENSVVUG00000027175	-	95	77.119	Vulpes_vulpes
ENSMZEG00005006429	syf2	86	80.976	ENSVVUG00000027181	-	100	73.790	Vulpes_vulpes
ENSMZEG00005006429	syf2	97	77.778	ENSXETG00000022797	syf2	94	77.778	Xenopus_tropicalis
ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.076	ENSXMAG00000022698	syf2	100	89.076	Xiphophorus_maculatus