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Description

Ensembl ID: ENSNGAG00000014508 (Gene tree)
Gene ID: 103740000
Gene Symbol: Msi1
Alias: Msi1|Msi1h|Musahi1|m-Msi-1
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Nannospalax_galili
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 24246 bases
Position: chrKL198941.1:409626-433871
Accession: 103740000
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNGAP00000012778	RRM_1	PF00076.22	3.3e-29	1	2
ENSNGAP00000012778	RRM_1	PF00076.22	3.3e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNGAT00000018344	-	1086	XM_008840534	ENSNGAP00000012778	361 (aa)	XP_008838756	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ngi03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNGAG00000014508	Msi1	51	42.308	ENSNGAG00000003560	Dazap1	52	41.772
ENSNGAG00000014508	Msi1	93	68.389	ENSNGAG00000017807	Msi2	94	70.659

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.855	ENSG00000135097	MSI1	98	93.855	Homo_sapiens
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSAPOG00000023458	-	94	85.410	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.410	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	81.365	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	81.365	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNGAG00000014508	Msi1	88	81.962	ENSACIG00000017754	-	78	81.962	Amphilophus_citrinellus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSAOCG00000003804	MSI1	94	85.410	Amphiprion_ocellaris
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	76.596	ENSAOCG00000009031	-	95	76.900	Amphiprion_ocellaris
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSAPEG00000006857	-	79	85.410	Amphiprion_percula
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSAPEG00000003245	MSI1	94	85.410	Amphiprion_percula
ENSNGAG00000014508	Msi1	92	81.982	ENSATEG00000023779	-	91	81.982	Anabas_testudineus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.106	ENSATEG00000017059	MSI1	99	82.969	Anabas_testudineus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	96.960	ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.960	Anolis_carolinensis
ENSNGAG00000014508	Msi1	79	89.116	ENSANAG00000027901	-	89	89.116	Aotus_nancymaae
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	96.286	ENSANAG00000027151	MSI1	98	96.286	Aotus_nancymaae
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	ENSACLG00000000117	-	100	84.802	Astatotilapia_calliptera
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	ENSACLG00000011230	MSI1	94	84.802	Astatotilapia_calliptera
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	83.891	ENSAMXG00000038960	msi1	76	83.891	Astyanax_mexicanus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	100.000	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	100.000	Bos_taurus
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.855	ENSCJAG00000008578	MSI1	98	93.855	Callithrix_jacchus
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.575	ENSCAFG00000010283	MSI1	98	93.575	Canis_familiaris
ENSNGAG00000014508	Msi1	93	100.000	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	88.493	ENSCHIG00000024304	MSI1	98	88.493	Capra_hircus
ENSNGAG00000014508	Msi1	93	100.000	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	Carlito_syrichta
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	100.000	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	100.000	Cavia_aperea
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	100.000	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.855	ENSCCAG00000035567	MSI1	98	93.855	Cebus_capucinus
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.855	ENSCATG00000030019	MSI1	98	93.855	Cercocebus_atys
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	100.000	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSNGAG00000014508	Msi1	72	88.278	ENSCSAG00000002265	MSI1	93	88.278	Chlorocebus_sabaeus
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	90.223	ENSCPBG00000011349	MSI1	98	90.223	Chrysemys_picta_bellii
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	100.000	ENSCANG00000040651	MSI1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.855	ENSCGRG00001018883	Msi1	98	93.855	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNGAG00000014508	Msi1	93	100.000	ENSCGRG00000002191	Msi1	73	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.106	ENSCSEG00000005834	-	94	85.106	Cynoglossus_semilaevis
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	77.508	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	77.508	Cynoglossus_semilaevis
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	83.891	ENSCSEG00000008352	-	94	83.891	Cynoglossus_semilaevis
ENSNGAG00000014508	Msi1	64	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSCVAG00000009100	MSI1	94	85.410	Cyprinodon_variegatus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	81.402	ENSDARG00000010710	msi1	100	85.022	Danio_rerio
ENSNGAG00000014508	Msi1	80	82.096	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	82.096	Danio_rerio
ENSNGAG00000014508	Msi1	99	87.222	ENSDNOG00000005713	MSI1	99	87.222	Dasypus_novemcinctus
ENSNGAG00000014508	Msi1	93	99.102	ENSDORG00000005610	Msi1	95	99.102	Dipodomys_ordii
ENSNGAG00000014508	Msi1	93	95.732	ENSETEG00000004756	MSI1	100	95.732	Echinops_telfairi
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.855	ENSEASG00005004736	MSI1	98	93.855	Equus_asinus_asinus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	100.000	ENSECAG00000017526	MSI1	98	93.855	Equus_caballus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	80.547	ENSELUG00000023280	-	100	80.243	Esox_lucius
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	79.656	ENSELUG00000023219	MSI1	92	79.656	Esox_lucius
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.855	ENSFCAG00000011007	MSI1	98	93.855	Felis_catus
ENSNGAG00000014508	Msi1	93	95.820	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	Ficedula_albicollis
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	99.695	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	Fukomys_damarensis
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.714	ENSFHEG00000022446	MSI1	94	85.714	Fundulus_heteroclitus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSFHEG00000003560	-	94	85.410	Fundulus_heteroclitus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	82.979	ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.675	Gadus_morhua
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	76.900	ENSGMOG00000017838	-	90	76.900	Gadus_morhua
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	95.238	ENSGALG00000007227	MSI1	96	81.654	Gallus_gallus
ENSNGAG00000014508	Msi1	92	68.373	ENSGAFG00000005860	-	90	68.373	Gambusia_affinis
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	84.802	Gambusia_affinis
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	81.155	ENSGACG00000008674	-	94	81.155	Gasterosteus_aculeatus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.195	ENSGACG00000012679	MSI1	94	84.195	Gasterosteus_aculeatus
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	90.223	ENSGAGG00000016037	MSI1	98	90.223	Gopherus_agassizii
ENSNGAG00000014508	Msi1	93	100.000	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	ENSHBUG00000011841	-	94	84.802	Haplochromis_burtoni
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	ENSHBUG00000021921	MSI1	94	84.802	Haplochromis_burtoni
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.575	ENSHGLG00000012782	MSI1	98	93.575	Heterocephalus_glaber_female
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	99.695	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	Heterocephalus_glaber_male
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	80.243	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	80.243	Hippocampus_comes
ENSNGAG00000014508	Msi1	92	83.133	ENSHCOG00000012067	-	90	83.133	Hippocampus_comes
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	83.283	ENSIPUG00000001976	msi1	95	83.283	Ictalurus_punctatus
ENSNGAG00000014508	Msi1	93	100.000	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	78.212	ENSJJAG00000010643	-	98	77.933	Jaculus_jaculus
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.855	ENSJJAG00000010463	Msi1	98	93.855	Jaculus_jaculus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.498	ENSKMAG00000011251	MSI1	94	84.498	Kryptolebias_marmoratus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	82.979	ENSKMAG00000019877	-	100	82.979	Kryptolebias_marmoratus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	ENSLBEG00000001375	-	94	84.802	Labrus_bergylta
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	ENSLBEG00000008789	MSI1	94	84.802	Labrus_bergylta
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	87.009	ENSLACG00000018287	MSI1	100	87.009	Latimeria_chalumnae
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	89.426	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.426	Loxodonta_africana
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	100.000	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	100.000	ENSMMUG00000031527	MSI1	91	100.000	Macaca_mulatta
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.855	ENSMNEG00000040034	MSI1	98	93.855	Macaca_nemestrina
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	100.000	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.195	ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.195	Mastacembelus_armatus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSMAMG00000018426	-	94	85.410	Mastacembelus_armatus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	ENSMZEG00005000340	-	94	84.802	Maylandia_zebra
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.802	Maylandia_zebra
ENSNGAG00000014508	Msi1	66	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSNGAG00000014508	Msi1	64	100.000	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.855	ENSMICG00000033181	MSI1	98	93.855	Microcebus_murinus
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.575	ENSMOCG00000002286	Msi1	98	93.575	Microtus_ochrogaster
ENSNGAG00000014508	Msi1	93	80.415	ENSMMOG00000012265	-	99	80.415	Mola_mola
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	75.380	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	75.380	Mola_mola
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	67.771	ENSMODG00000003189	-	100	67.771	Monodelphis_domestica
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.498	ENSMALG00000001426	-	100	84.498	Monopterus_albus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.802	Monopterus_albus
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.296	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	98	93.296	Mus_caroli
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.296	ENSMUSG00000054256	Msi1	99	96.049	Mus_musculus
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.017	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	98	93.017	Mus_pahari
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.296	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	98	93.296	Mus_spretus
ENSNGAG00000014508	Msi1	93	100.000	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	90.179	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	90.179	Myotis_lucifugus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	ENSNBRG00000000841	-	94	84.802	Neolamprologus_brichardi
ENSNGAG00000014508	Msi1	88	77.432	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	77.432	Neolamprologus_brichardi
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	89.634	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.634	Nomascus_leucogenys
ENSNGAG00000014508	Msi1	93	77.744	ENSMEUG00000015759	MSI1	100	77.744	Notamacropus_eugenii
ENSNGAG00000014508	Msi1	87	92.063	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	92.063	Ochotona_princeps
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	100.000	ENSODEG00000006328	MSI1	100	100.000	Octodon_degus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	ENSONIG00000011182	MSI1	94	84.802	Oreochromis_niloticus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.106	ENSONIG00000019452	-	94	85.106	Oreochromis_niloticus
ENSNGAG00000014508	Msi1	93	99.678	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	99.678	Oryctolagus_cuniculus
ENSNGAG00000014508	Msi1	98	80.055	ENSORLG00000029593	MSI1	94	85.410	Oryzias_latipes
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSORLG00000019978	-	94	85.410	Oryzias_latipes
ENSNGAG00000014508	Msi1	98	80.055	ENSORLG00020008266	MSI1	99	82.371	Oryzias_latipes_hni
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSORLG00020001208	-	67	85.410	Oryzias_latipes_hni
ENSNGAG00000014508	Msi1	98	80.055	ENSORLG00015003916	MSI1	99	82.371	Oryzias_latipes_hsok
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSORLG00015013672	-	71	81.763	Oryzias_latipes_hsok
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	86.322	ENSOMEG00000002272	-	97	86.322	Oryzias_melastigma
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSOMEG00000017536	MSI1	100	82.371	Oryzias_melastigma
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	99.096	ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.096	Otolemur_garnettii
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	96.061	ENSOARG00000012097	MSI1	100	96.061	Ovis_aries
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ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.855	ENSPTRG00000005531	MSI1	98	93.855	Pan_troglodytes
ENSNGAG00000014508	Msi1	97	93.575	ENSPANG00000006335	MSI1	98	93.575	Papio_anubis
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.106	ENSPKIG00000023575	-	94	85.106	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	86.018	ENSPKIG00000016497	MSI1	94	86.018	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	91.793	ENSPSIG00000011608	-	93	91.793	Pelodiscus_sinensis
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ENSNGAG00000014508	Msi1	88	81.013	ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.013	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	69.789	ENSPMGG00000007743	-	89	70.181	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNGAG00000014508	Msi1	99	94.382	ENSPEMG00000010491	Msi1	99	94.382	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSPFOG00000008319	-	81	85.410	Poecilia_formosa
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ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSPLAG00000012431	-	91	85.410	Poecilia_latipinna
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ENSNGAG00000014508	Msi1	91	84.802	ENSPMEG00000007025	-	93	77.204	Poecilia_mexicana
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	82.371	ENSPREG00000021416	-	94	82.371	Poecilia_reticulata
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ENSNGAG00000014508	Msi1	93	82.927	ENSPVAG00000002225	MSI1	100	82.927	Pteropus_vampyrus
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ENSNGAG00000014508	Msi1	91	83.587	ENSPNAG00000019337	msi1	94	83.587	Pygocentrus_nattereri
ENSNGAG00000014508	Msi1	93	99.678	ENSRNOG00000001156	Msi1	100	99.678	Rattus_norvegicus
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ENSNGAG00000014508	Msi1	91	81.515	ENSSMAG00000018824	MSI1	98	81.515	Scophthalmus_maximus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.106	ENSSDUG00000001027	MSI1	94	85.106	Seriola_dumerili
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ENSNGAG00000014508	Msi1	93	99.678	ENSSSCG00000029365	MSI1	100	99.678	Sus_scrofa
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ENSNGAG00000014508	Msi1	81	80.952	ENSTRUG00000016249	MSI1	100	73.783	Takifugu_rubripes
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	79.518	ENSTNIG00000011469	MSI1	94	79.518	Tetraodon_nigroviridis
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	60.933	ENSTNIG00000019814	-	95	60.933	Tetraodon_nigroviridis
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ENSNGAG00000014508	Msi1	91	91.818	ENSXETG00000012216	msi1	95	91.592	Xenopus_tropicalis
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	70.821	ENSXCOG00000017605	MSI1	89	70.821	Xiphophorus_couchianus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	ENSXMAG00000027103	MSI1	90	78.614	Xiphophorus_maculatus
ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.106	ENSXMAG00000018237	-	94	85.106	Xiphophorus_maculatus