EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNBRG00000010720 (Gene tree)
Gene ID: 102793427
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: pre-mRNA-splicing factor syf2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Neolamprologus_brichardi
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15662 bases
Position: chrJH422464.1:780565-796226
Accession: 102793427
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNBRP00000014000	SYF2	PF08231.12	4.3e-40	1	2
ENSNBRP00000014000	SYF2	PF08231.12	4.3e-40	2	2
ENSNBRP00000013976	SYF2	PF08231.12	7.8e-40	1	2
ENSNBRP00000013976	SYF2	PF08231.12	7.8e-40	2	2
ENSNBRP00000014008	SYF2	PF08231.12	1.6e-38	1	2
ENSNBRP00000014008	SYF2	PF08231.12	1.6e-38	2	2
ENSNBRP00000013949	SYF2	PF08231.12	3e-38	1	2
ENSNBRP00000013949	SYF2	PF08231.12	3e-38	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNBRT00000014382	-	690	-	ENSNBRP00000014000	229 (aa)	-	-
ENSNBRT00000014390	-	657	-	ENSNBRP00000014008	218 (aa)	-	-
ENSNBRT00000014330	-	660	-	ENSNBRP00000013949	219 (aa)	-	-
ENSNBRT00000014359	-	708	XM_006807495	ENSNBRP00000013976	235 (aa)	XP_006807558	-

Gene Model

Click here to download ENSNBRG00000010720's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSNBRG00000010720's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNBRG00000010720	syf2	100	69.583	ENSG00000117614	SYF2	97	72.083	Homo_sapiens
ENSNBRG00000010720	syf2	99	82.231	ENSAPOG00000001174	syf2	100	82.231	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNBRG00000010720	syf2	93	73.543	ENSAMEG00000010115	-	91	73.543	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNBRG00000010720	syf2	83	72.821	ENSAMEG00000010134	-	100	73.846	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNBRG00000010720	syf2	98	82.008	ENSACIG00000023688	syf2	94	82.008	Amphilophus_citrinellus
ENSNBRG00000010720	syf2	92	80.000	ENSAOCG00000010912	syf2	69	80.000	Amphiprion_ocellaris
ENSNBRG00000010720	syf2	100	81.070	ENSAOCG00000022046	syf2	99	81.172	Amphiprion_ocellaris
ENSNBRG00000010720	syf2	100	81.070	ENSAPEG00000018858	syf2	92	81.070	Amphiprion_percula
ENSNBRG00000010720	syf2	99	82.231	ENSATEG00000007745	syf2	100	82.231	Anabas_testudineus
ENSNBRG00000010720	syf2	85	75.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	75.000	Anas_platyrhynchos
ENSNBRG00000010720	syf2	87	71.635	ENSACAG00000013653	-	100	71.635	Anolis_carolinensis
ENSNBRG00000010720	syf2	71	58.333	ENSACAG00000026777	-	100	59.880	Anolis_carolinensis
ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.000	ENSANAG00000032473	SYF2	97	72.083	Aotus_nancymaae
ENSNBRG00000010720	syf2	99	87.190	ENSACLG00000019916	syf2	100	87.190	Astatotilapia_calliptera
ENSNBRG00000010720	syf2	99	74.793	ENSAMXG00000004051	syf2	100	74.793	Astyanax_mexicanus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	70.954	ENSBTAG00000001651	SYF2	97	73.362	Bos_taurus
ENSNBRG00000010720	syf2	89	47.393	WBGene00019402	syf-2	90	46.919	Caenorhabditis_elegans
ENSNBRG00000010720	syf2	91	74.178	ENSCJAG00000046570	SYF2	97	72.500	Callithrix_jacchus
ENSNBRG00000010720	syf2	90	70.000	ENSCAFG00000030331	-	92	70.335	Canis_familiaris
ENSNBRG00000010720	syf2	91	72.770	ENSCAFG00000012895	-	95	70.464	Canis_familiaris
ENSNBRG00000010720	syf2	77	62.842	ENSCAFG00020021094	-	95	64.286	Canis_lupus_dingo
ENSNBRG00000010720	syf2	91	72.770	ENSCAFG00020021091	-	95	70.464	Canis_lupus_dingo
ENSNBRG00000010720	syf2	99	71.130	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	71.008	Capra_hircus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	70.492	ENSTSYG00000005114	SYF2	99	70.492	Carlito_syrichta
ENSNBRG00000010720	syf2	85	72.864	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	74.242	Cavia_aperea
ENSNBRG00000010720	syf2	99	72.034	ENSCPOG00000005326	SYF2	95	72.034	Cavia_porcellus
ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.000	ENSCCAG00000022459	SYF2	97	72.500	Cebus_capucinus
ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.833	ENSCATG00000026917	SYF2	97	70.833	Cercocebus_atys
ENSNBRG00000010720	syf2	99	72.034	ENSCLAG00000008474	SYF2	95	72.034	Chinchilla_lanigera
ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.293	ENSCSAG00000000948	SYF2	97	70.293	Chlorocebus_sabaeus
ENSNBRG00000010720	syf2	71	51.955	ENSCHOG00000005273	-	96	53.448	Choloepus_hoffmanni
ENSNBRG00000010720	syf2	93	72.000	ENSCPBG00000025073	SYF2	96	69.874	Chrysemys_picta_bellii
ENSNBRG00000010720	syf2	97	49.561	ENSCING00000003017	-	97	47.414	Ciona_intestinalis
ENSNBRG00000010720	syf2	93	45.205	ENSCSAVG00000006627	-	100	45.205	Ciona_savignyi
ENSNBRG00000010720	syf2	100	67.727	ENSCANG00000037322	SYF2	96	67.727	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNBRG00000010720	syf2	96	72.414	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	68.548	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNBRG00000010720	syf2	83	73.980	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	74.242	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNBRG00000010720	syf2	90	79.717	ENSCSEG00000000117	syf2	100	74.486	Cynoglossus_semilaevis
ENSNBRG00000010720	syf2	99	81.070	ENSCVAG00000019543	syf2	100	81.070	Cyprinodon_variegatus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	76.446	ENSDARG00000004706	syf2	100	76.446	Danio_rerio
ENSNBRG00000010720	syf2	94	73.362	ENSDNOG00000047605	SYF2	93	73.362	Dasypus_novemcinctus
ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.782	ENSDORG00000001274	Syf2	95	73.593	Dipodomys_ordii
ENSNBRG00000010720	syf2	94	50.427	FBgn0033556	CG12343	99	50.427	Drosophila_melanogaster
ENSNBRG00000010720	syf2	84	60.606	ENSETEG00000015729	SYF2	100	55.652	Echinops_telfairi
ENSNBRG00000010720	syf2	83	62.366	ENSEBUG00000015402	syf2	95	62.431	Eptatretus_burgeri
ENSNBRG00000010720	syf2	98	71.967	ENSEASG00005004224	-	98	71.967	Equus_asinus_asinus
ENSNBRG00000010720	syf2	100	61.411	ENSEASG00005004232	-	100	61.411	Equus_asinus_asinus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	70.954	ENSECAG00000012023	-	98	70.954	Equus_caballus
ENSNBRG00000010720	syf2	97	72.034	ENSECAG00000010440	-	99	72.034	Equus_caballus
ENSNBRG00000010720	syf2	73	64.444	ENSEEUG00000015084	SYF2	98	64.444	Erinaceus_europaeus
ENSNBRG00000010720	syf2	100	76.132	ENSELUG00000003465	syf2	100	76.132	Esox_lucius
ENSNBRG00000010720	syf2	91	75.342	ENSFCAG00000010324	-	76	75.342	Felis_catus
ENSNBRG00000010720	syf2	100	69.106	ENSFCAG00000043095	-	98	69.421	Felis_catus
ENSNBRG00000010720	syf2	87	73.039	ENSFALG00000000460	SYF2	99	65.844	Ficedula_albicollis
ENSNBRG00000010720	syf2	99	71.610	ENSFDAG00000008310	SYF2	95	71.610	Fukomys_damarensis
ENSNBRG00000010720	syf2	94	68.304	ENSFHEG00000007238	syf2	100	68.304	Fundulus_heteroclitus
ENSNBRG00000010720	syf2	95	76.126	ENSGMOG00000019138	syf2	99	76.126	Gadus_morhua
ENSNBRG00000010720	syf2	95	71.983	ENSGALG00000013639	SYF2	93	71.130	Gallus_gallus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	79.752	ENSGAFG00000019435	syf2	100	79.752	Gambusia_affinis
ENSNBRG00000010720	syf2	94	79.386	ENSGACG00000007305	syf2	100	78.601	Gasterosteus_aculeatus
ENSNBRG00000010720	syf2	93	72.444	ENSGAGG00000010670	SYF2	96	70.293	Gopherus_agassizii
ENSNBRG00000010720	syf2	100	69.583	ENSGGOG00000012796	SYF2	97	72.083	Gorilla_gorilla
ENSNBRG00000010720	syf2	99	86.777	ENSHBUG00000020477	syf2	100	86.777	Haplochromis_burtoni
ENSNBRG00000010720	syf2	99	71.186	ENSHGLG00000014393	SYF2	95	71.186	Heterocephalus_glaber_female
ENSNBRG00000010720	syf2	92	66.820	ENSHGLG00000004304	-	99	65.368	Heterocephalus_glaber_female
ENSNBRG00000010720	syf2	99	71.186	ENSHGLG00100014722	SYF2	95	71.186	Heterocephalus_glaber_male
ENSNBRG00000010720	syf2	100	78.601	ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.601	Hippocampus_comes
ENSNBRG00000010720	syf2	99	75.000	ENSIPUG00000019859	syf2	100	74.180	Ictalurus_punctatus
ENSNBRG00000010720	syf2	62	63.946	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	65.753	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNBRG00000010720	syf2	85	73.500	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	74.372	Jaculus_jaculus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	81.818	ENSKMAG00000013856	syf2	100	81.818	Kryptolebias_marmoratus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	81.590	ENSLBEG00000014425	syf2	100	81.590	Labrus_bergylta
ENSNBRG00000010720	syf2	99	67.227	ENSLACG00000012064	SYF2	100	68.067	Latimeria_chalumnae
ENSNBRG00000010720	syf2	99	73.967	ENSLOCG00000002728	syf2	95	73.967	Lepisosteus_oculatus
ENSNBRG00000010720	syf2	94	74.236	ENSLAFG00000023150	-	100	69.512	Loxodonta_africana
ENSNBRG00000010720	syf2	77	48.087	ENSLAFG00000030814	-	100	48.087	Loxodonta_africana
ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.833	ENSMFAG00000041831	SYF2	97	70.833	Macaca_fascicularis
ENSNBRG00000010720	syf2	89	74.537	ENSMMUG00000002968	SYF2	97	70.833	Macaca_mulatta
ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.833	ENSMNEG00000030180	SYF2	97	70.833	Macaca_nemestrina
ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.833	ENSMLEG00000030248	SYF2	97	70.833	Mandrillus_leucophaeus
ENSNBRG00000010720	syf2	100	81.893	ENSMAMG00000010403	syf2	98	81.893	Mastacembelus_armatus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	87.603	ENSMZEG00005006429	syf2	100	87.603	Maylandia_zebra
ENSNBRG00000010720	syf2	84	74.874	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	74.874	Meleagris_gallopavo
ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.661	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	70.661	Mesocricetus_auratus
ENSNBRG00000010720	syf2	84	73.869	ENSMICG00000016191	SYF2	100	73.869	Microcebus_murinus
ENSNBRG00000010720	syf2	96	72.845	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	70.325	Microtus_ochrogaster
ENSNBRG00000010720	syf2	98	77.778	ENSMMOG00000002396	syf2	98	77.778	Mola_mola
ENSNBRG00000010720	syf2	93	70.089	ENSMODG00000013951	-	98	70.089	Monodelphis_domestica
ENSNBRG00000010720	syf2	99	79.592	ENSMALG00000010706	syf2	100	79.592	Monopterus_albus
ENSNBRG00000010720	syf2	100	71.130	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	70.732	Mus_caroli
ENSNBRG00000010720	syf2	100	71.130	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	70.732	Mus_musculus
ENSNBRG00000010720	syf2	100	71.130	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	70.732	Mus_pahari
ENSNBRG00000010720	syf2	100	71.130	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	70.732	Mus_spretus
ENSNBRG00000010720	syf2	100	67.901	ENSMPUG00000015802	-	98	68.313	Mustela_putorius_furo
ENSNBRG00000010720	syf2	99	69.456	ENSMPUG00000015801	-	96	69.874	Mustela_putorius_furo
ENSNBRG00000010720	syf2	96	71.368	ENSMLUG00000001885	SYF2	96	71.368	Myotis_lucifugus
ENSNBRG00000010720	syf2	98	70.763	ENSNGAG00000007912	Syf2	90	74.324	Nannospalax_galili
ENSNBRG00000010720	syf2	100	69.583	ENSNLEG00000035185	SYF2	97	72.083	Nomascus_leucogenys
ENSNBRG00000010720	syf2	99	70.042	ENSOPRG00000012870	SYF2	95	70.464	Ochotona_princeps
ENSNBRG00000010720	syf2	99	64.159	ENSODEG00000014338	-	97	64.159	Octodon_degus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	71.186	ENSODEG00000017664	-	97	71.186	Octodon_degus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	86.364	ENSONIG00000008213	syf2	100	86.364	Oreochromis_niloticus
ENSNBRG00000010720	syf2	86	72.772	ENSOANG00000009552	SYF2	100	72.772	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNBRG00000010720	syf2	91	74.178	ENSOCUG00000013050	SYF2	95	71.730	Oryctolagus_cuniculus
ENSNBRG00000010720	syf2	97	80.591	ENSORLG00000028820	syf2	100	80.591	Oryzias_latipes
ENSNBRG00000010720	syf2	99	79.752	ENSORLG00020018333	syf2	100	79.752	Oryzias_latipes_hni
ENSNBRG00000010720	syf2	99	80.165	ENSORLG00015014665	syf2	100	80.165	Oryzias_latipes_hsok
ENSNBRG00000010720	syf2	99	80.992	ENSOMEG00000013911	syf2	100	80.992	Oryzias_melastigma
ENSNBRG00000010720	syf2	99	72.034	ENSOGAG00000009962	SYF2	95	72.034	Otolemur_garnettii
ENSNBRG00000010720	syf2	83	48.205	ENSOARG00000006269	-	100	48.205	Ovis_aries
ENSNBRG00000010720	syf2	99	69.959	ENSOARG00000006348	-	98	69.959	Ovis_aries
ENSNBRG00000010720	syf2	100	69.583	ENSPPAG00000036579	SYF2	97	72.083	Pan_paniscus
ENSNBRG00000010720	syf2	91	75.342	ENSPPRG00000001638	-	89	75.342	Panthera_pardus
ENSNBRG00000010720	syf2	100	69.106	ENSPPRG00000001651	-	98	69.421	Panthera_pardus
ENSNBRG00000010720	syf2	91	74.178	ENSPTIG00000005711	-	83	72.845	Panthera_tigris_altaica
ENSNBRG00000010720	syf2	100	69.106	ENSPTIG00000007036	-	98	69.421	Panthera_tigris_altaica
ENSNBRG00000010720	syf2	100	69.583	ENSPTRG00000000352	SYF2	97	72.083	Pan_troglodytes
ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.833	ENSPANG00000008139	SYF2	97	70.833	Papio_anubis
ENSNBRG00000010720	syf2	99	74.153	ENSPKIG00000008130	syf2	100	73.663	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNBRG00000010720	syf2	97	70.763	ENSPSIG00000011816	SYF2	92	70.763	Pelodiscus_sinensis
ENSNBRG00000010720	syf2	100	76.151	ENSPMGG00000008755	syf2	91	78.481	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNBRG00000010720	syf2	96	72.414	ENSPEMG00000008283	Syf2	96	72.414	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNBRG00000010720	syf2	93	73.894	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	69.291	Phascolarctos_cinereus
ENSNBRG00000010720	syf2	100	77.406	ENSPFOG00000004116	syf2	99	77.406	Poecilia_formosa
ENSNBRG00000010720	syf2	97	79.747	ENSPLAG00000006691	syf2	100	79.747	Poecilia_latipinna
ENSNBRG00000010720	syf2	99	77.686	ENSPMEG00000011684	syf2	100	77.686	Poecilia_mexicana
ENSNBRG00000010720	syf2	99	79.752	ENSPREG00000003009	syf2	100	79.752	Poecilia_reticulata
ENSNBRG00000010720	syf2	100	71.667	ENSPPYG00000001713	SYF2	97	71.667	Pongo_abelii
ENSNBRG00000010720	syf2	99	48.707	ENSPCOG00000027011	SYF2	93	52.607	Propithecus_coquereli
ENSNBRG00000010720	syf2	100	62.140	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	62.140	Pteropus_vampyrus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	86.777	ENSPNYG00000004979	syf2	100	86.777	Pundamilia_nyererei
ENSNBRG00000010720	syf2	99	75.620	ENSPNAG00000015570	syf2	100	75.620	Pygocentrus_nattereri
ENSNBRG00000010720	syf2	100	71.130	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	70.732	Rattus_norvegicus
ENSNBRG00000010720	syf2	100	68.750	ENSRBIG00000042970	SYF2	97	68.750	Rhinopithecus_bieti
ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.833	ENSRROG00000001347	SYF2	97	70.833	Rhinopithecus_roxellana
ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.000	ENSSBOG00000020184	SYF2	96	71.250	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNBRG00000010720	syf2	93	72.124	ENSSHAG00000015630	-	89	72.444	Sarcophilus_harrisii
ENSNBRG00000010720	syf2	88	72.857	ENSSHAG00000007152	-	100	73.301	Sarcophilus_harrisii
ENSNBRG00000010720	syf2	92	77.376	ENSSFOG00015023647	syf2	93	77.376	Scleropages_formosus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	77.686	ENSSMAG00000009867	syf2	100	77.686	Scophthalmus_maximus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	80.579	ENSSDUG00000013072	syf2	100	80.579	Seriola_dumerili
ENSNBRG00000010720	syf2	99	80.579	ENSSLDG00000012677	syf2	100	80.579	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNBRG00000010720	syf2	99	52.846	ENSSARG00000012889	SYF2	99	52.846	Sorex_araneus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	68.145	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	68.145	Sphenodon_punctatus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	80.165	ENSSPAG00000009626	syf2	100	80.165	Stegastes_partitus
ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.539	ENSSSCG00000037481	SYF2	98	70.539	Sus_scrofa
ENSNBRG00000010720	syf2	62	41.026	ENSTGUG00000001126	SYF2	84	43.529	Taeniopygia_guttata
ENSNBRG00000010720	syf2	99	75.820	ENSTRUG00000001499	syf2	95	74.689	Takifugu_rubripes
ENSNBRG00000010720	syf2	93	79.646	ENSTNIG00000016912	syf2	99	80.180	Tetraodon_nigroviridis
ENSNBRG00000010720	syf2	99	51.004	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	51.004	Tupaia_belangeri
ENSNBRG00000010720	syf2	91	73.239	ENSTTRG00000003550	SYF2	99	69.421	Tursiops_truncatus
ENSNBRG00000010720	syf2	98	71.489	ENSUAMG00000002897	SYF2	98	68.724	Ursus_americanus
ENSNBRG00000010720	syf2	91	72.770	ENSUMAG00000013108	SYF2	98	68.313	Ursus_maritimus
ENSNBRG00000010720	syf2	99	69.512	ENSVPAG00000005705	SYF2	99	69.512	Vicugna_pacos
ENSNBRG00000010720	syf2	88	72.816	ENSVVUG00000027181	-	94	71.245	Vulpes_vulpes
ENSNBRG00000010720	syf2	91	72.770	ENSVVUG00000027175	-	95	70.464	Vulpes_vulpes
ENSNBRG00000010720	syf2	97	70.513	ENSXETG00000022797	syf2	94	70.513	Xenopus_tropicalis
ENSNBRG00000010720	syf2	99	78.512	ENSXMAG00000022698	syf2	100	78.512	Xiphophorus_maculatus