EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMZEG00005011298 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO2 (1 of many)
Alias: FLJ12155|IPO3|KPNB2B|TRN2
Full Name: transportin 2
Gene Type: protein_coding
Species: Maylandia_zebra
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10365 bases
Position: chrLG4:12849270-12859634
Accession: 19998
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMZEP00005015068	IBN_N	PF03810.19	7.3e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMZET00005015557	TNPO2 (1 of many)-201	2613	-	ENSMZEP00005015068	870 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSG00000105576	TNPO2	100	91.071	Homo_sapiens
ENSMZEG00005011298	TNPO2	81	91.873	ENSAPOG00000013185	-	96	91.873	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.461	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	91.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	86.444	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	86.111	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMZEG00005011298	TNPO2	87	94.194	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	94.194	Amphilophus_citrinellus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	87	91.074	ENSACIG00000009586	-	100	90.710	Amphilophus_citrinellus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.461	ENSAOCG00000010152	-	100	91.143	Amphiprion_ocellaris
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	94.944	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	94.944	Amphiprion_ocellaris
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.461	ENSAPEG00000013268	-	100	91.143	Amphiprion_percula
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	94.944	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	94.944	Amphiprion_percula
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	93.933	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	93.933	Anabas_testudineus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.461	ENSATEG00000019171	-	100	91.143	Anabas_testudineus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.326	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	89.213	Anolis_carolinensis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.876	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	88.539	Aotus_nancymaae
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	87.287	ENSACLG00000020672	-	100	87.287	Astatotilapia_calliptera
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	95.618	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	95.618	Astatotilapia_calliptera
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	90.808	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	90.808	Astyanax_mexicanus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.876	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	88.539	Bos_taurus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.000	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	87.667	Callithrix_jacchus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.876	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	88.764	Canis_familiaris
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.101	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	88.764	Canis_lupus_dingo
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	86.242	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	85.906	Capra_hircus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	88.652	Carlito_syrichta
ENSMZEG00005011298	TNPO2	93	86.461	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	86.105	Cavia_aperea
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	88.652	Cavia_porcellus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	88.652	Cebus_capucinus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.000	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	87.667	Cercocebus_atys
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	88.652	Chinchilla_lanigera
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	88.652	Chlorocebus_sabaeus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.438	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	89.326	Chrysemys_picta_bellii
ENSMZEG00005011298	TNPO2	96	89.044	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	88.695	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.111	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	87.778	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.101	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	88.764	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.338	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	89.338	Cynoglossus_semilaevis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	87	89.290	ENSCSEG00000011477	-	100	89.290	Cynoglossus_semilaevis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.461	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	91.461	Cyprinodon_variegatus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.134	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	91.246	Cyprinodon_variegatus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.876	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	88.876	Danio_rerio
ENSMZEG00005011298	TNPO2	88	79.363	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	79.236	Dasypus_novemcinctus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	82.483	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	91.241	Dipodomys_ordii
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	69.832	FBgn0024921	Tnpo	100	69.721	Drosophila_melanogaster
ENSMZEG00005011298	TNPO2	92	82.629	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	81.925	Echinops_telfairi
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	88.652	Equus_asinus_asinus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	88.652	Equus_caballus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	87	81.210	ENSELUG00000016542	-	99	81.596	Esox_lucius
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.907	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	91.907	Esox_lucius
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.000	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	87.667	Felis_catus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	88.652	Fukomys_damarensis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	97	90.498	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	90.498	Fundulus_heteroclitus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.582	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	91.695	Fundulus_heteroclitus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	83.687	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	83.687	Gadus_morhua
ENSMZEG00005011298	TNPO2	80	91.667	ENSGMOG00000014237	-	90	91.667	Gadus_morhua
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.236	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	90.919	Gambusia_affinis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	92.256	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	92.368	Gambusia_affinis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.438	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	89.326	Gopherus_agassizii
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	95.618	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	95.618	Haplochromis_burtoni
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.461	ENSHBUG00000018317	-	100	91.143	Haplochromis_burtoni
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.876	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	88.539	Heterocephalus_glaber_female
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	87.333	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	89.781	Heterocephalus_glaber_male
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	92.022	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	92.022	Hippocampus_comes
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.124	ENSHCOG00000020440	-	100	90.807	Hippocampus_comes
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	90.899	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	90.899	Ictalurus_punctatus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	92.135	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	92.135	Ictalurus_punctatus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.101	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	88.764	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.000	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	87.667	Jaculus_jaculus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	90.225	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	90.225	Kryptolebias_marmoratus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.348	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	91.348	Kryptolebias_marmoratus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.685	ENSLBEG00000005301	-	100	91.368	Labrus_bergylta
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	94.045	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	94.045	Labrus_bergylta
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	86.629	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	86.629	Latimeria_chalumnae
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	92.584	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	92.584	Lepisosteus_oculatus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.111	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	87.778	Loxodonta_africana
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.000	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	87.667	Macaca_fascicularis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	88.652	Macaca_mulatta
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	88.652	Macaca_nemestrina
ENSMZEG00005011298	TNPO2	96	88.098	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	87.673	Mandrillus_leucophaeus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.461	ENSMAMG00000011862	-	100	91.143	Mastacembelus_armatus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	92.018	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	92.018	Mastacembelus_armatus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.461	ENSMZEG00005007408	-	100	91.143	Maylandia_zebra
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	95.618	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	95.618	Maylandia_zebra
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	88.652	Microcebus_murinus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.101	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	88.764	Microtus_ochrogaster
ENSMZEG00005011298	TNPO2	87	90.179	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	90.179	Mola_mola
ENSMZEG00005011298	TNPO2	86	88.160	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	88.160	Mola_mola
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.111	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	89.111	Monodelphis_domestica
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	92.697	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	92.697	Monopterus_albus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.236	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	90.919	Monopterus_albus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.101	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	88.764	Mus_caroli
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.101	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	91.241	Mus_musculus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.101	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	88.764	Mus_pahari
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.101	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	88.764	Mus_spretus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.101	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	88.764	Mustela_putorius_furo
ENSMZEG00005011298	TNPO2	96	89.044	ENSMLUG00000012669	TNPO2	100	88.695	Myotis_lucifugus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.101	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	88.764	Nannospalax_galili
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.461	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	91.143	Neolamprologus_brichardi
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	90.337	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	90.337	Neolamprologus_brichardi
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	78.698	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	78.698	Nomascus_leucogenys
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	85.297	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	85.297	Notamacropus_eugenii
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	88.652	Octodon_degus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	90.545	ENSONIG00000017706	-	100	90.545	Oreochromis_niloticus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	95.393	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	95.393	Oreochromis_niloticus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.101	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	88.989	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	91	92.442	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	92.442	Oryctolagus_cuniculus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	58	91.434	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.434	Oryzias_latipes
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	93.708	ENSORLG00000010363	tnpo2	100	93.708	Oryzias_latipes
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	93.708	ENSORLG00020015785	tnpo2	100	93.708	Oryzias_latipes_hni
ENSMZEG00005011298	TNPO2	58	91.235	ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.235	Oryzias_latipes_hni
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	93.371	ENSORLG00015005489	tnpo2	100	92.921	Oryzias_latipes_hsok
ENSMZEG00005011298	TNPO2	58	91.434	ENSORLG00015003941	TNPO2	99	91.434	Oryzias_latipes_hsok
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.124	ENSOMEG00000013440	TNPO2	100	91.124	Oryzias_melastigma
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	93.483	ENSOMEG00000014877	TNPO2	100	93.483	Oryzias_melastigma
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	87.978	ENSOARG00000011717	TNPO2	92	87.944	Ovis_aries
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.000	ENSPPAG00000019494	TNPO2	100	87.667	Pan_paniscus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.111	ENSPPRG00000003075	TNPO2	100	87.778	Panthera_pardus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	84	83.733	ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	83.333	Panthera_tigris_altaica
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.000	ENSPTRG00000010535	TNPO2	100	87.667	Pan_troglodytes
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.000	ENSPANG00000016857	TNPO2	100	87.667	Papio_anubis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.236	ENSPKIG00000004824	tnpo2	100	91.236	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMZEG00005011298	TNPO2	97	89.195	ENSPKIG00000002899	-	99	89.183	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	85.841	ENSPSIG00000010215	TNPO2	100	85.730	Pelodiscus_sinensis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	86	90.439	ENSPMGG00000016459	TNPO2	98	90.439	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	54	96.829	ENSPMGG00000022850	tnpo2	99	91.235	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.111	ENSPEMG00000018702	Tnpo2	100	87.778	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMZEG00005011298	TNPO2	99	88.483	ENSPCIG00000015327	TNPO2	95	89.977	Phascolarctos_cinereus
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ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	92.368	ENSPLAG00000018842	tnpo2	100	92.929	Poecilia_latipinna
ENSMZEG00005011298	TNPO2	93	90.625	ENSPLAG00000010687	TNPO2	97	90.625	Poecilia_latipinna
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ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	92.368	ENSPMEG00000006069	tnpo2	100	92.929	Poecilia_mexicana
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.348	ENSPREG00000000415	TNPO2	99	91.031	Poecilia_reticulata
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	92.031	ENSPREG00000001121	TNPO2	100	92.593	Poecilia_reticulata
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSPPYG00000009602	TNPO2	100	88.652	Pongo_abelii
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	79.956	ENSPCAG00000014916	TNPO2	100	79.623	Procavia_capensis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSPCOG00000018386	TNPO2	100	88.652	Propithecus_coquereli
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	84.624	ENSPVAG00000013411	TNPO2	100	84.292	Pteropus_vampyrus
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ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	87.287	ENSPNYG00000001235	-	100	87.287	Pundamilia_nyererei
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	92.247	ENSPNAG00000024491	tnpo2	100	92.247	Pygocentrus_nattereri
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.910	ENSPNAG00000026208	-	100	91.592	Pygocentrus_nattereri
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.101	ENSRNOG00000003970	Tnpo2	97	88.764	Rattus_norvegicus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSRBIG00000036652	TNPO2	100	88.652	Rhinopithecus_bieti
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSRROG00000040402	TNPO2	100	88.652	Rhinopithecus_roxellana
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	88.652	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	96	90.210	ENSSHAG00000015858	TNPO2	99	90.210	Sarcophilus_harrisii
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.461	ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.461	Scleropages_formosus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.685	ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	91.685	Scleropages_formosus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	94.494	ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	94.494	Scophthalmus_maximus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.236	ENSSMAG00000004050	-	100	91.236	Scophthalmus_maximus
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ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	94.719	ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	94.719	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.573	ENSSLDG00000013107	-	100	91.256	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	83	89.736	ENSSARG00000003825	TNPO2	86	89.443	Sorex_araneus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.162	ENSSPUG00000000736	TNPO2	100	89.050	Sphenodon_punctatus
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ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.226	ENSSPAG00000008511	-	100	89.226	Stegastes_partitus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	89.101	ENSSSCG00000013726	TNPO2	100	88.764	Sus_scrofa
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.236	ENSTRUG00000009453	TNPO2	100	91.236	Takifugu_rubripes
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.798	ENSTRUG00000012698	tnpo2	99	91.798	Takifugu_rubripes
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.427	ENSTNIG00000014071	TNPO2	100	88.427	Tetraodon_nigroviridis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	83.596	ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	94.813	Tetraodon_nigroviridis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.111	ENSTTRG00000005443	TNPO2	100	87.778	Tursiops_truncatus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.000	ENSUAMG00000019621	TNPO2	100	87.667	Ursus_americanus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	85.366	ENSUMAG00000006504	TNPO2	99	85.033	Ursus_maritimus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	85.034	ENSVVUG00000023860	TNPO2	100	84.694	Vulpes_vulpes
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	86.496	ENSXETG00000004771	tnpo2	99	86.384	Xenopus_tropicalis
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.315	ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.315	Xiphophorus_couchianus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.348	ENSXMAG00000012793	TNPO2	100	91.031	Xiphophorus_maculatus
ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	92.368	ENSXMAG00000014217	TNPO2	100	92.929	Xiphophorus_maculatus