EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNBRG00000006068 (Gene tree)
Gene ID: 102793122
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC102793122
Gene Type: protein_coding
Species: Neolamprologus_brichardi
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9784 bases
Position: chrJH422279.1:4335308-4345091
Accession: 102793122
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNBRP00000007823	MMR_HSR1	PF01926.23	2.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNBRT00000008042	-	1341	XM_006784209	ENSNBRP00000007823	446 (aa)	XP_006784272	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	96	60.648	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.648

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.356	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	60.356	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	59.020	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	59.020	Amphilophus_citrinellus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	94.866	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	94.866	Amphilophus_citrinellus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Amphiprion_ocellaris
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.579	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.579	Amphiprion_ocellaris
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Amphiprion_percula
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.356	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	60.356	Amphiprion_percula
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.356	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.356	Anabas_testudineus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Anabas_testudineus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	99	58.166	ENSACAG00000028632	-	99	58.389	Anolis_carolinensis
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	98.884	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	98.884	Astatotilapia_calliptera
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	59.867	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.867	Astatotilapia_calliptera
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.044	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.044	Astyanax_mexicanus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	80.846	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	80.846	Astyanax_mexicanus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	80	62.570	ENSCING00000020807	-	94	62.570	Ciona_intestinalis
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	98	56.916	ENSCSAVG00000009987	-	98	56.916	Ciona_savignyi
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	58.705	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	59.465	Cynoglossus_semilaevis
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	89.062	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	86.557	Cynoglossus_semilaevis
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.179	Cyprinodon_variegatus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.579	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.579	Cyprinodon_variegatus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	61.024	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	75.000	Danio_rerio
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	98	83.864	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.864	Danio_rerio
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	80	56.546	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	96	56.546	Eptatretus_burgeri
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	99	81.166	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.166	Esox_lucius
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Fundulus_heteroclitus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Fundulus_heteroclitus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	89	55.860	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.860	Gadus_morhua
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	59.465	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.465	Gambusia_affinis
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	91.295	Gambusia_affinis
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	58	94.574	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	Gasterosteus_aculeatus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	85	64.136	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	62.189	Gasterosteus_aculeatus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	99.330	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	99.330	Haplochromis_burtoni
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Haplochromis_burtoni
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	99	85.747	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.747	Hippocampus_comes
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	59.688	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.688	Hippocampus_comes
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	96	59.861	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	59.861	Ictalurus_punctatus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	84	59.043	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	59.043	Ictalurus_punctatus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	77.852	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.852	Ictalurus_punctatus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.134	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	60.134	Kryptolebias_marmoratus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Kryptolebias_marmoratus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Labrus_bergylta
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	99	70.429	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.429	Latimeria_chalumnae
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	99	62.387	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.613	Latimeria_chalumnae
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	62.500	ENSLACG00000004899	-	99	62.500	Latimeria_chalumnae
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Lepisosteus_oculatus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Mastacembelus_armatus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	96	61.111	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Mastacembelus_armatus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	99.107	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	99.107	Maylandia_zebra
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	59.645	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.645	Maylandia_zebra
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	58.000	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.000	Mola_mola
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	61.024	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	61.024	Monopterus_albus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	98	91.076	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	91.076	Monopterus_albus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	98.214	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	98.214	Oreochromis_niloticus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	59.424	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Oreochromis_niloticus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.802	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	60.802	Oryzias_latipes
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	86.161	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	86.161	Oryzias_latipes
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	89.286	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	89.286	Oryzias_latipes_hni
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.579	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	60.579	Oryzias_latipes_hni
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	61.024	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	61.024	Oryzias_latipes_hsok
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	89.732	Oryzias_latipes_hsok
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Oryzias_melastigma
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	61.024	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	61.024	Oryzias_melastigma
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.134	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.134	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	77.506	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.506	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	58.705	ENSPKIG00000023918	-	98	58.705	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	86.384	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	86.384	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.310	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	60.310	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	90.466	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	90.466	Poecilia_formosa
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	61.024	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	99	61.024	Poecilia_formosa
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Poecilia_latipinna
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	61.024	ENSPLAG00000019794	si:ch211-11k18.4	99	61.024	Poecilia_latipinna
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	61.024	ENSPMEG00000024198	si:ch211-11k18.4	99	61.806	Poecilia_mexicana
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	91.295	Poecilia_mexicana
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	98	88.584	ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	88.584	Poecilia_reticulata
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	98	58.810	ENSPREG00000015319	si:ch211-11k18.4	98	58.810	Poecilia_reticulata
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	99.330	ENSPNYG00000017266	si:dkey-98f17.5	100	99.330	Pundamilia_nyererei
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSPNYG00000017099	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Pundamilia_nyererei
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ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	60.044	ENSPNAG00000022138	si:ch211-11k18.4	99	60.044	Pygocentrus_nattereri
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	59.560	ENSSFOG00015000985	si:ch211-11k18.4	94	59.560	Scleropages_formosus
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ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	59.465	ENSSMAG00000009651	si:ch211-11k18.4	99	59.465	Scophthalmus_maximus
ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Scophthalmus_maximus
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