EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNBRG00000011799 (Gene tree)
Gene ID: 102796523
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: protein pelota homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Neolamprologus_brichardi
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9189 bases
Position: chrJH422419.1:285757-294945
Accession: 102796523
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNBRP00000015257	eRF1_2	PF03464.15	1.9e-32	1	1
ENSNBRP00000015246	eRF1_2	PF03464.15	1.9e-32	1	1
ENSNBRP00000015246	eRF1_3	PF03465.15	1.4e-25	1	1
ENSNBRP00000015257	eRF1_3	PF03465.15	1.1e-13	1	1
ENSNBRP00000015246	eRF1_1	PF03463.15	5.2e-52	1	1
ENSNBRP00000015257	eRF1_1	PF03463.15	5.4e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNBRT00000015674	-	1107	-	ENSNBRP00000015257	368 (aa)	-	-
ENSNBRT00000015661	-	3239	XM_006805698	ENSNBRP00000015246	385 (aa)	XP_006805761	UPI0003EC2F1F

Gene Model

Click here to download ENSNBRG00000011799's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSNBRG00000011799's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSG00000152684	PELO	100	80.260	Homo_sapiens
ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.948	ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNBRG00000011799	pelo	67	92.713	ENSAPOG00000023700	-	90	92.713	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNBRG00000011799	pelo	67	92.713	ENSAPOG00000000616	pelo	90	92.713	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	ENSAMEG00000007734	PELO	100	80.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNBRG00000011799	pelo	97	88.740	ENSACIG00000014386	pelo	97	93.787	Amphilophus_citrinellus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	92.208	ENSAOCG00000023717	pelo	100	92.208	Amphiprion_ocellaris
ENSNBRG00000011799	pelo	100	92.208	ENSAPEG00000011235	pelo	100	92.208	Amphiprion_percula
ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.948	ENSATEG00000019550	pelo	100	91.948	Anabas_testudineus
ENSNBRG00000011799	pelo	77	70.470	ENSAPLG00000013265	PELO	100	70.470	Anas_platyrhynchos
ENSNBRG00000011799	pelo	97	79.467	ENSACAG00000004352	PELO	100	78.961	Anolis_carolinensis
ENSNBRG00000011799	pelo	100	79.740	ENSANAG00000014096	PELO	100	79.740	Aotus_nancymaae
ENSNBRG00000011799	pelo	100	99.481	ENSACLG00000010305	pelo	100	99.481	Astatotilapia_calliptera
ENSNBRG00000011799	pelo	97	90.885	ENSAMXG00000020299	pelo	100	90.155	Astyanax_mexicanus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	79.740	ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.740	Bos_taurus
ENSNBRG00000011799	pelo	97	60.800	WBGene00011280	pelo-1	98	60.800	Caenorhabditis_elegans
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.000	Callithrix_jacchus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.260	Canis_lupus_dingo
ENSNBRG00000011799	pelo	100	79.481	ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	Capra_hircus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.519	ENSTSYG00000005203	PELO	100	80.519	Carlito_syrichta
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	Cavia_porcellus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	ENSCCAG00000035600	PELO	100	80.000	Cebus_capucinus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSCATG00000011829	PELO	100	80.260	Cercocebus_atys
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.260	Chinchilla_lanigera
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.260	Chlorocebus_sabaeus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSCHOG00000000523	PELO	100	80.260	Choloepus_hoffmanni
ENSNBRG00000011799	pelo	97	80.000	ENSCPBG00000007544	PELO	100	79.481	Chrysemys_picta_bellii
ENSNBRG00000011799	pelo	97	64.075	ENSCING00000001979	-	100	64.416	Ciona_intestinalis
ENSNBRG00000011799	pelo	100	66.234	ENSCSAVG00000006158	-	100	66.234	Ciona_savignyi
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSCANG00000023382	PELO	100	80.260	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNBRG00000011799	pelo	97	79.893	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNBRG00000011799	pelo	97	80.697	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	80.779	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.649	ENSCSEG00000008807	pelo	100	90.649	Cynoglossus_semilaevis
ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.169	ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.169	Cyprinodon_variegatus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	88.831	ENSDARG00000055477	pelo	100	88.831	Danio_rerio
ENSNBRG00000011799	pelo	100	77.720	ENSDNOG00000036721	PELO	100	77.720	Dasypus_novemcinctus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.779	ENSDORG00000016689	Pelo	100	80.779	Dipodomys_ordii
ENSNBRG00000011799	pelo	96	67.297	FBgn0011207	pelo	97	66.057	Drosophila_melanogaster
ENSNBRG00000011799	pelo	71	78.363	ENSEBUG00000004955	pelo	99	78.363	Eptatretus_burgeri
ENSNBRG00000011799	pelo	100	79.740	ENSEASG00005013348	PELO	100	79.740	Equus_asinus_asinus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.390	ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	Esox_lucius
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	ENSFCAG00000032341	PELO	100	80.000	Felis_catus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	ENSFALG00000004559	PELO	100	80.000	Ficedula_albicollis
ENSNBRG00000011799	pelo	77	80.986	ENSFDAG00000002076	PELO	88	80.986	Fukomys_damarensis
ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.390	ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.390	Fundulus_heteroclitus
ENSNBRG00000011799	pelo	98	88.329	ENSGMOG00000005849	pelo	100	88.052	Gadus_morhua
ENSNBRG00000011799	pelo	100	89.870	ENSGAFG00000019350	pelo	100	89.870	Gambusia_affinis
ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.649	ENSGACG00000007245	pelo	100	90.649	Gasterosteus_aculeatus
ENSNBRG00000011799	pelo	97	80.000	ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.481	Gopherus_agassizii
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSGGOG00000012635	PELO	100	80.260	Gorilla_gorilla
ENSNBRG00000011799	pelo	100	99.481	ENSHBUG00000005866	pelo	100	99.481	Haplochromis_burtoni
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSHGLG00000005932	PELO	100	80.260	Heterocephalus_glaber_female
ENSNBRG00000011799	pelo	100	78.442	ENSHGLG00100017627	PELO	100	78.442	Heterocephalus_glaber_male
ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.909	ENSHCOG00000016782	pelo	100	90.909	Hippocampus_comes
ENSNBRG00000011799	pelo	100	89.091	ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	Ictalurus_punctatus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.779	ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.779	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	78.442	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	78.442	Jaculus_jaculus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.649	ENSKMAG00000021305	pelo	100	90.649	Kryptolebias_marmoratus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.909	ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.909	Labrus_bergylta
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.519	ENSLAFG00000020551	PELO	100	80.519	Loxodonta_africana
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSMFAG00000000651	PELO	100	80.260	Macaca_fascicularis
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSMMUG00000039101	PELO	100	80.260	Macaca_mulatta
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSMNEG00000035538	PELO	100	80.260	Macaca_nemestrina
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSMLEG00000039113	PELO	100	80.260	Mandrillus_leucophaeus
ENSNBRG00000011799	pelo	97	94.102	ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.247	Mastacembelus_armatus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	99.481	ENSMZEG00005014258	pelo	100	99.481	Maylandia_zebra
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.519	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	80.519	Mesocricetus_auratus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSMICG00000044040	PELO	100	80.260	Microcebus_murinus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.519	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	80.519	Microtus_ochrogaster
ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.169	ENSMMOG00000001324	pelo	100	91.169	Mola_mola
ENSNBRG00000011799	pelo	100	92.208	ENSMALG00000008194	pelo	100	92.208	Monopterus_albus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.519	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	80.519	Mus_caroli
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	80.000	Mus_musculus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	80.260	Mus_pahari
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	80.000	Mus_spretus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	79.740	ENSMLUG00000024132	PELO	100	79.740	Myotis_lucifugus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	81.039	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	81.039	Nannospalax_galili
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSNLEG00000035970	PELO	100	80.260	Nomascus_leucogenys
ENSNBRG00000011799	pelo	100	78.961	ENSMEUG00000005468	PELO	100	78.961	Notamacropus_eugenii
ENSNBRG00000011799	pelo	98	79.420	ENSOPRG00000018793	PELO	100	79.420	Ochotona_princeps
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	ENSODEG00000017579	PELO	100	80.000	Octodon_degus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	97.403	ENSONIG00000011511	pelo	100	97.403	Oreochromis_niloticus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.779	ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.779	Oryctolagus_cuniculus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.390	ENSORLG00000005827	pelo	100	90.390	Oryzias_latipes
ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.130	ENSORLG00020016456	pelo	100	90.130	Oryzias_latipes_hni
ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.130	ENSORLG00015014447	pelo	100	90.130	Oryzias_latipes_hsok
ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.429	ENSOMEG00000021567	pelo	100	91.429	Oryzias_melastigma
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.519	ENSOGAG00000027940	PELO	100	80.519	Otolemur_garnettii
ENSNBRG00000011799	pelo	100	79.740	ENSOARG00000008324	PELO	99	79.740	Ovis_aries
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSPPAG00000038951	PELO	100	80.260	Pan_paniscus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	ENSPPRG00000018800	PELO	100	80.000	Panthera_pardus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.000	Panthera_tigris_altaica
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.000	Pan_troglodytes
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSPANG00000010902	PELO	100	80.260	Papio_anubis
ENSNBRG00000011799	pelo	100	88.312	ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.312	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNBRG00000011799	pelo	97	79.733	ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.221	Pelodiscus_sinensis
ENSNBRG00000011799	pelo	69	91.732	ENSPMGG00000014561	pelo	94	91.732	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.779	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	80.779	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNBRG00000011799	pelo	100	79.740	ENSPCIG00000004880	PELO	100	79.740	Phascolarctos_cinereus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.169	ENSPFOG00000007277	pelo	100	91.169	Poecilia_formosa
ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.169	ENSPLAG00000020787	pelo	100	91.169	Poecilia_latipinna
ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.169	ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.169	Poecilia_mexicana
ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.169	ENSPREG00000023071	pelo	100	91.169	Poecilia_reticulata
ENSNBRG00000011799	pelo	97	80.697	ENSPPYG00000015451	PELO	96	80.519	Pongo_abelii
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSPCOG00000021178	PELO	100	80.260	Propithecus_coquereli
ENSNBRG00000011799	pelo	100	99.481	ENSPNYG00000017325	pelo	100	99.481	Pundamilia_nyererei
ENSNBRG00000011799	pelo	97	91.153	ENSPNAG00000012458	pelo	99	89.870	Pygocentrus_nattereri
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.779	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	80.779	Rattus_norvegicus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSRBIG00000007299	PELO	100	80.260	Rhinopithecus_bieti
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSRROG00000035507	PELO	100	80.260	Rhinopithecus_roxellana
ENSNBRG00000011799	pelo	97	32.368	YNL001W	-	97	32.368	Saccharomyces_cerevisiae
ENSNBRG00000011799	pelo	100	79.740	ENSSBOG00000036140	PELO	100	79.740	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNBRG00000011799	pelo	63	76.639	ENSSHAG00000010770	PELO	100	76.639	Sarcophilus_harrisii
ENSNBRG00000011799	pelo	98	89.390	ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.091	Scleropages_formosus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.688	ENSSMAG00000017171	pelo	100	91.688	Scophthalmus_maximus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.688	ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.688	Seriola_dumerili
ENSNBRG00000011799	pelo	100	88.052	ENSSLDG00000017884	pelo	100	88.052	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNBRG00000011799	pelo	97	81.067	ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	Sphenodon_punctatus
ENSNBRG00000011799	pelo	98	92.573	ENSSPAG00000008501	pelo	100	92.208	Stegastes_partitus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	78.701	ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.701	Sus_scrofa
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.519	ENSTGUG00000002416	PELO	100	80.519	Taeniopygia_guttata
ENSNBRG00000011799	pelo	100	89.870	ENSTRUG00000005809	pelo	100	89.870	Takifugu_rubripes
ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.649	ENSTNIG00000018937	pelo	100	90.649	Tetraodon_nigroviridis
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	ENSTTRG00000001857	PELO	100	80.000	Tursiops_truncatus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSUAMG00000002535	PELO	100	80.260	Ursus_americanus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSUMAG00000005809	PELO	100	80.260	Ursus_maritimus
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.000	ENSVPAG00000001113	PELO	100	80.000	Vicugna_pacos
ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	ENSVVUG00000025499	PELO	100	80.260	Vulpes_vulpes
ENSNBRG00000011799	pelo	81	77.097	ENSXETG00000018368	pelo	100	75.767	Xenopus_tropicalis
ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.688	ENSXMAG00000018474	pelo	100	91.688	Xiphophorus_maculatus