EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMZEG00005018140 (Gene tree)
Gene ID: 101468885
Gene Symbol: papolg
Alias: zgc:63762
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Maylandia_zebra
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18192 bases
Position: chrLG13:27581223-27599414
Accession: 101468885
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMZEP00005024261	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.9e-29	1	2
ENSMZEP00005024261	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.9e-29	2	2
ENSMZEP00005024259	PAP_RNA-bind	PF04926.15	6.3e-29	1	2
ENSMZEP00005024259	PAP_RNA-bind	PF04926.15	6.3e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMZET00005025057	-	2094	-	ENSMZEP00005024261	697 (aa)	-	-
ENSMZET00005025055	-	4718	XM_014414385	ENSMZEP00005024259	849 (aa)	XP_014269871	UPI0003AF7DB8

Gene Model

Click here to download ENSMZEG00005018140's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
mze03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMZEG00005018140's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.034	ENSG00000115421	PAPOLG	100	87.179	Homo_sapiens
ENSMZEG00005018140	papolg	100	88.746	ENSAPOG00000004798	papolg	100	89.215	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.190	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	70.082	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMZEG00005018140	papolg	100	92.980	ENSACIG00000010546	papolg	99	92.980	Amphilophus_citrinellus
ENSMZEG00005018140	papolg	100	88.863	ENSAOCG00000010254	papolg	100	89.097	Amphiprion_ocellaris
ENSMZEG00005018140	papolg	100	89.097	ENSAPEG00000006944	papolg	100	89.332	Amphiprion_percula
ENSMZEG00005018140	papolg	100	90.739	ENSATEG00000009007	papolg	100	89.566	Anabas_testudineus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	66.171	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	79.664	Anas_platyrhynchos
ENSMZEG00005018140	papolg	80	59.801	ENSACAG00000015048	-	67	73.201	Anolis_carolinensis
ENSMZEG00005018140	papolg	99	72.779	ENSANAG00000024627	PAPOLG	98	72.404	Aotus_nancymaae
ENSMZEG00005018140	papolg	100	100.000	ENSACLG00000015592	papolg	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSMZEG00005018140	papolg	99	76.333	ENSAMXG00000004611	papolg	100	75.974	Astyanax_mexicanus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.748	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	69.121	Bos_taurus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.862	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	69.401	Callithrix_jacchus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.014	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	60.104	Canis_familiaris
ENSMZEG00005018140	papolg	99	72.090	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	72.496	Canis_lupus_dingo
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.999	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	70.274	Capra_hircus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.645	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	68.823	Carlito_syrichta
ENSMZEG00005018140	papolg	55	80.840	ENSCAPG00000014901	-	100	80.840	Cavia_aperea
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.532	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	69.560	Cavia_porcellus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	73.202	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	98	72.688	Cebus_capucinus
ENSMZEG00005018140	papolg	89	83.562	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	81.818	Cercocebus_atys
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.708	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	69.638	Chinchilla_lanigera
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.725	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	69.271	Chlorocebus_sabaeus
ENSMZEG00005018140	papolg	89	67.820	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	66.860	Choloepus_hoffmanni
ENSMZEG00005018140	papolg	70	64.097	ENSCING00000024664	-	92	64.097	Ciona_intestinalis
ENSMZEG00005018140	papolg	69	65.155	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.155	Ciona_savignyi
ENSMZEG00005018140	papolg	99	72.920	ENSCANG00000038120	PAPOLG	98	72.404	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.692	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	70.396	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.692	ENSCGRG00000005552	-	100	70.396	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMZEG00005018140	papolg	100	89.201	ENSCSEG00000000771	papolg	94	97.487	Cynoglossus_semilaevis
ENSMZEG00005018140	papolg	100	86.722	ENSCVAG00000016602	papolg	100	86.518	Cyprinodon_variegatus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	78.776	ENSDARG00000012141	papolg	100	76.943	Danio_rerio
ENSMZEG00005018140	papolg	99	68.027	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	67.098	Dasypus_novemcinctus
ENSMZEG00005018140	papolg	60	86.223	ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.014	Dipodomys_ordii
ENSMZEG00005018140	papolg	99	57.551	ENSETEG00000011815	PAPOLG	100	55.886	Echinops_telfairi
ENSMZEG00005018140	papolg	62	72.396	ENSEBUG00000004020	papolg	90	72.396	Eptatretus_burgeri
ENSMZEG00005018140	papolg	66	58.952	ENSEBUG00000005042	-	78	58.952	Eptatretus_burgeri
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.163	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	69.470	Equus_asinus_asinus
ENSMZEG00005018140	papolg	100	70.109	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	69.891	Equus_caballus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	62.963	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.141	Erinaceus_europaeus
ENSMZEG00005018140	papolg	100	80.484	ENSELUG00000014497	papolg	98	78.682	Esox_lucius
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.924	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	69.082	Felis_catus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	60.408	ENSFALG00000011079	PAPOLG	77	73.120	Ficedula_albicollis
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.884	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	69.509	Fukomys_damarensis
ENSMZEG00005018140	papolg	64	84.899	ENSFHEG00000019080	papolg	97	83.610	Fundulus_heteroclitus
ENSMZEG00005018140	papolg	89	93.796	ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.357	Gadus_morhua
ENSMZEG00005018140	papolg	99	64.986	ENSGALG00000007853	PAPOLG	85	76.692	Gallus_gallus
ENSMZEG00005018140	papolg	100	85.932	ENSGAFG00000003263	papolg	100	85.781	Gambusia_affinis
ENSMZEG00005018140	papolg	99	84.647	ENSGACG00000002718	papolg	100	88.073	Gasterosteus_aculeatus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	73.061	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	98	72.546	Gorilla_gorilla
ENSMZEG00005018140	papolg	100	99.882	ENSHBUG00000004882	papolg	100	99.882	Haplochromis_burtoni
ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.175	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	69.492	Heterocephalus_glaber_female
ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.175	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	69.599	Heterocephalus_glaber_male
ENSMZEG00005018140	papolg	100	85.630	ENSHCOG00000006782	papolg	100	85.748	Hippocampus_comes
ENSMZEG00005018140	papolg	99	78.333	ENSIPUG00000021642	papolg	99	78.011	Ictalurus_punctatus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.405	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	69.340	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMZEG00005018140	papolg	60	86.461	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	86.247	Jaculus_jaculus
ENSMZEG00005018140	papolg	100	86.199	ENSKMAG00000016439	papolg	100	85.380	Kryptolebias_marmoratus
ENSMZEG00005018140	papolg	100	85.436	ENSLBEG00000023218	papolg	100	86.124	Labrus_bergylta
ENSMZEG00005018140	papolg	99	66.214	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	64.844	Latimeria_chalumnae
ENSMZEG00005018140	papolg	99	77.763	ENSLOCG00000016130	papolg	100	77.720	Lepisosteus_oculatus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.233	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	86.014	Loxodonta_africana
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.204	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	69.531	Macaca_fascicularis
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.204	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	69.531	Macaca_mulatta
ENSMZEG00005018140	papolg	99	63.043	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	62.354	Macaca_nemestrina
ENSMZEG00005018140	papolg	99	72.831	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	69.401	Mandrillus_leucophaeus
ENSMZEG00005018140	papolg	100	89.566	ENSMAMG00000010667	papolg	100	88.628	Mastacembelus_armatus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	63.165	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	60.802	Meleagris_gallopavo
ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.429	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	69.281	Mesocricetus_auratus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	72.560	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	69.100	Microcebus_murinus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.099	ENSMOCG00000006857	Papolg	99	70.259	Microtus_ochrogaster
ENSMZEG00005018140	papolg	99	88.684	ENSMMOG00000008020	papolg	99	87.895	Mola_mola
ENSMZEG00005018140	papolg	99	69.118	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	69.120	Monodelphis_domestica
ENSMZEG00005018140	papolg	100	87.222	ENSMALG00000007012	papolg	100	87.456	Monopterus_albus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.506	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	86.854	Mus_caroli
ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.332	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.854	Mus_musculus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.845	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	69.986	Mus_pahari
ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.196	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.854	Mus_spretus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	69.919	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	69.340	Mustela_putorius_furo
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.708	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	69.291	Myotis_lucifugus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.107	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	69.520	Nannospalax_galili
ENSMZEG00005018140	papolg	99	80.842	ENSNBRG00000011943	papolg	99	87.583	Neolamprologus_brichardi
ENSMZEG00005018140	papolg	60	86.811	ENSNLEG00000009507	-	100	85.781	Nomascus_leucogenys
ENSMZEG00005018140	papolg	65	68.923	ENSMEUG00000013605	-	68	68.923	Notamacropus_eugenii
ENSMZEG00005018140	papolg	99	69.865	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	68.952	Ochotona_princeps
ENSMZEG00005018140	papolg	60	83.373	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.373	Octodon_degus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	83.840	ENSONIG00000002985	papolg	100	87.071	Oreochromis_niloticus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	69.681	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	69.921	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.300	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	69.211	Oryctolagus_cuniculus
ENSMZEG00005018140	papolg	100	86.316	ENSORLG00000001577	papolg	100	85.848	Oryzias_latipes
ENSMZEG00005018140	papolg	100	86.550	ENSORLG00020002482	papolg	100	85.731	Oryzias_latipes_hni
ENSMZEG00005018140	papolg	100	86.316	ENSORLG00015008836	papolg	100	85.848	Oryzias_latipes_hsok
ENSMZEG00005018140	papolg	100	87.471	ENSOMEG00000001406	papolg	100	86.417	Oryzias_melastigma
ENSMZEG00005018140	papolg	56	61.743	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	60.880	Otolemur_garnettii
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.999	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	68.992	Ovis_aries
ENSMZEG00005018140	papolg	99	73.257	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	98	72.831	Pan_paniscus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.788	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	69.082	Panthera_pardus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.652	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	68.952	Panthera_tigris_altaica
ENSMZEG00005018140	papolg	99	73.257	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	98	72.831	Pan_troglodytes
ENSMZEG00005018140	papolg	99	66.985	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	66.104	Papio_anubis
ENSMZEG00005018140	papolg	99	77.419	ENSPKIG00000003313	papolg	99	77.119	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMZEG00005018140	papolg	99	75.316	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	75.421	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMZEG00005018140	papolg	99	66.578	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	65.608	Pelodiscus_sinensis
ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.175	ENSPEMG00000008960	-	100	69.332	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMZEG00005018140	papolg	99	53.701	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.010	Petromyzon_marinus
ENSMZEG00005018140	papolg	71	64.859	ENSPMAG00000004864	-	99	64.414	Petromyzon_marinus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.421	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.701	Phascolarctos_cinereus
ENSMZEG00005018140	papolg	100	86.251	ENSPFOG00000012909	papolg	100	85.198	Poecilia_formosa
ENSMZEG00005018140	papolg	100	86.235	ENSPLAG00000018445	papolg	100	85.064	Poecilia_latipinna
ENSMZEG00005018140	papolg	100	86.016	ENSPMEG00000003961	papolg	100	85.332	Poecilia_mexicana
ENSMZEG00005018140	papolg	100	85.647	ENSPREG00000010358	papolg	100	85.647	Poecilia_reticulata
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.759	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	69.271	Pongo_abelii
ENSMZEG00005018140	papolg	99	63.115	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	86	83.019	Procavia_capensis
ENSMZEG00005018140	papolg	99	67.525	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	64.052	Propithecus_coquereli
ENSMZEG00005018140	papolg	87	82.873	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	81.982	Pteropus_vampyrus
ENSMZEG00005018140	papolg	100	100.000	ENSPNYG00000006729	papolg	100	100.000	Pundamilia_nyererei
ENSMZEG00005018140	papolg	99	77.083	ENSPNAG00000015521	papolg	100	75.938	Pygocentrus_nattereri
ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.448	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	70.169	Rattus_norvegicus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	66.301	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	64.798	Rhinopithecus_bieti
ENSMZEG00005018140	papolg	99	73.305	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	69.361	Rhinopithecus_roxellana
ENSMZEG00005018140	papolg	99	73.061	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	98	72.831	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMZEG00005018140	papolg	95	69.456	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.315	Sarcophilus_harrisii
ENSMZEG00005018140	papolg	99	75.833	ENSSFOG00015002383	papolg	99	74.716	Scleropages_formosus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	69.688	ENSSFOG00015011874	papolg	99	68.028	Scleropages_formosus
ENSMZEG00005018140	papolg	95	98.155	ENSSMAG00000015598	papolg	100	88.188	Scophthalmus_maximus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	90.805	ENSSDUG00000000912	papolg	100	89.753	Seriola_dumerili
ENSMZEG00005018140	papolg	100	89.566	ENSSLDG00000001217	papolg	100	89.517	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.556	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	66.320	Sphenodon_punctatus
ENSMZEG00005018140	papolg	100	89.918	ENSSPAG00000009004	papolg	100	89.918	Stegastes_partitus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.529	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	69.470	Sus_scrofa
ENSMZEG00005018140	papolg	76	73.019	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	73.019	Taeniopygia_guttata
ENSMZEG00005018140	papolg	100	88.575	ENSTRUG00000006410	papolg	99	87.270	Takifugu_rubripes
ENSMZEG00005018140	papolg	99	77.568	ENSTNIG00000017106	papolg	100	79.739	Tetraodon_nigroviridis
ENSMZEG00005018140	papolg	99	64.169	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	99	63.624	Tupaia_belangeri
ENSMZEG00005018140	papolg	99	66.027	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	65.201	Tursiops_truncatus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	72.472	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	69.281	Ursus_americanus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.300	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	69.281	Ursus_maritimus
ENSMZEG00005018140	papolg	99	66.803	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	66.144	Vicugna_pacos
ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.909	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	70.315	Vulpes_vulpes
ENSMZEG00005018140	papolg	99	67.925	ENSXETG00000002208	papolg	100	66.839	Xenopus_tropicalis
ENSMZEG00005018140	papolg	71	96.593	ENSXCOG00000006611	papolg	73	96.593	Xiphophorus_couchianus
ENSMZEG00005018140	papolg	79	94.000	ENSXMAG00000007383	papolg	95	94.000	Xiphophorus_maculatus