EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNGAG00000017831 (Gene tree)
Gene ID: 103740145
Gene Symbol: Htatsf1
Alias: 1600023H17Rik|2600017A12Rik|2700077B20Rik|TAT-SF1
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Nannospalax_galili
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17210 bases
Position: chrKL202107.1:1050003-1067212
Accession: 103740145
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNGAP00000017393	RRM_1	PF00076.22	4.2e-17	1	2
ENSNGAP00000017393	RRM_1	PF00076.22	4.2e-17	2	2
ENSNGAP00000017389	RRM_1	PF00076.22	4.3e-17	1	2
ENSNGAP00000017389	RRM_1	PF00076.22	4.3e-17	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNGAT00000023023	-	2214	-	ENSNGAP00000017393	737 (aa)	-	-
ENSNGAT00000023019	-	2840	XM_008840701	ENSNGAP00000017389	744 (aa)	XP_008838923	UPI0004ED25EC

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	76.831	ENSG00000102241	HTATSF1	100	88.115	Homo_sapiens
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	55	60.993	ENSAPOG00000009823	htatsf1	81	64.228	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	73.732	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	98	72.668	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	63.613	ENSACIG00000020459	htatsf1	82	62.933	Amphilophus_citrinellus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	62.755	ENSAOCG00000020994	htatsf1	80	62.735	Amphiprion_ocellaris
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	63.776	ENSAPEG00000016432	htatsf1	80	63.271	Amphiprion_percula
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	50	62.240	ENSATEG00000008903	htatsf1	81	61.475	Anabas_testudineus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	95	66.667	ENSANAG00000027986	-	93	66.377	Aotus_nancymaae
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	93	75.000	ENSANAG00000025458	-	96	74.231	Aotus_nancymaae
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	63.544	ENSACLG00000008096	htatsf1	82	62.599	Astatotilapia_calliptera
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	65.140	ENSAMXG00000008387	htatsf1	79	64.439	Astyanax_mexicanus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	72.135	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	98	74.474	Bos_taurus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	70.267	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	98	72.517	Bos_taurus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	72.135	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	98	74.474	Bos_taurus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	76.841	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	97	76.349	Callithrix_jacchus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	76.096	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	98	75.436	Canis_familiaris
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	74.382	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	98	73.982	Canis_lupus_dingo
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	73.768	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	98	76.447	Capra_hircus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	77.630	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	98	77.658	Carlito_syrichta
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	77.480	ENSCCAG00000022701	-	97	76.870	Cebus_capucinus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	72.776	ENSCCAG00000025329	-	96	75.982	Cebus_capucinus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	76.101	ENSCATG00000029963	HTATSF1	97	77.534	Cercocebus_atys
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	75.526	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	98	75.134	Chinchilla_lanigera
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	76.235	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	97	77.671	Chlorocebus_sabaeus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	52	70.619	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	91	66.986	Chrysemys_picta_bellii
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	52.083	ENSCING00000005914	-	73	52.083	Ciona_intestinalis
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	76.636	ENSCANG00000028495	HTATSF1	97	77.839	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	82	79.553	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	98	77.184	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	73	72.647	ENSCGRG00000002085	Htatsf1	98	71.307	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	64.450	ENSCVAG00000014070	htatsf1	81	63.539	Cyprinodon_variegatus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	62.338	ENSDARG00000056649	htatsf1	80	61.308	Danio_rerio
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	72.930	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	98	73.271	Dasypus_novemcinctus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	77	56.164	ENSETEG00000006377	-	68	49.102	Echinops_telfairi
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	50.246	ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	50.521	Eptatretus_burgeri
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	71.745	ENSEASG00005003440	HTATSF1	98	73.062	Equus_asinus_asinus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	71.615	ENSECAG00000009156	HTATSF1	98	72.930	Equus_caballus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	63.791	ENSEEUG00000010668	HTATSF1	97	64.611	Erinaceus_europaeus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	50	63.271	ENSELUG00000005486	htatsf1	70	63.764	Esox_lucius
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	75.629	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	98	75.672	Felis_catus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	52	69.211	ENSFALG00000003728	HTATSF1	87	68.408	Ficedula_albicollis
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	72.872	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	98	73.190	Fukomys_damarensis
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	64.541	ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	63.904	Fundulus_heteroclitus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	68.475	ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.700	Gallus_gallus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	63.797	ENSGAFG00000003041	htatsf1	82	62.865	Gambusia_affinis
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	62.725	ENSGACG00000020459	htatsf1	82	61.995	Gasterosteus_aculeatus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	76.698	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	96	77.702	Gorilla_gorilla
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	63.544	ENSHBUG00000004392	htatsf1	82	62.069	Haplochromis_burtoni
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	97	74.658	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	98	74.696	Heterocephalus_glaber_female
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	60.714	ENSHCOG00000009056	htatsf1	89	60.714	Hippocampus_comes
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	65.000	ENSIPUG00000017828	htatsf1	76	64.820	Ictalurus_punctatus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	78.562	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	97	78.434	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	65.051	ENSKMAG00000007622	htatsf1	81	64.439	Kryptolebias_marmoratus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	50	64.829	ENSLBEG00000001154	htatsf1	79	64.463	Labrus_bergylta
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	65.969	ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	65.746	Latimeria_chalumnae
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	61	41.489	ENSLOCG00000015118	htatsf1	96	40.987	Lepisosteus_oculatus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	68.108	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	98	66.667	Loxodonta_africana
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	76.235	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	97	77.671	Macaca_fascicularis
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	75.968	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	97	77.397	Macaca_mulatta
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	73.442	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	96	74.306	Macaca_nemestrina
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	76.101	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	97	77.534	Mandrillus_leucophaeus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	64.031	ENSMAMG00000021225	htatsf1	83	63.807	Mastacembelus_armatus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	63.544	ENSMZEG00005000485	htatsf1	82	62.865	Maylandia_zebra
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	78.836	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	98	77.718	Mesocricetus_auratus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	76.862	ENSMICG00000009348	HTATSF1	98	77.193	Microcebus_murinus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	79.737	ENSMOCG00000023007	-	98	79.679	Microtus_ochrogaster
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	78.514	ENSMOCG00000022370	-	94	76.366	Microtus_ochrogaster
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	53	62.408	ENSMMOG00000011013	htatsf1	89	62.408	Mola_mola
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	53	71.285	ENSMODG00000014087	-	87	71.285	Monodelphis_domestica
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	53	60.591	ENSMALG00000019977	htatsf1	88	60.197	Monopterus_albus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	79.894	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	98	79.677	Mus_caroli
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	97	81.023	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	98	80.888	Mus_musculus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	97	80.888	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	98	80.754	Mus_spretus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	72.668	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	98	73.062	Mustela_putorius_furo
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	68.342	ENSMLUG00000009234	-	97	68.478	Myotis_lucifugus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	69.841	ENSMLUG00000028418	-	98	68.758	Myotis_lucifugus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	63.544	ENSNBRG00000003818	htatsf1	82	62.599	Neolamprologus_brichardi
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	76.032	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	96	77.123	Nomascus_leucogenys
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	54	68.687	ENSMEUG00000004133	-	95	69.444	Notamacropus_eugenii
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	63.038	ENSONIG00000008638	htatsf1	82	62.334	Oreochromis_niloticus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	75.330	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	98	75.335	Oryctolagus_cuniculus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	50	65.026	ENSORLG00000002356	htatsf1	84	64.267	Oryzias_latipes
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	53	62.350	ENSORLG00020017818	htatsf1	87	61.667	Oryzias_latipes_hni
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	53	62.228	ENSORLG00015002268	htatsf1	90	61.871	Oryzias_latipes_hsok
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	50	64.416	ENSOMEG00000007564	htatsf1	80	63.342	Oryzias_melastigma
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	97	75.513	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	98	76.107	Otolemur_garnettii
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	72.005	ENSOARG00000011215	-	98	74.342	Ovis_aries
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	71.447	ENSOARG00000000481	-	98	71.278	Ovis_aries
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	76.831	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	96	77.839	Pan_paniscus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	75.497	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	98	75.538	Panthera_pardus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	92	74.571	ENSPTIG00000016887	HTATSF1	94	74.601	Panthera_tigris_altaica
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	76.831	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	96	77.839	Pan_troglodytes
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	65.020	ENSPANG00000010946	HTATSF1	96	65.850	Papio_anubis
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	66.223	ENSPKIG00000024852	htatsf1	79	65.642	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	64.070	ENSPMGG00000006172	htatsf1	86	64.070	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	97	78.792	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	98	78.658	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	57	64.516	ENSPCIG00000030173	-	98	64.486	Phascolarctos_cinereus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	57	61.882	ENSPCIG00000018896	-	95	61.882	Phascolarctos_cinereus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	53	62.836	ENSPFOG00000007871	htatsf1	81	63.395	Poecilia_formosa
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	53	62.716	ENSPLAG00000007532	htatsf1	89	62.716	Poecilia_latipinna
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	53	62.562	ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	63.102	Poecilia_mexicana
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	64.796	ENSPREG00000007811	htatsf1	82	64.075	Poecilia_reticulata
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	86	78.328	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	84	79.062	Pongo_abelii
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	93	66.234	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	98	62.791	Procavia_capensis
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	77.454	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	98	78.543	Propithecus_coquereli
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	68.114	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	98	68.999	Pteropus_vampyrus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	63.797	ENSPNYG00000016693	htatsf1	82	63.130	Pundamilia_nyererei
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	53	63.291	ENSPNAG00000006166	htatsf1	93	61.205	Pygocentrus_nattereri
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	78.737	ENSRNOG00000027761	Htatsf1	98	78.244	Rattus_norvegicus
ENSNGAG00000017831	Htatsf1	98	66.756	ENSRBIG00000035486	HTATSF1	96	67.168	Rhinopithecus_bieti
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ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	65.707	ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.014	Xiphophorus_maculatus