EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNGAG00000007912 (Gene tree)
Gene ID: 103725059
Gene Symbol: Syf2
Alias: 1110018L13Rik|Cbpin|D4Bwg1551e|Gcipip|Ntc31|mp29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Nannospalax_galili
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6986 bases
Position: chrKL205159.1:648216-655201
Accession: 103725059
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNGAP00000005541	SYF2	PF08231.12	3.7e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNGAT00000009565	-	1324	XM_008822293	ENSNGAP00000005541	246 (aa)	XP_008820515	UPI0004ED3FB3

Gene Model

Click here to download ENSNGAG00000007912's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ngi03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSNGAG00000007912's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.276	ENSG00000117614	SYF2	100	92.276	Homo_sapiens
ENSNGAG00000007912	Syf2	90	83.784	ENSAPOG00000001174	syf2	100	77.642	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNGAG00000007912	Syf2	99	90.947	ENSAMEG00000010115	-	99	90.947	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNGAG00000007912	Syf2	79	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNGAG00000007912	Syf2	98	76.667	ENSACIG00000023688	syf2	94	76.667	Amphilophus_citrinellus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	78.455	ENSAOCG00000022046	syf2	94	84.234	Amphiprion_ocellaris
ENSNGAG00000007912	Syf2	93	76.856	ENSAOCG00000010912	syf2	69	76.856	Amphiprion_ocellaris
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	78.455	ENSAPEG00000018858	syf2	92	78.455	Amphiprion_percula
ENSNGAG00000007912	Syf2	88	82.949	ENSATEG00000007745	syf2	100	76.423	Anabas_testudineus
ENSNGAG00000007912	Syf2	81	88.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	Anas_platyrhynchos
ENSNGAG00000007912	Syf2	67	75.449	ENSACAG00000026777	-	94	75.796	Anolis_carolinensis
ENSNGAG00000007912	Syf2	83	85.294	ENSACAG00000013653	-	100	85.294	Anolis_carolinensis
ENSNGAG00000007912	Syf2	99	92.245	ENSANAG00000032473	SYF2	99	92.245	Aotus_nancymaae
ENSNGAG00000007912	Syf2	90	80.631	ENSACLG00000019916	syf2	100	76.050	Astatotilapia_calliptera
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	76.423	ENSAMXG00000004051	syf2	100	76.423	Astyanax_mexicanus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.308	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.277	Bos_taurus
ENSNGAG00000007912	Syf2	85	50.000	WBGene00019402	syf-2	98	45.957	Caenorhabditis_elegans
ENSNGAG00000007912	Syf2	99	92.653	ENSCJAG00000046570	SYF2	99	92.653	Callithrix_jacchus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.057	ENSCAFG00000012895	-	100	91.057	Canis_familiaris
ENSNGAG00000007912	Syf2	97	84.519	ENSCAFG00000030331	-	97	84.519	Canis_familiaris
ENSNGAG00000007912	Syf2	74	87.912	ENSCAFG00020021094	-	83	96.154	Canis_lupus_dingo
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.057	ENSCAFG00020021091	-	100	91.057	Canis_lupus_dingo
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.276	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.276	Capra_hircus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.276	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.276	Carlito_syrichta
ENSNGAG00000007912	Syf2	80	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.276	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	92.276	Cavia_porcellus
ENSNGAG00000007912	Syf2	99	92.653	ENSCCAG00000022459	SYF2	99	92.653	Cebus_capucinus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.463	ENSCATG00000026917	SYF2	100	91.463	Cercocebus_atys
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.089	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.089	Chinchilla_lanigera
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.057	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	91.057	Chlorocebus_sabaeus
ENSNGAG00000007912	Syf2	74	75.410	ENSCHOG00000005273	-	100	75.410	Choloepus_hoffmanni
ENSNGAG00000007912	Syf2	91	89.686	ENSCPBG00000025073	SYF2	95	86.017	Chrysemys_picta_bellii
ENSNGAG00000007912	Syf2	86	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.521	Ciona_intestinalis
ENSNGAG00000007912	Syf2	86	50.704	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.704	Ciona_savignyi
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	78.862	ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.862	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.089	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	93.089	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNGAG00000007912	Syf2	81	96.985	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	96.985	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNGAG00000007912	Syf2	89	77.982	ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.027	Cynoglossus_semilaevis
ENSNGAG00000007912	Syf2	90	81.448	ENSCVAG00000019543	syf2	100	75.610	Cyprinodon_variegatus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	76.829	ENSDARG00000004706	syf2	100	76.829	Danio_rerio
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.713	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	92.713	Dasypus_novemcinctus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.089	ENSDORG00000001274	Syf2	100	93.089	Dipodomys_ordii
ENSNGAG00000007912	Syf2	89	56.818	FBgn0033556	CG12343	97	56.818	Drosophila_melanogaster
ENSNGAG00000007912	Syf2	94	77.155	ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.155	Echinops_telfairi
ENSNGAG00000007912	Syf2	80	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	82.520	ENSEASG00005004232	-	100	82.520	Equus_asinus_asinus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.308	ENSEASG00005004224	-	100	92.308	Equus_asinus_asinus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.117	ENSECAG00000012023	-	100	93.117	Equus_caballus
ENSNGAG00000007912	Syf2	96	93.671	ENSECAG00000010440	-	98	93.671	Equus_caballus
ENSNGAG00000007912	Syf2	75	81.081	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.081	Erinaceus_europaeus
ENSNGAG00000007912	Syf2	96	80.932	ENSELUG00000003465	syf2	99	80.932	Esox_lucius
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	90.650	ENSFCAG00000043095	-	100	90.650	Felis_catus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.496	ENSFCAG00000010324	-	85	93.496	Felis_catus
ENSNGAG00000007912	Syf2	83	85.294	ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.466	Ficedula_albicollis
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.683	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.683	Fukomys_damarensis
ENSNGAG00000007912	Syf2	91	66.518	ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.518	Fundulus_heteroclitus
ENSNGAG00000007912	Syf2	89	83.486	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	Gadus_morhua
ENSNGAG00000007912	Syf2	91	88.789	ENSGALG00000013639	SYF2	93	85.169	Gallus_gallus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	73.171	ENSGAFG00000019435	syf2	100	73.171	Gambusia_affinis
ENSNGAG00000007912	Syf2	87	83.256	ENSGACG00000007305	syf2	99	76.132	Gasterosteus_aculeatus
ENSNGAG00000007912	Syf2	91	90.135	ENSGAGG00000010670	SYF2	95	86.441	Gopherus_agassizii
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.683	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	92.683	Gorilla_gorilla
ENSNGAG00000007912	Syf2	96	77.215	ENSHBUG00000020477	syf2	100	76.423	Haplochromis_burtoni
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.308	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.308	Heterocephalus_glaber_female
ENSNGAG00000007912	Syf2	92	83.260	ENSHGLG00000004304	-	100	77.236	Heterocephalus_glaber_female
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.308	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.308	Heterocephalus_glaber_male
ENSNGAG00000007912	Syf2	97	78.333	ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.333	Hippocampus_comes
ENSNGAG00000007912	Syf2	92	81.659	ENSIPUG00000019859	syf2	96	81.659	Ictalurus_punctatus
ENSNGAG00000007912	Syf2	59	96.575	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNGAG00000007912	Syf2	81	96.985	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	Jaculus_jaculus
ENSNGAG00000007912	Syf2	96	77.119	ENSKMAG00000013856	syf2	99	77.119	Kryptolebias_marmoratus
ENSNGAG00000007912	Syf2	89	83.105	ENSLBEG00000014425	syf2	100	76.423	Labrus_bergylta
ENSNGAG00000007912	Syf2	89	85.780	ENSLACG00000012064	SYF2	92	85.780	Latimeria_chalumnae
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	78.455	ENSLOCG00000002728	syf2	95	78.455	Lepisosteus_oculatus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.308	ENSLAFG00000023150	-	100	92.308	Loxodonta_africana
ENSNGAG00000007912	Syf2	74	64.130	ENSLAFG00000030814	-	100	64.130	Loxodonta_africana
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.870	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	91.870	Macaca_fascicularis
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.870	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	91.870	Macaca_mulatta
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.870	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	91.870	Macaca_nemestrina
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.463	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	91.463	Mandrillus_leucophaeus
ENSNGAG00000007912	Syf2	88	81.567	ENSMAMG00000010403	syf2	98	75.610	Mastacembelus_armatus
ENSNGAG00000007912	Syf2	93	77.872	ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.872	Maylandia_zebra
ENSNGAG00000007912	Syf2	81	88.945	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	Meleagris_gallopavo
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.683	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	92.683	Mesocricetus_auratus
ENSNGAG00000007912	Syf2	81	97.487	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	Microcebus_murinus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	94.309	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	94.309	Microtus_ochrogaster
ENSNGAG00000007912	Syf2	96	75.949	ENSMMOG00000002396	syf2	97	75.949	Mola_mola
ENSNGAG00000007912	Syf2	92	88.158	ENSMODG00000013951	-	99	88.158	Monodelphis_domestica
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	78.138	ENSMALG00000010706	syf2	100	78.138	Monopterus_albus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.496	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	93.496	Mus_caroli
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.496	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	93.496	Mus_musculus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.496	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	93.496	Mus_pahari
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.496	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	93.496	Mus_spretus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.093	ENSMPUG00000015801	-	100	91.093	Mustela_putorius_furo
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.903	ENSMPUG00000015802	-	100	91.903	Mustela_putorius_furo
ENSNGAG00000007912	Syf2	96	93.220	ENSMLUG00000001885	SYF2	97	93.220	Myotis_lucifugus
ENSNGAG00000007912	Syf2	90	74.324	ENSNBRG00000010720	syf2	98	70.763	Neolamprologus_brichardi
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.683	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	92.683	Nomascus_leucogenys
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.870	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.870	Ochotona_princeps
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	80.894	ENSODEG00000014338	-	99	83.122	Octodon_degus
ENSNGAG00000007912	Syf2	96	94.068	ENSODEG00000017664	-	99	94.068	Octodon_degus
ENSNGAG00000007912	Syf2	90	80.631	ENSONIG00000008213	syf2	100	76.050	Oreochromis_niloticus
ENSNGAG00000007912	Syf2	82	90.594	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.522	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.522	Oryctolagus_cuniculus
ENSNGAG00000007912	Syf2	93	79.565	ENSORLG00000028820	syf2	99	79.565	Oryzias_latipes
ENSNGAG00000007912	Syf2	99	76.230	ENSORLG00020018333	syf2	99	76.230	Oryzias_latipes_hni
ENSNGAG00000007912	Syf2	99	75.820	ENSORLG00015014665	syf2	99	75.820	Oryzias_latipes_hsok
ENSNGAG00000007912	Syf2	90	82.432	ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.432	Oryzias_melastigma
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.276	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.276	Otolemur_garnettii
ENSNGAG00000007912	Syf2	79	67.179	ENSOARG00000006269	-	100	67.179	Ovis_aries
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.566	ENSOARG00000006348	-	100	91.566	Ovis_aries
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.683	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	92.683	Pan_paniscus
ENSNGAG00000007912	Syf2	99	92.653	ENSPPRG00000001638	-	99	92.653	Panthera_pardus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	90.650	ENSPPRG00000001651	-	100	90.650	Panthera_pardus
ENSNGAG00000007912	Syf2	91	97.309	ENSPTIG00000005711	-	81	97.309	Panthera_tigris_altaica
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	90.650	ENSPTIG00000007036	-	100	90.650	Panthera_tigris_altaica
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.683	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	92.683	Pan_troglodytes
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.870	ENSPANG00000008139	SYF2	100	91.870	Papio_anubis
ENSNGAG00000007912	Syf2	93	81.034	ENSPKIG00000008130	syf2	99	81.034	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNGAG00000007912	Syf2	99	83.607	ENSPSIG00000011816	SYF2	94	83.607	Pelodiscus_sinensis
ENSNGAG00000007912	Syf2	96	78.390	ENSPMGG00000008755	syf2	92	78.390	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.902	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	93.902	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNGAG00000007912	Syf2	91	94.170	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	87.200	Phascolarctos_cinereus
ENSNGAG00000007912	Syf2	90	79.279	ENSPFOG00000004116	syf2	92	79.279	Poecilia_formosa
ENSNGAG00000007912	Syf2	93	77.253	ENSPLAG00000006691	syf2	100	77.253	Poecilia_latipinna
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	71.138	ENSPMEG00000011684	syf2	95	76.577	Poecilia_mexicana
ENSNGAG00000007912	Syf2	88	81.019	ENSPREG00000003009	syf2	100	73.577	Poecilia_reticulata
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.683	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	92.683	Pongo_abelii
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	63.415	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.008	Propithecus_coquereli
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	80.567	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	80.567	Pteropus_vampyrus
ENSNGAG00000007912	Syf2	90	80.631	ENSPNYG00000004979	syf2	100	76.050	Pundamilia_nyererei
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	78.455	ENSPNAG00000015570	syf2	100	78.455	Pygocentrus_nattereri
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.496	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	93.496	Rattus_norvegicus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	89.837	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	89.837	Rhinopithecus_bieti
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.870	ENSRROG00000001347	SYF2	100	91.870	Rhinopithecus_roxellana
ENSNGAG00000007912	Syf2	99	91.837	ENSSBOG00000020184	SYF2	99	91.837	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNGAG00000007912	Syf2	92	91.593	ENSSHAG00000015630	-	100	85.944	Sarcophilus_harrisii
ENSNGAG00000007912	Syf2	83	93.204	ENSSHAG00000007152	-	100	93.204	Sarcophilus_harrisii
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	78.455	ENSSFOG00015023647	syf2	100	78.455	Scleropages_formosus
ENSNGAG00000007912	Syf2	96	77.215	ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.215	Scophthalmus_maximus
ENSNGAG00000007912	Syf2	89	83.028	ENSSDUG00000013072	syf2	100	76.016	Seriola_dumerili
ENSNGAG00000007912	Syf2	89	83.028	ENSSLDG00000012677	syf2	100	76.016	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	74.390	ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.390	Sorex_araneus
ENSNGAG00000007912	Syf2	95	85.169	ENSSPUG00000005251	SYF2	93	85.169	Sphenodon_punctatus
ENSNGAG00000007912	Syf2	96	79.325	ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.325	Stegastes_partitus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.713	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	92.713	Sus_scrofa
ENSNGAG00000007912	Syf2	61	59.603	ENSTGUG00000001126	SYF2	84	59.884	Taeniopygia_guttata
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	74.390	ENSTRUG00000001499	syf2	96	75.207	Takifugu_rubripes
ENSNGAG00000007912	Syf2	91	78.924	ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.924	Tetraodon_nigroviridis
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	71.138	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.732	Tupaia_belangeri
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.683	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.683	Tursiops_truncatus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	90.244	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	90.244	Ursus_americanus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	90.650	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	90.650	Ursus_maritimus
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.463	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.463	Vicugna_pacos
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.057	ENSVVUG00000027175	-	100	91.057	Vulpes_vulpes
ENSNGAG00000007912	Syf2	100	89.558	ENSVVUG00000027181	-	100	89.558	Vulpes_vulpes
ENSNGAG00000007912	Syf2	93	84.279	ENSXETG00000022797	syf2	92	84.279	Xenopus_tropicalis
ENSNGAG00000007912	Syf2	87	80.930	ENSXMAG00000022698	syf2	97	76.695	Xiphophorus_maculatus