EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSNBRG00000004105 (Gene tree)
Gene ID: 102796021
Gene Symbol: mars
Alias: id:ibd5106
Full Name: methionine--tRNA ligase%2C cytoplasmic-like
Gene Type: protein_coding
Species: Neolamprologus_brichardi
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17561 bases
Position: chrJH422277.1:678144-695704
Accession: 102796021
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNBRP00000005214	tRNA-synt_1g	PF09334.11	1.7e-144	1	1
ENSNBRP00000005214	Anticodon_1	PF08264.13	4.8e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNBRT00000005371	-	2547	XM_006783430	ENSNBRP00000005214	848 (aa)	XP_006783493	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.703	ENSG00000166986	MARS	88	72.549	Homo_sapiens
ENSNBRG00000004105	mars	100	85.956	ENSAPOG00000020238	mars	95	86.086	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNBRG00000004105	mars	100	66.491	ENSAMEG00000004962	MARS	99	66.491	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNBRG00000004105	mars	100	91.219	ENSACIG00000016271	mars	100	89.412	Amphilophus_citrinellus
ENSNBRG00000004105	mars	100	86.476	ENSAOCG00000011411	mars	95	86.476	Amphiprion_ocellaris
ENSNBRG00000004105	mars	100	85.956	ENSAPEG00000008610	mars	95	85.956	Amphiprion_percula
ENSNBRG00000004105	mars	100	85.881	ENSATEG00000025019	mars	95	85.881	Anabas_testudineus
ENSNBRG00000004105	mars	90	66.537	ENSAPLG00000014821	MARS	88	66.537	Anas_platyrhynchos
ENSNBRG00000004105	mars	99	63.284	ENSACAG00000006698	MARS	91	63.151	Anolis_carolinensis
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.013	ENSANAG00000027589	MARS	100	64.351	Aotus_nancymaae
ENSNBRG00000004105	mars	100	95.325	ENSACLG00000018937	mars	97	95.325	Astatotilapia_calliptera
ENSNBRG00000004105	mars	100	68.522	ENSAMXG00000017335	mars	94	68.094	Astyanax_mexicanus
ENSNBRG00000004105	mars	100	59.086	ENSBTAG00000018405	MARS	99	58.785	Bos_taurus
ENSNBRG00000004105	mars	78	53.245	WBGene00003415	mars-1	85	57.071	Caenorhabditis_elegans
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.440	ENSCJAG00000007249	MARS	92	65.177	Callithrix_jacchus
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.440	ENSCAFG00000000229	MARS	99	65.440	Canis_familiaris
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.440	ENSCAFG00020023661	MARS	99	65.440	Canis_lupus_dingo
ENSNBRG00000004105	mars	100	58.977	ENSCHIG00000027023	MARS	99	65.177	Capra_hircus
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.440	ENSTSYG00000005193	MARS	92	65.440	Carlito_syrichta
ENSNBRG00000004105	mars	77	64.992	ENSCAPG00000014448	MARS	84	64.992	Cavia_aperea
ENSNBRG00000004105	mars	100	58.747	ENSCPOG00000012866	MARS	99	65.092	Cavia_porcellus
ENSNBRG00000004105	mars	100	64.629	ENSCCAG00000032206	MARS	93	65.046	Cebus_capucinus
ENSNBRG00000004105	mars	100	64.783	ENSCATG00000038907	MARS	99	64.783	Cercocebus_atys
ENSNBRG00000004105	mars	96	59.707	ENSCLAG00000012164	MARS	99	65.309	Chinchilla_lanigera
ENSNBRG00000004105	mars	100	64.146	ENSCSAG00000004852	MARS	92	64.146	Chlorocebus_sabaeus
ENSNBRG00000004105	mars	100	62.992	ENSCPBG00000017136	MARS	99	56.986	Chrysemys_picta_bellii
ENSNBRG00000004105	mars	80	59.593	ENSCING00000018550	-	99	59.169	Ciona_intestinalis
ENSNBRG00000004105	mars	69	63.095	ENSCSAVG00000006145	-	97	63.903	Ciona_savignyi
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.486	ENSCANG00000034583	MARS	92	65.046	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNBRG00000004105	mars	100	59.521	ENSCGRG00001019238	Mars	99	65.572	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNBRG00000004105	mars	100	59.521	ENSCGRG00000017321	Mars	99	65.572	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNBRG00000004105	mars	99	83.377	ENSCSEG00000010816	mars	95	83.117	Cynoglossus_semilaevis
ENSNBRG00000004105	mars	100	85.621	ENSCVAG00000009314	mars	94	85.621	Cyprinodon_variegatus
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.297	ENSDARG00000034396	mars	97	65.297	Danio_rerio
ENSNBRG00000004105	mars	100	58.836	ENSDNOG00000017502	MARS	99	58.919	Dasypus_novemcinctus
ENSNBRG00000004105	mars	100	64.258	ENSDORG00000007127	Mars	92	64.258	Dipodomys_ordii
ENSNBRG00000004105	mars	88	51.793	FBgn0034401	MetRS	72	50.965	Drosophila_melanogaster
ENSNBRG00000004105	mars	64	69.074	ENSETEG00000007106	MARS	99	68.889	Echinops_telfairi
ENSNBRG00000004105	mars	66	58.855	ENSEBUG00000010439	mars	87	58.855	Eptatretus_burgeri
ENSNBRG00000004105	mars	100	66.229	ENSEASG00005007208	MARS	92	66.229	Equus_asinus_asinus
ENSNBRG00000004105	mars	100	66.229	ENSECAG00000015175	MARS	92	66.229	Equus_caballus
ENSNBRG00000004105	mars	88	63.538	ENSEEUG00000015503	MARS	89	63.538	Erinaceus_europaeus
ENSNBRG00000004105	mars	100	77.922	ENSELUG00000010453	mars	96	77.326	Esox_lucius
ENSNBRG00000004105	mars	100	66.097	ENSFCAG00000002083	MARS	92	66.097	Felis_catus
ENSNBRG00000004105	mars	100	59.911	ENSFDAG00000010217	MARS	99	60.022	Fukomys_damarensis
ENSNBRG00000004105	mars	100	85.547	ENSFHEG00000016374	mars	95	85.938	Fundulus_heteroclitus
ENSNBRG00000004105	mars	100	79.051	ENSGMOG00000007987	mars	95	78.788	Gadus_morhua
ENSNBRG00000004105	mars	90	65.879	ENSGALG00000039315	MARS	83	65.879	Gallus_gallus
ENSNBRG00000004105	mars	100	85.620	ENSGAFG00000013461	mars	94	85.488	Gambusia_affinis
ENSNBRG00000004105	mars	100	84.915	ENSGACG00000006474	mars	96	84.915	Gasterosteus_aculeatus
ENSNBRG00000004105	mars	96	66.102	ENSGAGG00000011640	MARS	89	66.362	Gopherus_agassizii
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.572	ENSGGOG00000001982	MARS	99	59.736	Gorilla_gorilla
ENSNBRG00000004105	mars	100	81.185	ENSHBUG00000009575	mars	97	81.069	Haplochromis_burtoni
ENSNBRG00000004105	mars	95	51.469	ENSHGLG00000019739	-	92	51.586	Heterocephalus_glaber_female
ENSNBRG00000004105	mars	100	58.243	ENSHGLG00000013493	MARS	100	64.915	Heterocephalus_glaber_female
ENSNBRG00000004105	mars	96	50.291	ENSHGLG00100004906	-	93	50.350	Heterocephalus_glaber_male
ENSNBRG00000004105	mars	100	58.243	ENSHGLG00100006885	MARS	100	64.915	Heterocephalus_glaber_male
ENSNBRG00000004105	mars	100	80.909	ENSHCOG00000001090	mars	95	80.859	Hippocampus_comes
ENSNBRG00000004105	mars	91	65.752	ENSIPUG00000024410	mars	98	75.953	Ictalurus_punctatus
ENSNBRG00000004105	mars	72	78.748	ENSIPUG00000024413	mars	98	78.748	Ictalurus_punctatus
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.092	ENSSTOG00000001128	MARS	99	64.961	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNBRG00000004105	mars	100	58.849	ENSJJAG00000018827	Mars	99	64.915	Jaculus_jaculus
ENSNBRG00000004105	mars	100	86.104	ENSKMAG00000012408	mars	93	88.626	Kryptolebias_marmoratus
ENSNBRG00000004105	mars	100	85.528	ENSLBEG00000013609	mars	95	85.528	Labrus_bergylta
ENSNBRG00000004105	mars	100	66.494	ENSLACG00000018854	MARS	92	66.188	Latimeria_chalumnae
ENSNBRG00000004105	mars	100	57.935	ENSLAFG00000013525	MARS	81	65.309	Loxodonta_africana
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.309	ENSMFAG00000010123	MARS	99	64.621	Macaca_fascicularis
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.309	ENSMMUG00000011277	MARS	88	72.549	Macaca_mulatta
ENSNBRG00000004105	mars	100	63.863	ENSMNEG00000044464	MARS	92	63.863	Macaca_nemestrina
ENSNBRG00000004105	mars	87	69.748	ENSMLEG00000034638	MARS	91	69.748	Mandrillus_leucophaeus
ENSNBRG00000004105	mars	97	84.915	ENSMAMG00000010012	mars	100	76.596	Mastacembelus_armatus
ENSNBRG00000004105	mars	100	95.195	ENSMZEG00005007092	mars	97	95.195	Maylandia_zebra
ENSNBRG00000004105	mars	100	60.022	ENSMAUG00000011482	Mars	99	59.912	Mesocricetus_auratus
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.617	ENSMICG00000032056	MARS	99	65.486	Microcebus_murinus
ENSNBRG00000004105	mars	100	59.506	ENSMOCG00000010941	Mars	99	66.535	Microtus_ochrogaster
ENSNBRG00000004105	mars	99	81.890	ENSMMOG00000007461	mars	95	81.890	Mola_mola
ENSNBRG00000004105	mars	100	85.379	ENSMALG00000010005	mars	94	86.854	Monopterus_albus
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.046	MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	64.783	Mus_caroli
ENSNBRG00000004105	mars	100	64.915	ENSMUSG00000040354	Mars	99	64.652	Mus_musculus
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.046	MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	65.046	Mus_pahari
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.046	MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	92	64.783	Mus_spretus
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.879	ENSMPUG00000001831	MARS	99	65.879	Mustela_putorius_furo
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.617	ENSMLUG00000001037	MARS	92	65.486	Myotis_lucifugus
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.440	ENSNGAG00000018824	Mars	92	65.309	Nannospalax_galili
ENSNBRG00000004105	mars	100	59.412	ENSNLEG00000017297	MARS	99	59.304	Nomascus_leucogenys
ENSNBRG00000004105	mars	88	64.477	ENSMEUG00000007195	MARS	90	64.652	Notamacropus_eugenii
ENSNBRG00000004105	mars	100	57.018	ENSOPRG00000006518	MARS	99	62.943	Ochotona_princeps
ENSNBRG00000004105	mars	100	58.938	ENSODEG00000001752	MARS	99	65.486	Octodon_degus
ENSNBRG00000004105	mars	100	93.453	ENSONIG00000005090	mars	95	93.453	Oreochromis_niloticus
ENSNBRG00000004105	mars	70	60.778	ENSOANG00000013318	MARS	100	60.928	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.177	ENSOCUG00000007373	MARS	99	65.177	Oryctolagus_cuniculus
ENSNBRG00000004105	mars	100	82.768	ENSORLG00000005405	mars	94	83.681	Oryzias_latipes
ENSNBRG00000004105	mars	100	83.181	ENSORLG00020017397	mars	94	84.094	Oryzias_latipes_hni
ENSNBRG00000004105	mars	100	83.681	ENSORLG00015012976	mars	94	84.204	Oryzias_latipes_hsok
ENSNBRG00000004105	mars	100	84.129	ENSOMEG00000018411	mars	100	80.700	Oryzias_melastigma
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.229	ENSOGAG00000005226	MARS	100	64.791	Otolemur_garnettii
ENSNBRG00000004105	mars	100	59.086	ENSOARG00000006477	MARS	99	65.309	Ovis_aries
ENSNBRG00000004105	mars	100	59.609	ENSPPAG00000025147	MARS	99	64.752	Pan_paniscus
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.966	ENSPPRG00000023243	MARS	92	65.966	Panthera_pardus
ENSNBRG00000004105	mars	100	66.097	ENSPTIG00000006721	MARS	92	66.097	Panthera_tigris_altaica
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.572	ENSPTRG00000005135	MARS	92	65.440	Pan_troglodytes
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.046	ENSPANG00000009140	MARS	99	64.621	Papio_anubis
ENSNBRG00000004105	mars	100	73.924	ENSPKIG00000002833	mars	96	73.987	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNBRG00000004105	mars	61	60.638	ENSPSIG00000013607	MARS	99	40.522	Pelodiscus_sinensis
ENSNBRG00000004105	mars	99	82.092	ENSPMGG00000014847	mars	94	81.830	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNBRG00000004105	mars	100	66.229	ENSPEMG00000000046	Mars	99	65.834	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNBRG00000004105	mars	100	64.921	ENSPCIG00000023765	MARS	92	64.783	Phascolarctos_cinereus
ENSNBRG00000004105	mars	100	86.162	ENSPFOG00000006998	mars	95	85.770	Poecilia_formosa
ENSNBRG00000004105	mars	100	86.162	ENSPLAG00000017870	mars	95	85.770	Poecilia_latipinna
ENSNBRG00000004105	mars	100	86.579	ENSPMEG00000008197	mars	95	86.579	Poecilia_mexicana
ENSNBRG00000004105	mars	100	86.292	ENSPREG00000008123	mars	95	85.901	Poecilia_reticulata
ENSNBRG00000004105	mars	100	59.674	ENSPPYG00000004691	MARS	99	59.674	Pongo_abelii
ENSNBRG00000004105	mars	94	64.126	ENSPCAG00000016037	MARS	89	63.995	Procavia_capensis
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.177	ENSPCOG00000017598	MARS	99	65.177	Propithecus_coquereli
ENSNBRG00000004105	mars	80	62.672	ENSPVAG00000012112	MARS	72	62.672	Pteropus_vampyrus
ENSNBRG00000004105	mars	100	95.065	ENSPNYG00000013809	mars	97	95.065	Pundamilia_nyererei
ENSNBRG00000004105	mars	100	77.091	ENSPNAG00000017290	mars	97	77.349	Pygocentrus_nattereri
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.572	ENSRNOG00000025459	Mars	99	65.572	Rattus_norvegicus
ENSNBRG00000004105	mars	96	60.159	ENSRBIG00000044782	MARS	96	60.045	Rhinopithecus_bieti
ENSNBRG00000004105	mars	100	59.175	ENSRROG00000042331	MARS	99	59.155	Rhinopithecus_roxellana
ENSNBRG00000004105	mars	69	51.706	YGR264C	MES1	75	51.706	Saccharomyces_cerevisiae
ENSNBRG00000004105	mars	100	62.681	ENSSBOG00000022875	MARS	92	62.418	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNBRG00000004105	mars	100	59.283	ENSSHAG00000007182	MARS	99	59.175	Sarcophilus_harrisii
ENSNBRG00000004105	mars	100	74.902	ENSSFOG00015011038	mars	96	75.425	Scleropages_formosus
ENSNBRG00000004105	mars	100	85.214	ENSSMAG00000012409	mars	95	85.344	Scophthalmus_maximus
ENSNBRG00000004105	mars	100	86.900	ENSSDUG00000019070	mars	95	86.900	Seriola_dumerili
ENSNBRG00000004105	mars	90	88.922	ENSSLDG00000005561	mars	90	88.922	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNBRG00000004105	mars	90	69.474	ENSSARG00000002477	MARS	92	69.474	Sorex_araneus
ENSNBRG00000004105	mars	81	69.463	ENSSPUG00000007756	MARS	99	68.519	Sphenodon_punctatus
ENSNBRG00000004105	mars	100	86.494	ENSSPAG00000022691	mars	95	86.753	Stegastes_partitus
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.748	ENSSSCG00000023318	MARS	87	65.617	Sus_scrofa
ENSNBRG00000004105	mars	100	80.940	ENSTRUG00000014774	mars	95	80.809	Takifugu_rubripes
ENSNBRG00000004105	mars	100	76.765	ENSTNIG00000007060	mars	95	76.864	Tetraodon_nigroviridis
ENSNBRG00000004105	mars	71	62.541	ENSTBEG00000000303	MARS	77	62.376	Tupaia_belangeri
ENSNBRG00000004105	mars	82	68.975	ENSTTRG00000013088	MARS	75	68.543	Tursiops_truncatus
ENSNBRG00000004105	mars	50	56.598	ENSUAMG00000019284	-	99	56.891	Ursus_americanus
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.703	ENSUMAG00000019826	MARS	99	65.966	Ursus_maritimus
ENSNBRG00000004105	mars	55	74.510	ENSVPAG00000008665	MARS	53	74.510	Vicugna_pacos
ENSNBRG00000004105	mars	100	65.046	ENSVVUG00000017940	MARS	99	65.046	Vulpes_vulpes
ENSNBRG00000004105	mars	74	69.793	ENSXETG00000025174	mars	99	69.634	Xenopus_tropicalis
ENSNBRG00000004105	mars	100	85.267	ENSXCOG00000013878	mars	95	84.876	Xiphophorus_couchianus
ENSNBRG00000004105	mars	100	86.292	ENSXMAG00000017920	mars	95	85.901	Xiphophorus_maculatus