EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSNBRG00000005870 (Gene tree)
Gene ID: 102785023
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin-4-like
Gene Type: protein_coding
Species: Neolamprologus_brichardi
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11130 bases
Position: chrJH422306.1:5487674-5498803
Accession: 102785023
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNBRP00000007839	RIX1	PF08167.12	1.7e-09	1	1
ENSNBRP00000007819	RIX1	PF08167.12	3.2e-09	1	1
ENSNBRP00000007839	IBN_N	PF03810.19	5.7e-16	1	1
ENSNBRP00000007819	IBN_N	PF03810.19	5.9e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNBRT00000008038	-	3291	-	ENSNBRP00000007819	1096 (aa)	-	-
ENSNBRT00000008058	-	3255	XM_006794733	ENSNBRP00000007839	1084 (aa)	XP_006794796	UPI0003EBF14C

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.946	ENSG00000196497	IPO4	99	45.891	Homo_sapiens
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	83.118	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	83.118	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	44.958	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	44.783	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	86.777	ENSACIG00000004246	ipo4	100	86.777	Amphilophus_citrinellus
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	86.147	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	86.147	Amphiprion_ocellaris
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	86.330	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	86.330	Amphiprion_percula
ENSNBRG00000005870	ipo4	92	88.534	ENSATEG00000017082	ipo4	99	88.534	Anabas_testudineus
ENSNBRG00000005870	ipo4	84	46.875	ENSACAG00000003973	-	97	47.289	Anolis_carolinensis
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.760	ENSANAG00000037973	IPO4	99	45.799	Aotus_nancymaae
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	93.534	ENSACLG00000019742	ipo4	100	93.534	Astatotilapia_calliptera
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	72.970	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	72.970	Astyanax_mexicanus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.278	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.866	Bos_taurus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.132	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	46.076	Callithrix_jacchus
ENSNBRG00000005870	ipo4	98	46.355	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	46.211	Canis_familiaris
ENSNBRG00000005870	ipo4	98	45.946	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	45.023	Canis_lupus_dingo
ENSNBRG00000005870	ipo4	98	45.514	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	45.143	Capra_hircus
ENSNBRG00000005870	ipo4	98	45.981	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	45.841	Carlito_syrichta
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.791	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	45.606	Cavia_porcellus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.039	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	46.076	Cebus_capucinus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.132	ENSCATG00000040395	IPO4	99	46.076	Cercocebus_atys
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.976	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.891	Chinchilla_lanigera
ENSNBRG00000005870	ipo4	90	47.149	ENSCPBG00000025757	IPO4	97	46.464	Chrysemys_picta_bellii
ENSNBRG00000005870	ipo4	92	37.282	ENSCING00000008639	-	99	37.573	Ciona_intestinalis
ENSNBRG00000005870	ipo4	92	37.734	ENSCSAVG00000011482	-	98	38.128	Ciona_savignyi
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.853	ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.799	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.134	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	44.773	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.134	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	44.773	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	78.145	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	78.145	Cynoglossus_semilaevis
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	75.346	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	75.296	Cyprinodon_variegatus
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	76.081	ENSDARG00000041493	ipo4	100	76.081	Danio_rerio
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.389	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	46.389	Dasypus_novemcinctus
ENSNBRG00000005870	ipo4	98	46.262	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	46.019	Dipodomys_ordii
ENSNBRG00000005870	ipo4	97	30.663	FBgn0042177	CG32164	98	30.515	Drosophila_melanogaster
ENSNBRG00000005870	ipo4	97	30.314	FBgn0042178	CG32165	98	30.314	Drosophila_melanogaster
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.346	ENSETEG00000018381	IPO4	99	45.354	Echinops_telfairi
ENSNBRG00000005870	ipo4	90	47.406	ENSEASG00005011954	IPO4	96	47.208	Equus_asinus_asinus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.926	ENSECAG00000009909	IPO4	99	45.749	Equus_caballus
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	76.422	ENSELUG00000020628	ipo4	100	76.514	Esox_lucius
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.204	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	46.211	Felis_catus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	42.251	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	42.149	Fukomys_damarensis
ENSNBRG00000005870	ipo4	89	81.793	ENSFHEG00000009351	ipo4	98	81.561	Fundulus_heteroclitus
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	80.129	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	80.110	Gadus_morhua
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	81.485	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	81.852	Gambusia_affinis
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	83.057	ENSGACG00000002276	ipo4	99	82.965	Gasterosteus_aculeatus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.853	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	45.799	Gorilla_gorilla
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	94.843	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	94.843	Haplochromis_burtoni
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.606	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	45.614	Heterocephalus_glaber_female
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.328	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	45.337	Heterocephalus_glaber_male
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	78.281	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	78.281	Hippocampus_comes
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	74.954	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	74.862	Ictalurus_punctatus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	47.037	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	46.759	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNBRG00000005870	ipo4	98	46.405	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	46.076	Jaculus_jaculus
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	82.002	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	81.910	Kryptolebias_marmoratus
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	84.637	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	84.637	Labrus_bergylta
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	50.989	ENSLACG00000001428	IPO4	100	50.945	Latimeria_chalumnae
ENSNBRG00000005870	ipo4	79	70.844	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	69.821	Lepisosteus_oculatus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.672	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	45.656	Loxodonta_africana
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.226	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	46.168	Macaca_fascicularis
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.226	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	46.168	Macaca_mulatta
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.132	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	46.076	Macaca_nemestrina
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.226	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	46.168	Mandrillus_leucophaeus
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	83.871	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	83.871	Mastacembelus_armatus
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	94.936	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	94.936	Maylandia_zebra
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.102	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	45.111	Mesocricetus_auratus
ENSNBRG00000005870	ipo4	98	45.981	ENSMICG00000001719	IPO4	99	45.933	Microcebus_murinus
ENSNBRG00000005870	ipo4	98	44.725	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	44.742	Microtus_ochrogaster
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	81.943	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	81.760	Mola_mola
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	43.623	ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.993	Monodelphis_domestica
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	82.569	ENSMALG00000001587	ipo4	100	82.752	Monopterus_albus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	44.640	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	46.552	Mus_caroli
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	44.362	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	46.182	Mus_musculus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	44.681	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	46.650	Mus_pahari
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	44.640	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	46.305	Mus_spretus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.759	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	46.667	Mustela_putorius_furo
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.185	ENSMLUG00000025277	IPO4	85	45.370	Myotis_lucifugus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.019	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	45.741	Nannospalax_galili
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.574	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	46.574	Ochotona_princeps
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.531	ENSODEG00000002609	IPO4	99	46.168	Octodon_degus
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	97.330	ENSONIG00000014574	ipo4	100	97.330	Oreochromis_niloticus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.941	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	46.218	Oryctolagus_cuniculus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	80.908	ENSORLG00000006457	ipo4	99	82.184	Oryzias_latipes
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	81.969	ENSORLG00020004286	ipo4	100	81.601	Oryzias_latipes_hni
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	81.969	ENSORLG00015021856	ipo4	100	81.601	Oryzias_latipes_hsok
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	79.833	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	79.688	Oryzias_melastigma
ENSNBRG00000005870	ipo4	98	44.640	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	45.379	Otolemur_garnettii
ENSNBRG00000005870	ipo4	98	44.841	ENSOARG00000019188	IPO4	98	44.424	Ovis_aries
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.480	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	45.069	Pan_paniscus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.296	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	46.303	Panthera_pardus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.204	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	46.211	Panthera_tigris_altaica
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.666	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	45.522	Pan_troglodytes
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	46.319	ENSPANG00000026278	IPO4	99	46.260	Papio_anubis
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	69.991	ENSPKIG00000007683	-	99	69.898	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	69.513	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	70.275	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	73.670	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	73.578	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	43.900	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	44.004	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNBRG00000005870	ipo4	94	46.387	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	46.484	Phascolarctos_cinereus
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	81.927	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	81.927	Poecilia_formosa
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	82.018	ENSPLAG00000020556	ipo4	100	82.018	Poecilia_latipinna
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	81.927	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	81.927	Poecilia_mexicana
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	81.743	ENSPREG00000017605	ipo4	100	81.743	Poecilia_reticulata
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.946	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	45.983	Pongo_abelii
ENSNBRG00000005870	ipo4	98	46.828	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	47.048	Procavia_capensis
ENSNBRG00000005870	ipo4	98	45.140	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	45.102	Propithecus_coquereli
ENSNBRG00000005870	ipo4	98	45.685	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	46.104	Pteropus_vampyrus
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	96.961	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	96.961	Pundamilia_nyererei
ENSNBRG00000005870	ipo4	100	77.491	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	77.491	Pygocentrus_nattereri
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	44.773	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	44.691	Rattus_norvegicus
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.853	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	45.799	Rhinopithecus_bieti
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	45.853	ENSRROG00000011492	IPO4	99	45.799	Rhinopithecus_roxellana
ENSNBRG00000005870	ipo4	99	44.921	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	44.968	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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