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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSNBRG00000009998 (Gene tree)
Gene ID: 102786781
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin-1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Neolamprologus_brichardi
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15692 bases
Position: chrJH422319.1:3117272-3132963
Accession: 102786781
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNBRP00000012888	IBN_N	PF03810.19	1.1e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNBRT00000013249	-	2322	XM_006796851	ENSNBRP00000012888	773 (aa)	XP_006796914	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	86.010	ENSNBRG00000023849	TNPO2	87	86.010
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	80.052	ENSNBRG00000006242	TNPO2	86	80.052

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSG00000083312	TNPO1	87	92.765	Homo_sapiens
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	98.450	ENSAPOG00000003453	tnpo1	87	98.450	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	90.921	ENSAMEG00000007147	TNPO1	86	91.816	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNBRG00000009998	tnpo1	100	99.226	ENSACIG00000003711	tnpo1	100	99.226	Amphilophus_citrinellus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	98.450	ENSAOCG00000008154	tnpo1	87	98.450	Amphiprion_ocellaris
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	98.450	ENSAPEG00000001112	tnpo1	87	98.450	Amphiprion_percula
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	97.545	ENSATEG00000010408	tnpo1	87	97.545	Anabas_testudineus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	98	88.802	ENSAPLG00000009619	-	84	89.641	Anas_platyrhynchos
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.282	ENSACAG00000009599	TNPO1	87	93.282	Anolis_carolinensis
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	82.687	ENSANAG00000025351	-	86	82.687	Aotus_nancymaae
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	60.814	ENSANAG00000027118	-	86	60.687	Aotus_nancymaae
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.248	ENSANAG00000022453	-	86	92.248	Aotus_nancymaae
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	97.925	ENSACLG00000027223	tnpo1	87	97.925	Astatotilapia_calliptera
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.686	ENSAMXG00000009842	tnpo1	87	93.428	Astyanax_mexicanus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.894	ENSBTAG00000007979	TNPO1	86	92.894	Bos_taurus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.377	ENSCJAG00000016409	TNPO1	86	92.377	Callithrix_jacchus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	92.713	ENSCAFG00000008081	TNPO1	86	92.713	Canis_familiaris
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	90.272	ENSCAFG00020017397	TNPO1	87	90.052	Canis_lupus_dingo
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSCHIG00000023462	TNPO1	86	92.765	Capra_hircus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	88.817	ENSTSYG00000001871	TNPO1	84	91.475	Carlito_syrichta
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.248	ENSCCAG00000026472	TNPO1	87	92.248	Cebus_capucinus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSCATG00000043792	TNPO1	95	92.838	Cercocebus_atys
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.248	ENSCLAG00000016191	TNPO1	87	92.248	Chinchilla_lanigera
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSCSAG00000015616	TNPO1	86	92.765	Chlorocebus_sabaeus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	83.528	ENSCHOG00000001746	TNPO1	91	83.528	Choloepus_hoffmanni
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.411	ENSCPBG00000000260	TNPO1	82	93.411	Chrysemys_picta_bellii
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	75.871	ENSCSAVG00000010981	-	99	72.124	Ciona_savignyi
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSCANG00000004353	TNPO1	86	92.765	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.894	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	86	92.894	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	93.099	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	86	93.099	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	95.866	ENSCSEG00000012674	tnpo1	87	95.866	Cynoglossus_semilaevis
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.899	ENSCVAG00000001010	tnpo1	87	96.899	Cyprinodon_variegatus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	94.065	ENSDARG00000035390	tnpo1	87	93.935	Danio_rerio
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	86.822	ENSDNOG00000006647	TNPO1	86	86.822	Dasypus_novemcinctus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	92	92.997	ENSDORG00000006476	Tnpo1	86	92.987	Dipodomys_ordii
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	58.518	FBgn0035693	CG8219	86	57.997	Drosophila_melanogaster
ENSNBRG00000009998	tnpo1	88	93.548	ENSETEG00000017805	TNPO1	80	93.548	Echinops_telfairi
ENSNBRG00000009998	tnpo1	93	84.254	ENSEBUG00000001895	tnpo1	86	83.978	Eptatretus_burgeri
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSEASG00005018055	TNPO1	87	92.765	Equus_asinus_asinus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSECAG00000024424	TNPO1	86	92.765	Equus_caballus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	87.157	ENSELUG00000002821	tnpo1	87	86.849	Esox_lucius
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSFCAG00000013181	TNPO1	87	92.765	Felis_catus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.540	ENSFALG00000010292	TNPO1	87	93.540	Ficedula_albicollis
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.377	ENSFDAG00000013345	TNPO1	86	92.377	Fukomys_damarensis
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.645	ENSFHEG00000019234	tnpo1	87	96.645	Fundulus_heteroclitus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.921	ENSGMOG00000000347	tnpo1	87	92.921	Gadus_morhua
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSGALG00000015014	TNPO1	89	92.765	Gallus_gallus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.263	ENSGAFG00000000943	tnpo1	87	96.263	Gambusia_affinis
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.124	ENSGACG00000015841	tnpo1	86	96.124	Gasterosteus_aculeatus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.282	ENSGAGG00000013419	TNPO1	87	93.282	Gopherus_agassizii
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	78.968	ENSGGOG00000022535	-	86	78.968	Gorilla_gorilla
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSGGOG00000026800	TNPO1	87	92.765	Gorilla_gorilla
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	99.225	ENSHBUG00000008068	tnpo1	87	99.225	Haplochromis_burtoni
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.248	ENSHGLG00000000970	-	86	92.248	Heterocephalus_glaber_female
ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	92.297	ENSHGLG00100017090	-	86	92.297	Heterocephalus_glaber_male
ENSNBRG00000009998	tnpo1	96	71.063	ENSHGLG00100000963	-	84	70.296	Heterocephalus_glaber_male
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.894	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	84	92.894	Jaculus_jaculus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.124	ENSKMAG00000018195	tnpo1	87	96.124	Kryptolebias_marmoratus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	100	97.297	ENSLBEG00000009521	tnpo1	93	97.297	Labrus_bergylta
ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	90.579	ENSLACG00000012199	TNPO1	86	90.579	Latimeria_chalumnae
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	94.315	ENSLOCG00000011092	tnpo1	84	94.315	Lepisosteus_oculatus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	97	92.133	ENSLAFG00000011796	TNPO1	87	92.133	Loxodonta_africana
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSMFAG00000003636	TNPO1	86	92.765	Macaca_fascicularis
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.727	ENSMMUG00000020923	TNPO1	87	92.727	Macaca_mulatta
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSMNEG00000044581	TNPO1	86	92.765	Macaca_nemestrina
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSMLEG00000030740	TNPO1	86	92.765	Mandrillus_leucophaeus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	98.062	ENSMAMG00000001357	tnpo1	87	98.062	Mastacembelus_armatus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	99.481	ENSMZEG00005004913	tnpo1	87	99.481	Maylandia_zebra
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.894	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	88.630	ENSMICG00000008468	TNPO1	86	88.630	Microcebus_murinus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.894	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	86	92.894	Microtus_ochrogaster
ENSNBRG00000009998	tnpo1	100	96.915	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.915	Mola_mola
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	95.115	ENSMODG00000001721	TNPO1	69	95.115	Monodelphis_domestica
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.770	ENSMALG00000009782	tnpo1	87	96.770	Monopterus_albus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.894	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.820	Mus_caroli
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.894	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.820	Mus_musculus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.023	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	Mus_pahari
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.636	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.820	Mus_spretus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSMPUG00000014387	TNPO1	86	92.765	Mustela_putorius_furo
ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	92.328	ENSMLUG00000016317	TNPO1	86	92.328	Myotis_lucifugus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.023	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	87	93.023	Nannospalax_galili
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSNLEG00000004572	TNPO1	87	92.765	Nomascus_leucogenys
ENSNBRG00000009998	tnpo1	88	86.901	ENSOPRG00000012390	TNPO1	76	86.901	Ochotona_princeps
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	91.990	ENSODEG00000001771	TNPO1	86	91.990	Octodon_degus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	98.586	ENSONIG00000011151	tnpo1	86	98.586	Oreochromis_niloticus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	93.640	ENSOANG00000015785	TNPO1	90	93.640	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	85.676	ENSOCUG00000013318	TNPO1	86	85.405	Oryctolagus_cuniculus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	97.792	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.792	Oryzias_latipes
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	97.656	ENSORLG00020011559	tnpo1	87	97.656	Oryzias_latipes_hni
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	97.276	ENSORLG00015019113	tnpo1	87	97.276	Oryzias_latipes_hsok
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.628	ENSOMEG00000014567	tnpo1	87	96.628	Oryzias_melastigma
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSOGAG00000000808	TNPO1	86	92.765	Otolemur_garnettii
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.894	ENSOARG00000005038	TNPO1	73	92.894	Ovis_aries
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSPPAG00000042518	TNPO1	86	92.765	Pan_paniscus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSPPRG00000022336	TNPO1	87	92.765	Panthera_pardus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSPTIG00000018839	TNPO1	87	92.765	Panthera_tigris_altaica
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSPTRG00000016972	TNPO1	86	92.765	Pan_troglodytes
ENSNBRG00000009998	tnpo1	93	81.768	ENSPTRG00000047731	-	90	81.768	Pan_troglodytes
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	ENSPANG00000006074	TNPO1	86	92.765	Papio_anubis
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	89.793	ENSPKIG00000019795	tnpo1	87	89.793	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.669	ENSPSIG00000014366	TNPO1	86	93.669	Pelodiscus_sinensis
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.548	ENSPMGG00000017014	tnpo1	87	93.161	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	93.099	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	86	93.099	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	94.057	ENSPCIG00000026080	TNPO1	89	94.057	Phascolarctos_cinereus
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.268	ENSPFOG00000011447	tnpo1	87	96.268	Poecilia_formosa
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.268	ENSPLAG00000018696	tnpo1	87	96.268	Poecilia_latipinna
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.770	ENSPMEG00000024121	tnpo1	87	96.770	Poecilia_mexicana
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.649	ENSPREG00000020705	tnpo1	87	96.649	Poecilia_reticulata
ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.636	ENSPPYG00000015545	TNPO1	86	92.636	Pongo_abelii
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ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.636	ENSPVAG00000013051	TNPO1	86	92.636	Pteropus_vampyrus
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ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.774	ENSXMAG00000005440	tnpo1	87	96.774	Xiphophorus_maculatus