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Description

Ensembl ID: ENSMZEG00005026892 (Gene tree)
Gene ID: 101483923
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: RNA-binding protein Musashi homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Maylandia_zebra
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 24480 bases
Position: chrLG5:11603929-11628408
Accession: 101483923
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMZEP00005036043	RRM_1	PF00076.22	2.2e-33	1	2
ENSMZEP00005036043	RRM_1	PF00076.22	2.2e-33	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMZET00005037313	MSI1-201	4185	XM_004545211	ENSMZEP00005036043	351 (aa)	XP_004545268	UPI000329C0FA

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
mze03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	ENSG00000135097	MSI1	100	83.242	Homo_sapiens
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	98.006	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.006	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.877	ENSAPOG00000023458	-	100	92.877	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	63.780	ENSAMEG00000013302	MSI1	83	89.231	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMZEG00005026892	MSI1	93	88.073	ENSACIG00000017754	-	72	99.505	Amphilophus_citrinellus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	98.006	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	98.006	Amphiprion_ocellaris
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	83.587	ENSAOCG00000009031	-	95	83.587	Amphiprion_ocellaris
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.877	ENSAPEG00000006857	-	84	92.877	Amphiprion_percula
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	98.006	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	98.006	Amphiprion_percula
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	89.859	ENSATEG00000023779	-	100	89.859	Anabas_testudineus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	88.515	ENSATEG00000017059	MSI1	100	88.515	Anabas_testudineus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	84.254	ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.254	Anolis_carolinensis
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	ENSANAG00000027151	MSI1	100	83.242	Aotus_nancymaae
ENSMZEG00005026892	MSI1	82	83.333	ENSANAG00000027901	-	88	83.333	Aotus_nancymaae
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	100.000	ENSACLG00000011230	MSI1	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.593	ENSACLG00000000117	-	100	93.598	Astatotilapia_calliptera
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	89.969	ENSAMXG00000038960	msi1	76	89.969	Astyanax_mexicanus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	85.337	Bos_taurus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	83.242	Callithrix_jacchus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	82.967	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	82.967	Canis_familiaris
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	85.209	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	85.209	Canis_lupus_dingo
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	81.843	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	81.843	Capra_hircus
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.709	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	Carlito_syrichta
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	85.348	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	85.348	Cavia_aperea
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	85.380	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	85.380	Cavia_porcellus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	83.242	Cebus_capucinus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.242	Cercocebus_atys
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	85.380	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	85.380	Chinchilla_lanigera
ENSMZEG00005026892	MSI1	78	81.720	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	81.720	Chlorocebus_sabaeus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	86.686	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	86.686	Chrysemys_picta_bellii
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.756	ENSCANG00000040651	MSI1	100	84.756	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.242	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.802	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	84.802	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	83.841	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	83.841	Cynoglossus_semilaevis
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	97.436	ENSCSEG00000005834	-	100	97.436	Cynoglossus_semilaevis
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	90.883	ENSCSEG00000008352	-	100	90.883	Cynoglossus_semilaevis
ENSMZEG00005026892	MSI1	51	72.388	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	94	72.388	Cyprinodon_variegatus
ENSMZEG00005026892	MSI1	76	79.358	ENSCVAG00000017463	-	89	79.358	Cyprinodon_variegatus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.877	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	92.877	Cyprinodon_variegatus
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	85.397	ENSDARG00000010710	msi1	100	92.991	Danio_rerio
ENSMZEG00005026892	MSI1	79	90.741	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	98	90.741	Danio_rerio
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	81.646	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	81.646	Dasypus_novemcinctus
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.132	ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.132	Dipodomys_ordii
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	81.402	ENSETEG00000004756	MSI1	100	81.402	Echinops_telfairi
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	ENSEASG00005004736	MSI1	100	83.242	Equus_asinus_asinus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	ENSECAG00000017526	MSI1	100	83.242	Equus_caballus
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	86.533	ENSELUG00000023219	MSI1	92	86.533	Esox_lucius
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	87.195	ENSELUG00000023280	-	100	86.890	Esox_lucius
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.242	Felis_catus
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	89.000	ENSFALG00000007574	MSI1	100	89.000	Ficedula_albicollis
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.451	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	Fukomys_damarensis
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	97.436	ENSFHEG00000003560	-	100	97.436	Fundulus_heteroclitus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	93.162	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	93.162	Fundulus_heteroclitus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	90.313	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.028	Gadus_morhua
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	85.393	ENSGMOG00000017838	-	100	85.393	Gadus_morhua
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	89.695	ENSGALG00000007227	MSI1	98	75.318	Gallus_gallus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	70.621	ENSGAFG00000005860	-	100	70.621	Gambusia_affinis
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	96.657	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	96.657	Gambusia_affinis
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	87.328	ENSGACG00000008674	-	100	87.328	Gasterosteus_aculeatus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	91.168	ENSGACG00000012679	MSI1	100	91.168	Gasterosteus_aculeatus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	86.402	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	86.402	Gopherus_agassizii
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	85.032	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	85.032	Gorilla_gorilla
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	100.000	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.593	ENSHBUG00000011841	-	100	92.593	Haplochromis_burtoni
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	82.967	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	82.967	Heterocephalus_glaber_female
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.451	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	84.451	Heterocephalus_glaber_male
ENSMZEG00005026892	MSI1	90	94.921	ENSHCOG00000012019	MSI1	95	94.921	Hippocampus_comes
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	87.606	ENSHCOG00000012067	-	100	87.606	Hippocampus_comes
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	88.604	ENSIPUG00000001976	msi1	100	88.604	Ictalurus_punctatus
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	85.209	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.209	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	70.604	ENSJJAG00000010643	-	100	70.442	Jaculus_jaculus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	83.242	Jaculus_jaculus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.308	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	92.308	Kryptolebias_marmoratus
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	90.854	ENSKMAG00000019877	-	100	90.854	Kryptolebias_marmoratus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	98.575	ENSLBEG00000001375	-	100	98.575	Labrus_bergylta
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	93.162	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	93.162	Labrus_bergylta
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.302	ENSLACG00000018287	MSI1	100	84.302	Latimeria_chalumnae
ENSMZEG00005026892	MSI1	52	76.786	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	76.786	Lepisosteus_oculatus
ENSMZEG00005026892	MSI1	90	75.831	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	75.831	Loxodonta_africana
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	85.380	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	85.380	Macaca_fascicularis
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	85.380	ENSMMUG00000031527	MSI1	96	84.483	Macaca_mulatta
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	83.242	Macaca_nemestrina
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.756	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	84.756	Mandrillus_leucophaeus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	91.738	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	91.738	Mastacembelus_armatus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	97.151	ENSMAMG00000018426	-	100	97.151	Mastacembelus_armatus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.593	ENSMZEG00005000340	-	100	92.593	Maylandia_zebra
ENSMZEG00005026892	MSI1	63	93.491	ENSMGAG00000016518	-	100	93.491	Meleagris_gallopavo
ENSMZEG00005026892	MSI1	69	88.017	ENSMAUG00000016820	Msi1	99	88.017	Mesocricetus_auratus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	ENSMICG00000033181	MSI1	100	83.242	Microcebus_murinus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	82.967	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	82.967	Microtus_ochrogaster
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	81.763	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	81.763	Mola_mola
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	85.470	ENSMMOG00000012265	-	100	85.470	Mola_mola
ENSMZEG00005026892	MSI1	90	58.735	ENSMODG00000003189	-	100	58.735	Monodelphis_domestica
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	96.951	ENSMALG00000001426	-	100	96.951	Monopterus_albus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.593	ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.593	Monopterus_albus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	82.692	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	100	82.692	Mus_caroli
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	82.692	ENSMUSG00000054256	Msi1	99	87.346	Mus_musculus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	84.986	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	100	84.986	Mus_pahari
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	82.692	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	100	82.692	Mus_spretus
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	85.209	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	85.209	Mustela_putorius_furo
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	75.893	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	75.893	Myotis_lucifugus
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.802	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	Nannospalax_galili
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.593	ENSNBRG00000000841	-	100	92.593	Neolamprologus_brichardi
ENSMZEG00005026892	MSI1	88	90.984	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	90.984	Neolamprologus_brichardi
ENSMZEG00005026892	MSI1	90	75.305	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.305	Nomascus_leucogenys
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	66.159	ENSMEUG00000015759	MSI1	100	66.159	Notamacropus_eugenii
ENSMZEG00005026892	MSI1	90	77.460	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	77.460	Ochotona_princeps
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.756	ENSODEG00000006328	MSI1	100	84.756	Octodon_degus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	96.154	ENSONIG00000019452	-	100	96.154	Oreochromis_niloticus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.593	ENSONIG00000011182	MSI1	100	92.593	Oreochromis_niloticus
ENSMZEG00005026892	MSI1	94	85.209	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	85.209	Oryctolagus_cuniculus
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	96.296	ENSORLG00000029593	MSI1	100	96.296	Oryzias_latipes
ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.593	ENSORLG00000019978	-	100	92.593	Oryzias_latipes
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ENSMZEG00005026892	MSI1	100	92.593	ENSORLG00015013672	-	76	87.749	Oryzias_latipes_hsok
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