EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNBRG00000008679 (Gene tree)
Gene ID: 102780300
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: CBP80/20-dependent translation initiation factor-like
Gene Type: protein_coding
Species: Neolamprologus_brichardi
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 63812 bases
Position: chrJH422287.1:8779260-8843071
Accession: 102780300
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNBRP00000011130	MIF4G	PF02854.19	8.2e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNBRT00000011442	-	5257	XM_006789040	ENSNBRP00000011130	669 (aa)	XP_006789103	UPI0003EC2A3E

Gene Model

Click here to download ENSNBRG00000008679's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSNBRG00000008679's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.996	ENSG00000134030	CTIF	99	56.573	Homo_sapiens
ENSNBRG00000008679	ctif	100	71.917	ENSAPOG00000020192	ctif	100	84.570	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNBRG00000008679	ctif	88	54.063	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	53.322	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNBRG00000008679	ctif	100	85.429	ENSACIG00000017099	ctif	100	85.429	Amphilophus_citrinellus
ENSNBRG00000008679	ctif	100	77.068	ENSAOCG00000014275	ctif	100	78.052	Amphiprion_ocellaris
ENSNBRG00000008679	ctif	100	87.761	ENSAPEG00000016975	ctif	100	88.525	Amphiprion_percula
ENSNBRG00000008679	ctif	100	84.911	ENSATEG00000016752	ctif	100	85.355	Anabas_testudineus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	60.624	ENSACAG00000018006	CTIF	99	59.881	Anolis_carolinensis
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.287	ENSANAG00000024925	CTIF	99	55.865	Aotus_nancymaae
ENSNBRG00000008679	ctif	100	98.954	ENSACLG00000005956	ctif	100	98.954	Astatotilapia_calliptera
ENSNBRG00000008679	ctif	91	87.500	ENSBTAG00000018901	CTIF	98	87.500	Bos_taurus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.535	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	56.259	Callithrix_jacchus
ENSNBRG00000008679	ctif	97	55.940	ENSCAFG00000019076	CTIF	99	55.735	Canis_familiaris
ENSNBRG00000008679	ctif	97	56.090	ENSCAFG00020026482	CTIF	99	55.882	Canis_lupus_dingo
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.718	ENSCHIG00000014455	CTIF	99	54.919	Capra_hircus
ENSNBRG00000008679	ctif	81	59.640	ENSTSYG00000030461	CTIF	96	58.633	Carlito_syrichta
ENSNBRG00000008679	ctif	99	51.458	ENSCAPG00000011865	CTIF	99	51.092	Cavia_aperea
ENSNBRG00000008679	ctif	99	54.414	ENSCPOG00000001049	CTIF	99	54.191	Cavia_porcellus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.977	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	55.556	Cebus_capucinus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.476	ENSCATG00000038134	CTIF	98	65.000	Cercocebus_atys
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.681	ENSCLAG00000008174	CTIF	99	56.029	Chinchilla_lanigera
ENSNBRG00000008679	ctif	99	54.085	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	53.672	Chlorocebus_sabaeus
ENSNBRG00000008679	ctif	89	89.583	ENSCPBG00000025654	CTIF	98	89.583	Chrysemys_picta_bellii
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.252	ENSCANG00000030916	CTIF	99	57.989	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.725	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	56.158	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNBRG00000008679	ctif	99	53.116	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	52.415	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNBRG00000008679	ctif	100	72.867	ENSCSEG00000019857	ctif	100	80.263	Cynoglossus_semilaevis
ENSNBRG00000008679	ctif	100	80.415	ENSCVAG00000017158	ctif	100	80.861	Cyprinodon_variegatus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	67.047	ENSDARG00000090617	ctif	50	70.604	Danio_rerio
ENSNBRG00000008679	ctif	68	59.236	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	58.635	Dasypus_novemcinctus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.556	ENSDORG00000003221	Ctif	99	55.409	Dipodomys_ordii
ENSNBRG00000008679	ctif	78	87.500	ENSEASG00005016094	CTIF	81	87.500	Equus_asinus_asinus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.094	ENSECAG00000020473	CTIF	100	55.588	Equus_caballus
ENSNBRG00000008679	ctif	77	60.190	ENSEEUG00000012451	CTIF	91	59.160	Erinaceus_europaeus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	64.564	ENSELUG00000008733	ctif	100	63.844	Esox_lucius
ENSNBRG00000008679	ctif	89	87.500	ENSFCAG00000000664	CTIF	98	87.500	Felis_catus
ENSNBRG00000008679	ctif	97	55.521	ENSFALG00000008943	CTIF	88	63.989	Ficedula_albicollis
ENSNBRG00000008679	ctif	99	54.913	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	54.467	Fukomys_damarensis
ENSNBRG00000008679	ctif	100	75.530	ENSFHEG00000004334	ctif	100	84.746	Fundulus_heteroclitus
ENSNBRG00000008679	ctif	89	89.583	ENSGALG00000035912	-	71	89.583	Gallus_gallus
ENSNBRG00000008679	ctif	100	80.207	ENSGAFG00000011896	ctif	100	84.746	Gambusia_affinis
ENSNBRG00000008679	ctif	64	55.324	ENSGAGG00000020663	CTIF	86	60.606	Gopherus_agassizii
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.828	ENSGGOG00000015204	CTIF	99	56.554	Gorilla_gorilla
ENSNBRG00000008679	ctif	100	99.103	ENSHBUG00000018092	ctif	100	99.103	Haplochromis_burtoni
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.653	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	55.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.947	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	55.294	Heterocephalus_glaber_male
ENSNBRG00000008679	ctif	99	61.699	ENSHCOG00000011784	ctif	99	63.447	Hippocampus_comes
ENSNBRG00000008679	ctif	99	67.105	ENSIPUG00000014050	ctif	96	61.404	Ictalurus_punctatus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.831	ENSSTOG00000001967	CTIF	99	55.117	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	54.810	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	54.240	Jaculus_jaculus
ENSNBRG00000008679	ctif	100	82.265	ENSKMAG00000014651	ctif	100	82.370	Kryptolebias_marmoratus
ENSNBRG00000008679	ctif	92	79.167	ENSLBEG00000018277	ctif	99	80.220	Labrus_bergylta
ENSNBRG00000008679	ctif	99	67.695	ENSLOCG00000011697	ctif	99	67.452	Lepisosteus_oculatus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	49.721	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	77.273	Loxodonta_africana
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.476	ENSMFAG00000037903	CTIF	98	65.000	Macaca_fascicularis
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.476	ENSMMUG00000020898	CTIF	98	65.000	Macaca_mulatta
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.476	ENSMNEG00000039395	CTIF	98	65.000	Macaca_nemestrina
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.316	ENSMLEG00000041132	CTIF	98	65.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSNBRG00000008679	ctif	100	86.519	ENSMAMG00000014741	ctif	100	86.519	Mastacembelus_armatus
ENSNBRG00000008679	ctif	89	98.492	ENSMZEG00005019767	ctif	90	98.492	Maylandia_zebra
ENSNBRG00000008679	ctif	89	40.291	ENSMGAG00000001378	CTIF	55	89.583	Meleagris_gallopavo
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.268	ENSMAUG00000000656	Ctif	99	56.490	Mesocricetus_auratus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.241	ENSMICG00000010167	CTIF	99	54.257	Microcebus_murinus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.604	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	56.223	Microtus_ochrogaster
ENSNBRG00000008679	ctif	100	80.753	ENSMMOG00000000831	ctif	100	78.841	Mola_mola
ENSNBRG00000008679	ctif	99	52.749	ENSMODG00000003464	CTIF	99	52.232	Monodelphis_domestica
ENSNBRG00000008679	ctif	80	66.296	ENSMALG00000020553	ctif	99	87.179	Monopterus_albus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.177	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	54.520	Mus_caroli
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.119	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	55.398	Mus_musculus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	57.038	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	56.637	Mus_pahari
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.761	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	88	87.500	Mus_spretus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.783	ENSMPUG00000000844	CTIF	99	55.507	Mustela_putorius_furo
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.047	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	55.687	Myotis_lucifugus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.706	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	56.140	Nannospalax_galili
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.681	ENSNLEG00000011503	CTIF	99	56.259	Nomascus_leucogenys
ENSNBRG00000008679	ctif	99	49.031	ENSMEUG00000000218	CTIF	94	87.500	Notamacropus_eugenii
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.294	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	54.639	Ochotona_princeps
ENSNBRG00000008679	ctif	99	54.936	ENSODEG00000018390	CTIF	99	54.519	Octodon_degus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	87.856	ENSONIG00000007750	ctif	100	87.856	Oreochromis_niloticus
ENSNBRG00000008679	ctif	80	49.916	ENSOANG00000001337	CTIF	99	49.155	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.441	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	54.934	Oryctolagus_cuniculus
ENSNBRG00000008679	ctif	100	79.118	ENSORLG00000005786	ctif	100	78.235	Oryzias_latipes
ENSNBRG00000008679	ctif	100	79.290	ENSORLG00020005385	ctif	100	78.487	Oryzias_latipes_hni
ENSNBRG00000008679	ctif	100	80.030	ENSORLG00015011872	ctif	100	79.586	Oryzias_latipes_hsok
ENSNBRG00000008679	ctif	100	79.381	ENSOMEG00000007917	ctif	100	79.234	Oryzias_melastigma
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.718	ENSOGAG00000013927	CTIF	99	55.294	Otolemur_garnettii
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.947	ENSOARG00000003754	CTIF	99	55.147	Ovis_aries
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.828	ENSPPAG00000023554	CTIF	98	65.000	Pan_paniscus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.305	ENSPPRG00000002265	CTIF	99	55.882	Panthera_pardus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.305	ENSPTIG00000013761	CTIF	99	55.882	Panthera_tigris_altaica
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.828	ENSPTRG00000010009	CTIF	98	65.000	Pan_troglodytes
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.316	ENSPANG00000017087	CTIF	98	65.000	Papio_anubis
ENSNBRG00000008679	ctif	80	58.427	ENSPKIG00000011234	ctif	91	66.205	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNBRG00000008679	ctif	89	87.500	ENSPSIG00000006508	CTIF	98	87.500	Pelodiscus_sinensis
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.977	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	56.140	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNBRG00000008679	ctif	72	56.996	ENSPCIG00000026247	CTIF	82	70.073	Phascolarctos_cinereus
ENSNBRG00000008679	ctif	100	76.412	ENSPFOG00000009243	ctif	100	73.958	Poecilia_formosa
ENSNBRG00000008679	ctif	100	80.323	ENSPLAG00000019171	ctif	100	80.029	Poecilia_latipinna
ENSNBRG00000008679	ctif	100	80.323	ENSPMEG00000020089	ctif	100	79.883	Poecilia_mexicana
ENSNBRG00000008679	ctif	100	75.319	ENSPREG00000017326	ctif	100	75.887	Poecilia_reticulata
ENSNBRG00000008679	ctif	80	60.734	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	60.221	Pongo_abelii
ENSNBRG00000008679	ctif	99	54.480	ENSPCOG00000013391	CTIF	99	54.058	Propithecus_coquereli
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.642	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	55.848	Pteropus_vampyrus
ENSNBRG00000008679	ctif	100	99.103	ENSPNYG00000007879	ctif	100	99.103	Pundamilia_nyererei
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.891	ENSRNOG00000018342	Ctif	99	56.324	Rattus_norvegicus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.316	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	54.755	Rhinopithecus_bieti
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.172	ENSRROG00000006039	CTIF	99	54.611	Rhinopithecus_roxellana
ENSNBRG00000008679	ctif	89	86.000	ENSSBOG00000028468	CTIF	99	86.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNBRG00000008679	ctif	99	52.500	ENSSHAG00000016321	CTIF	99	51.988	Sarcophilus_harrisii
ENSNBRG00000008679	ctif	99	66.815	ENSSFOG00015022594	ctif	100	65.879	Scleropages_formosus
ENSNBRG00000008679	ctif	100	84.024	ENSSMAG00000005707	ctif	100	86.243	Scophthalmus_maximus
ENSNBRG00000008679	ctif	100	80.857	ENSSDUG00000016033	ctif	100	83.429	Seriola_dumerili
ENSNBRG00000008679	ctif	100	83.580	ENSSLDG00000007282	ctif	100	86.243	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNBRG00000008679	ctif	99	56.677	ENSSPUG00000014734	CTIF	96	68.571	Sphenodon_punctatus
ENSNBRG00000008679	ctif	100	76.453	ENSSPAG00000003721	ctif	100	75.559	Stegastes_partitus
ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.900	ENSSSCG00000004506	CTIF	99	55.473	Sus_scrofa
ENSNBRG00000008679	ctif	99	54.676	ENSTGUG00000000030	CTIF	91	59.845	Taeniopygia_guttata
ENSNBRG00000008679	ctif	51	73.699	ENSTRUG00000002320	ctif	99	73.699	Takifugu_rubripes
ENSNBRG00000008679	ctif	99	66.617	ENSTNIG00000018763	ctif	100	65.868	Tetraodon_nigroviridis
ENSNBRG00000008679	ctif	84	66.250	ENSTBEG00000002613	CTIF	73	66.250	Tupaia_belangeri
ENSNBRG00000008679	ctif	99	53.392	ENSTTRG00000004347	CTIF	99	52.585	Tursiops_truncatus
ENSNBRG00000008679	ctif	87	51.597	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	51.096	Ursus_americanus
ENSNBRG00000008679	ctif	89	87.500	ENSUMAG00000002735	CTIF	98	87.500	Ursus_maritimus
ENSNBRG00000008679	ctif	86	90.625	ENSVVUG00000014347	CTIF	98	85.417	Vulpes_vulpes
ENSNBRG00000008679	ctif	97	47.465	ENSXETG00000026836	ctif	70	71.825	Xenopus_tropicalis
ENSNBRG00000008679	ctif	61	75.366	ENSXCOG00000002477	ctif	94	74.413	Xiphophorus_couchianus
ENSNBRG00000008679	ctif	100	79.407	ENSXMAG00000004236	ctif	100	80.917	Xiphophorus_maculatus