EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMZEG00005016572 (Gene tree)
Gene ID: 101475617
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC101475617
Gene Type: protein_coding
Species: Maylandia_zebra
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14331 bases
Position: chrLG12:16945316-16959646
Accession: 101475617
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMZEP00005022096	MMR_HSR1	PF01926.23	3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMZET00005022833	-	6109	XM_004544526	ENSMZEP00005022096	448 (aa)	XP_004544583	UPI00032A1992

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	58.980	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.980	Amphilophus_citrinellus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	95.089	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	95.089	Amphilophus_citrinellus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	93.080	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	93.080	Amphiprion_ocellaris
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Amphiprion_ocellaris
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Amphiprion_percula
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	92.857	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	92.857	Amphiprion_percula
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Anabas_testudineus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Anabas_testudineus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	99	57.812	ENSACAG00000028632	-	99	57.906	Anolis_carolinensis
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	99.777	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	99.777	Astatotilapia_calliptera
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	59.956	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.956	Astatotilapia_calliptera
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	60.132	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.132	Astyanax_mexicanus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	81.069	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.069	Astyanax_mexicanus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	79	62.079	ENSCING00000020807	-	94	62.079	Ciona_intestinalis
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	98	56.591	ENSCSAVG00000009987	-	98	56.818	Ciona_savignyi
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	58.444	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Cynoglossus_semilaevis
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	87.028	Cynoglossus_semilaevis
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Cyprinodon_variegatus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Cyprinodon_variegatus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	98	83.864	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.864	Danio_rerio
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	75.000	Danio_rerio
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	80	56.546	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	96	56.546	Eptatretus_burgeri
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	99	81.390	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.390	Esox_lucius
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Fundulus_heteroclitus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Fundulus_heteroclitus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	89	55.860	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.860	Gadus_morhua
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Gambusia_affinis
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	91.964	Gambusia_affinis
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	58	94.574	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	Gasterosteus_aculeatus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	85	64.136	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	62.189	Gasterosteus_aculeatus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	60.177	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	60.177	Haplochromis_burtoni
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	99.777	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	99.777	Haplochromis_burtoni
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	99	85.135	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.135	Hippocampus_comes
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Hippocampus_comes
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	77.060	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.060	Ictalurus_punctatus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	96	60.508	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.508	Ictalurus_punctatus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	84	59.043	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	59.043	Ictalurus_punctatus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Kryptolebias_marmoratus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Kryptolebias_marmoratus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Labrus_bergylta
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	99	62.472	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.697	Latimeria_chalumnae
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	62.361	ENSLACG00000004899	-	99	62.361	Latimeria_chalumnae
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	99	70.495	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.495	Latimeria_chalumnae
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Lepisosteus_oculatus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Mastacembelus_armatus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	96	60.970	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.970	Mastacembelus_armatus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	59.735	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.735	Maylandia_zebra
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	58.093	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.093	Mola_mola
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Monopterus_albus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	98	90.205	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	90.205	Monopterus_albus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	96	60.739	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.739	Neolamprologus_brichardi
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	99.107	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	99.107	Neolamprologus_brichardi
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	98.661	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	98.661	Oreochromis_niloticus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Oreochromis_niloticus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	86.830	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	86.830	Oryzias_latipes
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Oryzias_latipes
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Oryzias_latipes_hni
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Oryzias_latipes_hni
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Oryzias_latipes_hsok
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Oryzias_latipes_hsok
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Oryzias_melastigma
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Oryzias_melastigma
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	58.797	ENSPKIG00000023918	-	98	58.797	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	77.506	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.506	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	86.607	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	86.607	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	60.177	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	60.177	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	61.556	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	99	61.556	Poecilia_formosa
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ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Poecilia_latipinna
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ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	98	89.066	ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	89.066	Poecilia_reticulata
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