EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMZEG00005016784 (Gene tree)
Gene ID: 101484562
Gene Symbol: eef1db
Alias: EF-1D|FLJ20897
Full Name: eukaryotic translation elongation factor 1 delta
Gene Type: protein_coding
Species: Maylandia_zebra
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6485 bases
Position: chrLG17:8750262-8756746
Accession: 101484562
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMZEP00005022406	EF1_GNE	PF00736.19	2.8e-36	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMZET00005023152	-	2554	XM_004567348	ENSMZEP00005022406	722 (aa)	XP_004567405	UPI000329C3D6

Gene Model

Click here to download ENSMZEG00005016784's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMZEG00005016784's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMZEG00005016784	eef1db	94	42.918	ENSG00000104529	EEF1D	100	78.512	Homo_sapiens
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	80.384	ENSAPOG00000023431	eef1db	100	80.384	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	42.770	ENSAMEG00000006602	EEF1D	60	53.425	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMZEG00005016784	eef1db	99	84.240	ENSACIG00000010650	eef1db	96	83.961	Amphilophus_citrinellus
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	82.280	ENSAOCG00000014204	eef1db	100	82.830	Amphiprion_ocellaris
ENSMZEG00005016784	eef1db	70	61.873	ENSAPEG00000024651	eef1da	100	61.386	Amphiprion_percula
ENSMZEG00005016784	eef1db	91	42.297	ENSACAG00000001861	EEF1D	91	62.928	Anolis_carolinensis
ENSMZEG00005016784	eef1db	88	44.257	ENSANAG00000019322	-	99	54.636	Aotus_nancymaae
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	100.000	ENSACLG00000024793	eef1db	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	53.748	ENSAMXG00000042563	eef1db	100	73.684	Astyanax_mexicanus
ENSMZEG00005016784	eef1db	93	42.158	ENSBTAG00000014643	EEF1D	95	59.247	Bos_taurus
ENSMZEG00005016784	eef1db	90	43.769	ENSCJAG00000021419	-	99	54.967	Callithrix_jacchus
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	42.812	ENSCAFG00000001317	EEF1D	76	54.223	Canis_familiaris
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	42.620	ENSTSYG00000037283	EEF1D	99	59.868	Carlito_syrichta
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	43.760	ENSCAPG00000011840	EEF1D	89	77.465	Cavia_aperea
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	43.760	ENSCPOG00000000048	EEF1D	89	77.465	Cavia_porcellus
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	44.328	ENSCCAG00000027651	-	99	60.526	Cebus_capucinus
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	44.277	ENSCATG00000028384	EEF1D	99	60.855	Cercocebus_atys
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	45.800	ENSCSAG00000008996	EEF1D	84	45.024	Chlorocebus_sabaeus
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	44.949	ENSCPBG00000019036	EEF1D	88	59.939	Chrysemys_picta_bellii
ENSMZEG00005016784	eef1db	84	38.705	ENSCANG00000041983	-	84	45.345	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	42.386	ENSCGRG00001014276	Eef1d	89	74.126	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMZEG00005016784	eef1db	78	41.924	ENSCGRG00000007914	Eef1d	89	74.126	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMZEG00005016784	eef1db	61	48.894	ENSCSEG00000002444	-	98	60.465	Cynoglossus_semilaevis
ENSMZEG00005016784	eef1db	99	70.972	ENSCVAG00000005186	eef1db	97	71.548	Cyprinodon_variegatus
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	41.066	ENSDNOG00000046639	EEF1D	79	40.816	Dasypus_novemcinctus
ENSMZEG00005016784	eef1db	92	42.151	ENSDORG00000000593	Eef1d	89	74.825	Dipodomys_ordii
ENSMZEG00005016784	eef1db	94	41.443	ENSEASG00005009652	EEF1D	53	54.496	Equus_asinus_asinus
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	43.438	ENSECAG00000007976	EEF1D	53	53.951	Equus_caballus
ENSMZEG00005016784	eef1db	59	83.117	ENSEEUG00000013475	EEF1D	59	83.117	Erinaceus_europaeus
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	51.511	ENSELUG00000002069	eef1db	88	93.506	Esox_lucius
ENSMZEG00005016784	eef1db	99	39.535	ENSFCAG00000027237	EEF1D	99	53.156	Felis_catus
ENSMZEG00005016784	eef1db	92	42.959	ENSFALG00000009498	EEF1D	97	41.168	Ficedula_albicollis
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	70.564	ENSFHEG00000007592	eef1db	100	71.252	Fundulus_heteroclitus
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	56.320	ENSGMOG00000014076	eef1db	93	56.640	Gadus_morhua
ENSMZEG00005016784	eef1db	94	43.828	ENSGALG00000040098	EEF1D	99	58.786	Gallus_gallus
ENSMZEG00005016784	eef1db	91	65.809	ENSGACG00000005657	-	98	65.224	Gasterosteus_aculeatus
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	42.938	ENSGAGG00000018441	EEF1D	99	59.627	Gopherus_agassizii
ENSMZEG00005016784	eef1db	94	42.493	ENSGGOG00000002389	EEF1D	99	57.616	Gorilla_gorilla
ENSMZEG00005016784	eef1db	99	99.161	ENSHBUG00000022389	eef1db	99	99.161	Haplochromis_burtoni
ENSMZEG00005016784	eef1db	94	43.564	ENSHGLG00000016981	EEF1D	89	76.056	Heterocephalus_glaber_female
ENSMZEG00005016784	eef1db	94	42.574	ENSHGLG00100006503	EEF1D	89	76.056	Heterocephalus_glaber_male
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	43.438	ENSSTOG00000000025	EEF1D	90	41.854	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	43.642	ENSJJAG00000012433	-	99	52.318	Jaculus_jaculus
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	75.341	ENSLBEG00000004547	-	62	75.204	Labrus_bergylta
ENSMZEG00005016784	eef1db	94	42.938	ENSLACG00000004419	EEF1D	99	61.514	Latimeria_chalumnae
ENSMZEG00005016784	eef1db	96	48.700	ENSLOCG00000008527	eef1db	100	49.106	Lepisosteus_oculatus
ENSMZEG00005016784	eef1db	96	41.886	ENSLAFG00000029200	EEF1D	53	53.514	Loxodonta_africana
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	44.428	ENSMFAG00000034313	EEF1D	99	60.855	Macaca_fascicularis
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	44.428	ENSMMUG00000001645	EEF1D	99	60.855	Macaca_mulatta
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	44.428	ENSMNEG00000042392	EEF1D	89	42.081	Macaca_nemestrina
ENSMZEG00005016784	eef1db	77	84.416	ENSMLEG00000042065	EEF1D	79	84.416	Mandrillus_leucophaeus
ENSMZEG00005016784	eef1db	86	44.648	ENSMGAG00000013035	EEF1D	99	61.238	Meleagris_gallopavo
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	43.868	ENSMICG00000028262	EEF1D	99	53.974	Microcebus_murinus
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	43.239	ENSMOCG00000010950	-	89	74.825	Microtus_ochrogaster
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	44.105	ENSMODG00000011225	EEF1D	91	43.129	Monodelphis_domestica
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	43.553	MGP_CAROLIEiJ_G0019901	Eef1d	89	76.667	Mus_caroli
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	43.780	ENSMUSG00000055762	Eef1d	89	76.667	Mus_musculus
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	42.767	MGP_PahariEiJ_G0019909	Eef1d	81	80.000	Mus_pahari
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	43.553	MGP_SPRETEiJ_G0020801	Eef1d	89	76.667	Mus_spretus
ENSMZEG00005016784	eef1db	90	41.791	ENSMPUG00000008287	-	85	41.353	Mustela_putorius_furo
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	43.082	ENSNGAG00000020992	Eef1d	90	74.126	Nannospalax_galili
ENSMZEG00005016784	eef1db	73	44.022	ENSNLEG00000001832	-	99	61.184	Nomascus_leucogenys
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	43.574	ENSODEG00000013624	-	89	75.352	Octodon_degus
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	96.823	ENSONIG00000010994	eef1db	100	96.823	Oreochromis_niloticus
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	72.077	ENSORLG00000012458	-	100	80.602	Oryzias_latipes
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	72.077	ENSORLG00020003803	eef1db	100	78.595	Oryzias_latipes_hni
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	72.314	ENSORLG00015002276	eef1db	100	79.599	Oryzias_latipes_hsok
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	44.234	ENSOGAG00000014938	EEF1D	53	53.804	Otolemur_garnettii
ENSMZEG00005016784	eef1db	94	42.776	ENSPPAG00000019348	EEF1D	99	67.027	Pan_paniscus
ENSMZEG00005016784	eef1db	94	42.857	ENSPTRG00000020660	EEF1D	99	67.027	Pan_troglodytes
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	44.812	ENSPANG00000012667	EEF1D	91	73.333	Papio_anubis
ENSMZEG00005016784	eef1db	76	56.952	ENSPKIG00000002308	eef1db	100	69.767	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMZEG00005016784	eef1db	93	43.247	ENSPSIG00000009932	EEF1D	98	58.462	Pelodiscus_sinensis
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	42.835	ENSPEMG00000012989	Eef1d	89	74.825	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	43.000	ENSPCIG00000008858	-	91	41.320	Phascolarctos_cinereus
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	74.176	ENSPFOG00000000287	-	100	83.000	Poecilia_formosa
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	73.937	ENSPREG00000010251	-	100	82.609	Poecilia_reticulata
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	40.807	ENSPPYG00000018938	EEF1D	75	49.457	Pongo_abelii
ENSMZEG00005016784	eef1db	93	40.929	ENSPCAG00000005528	EEF1D	85	53.552	Procavia_capensis
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	44.550	ENSPCOG00000025419	-	99	54.305	Propithecus_coquereli
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	44.076	ENSPVAG00000005990	EEF1D	54	53.951	Pteropus_vampyrus
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	55.680	ENSPNAG00000007955	eef1db	100	74.751	Pygocentrus_nattereri
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	43.868	ENSRNOG00000021638	Eef1d	52	53.804	Rattus_norvegicus
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	43.759	ENSRBIG00000044433	EEF1D	99	60.197	Rhinopithecus_bieti
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	44.060	ENSRROG00000031483	EEF1D	99	60.855	Rhinopithecus_roxellana
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	43.498	ENSSBOG00000024169	-	99	60.066	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMZEG00005016784	eef1db	89	43.195	ENSSHAG00000007688	EEF1D	91	41.864	Sarcophilus_harrisii
ENSMZEG00005016784	eef1db	97	59.517	ENSSFOG00015006740	eef1d	100	64.634	Scleropages_formosus
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	71.837	ENSSMAG00000018035	eef1db	99	71.837	Scophthalmus_maximus
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	82.167	ENSSDUG00000021580	eef1db	99	82.579	Seriola_dumerili
ENSMZEG00005016784	eef1db	79	59.639	ENSSDUG00000015374	eef1da	100	62.000	Seriola_dumerili
ENSMZEG00005016784	eef1db	79	59.706	ENSSLDG00000015251	eef1da	99	64.495	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMZEG00005016784	eef1db	93	37.591	ENSSARG00000011522	EEF1D	56	47.123	Sorex_araneus
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	43.423	ENSSSCG00000006954	EEF1D	99	58.746	Sus_scrofa
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	44.969	ENSTGUG00000012761	EEF1D	60	55.738	Taeniopygia_guttata
ENSMZEG00005016784	eef1db	85	63.799	ENSTNIG00000008232	eef1db	100	64.078	Tetraodon_nigroviridis
ENSMZEG00005016784	eef1db	93	40.580	ENSTTRG00000015166	EEF1D	85	41.429	Tursiops_truncatus
ENSMZEG00005016784	eef1db	99	40.356	ENSUAMG00000012897	EEF1D	98	40.108	Ursus_americanus
ENSMZEG00005016784	eef1db	94	43.944	ENSXETG00000004674	eef1d	100	60.645	Xenopus_tropicalis
ENSMZEG00005016784	eef1db	100	73.590	ENSXMAG00000005913	-	100	82.943	Xiphophorus_maculatus