EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSNGAG00000017834 (Gene tree)
Gene ID: 103738304
Gene Symbol: Eftud2
Alias: 116kDa|Snrp116|U5-116kD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Nannospalax_galili
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 49957 bases
Position: chrKL201675.1:1457606-1507562
Accession: 103738304
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNGAP00000017413	GTP_EFTU	PF00009.27	2.8e-45	1	1
ENSNGAP00000017413	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	9.3e-13	1	1
ENSNGAP00000017413	EFG_IV	PF03764.18	2.2e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNGAT00000023043	-	3349	XM_008838211	ENSNGAP00000017413	972 (aa)	XP_008836433	UPI0004ED4675

Gene Model

Click here to download ENSNGAG00000017834's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ngi03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSNGAG00000017834's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNGAG00000017834	Eftud2	51	30.769	ENSNGAG00000012375	Gfm1	60	30.769
ENSNGAG00000017834	Eftud2	87	39.175	ENSNGAG00000001879	Eef2	99	39.175
ENSNGAG00000017834	Eftud2	57	34.074	ENSNGAG00000013586	Gfm2	68	34.074

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.872	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.770	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.691	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	88.374	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.272	Amphilophus_citrinellus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.975	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	91.872	Amphiprion_percula
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	92.284	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.181	Anabas_testudineus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	99	94.130	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.130	Anas_platyrhynchos
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	97.325	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.325	Anolis_carolinensis
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.486	Aotus_nancymaae
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.872	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.770	Astatotilapia_calliptera
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.505	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.588	Bos_taurus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	99	70.248	WBGene00001166	eftu-2	99	69.938	Caenorhabditis_elegans
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.486	Callithrix_jacchus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.691	Canis_familiaris
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.691	Canis_lupus_dingo
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.588	Capra_hircus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.280	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.280	Carlito_syrichta
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.074	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	99.074	Cavia_aperea
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.074	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	Cavia_porcellus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.486	Cebus_capucinus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.486	Cercocebus_atys
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	98.971	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	Chinchilla_lanigera
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.486	Chlorocebus_sabaeus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	91	86.824	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	98.354	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.354	Chrysemys_picta_bellii
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	77.846	ENSCING00000009372	-	100	77.641	Ciona_intestinalis
ENSNGAG00000017834	Eftud2	99	78.150	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.486	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.794	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.794	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.794	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.794	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.461	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	Cynoglossus_semilaevis
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	92.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.181	Cyprinodon_variegatus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	90.844	ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.947	Danio_rerio
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	98.868	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.868	Dasypus_novemcinctus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.691	Dipodomys_ordii
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	75.385	FBgn0039566	CG4849	100	74.974	Drosophila_melanogaster
ENSNGAG00000017834	Eftud2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSNGAG00000017834	Eftud2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.691	Equus_asinus_asinus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.588	Equus_caballus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.152	ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.049	Esox_lucius
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.588	Felis_catus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	97.942	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	Ficedula_albicollis
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.691	Fukomys_damarensis
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	92.387	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.284	Fundulus_heteroclitus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	90.844	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.667	Gadus_morhua
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	97.840	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	Gallus_gallus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	92.181	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	92.078	Gambusia_affinis
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.564	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.255	Gasterosteus_aculeatus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.486	Gorilla_gorilla
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.770	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.667	Haplochromis_burtoni
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.280	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	99.280	Heterocephalus_glaber_female
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.280	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.280	Heterocephalus_glaber_male
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	90.947	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.947	Hippocampus_comes
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.564	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	Ictalurus_punctatus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	93.416	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	96	99.786	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.786	Jaculus_jaculus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.564	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.255	Kryptolebias_marmoratus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	95	91.586	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	93.930	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	Latimeria_chalumnae
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	92.078	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.078	Lepisosteus_oculatus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.383	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.383	Loxodonta_africana
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.486	Macaca_fascicularis
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.486	Macaca_nemestrina
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.486	Mandrillus_leucophaeus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	92.284	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.181	Mastacembelus_armatus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.872	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.770	Maylandia_zebra
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	97.844	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.844	Meleagris_gallopavo
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.794	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.794	Mesocricetus_auratus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.486	Microcebus_murinus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.897	ENSMOCG00000009039	-	100	99.897	Microtus_ochrogaster
ENSNGAG00000017834	Eftud2	92	82.022	ENSMOCG00000017653	-	90	82.022	Microtus_ochrogaster
ENSNGAG00000017834	Eftud2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.177	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.177	Monodelphis_domestica
ENSNGAG00000017834	Eftud2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.588	Mus_caroli
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.588	Mus_musculus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.588	Mus_pahari
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.588	Mus_spretus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	97	99.682	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.682	Mustela_putorius_furo
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.691	Myotis_lucifugus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.770	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.667	Neolamprologus_brichardi
ENSNGAG00000017834	Eftud2	97	97.662	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.662	Nomascus_leucogenys
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	95.473	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.473	Notamacropus_eugenii
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.358	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	Ochotona_princeps
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	98.971	ENSODEG00000018041	-	100	98.971	Octodon_degus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.872	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.770	Oreochromis_niloticus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	Oryctolagus_cuniculus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.564	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	Oryzias_latipes
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.461	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.461	Oryzias_latipes_hni
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.461	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	97.222	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.222	Otolemur_garnettii
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.588	Ovis_aries
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.588	Pan_paniscus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.691	Panthera_pardus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.691	Panthera_tigris_altaica
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.588	Pan_troglodytes
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.486	Papio_anubis
ENSNGAG00000017834	Eftud2	93	97.023	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.023	Pelodiscus_sinensis
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	84.362	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.794	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.794	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.177	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.177	Phascolarctos_cinereus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	92.181	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	92.078	Poecilia_formosa
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	92.181	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	92.078	Poecilia_latipinna
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	92.181	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	92.078	Poecilia_mexicana
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	98.045	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.045	Pongo_abelii
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	95.165	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.165	Procavia_capensis
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.383	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.383	Propithecus_coquereli
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	94.753	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.753	Pteropus_vampyrus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.770	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.667	Pundamilia_nyererei
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.975	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	Pygocentrus_nattereri
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.588	Rattus_norvegicus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.383	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.383	Rhinopithecus_bieti
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.383	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.383	Rhinopithecus_roxellana
ENSNGAG00000017834	Eftud2	97	34.190	YKL173W	SNU114	97	33.794	Saccharomyces_cerevisiae
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.486	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSNGAG00000017834	Eftud2	97	99.147	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.147	Sarcophilus_harrisii
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.564	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.564	Scleropages_formosus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.667	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.564	Scophthalmus_maximus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.975	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.872	Seriola_dumerili
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	92.078	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	91.975	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.049	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	Sorex_araneus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	97.222	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.222	Sphenodon_punctatus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	92.078	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	91.975	Stegastes_partitus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.486	Sus_scrofa
ENSNGAG00000017834	Eftud2	84	97.324	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	Taeniopygia_guttata
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.049	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.947	Takifugu_rubripes
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	86.578	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.475	Tetraodon_nigroviridis
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	93.827	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.827	Tupaia_belangeri
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	90.947	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	98.563	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.563	Ursus_americanus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.691	Ursus_maritimus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.691	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.691	Vulpes_vulpes
ENSNGAG00000017834	Eftud2	97	94.456	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSNGAG00000017834	Eftud2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	92.181	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.078	Xiphophorus_maculatus