EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNBRG00000020081 (Gene tree)
Gene ID: 102798265
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component-like
Gene Type: protein_coding
Species: Neolamprologus_brichardi
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14576 bases
Position: chrJH422328.1:3724118-3738693
Accession: 102798265
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNBRP00000026301	GTP_EFTU	PF00009.27	1e-44	1	1
ENSNBRP00000026301	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	9.9e-13	1	1
ENSNBRP00000026301	EFG_IV	PF03764.18	1.6e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNBRT00000026995	-	3384	XM_006798292	ENSNBRP00000026301	971 (aa)	XP_006798355	UPI0003EC4293

Gene Model

Click here to download ENSNBRG00000020081's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSNBRG00000020081's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNBRG00000020081	eftud2	85	37.806	ENSNBRG00000020205	eef2b	98	37.572
ENSNBRG00000020081	eftud2	86	37.688	ENSNBRG00000011329	-	99	37.688

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	98.970	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	98.970	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	92.078	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	95.469	ENSACIG00000009096	eftud2	100	95.469	Amphilophus_citrinellus
ENSNBRG00000020081	eftud2	88	92.588	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	92.588	Amphiprion_ocellaris
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	98.970	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	98.970	Amphiprion_percula
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	99.176	ENSATEG00000000457	eftud2	100	99.176	Anabas_testudineus
ENSNBRG00000020081	eftud2	99	88.568	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.774	Anas_platyrhynchos
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.255	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.667	Anolis_carolinensis
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.181	Aotus_nancymaae
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	99.897	ENSACLG00000001296	eftud2	100	99.897	Astatotilapia_calliptera
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	94.371	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.371	Astyanax_mexicanus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	92.078	Bos_taurus
ENSNBRG00000020081	eftud2	99	71.001	WBGene00001166	eftu-2	99	70.558	Caenorhabditis_elegans
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.181	Callithrix_jacchus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	92.078	Canis_familiaris
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.078	Canis_lupus_dingo
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.078	Capra_hircus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.181	Carlito_syrichta
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	92.078	Cavia_aperea
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.078	Cavia_porcellus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	92.181	Cebus_capucinus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.181	Cercocebus_atys
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.872	Chinchilla_lanigera
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.181	Chlorocebus_sabaeus
ENSNBRG00000020081	eftud2	91	80.968	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.968	Choloepus_hoffmanni
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.975	Chrysemys_picta_bellii
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	78.645	ENSCING00000009372	-	100	78.542	Ciona_intestinalis
ENSNBRG00000020081	eftud2	99	78.243	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.835	Ciona_savignyi
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	92.181	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.667	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.770	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.667	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.770	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.940	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.940	Cynoglossus_semilaevis
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.528	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.528	Cyprinodon_variegatus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	94.245	ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.245	Danio_rerio
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.667	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	91.872	Dasypus_novemcinctus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.872	Dipodomys_ordii
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	74.821	FBgn0039566	CG4849	100	74.769	Drosophila_melanogaster
ENSNBRG00000020081	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSNBRG00000020081	eftud2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.344	Eptatretus_burgeri
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	92.078	Equus_asinus_asinus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	91.975	Equus_caballus
ENSNBRG00000020081	eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	94.336	ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.924	Esox_lucius
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.975	Felis_catus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.667	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.770	Ficedula_albicollis
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.078	Fukomys_damarensis
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.322	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	97.322	Fundulus_heteroclitus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	95.675	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	95.675	Gadus_morhua
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.564	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.587	Gallus_gallus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.631	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	97.631	Gambusia_affinis
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	98.043	ENSGACG00000009163	eftud2	100	98.043	Gasterosteus_aculeatus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	92.181	Gorilla_gorilla
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	99.794	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	99.794	Haplochromis_burtoni
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	91.872	Heterocephalus_glaber_female
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.872	Heterocephalus_glaber_male
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.016	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.016	Hippocampus_comes
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	94.439	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.439	Ictalurus_punctatus
ENSNBRG00000020081	eftud2	91	93.018	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.820	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNBRG00000020081	eftud2	95	93.696	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.696	Jaculus_jaculus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.631	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	97.631	Kryptolebias_marmoratus
ENSNBRG00000020081	eftud2	95	98.056	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.176	Labrus_bergylta
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	93.100	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.100	Latimeria_chalumnae
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	94.645	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	94.336	Lepisosteus_oculatus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.872	Loxodonta_africana
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	92.181	Macaca_fascicularis
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	92.181	Macaca_nemestrina
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	92.181	Mandrillus_leucophaeus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	98.249	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	98.249	Mastacembelus_armatus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	99.897	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	99.897	Maylandia_zebra
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.376	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.581	Meleagris_gallopavo
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	91.872	Mesocricetus_auratus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	92.181	Microcebus_murinus
ENSNBRG00000020081	eftud2	92	75.281	ENSMOCG00000017653	-	90	75.393	Microtus_ochrogaster
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	ENSMOCG00000009039	-	100	91.872	Microtus_ochrogaster
ENSNBRG00000020081	eftud2	88	98.706	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	98.706	Mola_mola
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.181	Monodelphis_domestica
ENSNBRG00000020081	eftud2	88	96.824	ENSMALG00000014501	eftud2	100	96.824	Monopterus_albus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	91.975	Mus_caroli
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	92.070	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	92.070	Mus_musculus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.975	Mus_pahari
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	91.975	Mus_spretus
ENSNBRG00000020081	eftud2	97	91.419	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	91.631	Mustela_putorius_furo
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	92.078	Myotis_lucifugus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.667	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.770	Nannospalax_galili
ENSNBRG00000020081	eftud2	97	89.904	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.117	Nomascus_leucogenys
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	88.272	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.477	Notamacropus_eugenii
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	83.951	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.156	Ochotona_princeps
ENSNBRG00000020081	eftud2	94	75.753	ENSODEG00000003385	-	100	75.862	Octodon_degus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSODEG00000018041	-	100	91.358	Octodon_degus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	99.897	ENSONIG00000000912	eftud2	100	99.897	Oreochromis_niloticus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.078	Oryctolagus_cuniculus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.322	ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.322	Oryzias_latipes
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.425	ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.425	Oryzias_latipes_hni
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.322	ENSORLG00015002611	eftud2	100	98.039	Oryzias_latipes_hsok
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	90.329	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	90.535	Otolemur_garnettii
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	92.078	Ovis_aries
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	92.181	Pan_paniscus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	92.078	Panthera_pardus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	92.078	Panthera_tigris_altaica
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.181	Pan_troglodytes
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	92.181	Papio_anubis
ENSNBRG00000020081	eftud2	93	90.077	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.298	Pelodiscus_sinensis
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	89.392	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	89.392	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	91.975	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	92.181	Phascolarctos_cinereus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.837	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	97.837	Poecilia_formosa
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.837	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	97.837	Poecilia_latipinna
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.837	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	97.837	Poecilia_mexicana
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	90.741	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.947	Pongo_abelii
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	88.169	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.374	Procavia_capensis
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.181	Propithecus_coquereli
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	87.654	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.860	Pteropus_vampyrus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	99.794	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	99.794	Pundamilia_nyererei
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	94.748	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.748	Pygocentrus_nattereri
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	92.173	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.173	Rattus_norvegicus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	92.078	Rhinopithecus_bieti
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.078	Rhinopithecus_roxellana
ENSNBRG00000020081	eftud2	97	33.863	YKL173W	SNU114	91	34.538	Saccharomyces_cerevisiae
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.181	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNBRG00000020081	eftud2	95	93.696	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.696	Sarcophilus_harrisii
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	94.851	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.881	Scleropages_formosus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.837	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	97.837	Scophthalmus_maximus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	99.176	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	99.176	Seriola_dumerili
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	99.279	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	99.279	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	83.951	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.156	Sorex_araneus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.564	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.770	Sphenodon_punctatus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	99.176	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	99.176	Stegastes_partitus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.872	Sus_scrofa
ENSNBRG00000020081	eftud2	83	92.537	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.537	Taeniopygia_guttata
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	96.601	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.601	Takifugu_rubripes
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.897	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.897	Tetraodon_nigroviridis
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	86.626	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.831	Tupaia_belangeri
ENSNBRG00000020081	eftud2	91	89.784	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.784	Tursiops_truncatus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	90.741	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.947	Ursus_americanus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	92.078	Ursus_maritimus
ENSNBRG00000020081	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	92.078	Vulpes_vulpes
ENSNBRG00000020081	eftud2	96	92.727	ENSXETG00000003394	eftud2	98	93.471	Xenopus_tropicalis
ENSNBRG00000020081	eftud2	81	97.959	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.959	Xiphophorus_couchianus
ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.631	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.631	Xiphophorus_maculatus