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Description

Ensembl ID: ENSNGAG00000021263 (Gene tree)
Gene ID: 103738459
Gene Symbol: Tnpo1
Alias: D13Ertd688e|Kpnb2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Nannospalax_galili
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 92164 bases
Position: chrKL201678.1:1805223-1897386
Accession: 103738459
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSNGAP00000022383	IBN_N	PF03810.19	5.5e-16	1	1
ENSNGAP00000022380	IBN_N	PF03810.19	5.6e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSNGAT00000028068	-	2685	-	ENSNGAP00000022383	894 (aa)	-	-
ENSNGAT00000028065	-	3075	XM_008838470	ENSNGAP00000022380	898 (aa)	XP_008836692	UPI0004ED3325

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	85.795	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	99	85.795

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.820	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	Acanthochromis_polyacanthus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	98.779	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.779	Ailuropoda_melanoleuca
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	87	93.152	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.152	Amphilophus_citrinellus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.933	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.933	Amphiprion_ocellaris
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.933	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	Amphiprion_percula
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.483	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	Anabas_testudineus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	98	92.446	ENSAPLG00000009619	-	97	93.448	Anas_platyrhynchos
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	96.629	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.629	Anolis_carolinensis
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.220	ENSANAG00000022453	-	100	99.220	Aotus_nancymaae
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	88.307	ENSANAG00000025351	-	100	88.307	Aotus_nancymaae
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	64.199	ENSANAG00000027118	-	99	63.978	Aotus_nancymaae
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	91.798	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.798	Astatotilapia_calliptera
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.713	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	Astyanax_mexicanus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.443	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	99.443	Bos_taurus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.332	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.332	Callithrix_jacchus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	96	99.533	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.533	Canis_familiaris
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	96.517	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.517	Canis_lupus_dingo
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.332	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.332	Capra_hircus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	95.480	ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.737	Carlito_syrichta
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.220	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.220	Cebus_capucinus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.666	Cercocebus_atys
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.220	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.220	Chinchilla_lanigera
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.555	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.555	Chlorocebus_sabaeus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	94	86.777	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.777	Choloepus_hoffmanni
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	97.643	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	Chrysemys_picta_bellii
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	75.758	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.421	Ciona_savignyi
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	99.666	Colobus_angolensis_palliatus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.777	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.777	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	96	99.883	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.883	Cricetulus_griseus_crigri
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.247	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	Cynoglossus_semilaevis
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.258	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	Cyprinodon_variegatus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.817	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.480	Danio_rerio
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.415	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.415	Dasypus_novemcinctus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	93	99.518	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.517	Dipodomys_ordii
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	57.901	FBgn0035693	CG8219	99	57.562	Drosophila_melanogaster
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	86	99.251	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.251	Echinops_telfairi
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	94	85.238	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.357	Eptatretus_burgeri
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.666	Equus_asinus_asinus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.443	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.443	Equus_caballus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	86.819	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.383	Esox_lucius
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.666	Felis_catus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	97.303	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.303	Ficedula_albicollis
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.332	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.332	Fukomys_damarensis
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.603	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	Fundulus_heteroclitus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	90.179	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.179	Gadus_morhua
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	96.214	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	Gallus_gallus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.377	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	Gambusia_affinis
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.953	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	Gasterosteus_aculeatus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	97.416	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	Gopherus_agassizii
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	82.905	ENSGGOG00000022535	-	99	82.905	Gorilla_gorilla
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.666	Gorilla_gorilla
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.371	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.371	Haplochromis_burtoni
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	98.998	ENSHGLG00000000970	-	100	98.998	Heterocephalus_glaber_female
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	75.278	ENSHGLG00100000963	-	99	76.977	Heterocephalus_glaber_male
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	96	98.949	ENSHGLG00100017090	-	99	98.949	Heterocephalus_glaber_male
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	99.664	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.664	Jaculus_jaculus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.483	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.483	Kryptolebias_marmoratus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	90	90.136	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	Labrus_bergylta
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	96	89.419	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.419	Latimeria_chalumnae
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	95.297	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	95.190	Lepisosteus_oculatus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	97	98.845	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	Loxodonta_africana
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	99.666	Macaca_fascicularis
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.555	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.555	Macaca_mulatta
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	99.666	Macaca_nemestrina
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	99.666	Mandrillus_leucophaeus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.483	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	Mastacembelus_armatus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.146	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.146	Maylandia_zebra
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	99.776	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	99.438	Mesocricetus_auratus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	95.521	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	Microcebus_murinus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	99.776	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.776	Microtus_ochrogaster
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	87	92.526	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	Mola_mola
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	97.660	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	Monodelphis_domestica
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.360	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	Monopterus_albus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.555	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	99.555	Mus_caroli
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.777	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	99.777	Mus_musculus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	99.666	Mus_pahari
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.555	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	99.555	Mus_spretus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.555	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.555	Mustela_putorius_furo
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	96	99.069	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.069	Myotis_lucifugus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	87	93.023	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.023	Neolamprologus_brichardi
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.666	Nomascus_leucogenys
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	91	92.966	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	Ochotona_princeps
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	98.998	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.998	Octodon_degus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.539	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.539	Oreochromis_niloticus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	92	97.927	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	Ornithorhynchus_anatinus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	96	92.991	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.991	Oryctolagus_cuniculus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	86	92.737	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	Oryzias_latipes
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.010	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	Oryzias_latipes_hni
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.123	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	Oryzias_latipes_hsok
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.010	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	Oryzias_melastigma
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.555	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.555	Otolemur_garnettii
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.443	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.443	Ovis_aries
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	99.666	Pan_paniscus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.666	Panthera_pardus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.666	Panthera_tigris_altaica
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	99.666	Pan_troglodytes
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	94	86.602	ENSPTRG00000047731	-	100	86.602	Pan_troglodytes
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	99.666	Papio_anubis
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	90.562	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	Paramormyrops_kingsleyae
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	96.882	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.882	Pelodiscus_sinensis
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	90.460	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.460	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	96	99.883	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.883	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	98.090	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.090	Phascolarctos_cinereus
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.169	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.169	Poecilia_formosa
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.169	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.169	Poecilia_latipinna
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.371	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.371	Poecilia_mexicana
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.274	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.274	Poecilia_reticulata
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.555	ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	99.555	Pongo_abelii
ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.555	ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.555	Propithecus_coquereli
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