EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMZEG00005008319 (Gene tree)
Gene ID: 101481857
Gene Symbol: nrde2
Alias: c14orf102
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Maylandia_zebra
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12555 bases
Position: chrLG19:10842926-10855480
Accession: 101481857
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMZEP00005011084	NRDE-2	PF08424.10	8.4e-99	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMZET00005011467	-	4427	XM_004559301	ENSMZEP00005011084	1186 (aa)	XP_004559358	UPI000D30AF6F

Gene Model

Click here to download ENSMZEG00005008319's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMZEG00005008319's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.959	ENSG00000119720	NRDE2	100	65.196	Homo_sapiens
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	76.226	ENSAPOG00000009202	nrde2	99	76.309	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.573	ENSAMEG00000001807	NRDE2	100	45.103	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMZEG00005008319	nrde2	97	84.549	ENSACIG00000014783	nrde2	100	84.201	Amphilophus_citrinellus
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	77.212	ENSAOCG00000015576	nrde2	99	77.379	Amphiprion_ocellaris
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	77.155	ENSAPEG00000001711	nrde2	99	77.322	Amphiprion_percula
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	74.274	ENSATEG00000010247	nrde2	99	74.689	Anabas_testudineus
ENSMZEG00005008319	nrde2	98	45.652	ENSAPLG00000015870	NRDE2	99	45.840	Anas_platyrhynchos
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.500	ENSACAG00000014571	NRDE2	100	45.447	Anolis_carolinensis
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	43.292	ENSANAG00000025313	NRDE2	100	43.195	Aotus_nancymaae
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	99.578	ENSACLG00000025154	nrde2	100	99.578	Astatotilapia_calliptera
ENSMZEG00005008319	nrde2	86	67.347	ENSAMXG00000034642	nrde2	93	46.471	Astyanax_mexicanus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.695	ENSBTAG00000005427	NRDE2	100	46.015	Bos_taurus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.319	ENSCJAG00000017711	NRDE2	100	45.611	Callithrix_jacchus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	42.929	ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	43.113	Canis_familiaris
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.087	ENSCAFG00020016346	NRDE2	100	45.238	Canis_lupus_dingo
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.568	ENSCHIG00000005876	NRDE2	100	45.552	Capra_hircus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.244	ENSTSYG00000000161	NRDE2	100	44.763	Carlito_syrichta
ENSMZEG00005008319	nrde2	97	44.688	ENSCAPG00000012039	NRDE2	89	47.721	Cavia_aperea
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.996	ENSCPOG00000002428	NRDE2	100	45.180	Cavia_porcellus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.033	ENSCCAG00000024917	NRDE2	100	45.492	Cebus_capucinus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.463	ENSCLAG00000015185	NRDE2	100	44.435	Chinchilla_lanigera
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.281	ENSCSAG00000011451	NRDE2	100	45.574	Chlorocebus_sabaeus
ENSMZEG00005008319	nrde2	74	45.518	ENSCHOG00000006165	NRDE2	75	45.983	Choloepus_hoffmanni
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.103	ENSCPBG00000008537	NRDE2	98	45.069	Chrysemys_picta_bellii
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.868	ENSCANG00000029067	NRDE2	100	45.082	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.884	ENSCGRG00001015658	Nrde2	100	44.935	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.033	ENSCGRG00000005062	Nrde2	100	45.082	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMZEG00005008319	nrde2	97	67.652	ENSCSEG00000000089	nrde2	100	67.579	Cynoglossus_semilaevis
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	72.120	ENSCVAG00000023105	nrde2	100	71.953	Cyprinodon_variegatus
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	53.846	ENSDARG00000074726	nrde2	100	53.389	Danio_rerio
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.737	ENSDNOG00000024057	NRDE2	100	44.554	Dasypus_novemcinctus
ENSMZEG00005008319	nrde2	77	47.033	ENSDORG00000003197	Nrde2	96	47.970	Dipodomys_ordii
ENSMZEG00005008319	nrde2	60	44.258	ENSETEG00000000198	NRDE2	60	44.596	Echinops_telfairi
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	38.733	ENSEBUG00000014552	nrde2	99	38.026	Eptatretus_burgeri
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.380	ENSEASG00005020675	NRDE2	100	45.174	Equus_asinus_asinus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.462	ENSECAG00000003862	NRDE2	100	45.275	Equus_caballus
ENSMZEG00005008319	nrde2	65	59.398	ENSEEUG00000004026	-	69	59.398	Erinaceus_europaeus
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	58.209	ENSELUG00000005973	nrde2	100	58.056	Esox_lucius
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	45.140	ENSFCAG00000011312	NRDE2	100	45.425	Felis_catus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.164	ENSFALG00000012260	NRDE2	99	45.738	Ficedula_albicollis
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	43.364	ENSFDAG00000021350	NRDE2	100	44.016	Fukomys_damarensis
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	73.239	ENSFHEG00000021385	nrde2	99	72.742	Fundulus_heteroclitus
ENSMZEG00005008319	nrde2	64	74.741	ENSGMOG00000015815	nrde2	100	65.839	Gadus_morhua
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.861	ENSGALG00000010677	NRDE2	99	45.875	Gallus_gallus
ENSMZEG00005008319	nrde2	92	72.273	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	75.810	Gambusia_affinis
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	73.000	ENSGACG00000012619	nrde2	100	72.705	Gasterosteus_aculeatus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.906	ENSGAGG00000003252	NRDE2	100	46.141	Gopherus_agassizii
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.922	ENSGGOG00000008835	NRDE2	100	45.254	Gorilla_gorilla
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	98.820	ENSHBUG00000016736	nrde2	100	98.820	Haplochromis_burtoni
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.463	ENSHGLG00000006731	NRDE2	100	44.600	Heterocephalus_glaber_female
ENSMZEG00005008319	nrde2	98	44.249	ENSHGLG00100017736	NRDE2	99	44.389	Heterocephalus_glaber_male
ENSMZEG00005008319	nrde2	92	65.608	ENSHCOG00000009559	nrde2	98	65.127	Hippocampus_comes
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	50.000	ENSIPUG00000016129	nrde2	100	49.416	Ictalurus_punctatus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	43.997	ENSSTOG00000001678	NRDE2	100	45.074	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.289	ENSJJAG00000000907	Nrde2	100	45.328	Jaculus_jaculus
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	74.627	ENSKMAG00000008647	nrde2	100	74.627	Kryptolebias_marmoratus
ENSMZEG00005008319	nrde2	92	72.417	ENSLBEG00000021428	nrde2	98	72.190	Labrus_bergylta
ENSMZEG00005008319	nrde2	71	50.237	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.594	Latimeria_chalumnae
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	53.583	ENSLOCG00000009037	nrde2	99	53.339	Lepisosteus_oculatus
ENSMZEG00005008319	nrde2	98	43.993	ENSLAFG00000004966	NRDE2	91	45.738	Loxodonta_africana
ENSMZEG00005008319	nrde2	77	48.652	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	65.196	Macaca_mulatta
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	74.274	ENSMAMG00000013452	nrde2	99	74.108	Mastacembelus_armatus
ENSMZEG00005008319	nrde2	86	45.886	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	45.402	Meleagris_gallopavo
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.950	ENSMAUG00000018578	Nrde2	100	45.000	Mesocricetus_auratus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.183	ENSMICG00000016741	NRDE2	100	45.267	Microcebus_murinus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	42.951	ENSMOCG00000014472	Nrde2	100	43.219	Microtus_ochrogaster
ENSMZEG00005008319	nrde2	73	70.286	ENSMMOG00000004703	nrde2	91	70.057	Mola_mola
ENSMZEG00005008319	nrde2	94	43.867	ENSMODG00000002711	NRDE2	100	44.255	Monodelphis_domestica
ENSMZEG00005008319	nrde2	91	71.625	ENSMALG00000021869	nrde2	99	70.965	Monopterus_albus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.683	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.008	Mus_caroli
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.335	ENSMUSG00000021179	Nrde2	100	44.898	Mus_musculus
ENSMZEG00005008319	nrde2	88	47.259	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	44.935	Mus_pahari
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.637	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	96	65.306	Mus_spretus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.003	ENSMPUG00000008135	NRDE2	100	44.308	Mustela_putorius_furo
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.719	ENSMLUG00000007484	NRDE2	100	44.636	Myotis_lucifugus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.089	ENSNGAG00000002993	Nrde2	100	44.915	Nannospalax_galili
ENSMZEG00005008319	nrde2	94	92.218	ENSNBRG00000010184	nrde2	100	92.730	Neolamprologus_brichardi
ENSMZEG00005008319	nrde2	97	44.501	ENSNLEG00000017032	NRDE2	100	44.426	Nomascus_leucogenys
ENSMZEG00005008319	nrde2	73	48.207	ENSMEUG00000011097	NRDE2	74	48.207	Notamacropus_eugenii
ENSMZEG00005008319	nrde2	59	58.696	ENSOPRG00000001375	-	60	61.165	Ochotona_princeps
ENSMZEG00005008319	nrde2	89	45.489	ENSODEG00000012422	NRDE2	90	45.337	Octodon_degus
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	91.191	ENSONIG00000019512	nrde2	100	90.940	Oreochromis_niloticus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.917	ENSOCUG00000010083	NRDE2	99	44.959	Oryctolagus_cuniculus
ENSMZEG00005008319	nrde2	95	67.986	ENSORLG00000017730	nrde2	99	68.190	Oryzias_latipes
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	70.199	ENSORLG00020015965	nrde2	100	70.447	Oryzias_latipes_hni
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	71.275	ENSORLG00015012437	nrde2	100	71.026	Oryzias_latipes_hsok
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	71.642	ENSOMEG00000010890	nrde2	100	71.808	Oryzias_melastigma
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.942	ENSOGAG00000006624	NRDE2	100	45.522	Otolemur_garnettii
ENSMZEG00005008319	nrde2	97	43.729	ENSOARG00000003475	NRDE2	100	43.548	Ovis_aries
ENSMZEG00005008319	nrde2	97	45.224	ENSPPAG00000034133	NRDE2	96	49.041	Pan_paniscus
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	44.893	ENSPPRG00000006422	NRDE2	100	45.425	Panthera_pardus
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	44.646	ENSPTIG00000009989	NRDE2	100	45.177	Panthera_tigris_altaica
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.169	ENSPTRG00000023399	NRDE2	100	45.499	Pan_troglodytes
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	50.748	ENSPKIG00000009331	nrde2	100	50.413	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.124	ENSPSIG00000005588	NRDE2	100	44.890	Pelodiscus_sinensis
ENSMZEG00005008319	nrde2	97	63.503	ENSPMGG00000024089	nrde2	100	63.072	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.454	ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	44.735	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMZEG00005008319	nrde2	53	41.826	ENSPMAG00000003270	-	99	42.090	Petromyzon_marinus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.597	ENSPCIG00000018567	NRDE2	100	45.959	Phascolarctos_cinereus
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	72.222	ENSPFOG00000013217	nrde2	99	71.476	Poecilia_formosa
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	73.798	ENSPLAG00000022350	nrde2	99	73.217	Poecilia_latipinna
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	73.881	ENSPMEG00000000778	nrde2	99	73.300	Poecilia_mexicana
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	73.859	ENSPREG00000009066	nrde2	99	73.527	Poecilia_reticulata
ENSMZEG00005008319	nrde2	85	45.383	ENSPPYG00000006245	NRDE2	100	45.640	Pongo_abelii
ENSMZEG00005008319	nrde2	71	66.154	ENSPCAG00000016399	NRDE2	72	66.154	Procavia_capensis
ENSMZEG00005008319	nrde2	95	44.000	ENSPCOG00000024684	NRDE2	100	43.913	Propithecus_coquereli
ENSMZEG00005008319	nrde2	97	42.034	ENSPVAG00000010023	NRDE2	100	42.833	Pteropus_vampyrus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	95.210	ENSPNYG00000022833	nrde2	99	95.210	Pundamilia_nyererei
ENSMZEG00005008319	nrde2	92	53.993	ENSPNAG00000015807	nrde2	97	53.707	Pygocentrus_nattereri
ENSMZEG00005008319	nrde2	91	43.722	ENSRNOG00000004004	Nrde2	100	43.902	Rattus_norvegicus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.319	ENSSBOG00000024346	NRDE2	100	45.611	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.674	ENSSHAG00000016736	NRDE2	97	45.209	Sarcophilus_harrisii
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	52.736	ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.405	Scleropages_formosus
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	72.886	ENSSMAG00000011671	nrde2	99	72.750	Scophthalmus_maximus
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	76.689	ENSSDUG00000017948	nrde2	99	76.277	Seriola_dumerili
ENSMZEG00005008319	nrde2	92	74.188	ENSSLDG00000023798	nrde2	99	76.124	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMZEG00005008319	nrde2	89	47.092	ENSSPUG00000006348	NRDE2	97	46.803	Sphenodon_punctatus
ENSMZEG00005008319	nrde2	95	75.044	ENSSPAG00000000539	nrde2	99	77.081	Stegastes_partitus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.702	ENSSSCG00000002434	NRDE2	100	45.604	Sus_scrofa
ENSMZEG00005008319	nrde2	90	47.659	ENSTGUG00000012462	-	99	45.928	Taeniopygia_guttata
ENSMZEG00005008319	nrde2	78	68.925	ENSTRUG00000002798	nrde2	97	69.032	Takifugu_rubripes
ENSMZEG00005008319	nrde2	85	48.673	ENSTBEG00000011834	NRDE2	86	46.667	Tupaia_belangeri
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	45.228	ENSTTRG00000013583	NRDE2	100	45.926	Tursiops_truncatus
ENSMZEG00005008319	nrde2	90	45.926	ENSUAMG00000004159	NRDE2	95	46.251	Ursus_americanus
ENSMZEG00005008319	nrde2	90	45.093	ENSUMAG00000006393	NRDE2	97	44.272	Ursus_maritimus
ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.754	ENSVVUG00000018202	NRDE2	100	44.580	Vulpes_vulpes
ENSMZEG00005008319	nrde2	92	44.565	ENSXETG00000015708	nrde2	100	43.142	Xenopus_tropicalis
ENSMZEG00005008319	nrde2	92	71.182	ENSXCOG00000013298	nrde2	98	71.273	Xiphophorus_couchianus
ENSMZEG00005008319	nrde2	100	73.693	ENSXMAG00000009320	nrde2	100	74.108	Xiphophorus_maculatus